Jatropha Genome Database
- JcCA0153201.20
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0153201.20 + phase: 0
(1689 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c01274 1729 0.0
KJC_c01758 1241 0.0
KJC_c04693 82 5e-15
KJC_c09892 54 1e-06
>KJC_c01274
Length = 889
Score = 1729 bits (872), Expect = 0.0
Identities = 886/888 (99%), Gaps = 2/888 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 682 aatttcttgttggtgaacaaggatgatgacttctctctcaaagccattgattttggactg 741
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 889 aatttcttgttggtgaacaaggatgatgacttctctctcaaagccattgattttggactg 830
Query: 742 tctgtattcttcaaaccaggtcaaattttcactgatgtggttgggagcccatattacgtt 801
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 829 tctgtattcttcaaaccaggtcaaattttcactgatgtggttgggagcccatattacgtt 770
Query: 802 gctcctgaggtactcctgaagcattatgggccagaagcagatgtatggacagctggagtc 861
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 769 gctcctgaggtactcctgaagcattatgggccagaagcagatgtatggacagctggagtc 710
Query: 862 atattgtacatattgctaagtggagtgccaccgttttgggcagaaacacagcaaggaata 921
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 709 atattgtacatattgctaagtggagtgccaccgttttgg-cagaaacacagcaaggaata 651
Query: 922 ttcgatgctgtactgaagggatatattgactttgagtcagatccttggcccctaatatca 981
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 650 ttcgatgctgtactgaagggatatattgactttgagtcagatccttggcccctaatatca 591
Query: 982 gatagtgccaaagatctcatccggggg-atgctttgctctcgaccttcagaacgcttgac 1040
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 590 gatagtgccaaagatctcatccggggggatgctttgctctcgaccttcagaacgcttgac 531
Query: 1041 tgcacatgaagtgttatgccatccttggatttgtgaaagtggagttgctccggatagagc 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 530 tgcacatgaagtgttatgccatccttggatttgtgaaagtggagttgctccggatagagc 471
Query: 1101 acttgacccggctgtactttctcgccttaagcaattctccgctatgaataaattgaagaa 1160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 470 acttgacccggctgtactttctcgccttaagcaattctccgctatgaataaattgaagaa 411
Query: 1161 gatggctttacgggtaatagctgaaagcctttctgaggaggagattgctggtctgcgaga 1220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 410 gatggctttacgggtaatagctgaaagcctttctgaggaggagattgctggtctgcgaga 351
Query: 1221 aatgttcaaggctatggatactgataacagtggtgcaatcacatttgatgaactaaaagc 1280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 350 aatgttcaaggctatggatactgataacagtggtgcaatcacatttgatgaactaaaagc 291
Query: 1281 tggtttgagaagatatggctctaccttgaaagacatagagatacgcgatcttatggatgc 1340
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 290 tggtttgagaagatatggctctaccttgaaagacatagagatacgcgatcttatggatgc 231
Query: 1341 ggctgatgtggacaacagtgggactattgactatggggaatttatagctgcaacagtgca 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 230 ggctgatgtggacaacagtgggactattgactatggggaatttatagctgcaacagtgca 171
Query: 1401 tcttaacaaattagaacgagaggagcaccttgttgcggcattcagatactttgataagga 1460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 170 tcttaacaaattagaacgagaggagcaccttgttgcggcattcagatactttgataagga 111
Query: 1461 tggaagtggttatatcaccatggatgagcttcagcaagcttgtgcagagcataacatgac 1520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 110 tggaagtggttatatcaccatggatgagcttcagcaagcttgtgcagagcataacatgac 51
Query: 1521 tgatgttttgcttgaagatataatcagagaagttgaccaagacaatga 1568
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 50 tgatgttttgcttgaagatataatcagagaagttgaccaagacaatga 3
