Jatropha Genome Database
- JcCA0150851.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0150851.10 - phase: 1 /pseudo/partial
(2202 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c00521 4236 0.0
KJC_s14747 710 0.0
KJC_s14290 190 1e-47
KJC_c10825 180 1e-44
KJC_c03014 178 4e-44
KJC_c01131 82 7e-15
>KJC_c00521
Length = 3022
Score = 4236 bits (2137), Expect = 0.0
Identities = 2165/2169 (99%), Gaps = 4/2169 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 ttaatgaaaacccttttactagcatattaaagacacttgagaaacctgatggtggtgaat 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2938 ttaatgaaaacccttttactagcatattaaagacacttgagaaacctgatggtggtgaat 2879
Query: 61 ttggcaagtactatagcttgcctgctctcaatgatccgagaatcgataagctgccatatt 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2878 ttggcaagtactatagcttgcctgctctcaatgatccgagaatcgataagctgccatatt 2819
Query: 121 ctattaagatccttttagagtctgctatccgaaactgtgatgagtttcaggttaagagca 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2818 ctattaagatccttttagagtctgctatccgaaactgtgatgagtttcaggttaagagca 2759
Query: 181 aggacgtcgagaagatcattgactgggagaatacttctcctaaacaagttgaaatcccat 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2758 aggacgtcgagaagatcattgactgggagaatacttctcctaaacaagttgaaatcccat 2699
Query: 241 tcaagcctgccagagtcctccttcaggattttactggtgttcctgctgttgttgatcttg 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2698 tcaagcctgccagagtcctccttcaggattttactggtgttcctgctgttgttgatcttg 2639
Query: 301 cttgcatgcgagatgcaatgaacagtcttggaggtgattctaataaaattaatccactgg 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2638 cttgcatgcgagatgcaatgaacagtcttggaggtgattctaataaaattaatccactgg 2579
Query: 361 ttccggttgatctcgttattgatcactcagttcaggttgatgtggcaagatcagaaaatg 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2578 ttccggttgatctcgttattgatcactcagttcaggttgatgtggcaagatcagaaaatg 2519
Query: 421 cagtgcaggctaatatggaacttgagtttcaaagaaacaaagaaagatttgcttttctaa 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2518 cagtgcaggctaatatggaacttgagtttcaaagaaacaaagaaagatttgcttttctaa 2459
Query: 481 aatggggttcaaatgcgtttcataacatgctcgttgttcctcctggatctgggatagtcc 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2458 aatggggttcaaatgcgtttcataacatgctcgttgttcctcctggatctgggatagtcc 2399
Query: 541 atcaggtcaatttagagtaccttgggagagttgtattcaacacaaatggcatcctttacc 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2398 atcaggtcaatttagagtaccttgggagagttgtattcaacacaaatggcatcctttacc 2339
Query: 601 ctgatagtgttgttggaacagattcacacacaactatgatagatggattaggtgttgctg 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2338 ctgatagtgttgttggaacagattcacacacaactatgatagatggattaggtgttgctg 2279
Query: 661 gctggggagttggtgggatagaagcagaagctgcgatgcttggccagcccatgagcatgg 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2278 gctggggagttggtgggatagaagcagaagctgcgatgcttggccagcccatgagcatgg 2219
Query: 721 tccttcctggtgtggttggtttcaagttatcaggaaaactgagggatggtgttacagcta 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2218 tccttcctggtgtggttggtttcaagttatcaggaaaactgagggatggtgttacagcta 2159
Query: 781 ctgatttggtttt-gactgtaacacaaatgctaaggaagcacggtgttgttggcaagttt 839
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2158 ctgatttggtttttgactgtaacacaaatgctaaggaagcacggtgttgttggcaagttt 2099
Query: 840 gtggagttctacggagaaggcatgagtgaactttcattagcagatcgcgctactattgca 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2098 gtggagttctacggagaaggcatgagtgaactttcattagcagatcgcgctactattgca 2039
Query: 900 aacatgtctcctgagtatggtgcaaccatgggctttttccctgtggatcatgttacactg 959
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2038 aacatgtctcctgagtatggtgcaaccatgggctttttccctgtggatcatgttacactg 1979
Query: 960 cagtatctcaaactaactggcagaactgatgaaactgtctgtctgatagaatcctattta 1019
