Jatropha Genome Database
- JcCA0150301.20
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0150301.20 + phase: 0
(1440 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c04901 1156 0.0
KJC_c08913 577 e-164
>KJC_c04901
Length = 787
Score = 1156 bits (583), Expect = 0.0
Identities = 641/650 (98%), Gaps = 8/650 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 765 agatggaaacatatggcctaacatccgaatagctgattgtggt-cataaaatt-ggtttg 822
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||
Sbjct: 1 agatggaaacatatggc-taacatccgaatagctgattgtggtacntaaaattaggtttg 59
Query: 823 aatggtgttgataatggtcgaatctggtttgacaatgtgagaatccccagagagaatctg 882
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 60 aatggtgttgataatggtcgaatctggtttgacaatgtgagaatccccagagagaatctg 119
Query: 883 ttgaattcagtagctgatgtttcaccggatggacaatatcttagtgctattaaagacgca 942
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 120 ttgaattcagtagctgatgtttcaccggatggacaatatcttagtgctattaaagacgca 179
Query: 943 gatcaaagatttgcagcatttcttgcccctctgacatctggtcgtgtaaccattgctgtt 1002
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 180 gatcaaagatttgcagcatttcttgcccctctgacatctggtcgtgtaaccattgctgtt 239
Query: 1003 agtgcaatttactcatcaaagataggtctagcaactgccataaggtattcattatctagg 1062
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 240 agtgcaatttactcatcaaagataggtctagcaactgccataaggtattcattatctagg 299
Query: 1063 caggcattttctgttacaccgaatggacctgaagtcctattacttgattatccgagtcac 1122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 300 caggcattttctgttacaccgaatggacctgaagtcctattacttgattatccgagtcac 359
Query: 1123 caacgacgactcttgccccttcttgcaaagacatatgctatgagctttgctggaaattat 1182
||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 360 caacgacgactcttgcccc-tcttgc-aagacatatgctatgagctttgctggaaattat 417
Query: 1183 ttgaaaatgatatactggaataggacgccagaaacaaataaaacccttcatgttgtttca 1242
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||
Sbjct: 418 ttgaaaatgatatactggaataggacgccagaaac-aataaaa-ccttcatg-tgtttca 474
Query: 1243 agtgcattcaaggctaccttgacctggcatgatatgagaacacttcaagaatgccgtgaa 1302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 475 agtgcattcaaggctaccttgacctggcatgatatgagaacacttcaagaatgccgtgaa 534
Query: 1303 gcttgtggaggacaaggcttgaagactgagaatcgagttggtcatttgaagagtgaattt 1362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 535 gcttgtggaggacaaggcttgaagactgagaatcgagttggtcatttgaagagtgaattt 594
Query: 1363 gatgttcagtccacctttgagggggacaataatgttctcatgcagcaggt 1412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 595 gatgttcagtccacctttgagggggacaataatgttctcatgcagcaggt 644
>KJC_c08913
Length = 503
Score = 577 bits (291), Expect = e-164
Identities = 291/291 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 478 gaaagacatcacgataagtggcttagggacaccgaaacttatgcaattaaaggttgcttt 537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 213 gaaagacatcacgataagtggcttagggacaccgaaacttatgcaattaaaggttgcttt 272
Query: 538 gctatgacagaattggggcatggaagtaatgtccgaggaattgaaactgtcactatatat 597
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 273 gctatgacagaattggggcatggaagtaatgtccgaggaattgaaactgtcactatatat 332
Query: 598 gattcgaacacaggggaatttgtaatcaatactccttgtgaatcagctcagaagtattgg 657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 333 gattcgaacacaggggaatttgtaatcaatactccttgtgaatcagctcagaagtattgg 392
Query: 658 attggtggagctgctaatcatgcaacgcacaccatagtgttctcacagctcaatataaat 717
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 393 attggtggagctgctaatcatgcaacgcacaccatagtgttctcacagctcaatataaat 452
Query: 718 gggatgagtgaaggggtgcatgcattcatagcccaaatcagggatgcagat 768
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 453 gggatgagtgaaggggtgcatgcattcatagcccaaatcagggatgcagat 503
Score = 349 bits (176), Expect = 1e-95
Identities = 183/184 (99%), Gaps = 1/184 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 296 ccatggaacagcagagagaaataacgatgagacgggtggcgtatctattggaaagagggg 355
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ccatggaacagcagagagaaataacgatgagacgggtggcgtatctattggaaagagggg 60
Query: 356 tttttgatggttggttaacagggaaaggtcttgaatcggaaatg-aaaaaatggccttgt 414
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 61 tttttgatggttggttaacagggaaaggtcttgaatcggaaatgaaaaaaatggccttgt 120
Query: 415 ttgaagttattggcatgtttgatcactccctcgctattaaactcggtgttcacttctttt 474
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ttgaagttattggcatgtttgatcactccctcgctattaaactcggtgttcacttctttt 180
Query: 475 tatg 478
||||
Sbjct: 181 tatg 184