Jatropha Genome Database
- JcCA0154061.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0154061.10 - phase: 0
(2763 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c04679 1578 0.0
KJC_c06306 222 4e-57
>KJC_c04679
Length = 800
Score = 1578 bits (796), Expect = 0.0
Identities = 799/800 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 689 ccgagactttgactctatggaatgctgatattgccagtcttaatcctgatcttaatctct 748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ccgagactttgactctatggaatgctgatattgccagtcttaatcctgatcttaatctct 60
Query: 749 atgggtcccatccgttttacatggatgtcagatcgccgtcacccgacggtaaggttgaag 808
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 atgggtcccatccgttttacatggatgtcagatcgccgtcacccgacggtaaggttgaag 120
Query: 809 cagggactagtcatggggttttgttgcttaatagtaatggtatggatataagttatggag 868
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cagggactagtcatggggttttgttgcttaatagtaatggtatggatataagttatggag 180
Query: 869 gggatagaattagttacaaggtaattggtggaattattgatttgtatgttttcgccgggc 928
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 gggatagaattagttacaaggtaattggtggaattattgatttgtatgttttcgccgggc 240
Query: 929 cttccccggagttggtaatgcagcaatatacaaagctcattggccggcctgcccctatgc 988
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 cttccccggagttggtaatgcagcaatatacaaagctcattggccggcctgcccctatgc 300
Query: 989 cttattggtcctttgggtttcatcaatgtcggtggggttaccggaatgtttccgatctag 1048
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 cttattggtcctttgggtttcatcaatgtcggtggggttaccggaatgtttccgatctag 360
Query: 1049 aaggggttgttgcaggctatgcaaaagctggtattcctcttgaagtaatatggacagaca 1108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 aaggggttgttgcaggctatgcaaaagctggtattcctcttgaagtaatatggacagaca 420
Query: 1109 ttgattacatggatggatataaagatttcactcttgatcctatcaattttcctcgagaaa 1168
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ttgattacatggatggatataaagatttcactcttgatcctatcaattttcctcgagaaa 480
Query: 1169 aaatgaagaattttgttgatactcttcaccaaaatggtcaaaaatatgtgcttatattgg 1228
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aaatgaagaattttgttgatactcttcaccaaaatggtcaaaaatatgtgcttatattgg 540
Query: 1229 atcctggtattagtgtggacagtacatatgcaacttctaaaagagggatggaagctgata 1288
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 atcctggtattagtgtggacagtacatatgcaacttctaaaagagggatggaagctgata 600
Query: 1289 tattcatcaaacatgatggcattccttacgtgggaaaggtctggcctggatcggtctact 1348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 tattcatcaaacatgatggcattccttacgtgggaaaggtctggcctggatcggtctact 660
Query: 1349 atccggactttttacatccggcaggcgaacagttttggagtaatgagatcaaattgttta 1408
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 atccggactttttacatccggcaggcgaacagttttggagtaatgagatcaaattgttta 720
Query: 1409 gagatattctcccctttgatggtatttggcttgatatgaatgaactgtccaatttcataa 1468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 gagatattctcccctttgatggtatttggcttgatatgaatgaactgtccaatttcataa 780
Query: 1469 cttcctctcctacaccatcc 1488
|||||||||||||| |||||
Sbjct: 781 cttcctctcctacatcatcc 800
>KJC_c06306
Length = 579
Score = 222 bits (112), Expect = 4e-57
Identities = 271/324 (83%)
Strand = Plus / Plus
Query: 838 aatagtaatggtatggatataagttatggaggggatagaattagttacaaggtaattggt 897
|||||||| || |||||||||| ||| | || ||||| || ||||| ||||||||||||
Sbjct: 256 aatagtaacggaatggatataatttacagcggtgataggataagttataaggtaattggt 315
Query: 898 ggaattattgatttgtatgttttcgccgggccttccccggagttggtaatgcagcaatat 957
|| || ||||||||||| ||||||| || |||| || || | ||| || ||||||||
Sbjct: 316 ggtataattgatttgtacattttcgctggagcttctcctgattcggtgatacagcaatac 375
Query: 958 acaaagctcattggccggcctgcccctatgccttattggtcctttgggtttcatcaatgt 1017
|| |||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||
Sbjct: 376 acggagcttattggcaggcctgcgcccatgccttattggtcatttggatttcatcaatgt 435
Query: 1018 cggtggggttaccggaatgtttccgatctagaaggggttgttgcaggctatgcaaaagct 1077
|| | |||||| |||||| |||||||| || | || ||||| || ||||||||||||
Sbjct: 436 cgatatggttacaagaatgtgtccgatcttgaggcagtggttgctgggtatgcaaaagct 495
Query: 1078 ggtattcctcttgaagtaatatggacagacattgattacatggatggatataaagatttc 1137
||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 496 ggtatacctcttgaagttatgtggacagatattgattacatggatgcatataaagatttt 555
Query: 1138 actcttgatcctatcaattttcct 1161
||||||||||| ||||| ||||||
Sbjct: 556 actcttgatccaatcaactttcct 579