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1978 cagtatctcaaactaactggcagaactgatgaaactgtctgtctgatagaatcctattta 1919
Query: 1020 agagctaacaagatgtttgtcgactacagcgagccccaaatagagagagtgtacacctca 1079
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1918 agagctaacaagatgtttgtcgactacagcgagccccaaatagagagagtgtacacctca 1859
Query: 1080 tatctagaattgaatctcgaggatgtggaaccttgtgtatcagggcccaagaggcctcat 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1858 tatctagaattgaatctcgaggatgtggaaccttgtgtatcagggcccaagaggcctcat 1799
Query: 1140 gatcgagttcctttgaaggaaatgaaagcagattggcattcatgcttggacagtagagtt 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1798 gatcgagttcctttgaaggaaatgaaagcagattggcattcatgcttggacagtagagtt 1739
Query: 1200 ggctttaagggattcgctataccaaaggaatctcaaagtaaggttgtagagttcaatttt 1259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1738 ggctttaagggattcgctataccaaaggaatctcaaagtaaggttgtagagttcaatttt 1679
Query: 1260 cacgggactccagcacaactcaagcatggtgatgtggttatagctgctattactagttgc 1319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1678 cacgggactccagcacaactcaagcatggtgatgtggttatagctgctattactagttgc 1619
Query: 1320 acaaatacctcaaaccctagtgtaatgctgggagctgctttggtcgcaaagaaagctttt 1379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1618 acaaatacctcaaaccctagtgtaatgctgggagctgctttggtcgcaaagaaagctttt 1559
Query: 1380 gaactaggactggaggtaaaaccatgggtcaaaacaagtcttgcaccaggttctggggtt 1439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1558 gaactaggactggaggtaaaaccatgggtcaaaacaagtcttgcaccaggttctggggtt 1499
Query: 1440 gtcaccaaatacttggaaaagagtggcctgcagaagtatttgaatcatttagggttccac 1499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1498 gtcaccaaatacttggaaaagagtggcctgcagaagtatttgaatcatttagggttccac 1439
Query: 1500 atagttggttatggatgcaccacttgcattggcaattcaggtgacattgatgaagcagtg 1559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1438 atagttggttatggatgcaccacttgcattggcaattcaggtgacattgatgaagcagtg 1379
Query: 1560 gcatcagctattactgaaaatgatttagttgcagcagctgtattgtctgggaataggaat 1619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1378 gcatcagctattactgaaaatgatttagttgcagcagctgtattgtctgggaataggaat 1319
Query: 1620 tttgagggtcgtgtgcatcctttaacaagagctaattatcttgcctcacctccgcttgtg 1679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1318 tttgagggtcgtgtgcatcctttaacaagagctaattatcttgcctcacctccgcttgtg 1259
Query: 1680 gttgcctatgcacttgctggaacggtggatattgattttgaaacagaaccaattggggta 1739
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 1258 gttgcctatgcacttgctggaacggtggatattgattttgaaacagaaccaatt-gggta 1200
Query: 1740 ggaaaagatggaaagcagatatttttcagggatatttggccatccaatgaagaagtcgca 1799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1199 ggaaaagatggaaagcagatatttttcagggatatttggccatccaatgaagaagtcgca 1140
Query: 1800 caagttgtacaatcaagtgtgctgcctgatatgttcaaagctacttatgaggcaatcact 1859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1139 caagttgtacaatcaagtgtgctgcctgatatgttcaaagctacttatgaggcaatcact 1080
Query: 1860 aaaggaaatcccatgtggaacgacttatctgtaccttctggcacactctactcttgggat 1919
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1079 aaaggaaatcccatgtggaacgacttatctgtaccttctggcacactctactcttgggat 1020
Query: 1920 ccagcgtcaacatacatacacgagcctccctatttcaaaagcatgaccatgtcacctcct 1979
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1019 ccagcgtcaacatacatacacgagcctccctatttcaaaagcatgaccatgtcacctcct 960
Query: 1980 ggaccacacggtgtgaaggatgcttactgcttgctcaattttggggatagtatcacaact 2039
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 959 ggaccacacggtgtgaaggatgcttactgcttgctcaattttggggatagtatcacaact 900
Query: 2040 gatcacatttcacctgctggtagcatacacaaagacagtcctgctgccagatacctcatt 2099
