Jatropha Genome Database
- JcCA0132221.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0132221.10 + phase: 0 /partial
(1262 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c01383 1497 0.0
KJC_s16459 581 e-165
KJC_c10075 488 e-137
>KJC_c01383
Length = 2242
Score = 1497 bits (755), Expect = 0.0
Identities = 765/767 (99%), Gaps = 1/767 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 atggcgactggaactgtaccggcttcttttactggtctcaaggccagggaatccagtttg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2134 atggcgactggaactgtaccggcttcttttactggtctcaaggccagggaatccagtttg 2075
Query: 61 ggcttcgggaaaagcatggattttgtgcgagtttgtgatttgaagaggatcaagtctggt 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2074 ggcttcgggaaaagcatggattttgtgcgagtttgtgatttgaagaggatcaagtctggt 2015
Query: 121 aggaagaagatttcaatgattaggaactcgaatcctggtcctgaaatggttgaactgcag 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2014 aggaagaagatttcaatgattaggaactcgaatcctggtcctgaaatggttgaactgcag 1955
Query: 181 cctgcttcagaagggagtcctttgttagttcctagacagaagtattgtgagtctgtacac 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1954 cctgcttcagaagggagtcctttgttagttcctagacagaagtattgtgagtctgtacac 1895
Query: 241 aagactgtcaggaggaaaacacgaactgtaatggtgggaaatgtagctcttggtagtgat 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1894 aagactgtcaggaggaaaacacgaactgtaatggtgggaaatgtagctcttggtagtgat 1835
Query: 301 catcctatcagagttcagactatgactacatccgacactaaagacgttgctggaacagtt 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1834 catcctatcagagttcagactatgactacatccgacactaaagacgttgctggaacagtt 1775
Query: 361 gaacaggttatgagaatagcagaccagggagcaaatttagttcggattacagttcaaggg 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1774 gaacaggttatgagaatagcagaccagggagcaaatttagttcggattacagttcaaggg 1715
Query: 421 aagagagaagcagatgctgccttcgaaataaaaaatactcttgtgcagaaaaattacaat 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1714 aagagagaagcagatgctgccttcgaaataaaaaatactcttgtgcagaaaaattacaat 1655
Query: 481 atacctctggttgcagatattcattttgcaccaactgttgcactgcgagtagctgaatgc 540
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1654 atacctctggtcgcagatattcattttgcaccaactgttgcactgcgagtagctgaatgc 1595
Query: 541 tttgacaagattcgtgtaaatcctggaaattttgctgataggcgggctcagtttgagaag 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1594 tttgacaagattcgtgtaaatcctggaaattttgctgataggcgggctcagtttgagaag 1535
Query: 601 ctagagtacacagatgaggactatcagaaagagctcgagcacattgagcaggtttttact 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1534 ctagagtacacagatgaggactatcagaaagagctcgagcacattgagcaggtttttact 1475
Query: 661 ccattggttgagaaatgtaagaagtatggaagggcaatgcgcattgggacaaaccatgga 720
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1474 ccattggttgagaaatgtaagaagtatggaagggcaatgcgcattgggacaaaccatgg- 1416
Query: 721 agcctttcagatcgcataatgagctactatggagattctcctagggg 767
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1415 agcctttcagatcgcataatgagctactatggagattctcctagggg 1369
Score = 961 bits (485), Expect = 0.0
Identities = 485/485 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 772 gcaagcaaccctgtcatcatggtccaggcataccgtttgctcgtagcagaaatgtatgtt 831
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1292 gcaagcaaccctgtcatcatggtccaggcataccgtttgctcgtagcagaaatgtatgtt 1233
Query: 832 cagggctgggattatccattacacttgggtgtcactgaagctggagaaggtgaagatggg 891
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1232 cagggctgggattatccattacacttgggtgtcactgaagctggagaaggtgaagatggg 1173