>KJC_c01758
Length = 727
Score = 1241 bits (626), Expect = 0.0
Identities = 626/626 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 atgggcaacacatgccgtggatctttcaaagggaaactttatcagggcatcaatcagccc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 626 atgggcaacacatgccgtggatctttcaaagggaaactttatcagggcatcaatcagccc 567
Query: 61 gaggaacaatctgctgcttcccattccaagcgcaatccgtcctctgaacactctagttct 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 566 gaggaacaatctgctgcttcccattccaagcgcaatccgtcctctgaacactctagttct 507
Query: 121 gagcatttaccctctagtttcgctcctggacaagaattccccaaggaaaaccccaaaaag 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 506 gagcatttaccctctagtttcgctcctggacaagaattccccaaggaaaaccccaaaaag 447
Query: 181 gatagtaatttacctctcattagccccaataagaaagatttaataatgaggcgcagtgct 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 446 gatagtaatttacctctcattagccccaataagaaagatttaataatgaggcgcagtgct 387
Query: 241 gataaccagtcttattatgttttgggtcataaaactgcaaacattcgtgatctttacact 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 386 gataaccagtcttattatgttttgggtcataaaactgcaaacattcgtgatctttacact 327
Query: 301 ttaggccgtaaattaggacaaggacaatttgggactacttatttatgcactgagaattct 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 326 ttaggccgtaaattaggacaaggacaatttgggactacttatttatgcactgagaattct 267
Query: 361 acagggattgagtatgcttgtaagtctatatccaagaggaaattaatttccaaagaagat 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 266 acagggattgagtatgcttgtaagtctatatccaagaggaaattaatttccaaagaagat 207
Query: 421 gttgaggatgttcgaagggagattcaaataatgcaccatttggcaggtcataagaatatt 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 206 gttgaggatgttcgaagggagattcaaataatgcaccatttggcaggtcataagaatatt 147
Query: 481 gttaccattaagggtgcttatgaagatccattatatgttcatattgttatggagctttgc 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 146 gttaccattaagggtgcttatgaagatccattatatgttcatattgttatggagctttgc 87
Query: 541 tctgggggagagttgtttgatagaatcatccagagaggtcattatagtgagaggaaagca 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 86 tctgggggagagttgtttgatagaatcatccagagaggtcattatagtgagaggaaagca 27
Query: 601 gctgagttgacgaaaattattgtggg 626
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 26 gctgagttgacgaaaattattgtggg 1
>KJC_c04693
Length = 762
Score = 81.8 bits (41), Expect = 5e-15
Identities = 155/193 (80%)
Strand = Plus / Minus
Query: 716 ctctcaaagccattgattttggactgtctgtattcttcaaaccaggtcaaattttcactg 775
||||||| |||| ||||||||| || ||||| |||| || |||||| ||| ||| |||
Sbjct: 533 ctctcaaggccactgattttggtctttctgtgttctataagccaggtgaaactttttctg 474
Query: 776 atgtggttgggagcccatattacgttgctcctgaggtactcctgaagcattatgggccag 835
|||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||| | | ||| ||||||| || |
Sbjct: 473 atgttgttgggagtccatactatgttgcaccagaggtgttgcgcaagtattatggacctg 414
Query: 836 aagcagatgtatggacagctggagtcatattgtacatattgctaagtggagtgccaccgt 895
||||||||||||||| || ||| | || |||||||| || || |||||||||||| |
Sbjct: 413 aagcagatgtatggagcgcaggaattattttgtacatcttactgtctggagtgccaccct 354
Query: 896 tttgggcagaaac 908
|||||||||||||
Sbjct: 353 tttgggcagaaac 341
>KJC_c09892
Length = 513
Score = 54.0 bits (27), Expect = 1e-06
Identities = 33/35 (94%)
Strand = Plus / Minus
Query: 658 atgcatagagatctaaagcctgagaatttcttgtt 692
|||||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct: 420 atgcatagagatcttaagcctgaaaatttcttgtt 386