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 899 gatcacatttcacctgctggtagcatacacaaagacagtcctgctgccagatacctcatt 840
Query: 2100 gaacgtggtgtacaacagaagggtactttaactcgtatggaagtcgtcgtggtaatgatg 2159
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 839 gaacgtggtgt-caacagaaggg-actttaactcgtatggaagtcgtcgtggtaatgatg 782
Query: 2160 aggtgatgg 2168
|||||||||
Sbjct: 781 aggtgatgg 773
>KJC_s14747
Length = 405
Score = 710 bits (358), Expect = 0.0
Identities = 399/409 (97%), Gaps = 6/409 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 265 aggattttactggtgttcctgctgttgttgatcttgcttgcatgcgagatgcaatgaaca 324
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 405 aggattttactggtgttcctgctgttgttgancttgcttgcatgcgagatgcaatgaaca 346
Query: 325 gtcttggaggtgattctaataaaattaatccactggttccggttgatctcgttattgatc 384
| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 345 g-cttg-aggtgattctat--aaattaatccactg--tccggttgatcncgttattgatc 292
Query: 385 actcagttcaggttgatgtggcaagatcagaaaatgcagtgcaggctaatatggaacttg 444
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 291 actcagttcaggttgatgtggcaagatcngaaaatgcagtgcaggctaatatggaacttg 232
Query: 445 agtttcaaagaaacaaagaaagatttgcttttctaaaatggggttcaaatgcgtttcata 504
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 231 agtttcaaagaaacaaagaaagatttgcttttctaaaatggggttcaaatgcgtttcata 172
Query: 505 acatgctcgttgttcctcctggatctgggatagtccatcaggtcaatttagagtaccttg 564
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 171 acatgctcgttgttcctcctggatctgggatagtccatcaggtcaatttagagtaccttg 112
Query: 565 ggagagttgtattcaacacaaatggcatcctttaccctgatagtgttgttggaacagatt 624
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 111 ggagagttgtattcaacacaaatggcatcctttaccctgatagtgttgttggaacagatt 52
Query: 625 cacacacaactatgatagatggattaggtgttgctggctggggagttgg 673
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 51 cacacacaactatgatagatggattaggtgttgctggctggggagttgg 3
>KJC_s14290
Length = 123
Score = 190 bits (96), Expect = 1e-47
Identities = 119/123 (96%), Gaps = 4/123 (3%)
Strand = Plus / Minus
Query: 555 gagtaccttgggagagttgtattcaa-cacaaat-ggcatcctttaccctg--atagtgt 610
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 123 gagtaccttgggagagttgtattcaaacacaaataggcatcctttaccctggaatagtgt 64
Query: 611 tgttggaacagattcacacacaactatgatagatggattaggtgttgctggctggggagt 670
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 63 tgttggaacagattcacacacaactatgatagatggattaggtgttgctggctggggagt 4
Query: 671 tgg 673
|||
Sbjct: 3 tgg 1
>KJC_c10825
Length = 355
Score = 180 bits (91), Expect = 1e-44
Identities = 251/303 (82%), Gaps = 1/303 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 696 atgcttggcca-gcccatgagcatggtccttcctggtgtggttggtttcaagttatcagg 754
||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||| |||| ||
Sbjct: 355 atgcttggccacgcccatgagcatggtgttgcctggtgttgttgggttcaagctatctgg 296
Query: 755 aaaactgagggatggtgttacagctactgatttggttttgactgtaacacaaatgctaag 814
|||| | | |||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||
Sbjct: 295 aaaattacgcaatggcgtaacagctactgacttagttttgactgtgacacaaatgctgag 236
Query: 815 gaagcacggtgttgttggcaagtttgtggagttctacggagaaggcatgagtgaactttc 874
|||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || || || ||| |||| || ||
Sbjct: 235 gaagcatggtgttgttggcaaatttgtcgagttttatggggatggtatgggtgagctatc 176
Query: 875 attagcagatcgcgctactattgcaaacatgtctcctgagtatggtgcaaccatgggctt 934
|||||| || | || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||
Sbjct: 175 attagctgacagggccaccatagctaacatgtctcctgagtatggtgcgaccatgggatt 116
Query: 935 tttccctgtggatcatgttacactgcagtatctcaaactaactggcagaactgatgaaac 994
|||||||| ||||||||||| | || ||||| ||| | ||||| || | |||||||||
