Jatropha Genome Database
- JcCA0155041.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0155041.10 - phase: 0 /pseudo/partial
(1620 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c00129 3025 0.0
KJC_s13198 624 e-178
KJC_c10515 486 e-137
KJC_s17409 214 5e-55
KJC_s18456 139 2e-32
KJC_c08065 72 5e-12
KJC_c00661 60 2e-08
>KJC_c00129
Length = 2849
Score = 3025 bits (1526), Expect = 0.0
Identities = 1526/1526 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 atgacgatcacgccaaagatttcaatcaatgatggcagccttgttgttcatggaaagact 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2660 atgacgatcacgccaaagatttcaatcaatgatggcagccttgttgttcatggaaagact 2601
Query: 61 atattaactggagtgccagataacattgtcttaactcctgggtcgggtgctgggctcgtc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2600 atattaactggagtgccagataacattgtcttaactcctgggtcgggtgctgggctcgtc 2541
Query: 121 gctggtgctttcattggtgccagtgcttcccatagcaaaagtctgcatgtctttcccgtt 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2540 gctggtgctttcattggtgccagtgcttcccatagcaaaagtctgcatgtctttcccgtt 2481
Query: 181 ggggtcttagagggtctccgttttatgtgttgtttccgattcaagttatggtggatgacc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2480 ggggtcttagagggtctccgttttatgtgttgtttccgattcaagttatggtggatgacc 2421
Query: 241 cagaggatgggcaagtgtggtaaagacattcctttggagacccaattcatgctagtggag 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2420 cagaggatgggcaagtgtggtaaagacattcctttggagacccaattcatgctagtggag 2361
Query: 301 agcagggatggtggtgaaggagttgatcaagatgatgctcagaccatttacactgtcttc 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2360 agcagggatggtggtgaaggagttgatcaagatgatgctcagaccatttacactgtcttc 2301
Query: 361 cttcctctccttgaaggccaattccgtgctgttctgcaaggcaacgaaaataatgagatg 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2300 cttcctctccttgaaggccaattccgtgctgttctgcaaggcaacgaaaataatgagatg 2241
Query: 421 gagatctgccttgagagtggggataatgctgttgaaaccaaccaaggccttcaccttgtc 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2240 gagatctgccttgagagtggggataatgctgttgaaaccaaccaaggccttcaccttgtc 2181
Query: 481 tacatgcatgctgggaccaatccctttgaagtaatcaatcaggctgtaaaggctgtggaa 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2180 tacatgcatgctgggaccaatccctttgaagtaatcaatcaggctgtaaaggctgtggaa 2121
Query: 541 aaatatatgcaaacttttcttcatcgtgagaagaaaaagttgccctctttccttgattgg 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2120 aaatatatgcaaacttttcttcatcgtgagaagaaaaagttgccctctttccttgattgg 2061
Query: 601 tttggctggtgcacgtgggatgcattttacactgatgttacagctgagggtgttgaggaa 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2060 tttggctggtgcacgtgggatgcattttacactgatgttacagctgagggtgttgaggaa 2001
Query: 661 ggccttaaaagcttatcagaaggaggaactcctgcacgatttttgatcatagatgatggc 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2000 ggccttaaaagcttatcagaaggaggaactcctgcacgatttttgatcatagatgatggc 1941
Query: 721 tggcaacagattgaaagcaaacctaaggaagattctaatgttgttgtacaagaaggagca 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1940 tggcaacagattgaaagcaaacctaaggaagattctaatgttgttgtacaagaaggagca 1881
Query: 781 caatttgcaagcagactcactggaataaaagagaatgaaaaatttcagaagaatgataaa 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1880 caatttgcaagcagactcactggaataaaagagaatgaaaaatttcagaagaatgataaa 1821
Query: 841 aagaacgaggaatccactggactaaagtatgtggtggaacatgccaagaaggactacaac 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1820 aagaacgaggaatccactggactaaagtatgtggtggaacatgccaagaaggactacaac 1761
Query: 901 gtgaagtatgtgtatgtgtggcacgctttagcgggctactggggaggagtaaaaccagct 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1760 gtgaagtatgtgtatgtgtggcacgctttagcgggctactggggaggagtaaaaccagct 1701
Query: 961 gctgctggtatggaacattatgacactttgttggcatatccagttcaatcaccaggtgta 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1700 gctgctggtatggaacattatgacactttgttggcatatccagttcaatcaccaggtgta 1641
Query: 1021 ttaggcaaccaaccagacattgtaatggacagtctttctgttcatggccttggtttggtg 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1640 ttaggcaaccaaccagacattgtaatggacagtctttctgttcatggccttggtttggtg 1581
Query: 1081 catcccaaaaaggttttcgacttctacaatgagcttcatgcctacttggcctcttgtgga 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1580 catcccaaaaaggttttcgacttctacaatgagcttcatgcctacttggcctcttgtgga 1521
Query: 1141 gtagatggagtaaaagttgatgttcagaacattattgagacccttggtgctggccatggt 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1520 gtagatggagtaaaagttgatgttcagaacattattgagacccttggtgctggccatggt 1461
Query: 1201 ggaagagtttccctcacccgcagttatcaccaagctcttgaggcttcaattgcacgaaac 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1460 ggaagagtttccctcacccgcagttatcaccaagctcttgaggcttcaattgcacgaaac 1401
Query: 1261 ttccccgacaatggatgtattgcttgcatgtgccataacactgatggactatatagtgcc 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1400 ttccccgacaatggatgtattgcttgcatgtgccataacactgatggactatatagtgcc 1341