Query: 892 cgtatgaagtctgcaattggtattgggacacttcttcaggatggtttgggggatacaatc 951
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1172 cgtatgaagtctgcaattggtattgggacacttcttcaggatggtttgggggatacaatc 1113
Query: 952 agggtgtcacttacagagccaccagagaaagagatagacccttgcagaaggttggccaac 1011
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1112 agggtgtcacttacagagccaccagagaaagagatagacccttgcagaaggttggccaac 1053
Query: 1012 cttggtatgagagcatctgcaatccaacaaggagtggcaccatttgaagaaaaacatagg 1071
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1052 cttggtatgagagcatctgcaatccaacaaggagtggcaccatttgaagaaaaacatagg 993
Query: 1072 cattattttgatttccagcgccgatctggtcaattgccagtacaaaaggagggtgaggag 1131
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 992 cattattttgatttccagcgccgatctggtcaattgccagtacaaaaggagggtgaggag 933
Query: 1132 gtggattatagaggtgtcctgcaccgtgatggctctgttcttatgtcagtttccttggat 1191
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 932 gtggattatagaggtgtcctgcaccgtgatggctctgttcttatgtcagtttccttggat 873
Query: 1192 cagttaaaggctcctgaactcctatacaagtcacttgcagcaaagcttgttgttggaatg 1251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 872 cagttaaaggctcctgaactcctatacaagtcacttgcagcaaagcttgttgttggaatg 813
Query: 1252 ccttt 1256
|||||
Sbjct: 812 ccttt 808
>KJC_s16459
Length = 455
Score = 581 bits (293), Expect = e-165
Identities = 314/317 (99%), Gaps = 3/317 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 860 gtgtcactgaagctggagaaggtgaagatgggcgtatgaagtctgcaattggtattggga 919
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gtgtcactgaagctggagaaggtgaagatgggcgtatgaagtctgcaattggtattggga 60
Query: 920 cacttcttcaggatggtttgggg-gatacaatcagggtgtcacttacagagccaccagag 978
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 cacttcttcaggatggtttggggggatacaatcagggtgtcacttacagagccaccagag 120
Query: 979 aaagagatagacccttgcagaaggttggccaaccttggtatgagagcatctgcaatccaa 1038
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 aaagagatagacccttgcagaaggttggccaaccttggtatgagagcatctgcaatccaa 180
Query: 1039 caaggagtggcaccatttgaagaaaaacat-aggcattattttgatttccagcgccgatc 1097
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 caaggagtggcaccatttgaagaaaaacataaggcatta-tttgatttccagcgccgatc 239
Query: 1098 tggtcaattgccagtacaaaaggagggtgaggaggtggattatagaggtgtcctgcaccg 1157
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 240 tggtcaattgccagtacaaaaggagggtgaggaggtggattatagaggtgtcctgcaccg 299
Query: 1158 tgatggctctgttctta 1174
|||||||||||||||||
Sbjct: 300 tgatggctctgttctta 316
>KJC_c10075
Length = 435
Score = 488 bits (246), Expect = e-137
Identities = 260/262 (99%), Gaps = 2/262 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggcgactggaactgtaccggcttcttttactggtctcaaggccagggaatccagtttg 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 175 atggcgactggaactgtaccggcttcttttactggtctcaaggccagg-aatccagtttg 233
Query: 61 ggcttcgggaaaagcatggattttgtgcgagtttgtgatttgaagaggatcaagtctggt 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 234 ggcttcgggaaaagcatggattttgtgcgagtttgtgatttgaagaggatcaagtctggt 293
Query: 121 aggaagaagatttcaatgattaggaactcgaatcctggtcctgaaatggttgaactgcag 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 294 aggaagaagatttcaatgattaggaactcgaatcctggtcctgaaatggttgaactgcag 353
Query: 181 cctgcttcagaagggagtcctttgttagttcctagacagaagtattgtgagt-ctgtaca 239
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 354 cctgcttcagaagggagtcctttgttagttcctagacagaagtattgtgagtcctgtaca 413
Query: 240 caagactgtcaggaggaaaaca 261
||||||||||||||||||||||
Sbjct: 414 caagactgtcaggaggaaaaca 435