Sbjct: 115 cttccctgttgatcatgttactttacaatatctaaaattgactggaaggagtgatgaaac 56
Query: 995 tgt 997
|||
Sbjct: 55 tgt 53
>KJC_c03014
Length = 543
Score = 178 bits (90), Expect = 4e-44
Identities = 324/402 (80%)
Strand = Plus / Minus
Query: 50 tggtggtgaatttggcaagtactatagcttgcctgctctcaatgatccgagaatcgataa 109
||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| |||||||| || || |||||
Sbjct: 409 tggtggtgaatttgggaaattctatagtctgcctgctctaaatgatccaaggattgataa 350
Query: 110 gctgccatattctattaagatccttttagagtctgctatccgaaactgtgatgagtttca 169
||||| |||||||| | |||||| | || ||||| || || || ||||| | || ||
Sbjct: 349 actgccttattctatcagaatccttcttgaatctgcaattcgtaattgtgacaacttcca 290
Query: 170 ggttaagagcaaggacgtcgagaagatcattgactgggagaatacttctcctaaacaagt 229
|||| | |||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||
Sbjct: 289 agttactaaagaggatgttgagaagattattgattgggaaaatacatctccaaaacaagt 230
Query: 230 tgaaatcccattcaagcctgccagagtcctccttcaggattttactggtgttcctgctgt 289
|||||| || ||||||||||| | || ||| | ||||||||||||||||| || |||||
Sbjct: 229 tgaaattcctttcaagcctgctcgtgttctcttacaggattttactggtgtaccagctgt 170
Query: 290 tgttgatcttgcttgcatgcgagatgcaatgaacagtcttggaggtgattctaataaaat 349
||| || || |||| ||||| ||||| |||| | ||||| |||||||| || || ||
Sbjct: 169 tgtggacctagcttctatgcgggatgccatgagtaagcttggtggtgattccaacaagat 110
Query: 350 taatccactggttccggttgatctcgttattgatcactcagttcaggttgatgtggcaag 409
||||| ||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||
Sbjct: 109 caatcctttggttcctgtagatctggtcattgatcactcggttcaagttgacgtggcaag 50
Query: 410 atcagaaaatgcagtgcaggctaatatggaacttgagtttca 451
|||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||
Sbjct: 49 atcagaaaatgctgtgcaagcaaatatggagcttgaatttca 8
>KJC_c01131
Length = 1654
Score = 81.8 bits (41), Expect = 7e-15
Identities = 209/265 (78%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1615 ggaattttgagggtcgtgtgcatcctttaacaagagctaattatcttgcctcacctccgc 1674
||||||||||||||||||| || || || |||||||| || |||||||| || |||||
Sbjct: 524 ggaattttgagggtcgtgttcaccccttgacaagagcaaactatcttgcttcccctcctt 583
Query: 1675 ttgtggttgcctatgcacttgctggaacggtggatattgattttgaaacagaaccaattg 1734
| ||||| || ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| | || || ||||
Sbjct: 584 tggtggtcgcatatgctcttgctggcacggttgacatcgactttgataaggagcctattg 643
Query: 1735 gggtaggaaaagatggaaagcagatatttttcagggatatttggccatccaatgaagaag 1794
| | || |||||||| ||| | | | ||||| |||||| |||||| | | ||||||
Sbjct: 644 gaattgggaaagatggtaagaatgtctatttcaaggatatctggccaactacagaagaaa 703
Query: 1795 tcgcacaagttgtacaatcaagtgtgctgcctgatatgttcaaagctacttatgaggcaa 1854
| ||| | ||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |
Sbjct: 704 ttgcagagactgttcaatctagtgtgttgcctgagatgttcaaaagtacttatgaggcta 763
Query: 1855 tcactaaaggaaatcccatgtggaa 1879
|||| || || ||||||||||||||
Sbjct: 764 tcacaaagggcaatcccatgtggaa 788
Score = 81.8 bits (41), Expect = 7e-15
Identities = 95/113 (84%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1974 cctcctggaccacacggtgtgaaggatgcttactgcttgctcaattttggggatagtatc 2033
|||||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||
Sbjct: 883 cctcctggtgcacatggagtgaaggatgcctactgtttgctgaatttcggtgatagcatc 942
Query: 2034 acaactgatcacatttcacctgctggtagcatacacaaagacagtcctgctgc 2086
|| || ||||||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||||
Sbjct: 943 actacagatcacatttctccagcaggaagcatccacaaggacagtcctgctgc 995
Score = 58.0 bits (29), Expect = 1e-07
Identities = 47/53 (88%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1128 aagaggcctcatgatcgagttcctttgaaggaaatgaaagcagattggcattc 1180
||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||
Sbjct: 37 aagagaccacatgatcgggttcctttgaaagaaatgaaggctgattggcattc 89