Query: 1321 aagcagactgctgttgtcagagcttctgatgacttctatcctagagaccctgcttctcac 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1340 aagcagactgctgttgtcagagcttctgatgacttctatcctagagaccctgcttctcac 1281
Query: 1381 accgttcatatttcttctgtggcttacaacactcttttccttggagaatttatgcaacca 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1280 accgttcatatttcttctgtggcttacaacactcttttccttggagaatttatgcaacca 1221
Query: 1441 gactgggatatgttccatagtttacaccctgctgcagattatcacgctgcaggacgtgct 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1220 gactgggatatgttccatagtttacaccctgctgcagattatcacgctgcaggacgtgct 1161
Query: 1501 gttggtggctgtccgatatatgtcag 1526
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1160 gttggtggctgtccgatatatgtcag 1135
>KJC_s13198
Length = 350
Score = 624 bits (315), Expect = e-178
Identities = 322/323 (99%), Gaps = 1/323 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 417 gatggagatctgccttgagagtggggataatgctgttgaaaccaaccaaggccttcacct 476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 28 gatggagatctgccttgagagtggggataatgctgttgaaaccaaccaaggccttcacct 87
Query: 477 tgtctacatgcatgctgggaccaatccctttgaagtaatcaatcaggctgtaaaggctgt 536
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 88 tgtctacatgcatgctgggaccaatccctttgaagtaatcaatcaggctgtaaaggctgt 147
Query: 537 ggaaaaatatatgcaaacttttcttcatcgtgagaagaaaaagttgccctctttccttga 596
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 148 ggaaaaatatatgcaaacttttcttcatcgtgagaagaaaaagttgccctctttccttga 207
Query: 597 ttggtttggctggtgcacgtgggatgcattttacactgatgttacagctgagggtgttga 656
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 208 ttggtttggctggtgcacgtgggatgcattttacactgatgttacagctgagggtgttga 267
Query: 657 ggaaggccttaaaagcttatcagaaggaggaactcctgcacga-tttttgatcatagatg 715
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 268 ggaaggccttaaaagcttatcagaaggaggaactcctgcacgattttttgatcatagatg 327
Query: 716 atggctggcaacagattgaaagc 738
|||||||||||||||||||||||
Sbjct: 328 atggctggcaacagattgaaagc 350
>KJC_c10515
Length = 753
Score = 486 bits (245), Expect = e-137
Identities = 252/253 (99%), Gaps = 1/253 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 253 aagtgtggtaaagacattcctttggagacccaattcatgctagtggagagcagggatggt 312
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 751 aagtgtggtaaagacat-cctttggagacccaattcatgctagtggagagcagggatggt 693
Query: 313 ggtgaaggagttgatcaagatgatgctcagaccatttacactgtcttccttcctctcctt 372
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 692 ggtgaaggagttgatcaagatgatgctcagaccatttacactgtcttccttcctctcctt 633
Query: 373 gaaggccaattccgtgctgttctgcaaggcaacgaaaataatgagatggagatctgcctt 432
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 632 gaaggccaattccgtgctgttctgcaaggcaacgaaaataatgagatggagatctgcctt 573
Query: 433 gagagtggggataatgctgttgaaaccaaccaaggccttcaccttgtctacatgcatgct 492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 572 gagagtggggataatgctgttgaaaccaaccaaggccttcaccttgtctacatgcatgct 513
Query: 493 gggaccaatccct 505
|||||||||||||
Sbjct: 512 gggaccaatccct 500
>KJC_s17409
Length = 452
Score = 214 bits (108), Expect = 5e-55
Identities = 108/108 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 118 gtcgctggtgctttcattggtgccagtgcttcccatagcaaaagtctgcatgtctttccc 177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 108 gtcgctggtgctttcattggtgccagtgcttcccatagcaaaagtctgcatgtctttccc 49
Query: 178 gttggggtcttagagggtctccgttttatgtgttgtttccgattcaag 225
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 48 gttggggtcttagagggtctccgttttatgtgttgtttccgattcaag 1
>KJC_s18456
Length = 312
Score = 139 bits (70), Expect = 2e-32
Identities = 70/70 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 371 ttgaaggccaattccgtgctgttctgcaaggcaacgaaaataatgagatggagatctgcc 430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ttgaaggccaattccgtgctgttctgcaaggcaacgaaaataatgagatggagatctgcc 60
Query: 431 ttgagagtgg 440
||||||||||
Sbjct: 61 ttgagagtgg 70
>KJC_c08065
Length = 486
Score = 71.9 bits (36), Expect = 5e-12
Identities = 52/56 (92%), Gaps = 1/56 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 598 tggtttggctggtgcacgtgggatgcattttacactgatgttacagctgagggtgt 653
||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||
Sbjct: 182 tggtttggctggtgcacatgggatgc-ttttacactgatgttactgcagagggtgt 236
>KJC_c00661
Length = 1857
Score = 60.0 bits (30), Expect = 2e-08
Identities = 69/82 (84%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1225 tatcaccaagctcttgaggcttcaattgcacgaaacttccccgacaatggatgtattgct 1284
||||| ||||||||||| ||||| | || |||| ||||| || ||||| || ||||||
Sbjct: 524 tatcatcaagctcttgatgcttctgtagctagaaatttccctgataatgggtgcattgct 465
Query: 1285 tgcatgtgccataacactgatg 1306
|||||| |||||||||||||||
Sbjct: 464 tgcatgagccataacactgatg 443