Jatropha Genome Database
- JcCA0149941.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0149941.10 - phase: 0
(2628 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c03696 1806 0.0
KJC_c03510 1655 0.0
>KJC_c03696
Length = 932
Score = 1806 bits (911), Expect = 0.0
Identities = 932/935 (99%), Gaps = 3/935 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 262 cctgtttttacttcaccagtccggcctgctgctgtgccttttcgaacatctcctgcaact 321
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 cctgtttttacttcaccagtccggcctgctgctgtgccttttcgaacatctcctgcaact 60
Query: 322 cctcagccagttgctttctcatcaggctcatcactgcccacatcatcacctccacatttc 381
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 cctcagccagttgctttctcatcaggctcatcactgcccacatcatcacctccacatttc 120
Query: 382 tcaaatggatcagctgagttgcagcaccaagttcctgaatctgcagaggacacattgcct 441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 tcaaatggatcagctgagttgcagcaccaagttcctgaatctgcagaggacacattgcct 180
Query: 442 attggggaattaccatgtgtcttattctctgctcacaaggttttaaagcagaagaaactt 501
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 attggggaattaccatgtgtcttattctctgctcacaaggttttaaagcagaagaaactt 240
Query: 502 gcaaatgtacccagtttaggttttggggcattgatttcccctgggagggagatttcacca 561
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gcaaatgtacccagtttaggttt-ggggcattgatttcccctgggagggagatttcacca 299
Query: 562 ggtccacaaataatacagcgtgatccccatcgctgccaaaattgtggagcttattctaac 621
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 300 ggtccacaaataatacagcgtgatccccatcgctgccaaaattgtggagcttattctaac 359
Query: 622 ctctattccaagatattacttggttcaggccagtggcaatgtgtactttgcaggacattg 681
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 360 ctctattccaagatattacttggttcaggccagtggcaatgtgtactttgcaggacattg 419
Query: 682 aatggaagtggtggtgaatacatagctccaagcaaagaagatcttcgtaacttcccagaa 741
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 420 aatggaagtggtggtgaatacatagctccaagcaaagaagatcttcgtaacttcccagaa 479
Query: 742 atgtcatcgcccatggttgattatgttcaaactgggaataagagacctggttttattcca 801
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 480 atgtcatcgcccatggttgattatgttcaaactgggaataagagacctggttttattcca 539
Query: 802 gtttccgattccagaatgtctgcacccatcatccttgttatagatgactgtttagatgaa 861
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 540 gtttccgattccagaatgtctgcacccatcatccttgttatagatgactgtttagatgaa 599
Query: 862 ccacacctgcaacatttacaaagctccttgcatgcgtttgtcgattcacttccccctaca 921
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 600 ccacacctgcaacatttacaaagctccttgcatgcgtttgtcgattcacttccccctaca 659
Query: 922 gcaagaattggaatcatattgtatggacgcactgtgtcggtttatgatttttcggaggaa 981
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 660 gcaagaattggaatcatattgtatggacgcactgtgtcggtttatgatttttcggaggaa 719
Query: 982 tcaatggcatcagctgatgtgcttcctggtgacaaatcaccttctcaggaatccttgaaa 1041
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 720 tcaatggcatcagctgatgtgcttcctggtgacaaatcaccttctcaggaatccttgaaa 779
Query: 1042 gcattgatctatggaactggggtgtacttatcgcctatgcatgcttcaaaagaagtagca 1101
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 780 gcattgatctatggaactggggtgtacttatcgcctatgcatgcttcaaaag-agtagca 838
Query: 1102 caccaaattttttcatcacttagaccatataaactgaacattgcagaagcttcaagagat 1161
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 839 caccaaa-tttttcatcacttagaccatataaactgaacattgcagaagcttcaagagat 897
Query: 1162 cggtgcctgggtactgcagttgaggttgctctggg 1196
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 898 cggtgcctgggtactgcagttgaggttgctctggg 932
>KJC_c03510
Length = 856
Score = 1655 bits (835), Expect = 0.0
Identities = 856/859 (99%), Gaps = 3/859 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1173 tactgcagttgaggttgctctgggtataattcaaggaccatcagcagaaatgtctcgagg 1232
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tactgcagttgaggttgctctgggtataattcaaggaccatcagcagaaatgtctcgagg 60
Query: 1233 tgtagtcaagagggctggaggtaatagcaggataattgtgtgtgctggcggacctaacac 1292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tgtagtcaagagggctggaggtaatagcaggataattgtgtgtgctggcggacctaacac 120
Query: 1293 ttatggccctggatcagtcccccattcttttagtcatccaaattatcctcatatggaaaa 1352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ttatggccctggatcagtcccccattcttttagtcatccaaattatcctcatatggaaaa 180
Query: 1353 gatggcgttgaaatggatggagcatctgggtcacgaagctcatcgacacaatacagtggt 1412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 gatggcgttgaaatggatggagcatctgggtcacgaagctcatcgacacaatacagtggt 240
Query: 1413 tgacattctgtgtgctggaacttgtcctgttagagttccagttttgcagcctcttgctaa 1472
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tgacattctgtgtgctggaacttgtcctgttagagttccagttttgcagcctcttgctaa 300
Query: 1473 agcttctgggggtgttttggtactccatgatgactttggagaagcctttggggtaaattt 1532
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 agcttctgggggtgttttggtactccatgatgactttggagaagcctttggggtaaattt 360
Query: 1533 gcaaagggcatcttcccgggcatcaggttcccagggtttactggagattcgatgttctaa 1592
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gcaaagggcatctt-ccgggcatcaggttcccagggtttactggagattcgatgttctaa 419
Query: 1593 tgatattcttattactcaagttgtgggtcctggtgaagaggcacatatagacactcatga 1652
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 420 tgatattcttattactcaagttgtgggtcctggtgaagaggcacatatagacactcatga 479
Query: 1653 aacatttaaaaatgacatgtctctctctattcaaatgttgagcgtcgaagaaacccaaag 1712
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 480 aacatttaaaaatgacatgtctctctctattcaaatgttgagcgtcgaagaaacccaaag 539
Query: 1713 ctttgcactctccatggaaactaaaggggacatcaagaatgattttgtatatttccaatt 1772
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 540 ctttgcactctccatggaaact-aaggggacatcaagaatgattttgtata-ttccaatt 597
Query: 1773 tgcaattcaatattcaagcatttatcaagctgatatctccagagttattacggtcagatt 1832
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 598 tgcaattcaatattcaagcatttatcaagctgatatctccagagttattacggtcagatt 657
Query: 1833 gcctgctgttgatagcatttcaacatacctagagagtgttcaggatgaagtggctgcaat 1892
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 658 gcctgctgttgatagcatttcaacatacctagagagtgttcaggatgaagtggctgcaat 717
Query: 1893 cctcattgccaagaggactctcttgcgagccaaaaactattctgatgcagttgatatgcg 1952
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 718 cctcattgccaagaggactctcttgcgagccaaaaactattctgatgcagttgatatgcg 777
Query: 1953 agcaacaatagatgagagaattaaagacattgctttgaaatttgggtcccaggtaccaaa 2012
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 778 agcaacaatagatgagagaattaaagacattgctttgaaatttgggtcccaggtaccaaa 837
Query: 2013 gtcaaaacttcatcgattc 2031
|||||||||||||||||||
Sbjct: 838 gtcaaaacttcatcgattc 856