Jatropha Genome Database
- JcCA0144801.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0144801.10 + phase: 0
(750 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c01434 1423 0.0
>KJC_c01434
Length = 736
Score = 1423 bits (718), Expect = 0.0
Identities = 718/718 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 33 agtgaaggcaacagcccgagttgataagttctctaaaagtgatattattgtttccccatc 92
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 736 agtgaaggcaacagcccgagttgataagttctctaaaagtgatattattgtttccccatc 677
Query: 93 cattctctctgctaattttgcaaagctaggagagcaggtaaaagcagttgaggtggcagg 152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 676 cattctctctgctaattttgcaaagctaggagagcaggtaaaagcagttgaggtggcagg 617
Query: 153 ttgtgattggatccatgtagatgtaatggatggtcgatttgttccaaacattaccattgg 212
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 616 ttgtgattggatccatgtagatgtaatggatggtcgatttgttccaaacattaccattgg 557
Query: 213 acctcttgtggttgatgctttgcgcccagtgacagatcttcctttggatgtgcatttgat 272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 556 acctcttgtggttgatgctttgcgcccagtgacagatcttcctttggatgtgcatttgat 497
Query: 273 gattgtggaacctgaacaacgagtgccagattttatcaaagcaggagctgacatagtcag 332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 496 gattgtggaacctgaacaacgagtgccagattttatcaaagcaggagctgacatagtcag 437
Query: 333 tgttcactgtgagcaatcttccaccatccacttgcatcgcacagtaaatcagataaaaga 392
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 436 tgttcactgtgagcaatcttccaccatccacttgcatcgcacagtaaatcagataaaaga 377
Query: 393 tcttggagctaaagctggagtcgtcttgaaccctgctactccattgagtgctatagaata 452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 376 tcttggagctaaagctggagtcgtcttgaaccctgctactccattgagtgctatagaata 317
Query: 453 tgttcttgatgtggttgatcttgtcttgattatgtctgtcaaccctggttttggtggtca 512
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 316 tgttcttgatgtggttgatcttgtcttgattatgtctgtcaaccctggttttggtggtca 257
Query: 513 aggctttattgagagtcaagtgaagaaaatctcagatttgagaagactgtgtgcagagaa 572
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 256 aggctttattgagagtcaagtgaagaaaatctcagatttgagaagactgtgtgcagagaa 197
Query: 573 gggggtaaatccatggattgaggtagatggtggagttggtcccaagaatgcatataaggt 632
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 196 gggggtaaatccatggattgaggtagatggtggagttggtcccaagaatgcatataaggt 137
Query: 633 tattgaggctggggctaatgctttggttgctggttcagcagtttttggagctaaagatta 692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 136 tattgaggctggggctaatgctttggttgctggttcagcagtttttggagctaaagatta 77
Query: 693 tgctgaagctataaaaggaatcaaaaccagcaaaaggccagtagcagtgccagcatga 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 76 tgctgaagctataaaaggaatcaaaaccagcaaaaggccagtagcagtgccagcatga 19