Jatropha Genome Database
- JcCA0126401.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0126401.10 + phase: 0 /pseudo
(858 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c02321 1588 0.0
>KJC_c02321
Length = 1036
Score = 1588 bits (801), Expect = 0.0
Identities = 801/801 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgtcccctgcggttgcaatgacacttagtttaggcaattctatttgtgataactcaggt 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 236 atgtcccctgcggttgcaatgacacttagtttaggcaattctatttgtgataactcaggt 295
Query: 61 attgctacccatgtagaaattacacggctaaagcttgtaacagacgctgtgagcttgctg 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 296 attgctacccatgtagaaattacacggctaaagcttgtaacagacgctgtgagcttgctg 355
Query: 121 tctgatcctgctaaggtagtatccgatgaggctgttgcagtgtgcagtggaagctctgat 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 356 tctgatcctgctaaggtagtatccgatgaggctgttgcagtgtgcagtggaagctctgat 415
Query: 181 gatgctaaaaatggaatggaattcaccaccttgtctgaatcaaaagatggtggtgttgga 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 416 gatgctaaaaatggaatggaattcaccaccttgtctgaatcaaaagatggtggtgttgga 475
Query: 241 ggaaatgattcagttcctactgatgctatgattcaggaaagtgacgaagatgaagtatcg 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 476 ggaaatgattcagttcctactgatgctatgattcaggaaagtgacgaagatgaagtatcg 535
Query: 301 tctgttgtggaagacactaatggaactatatctgaggagttgttagcattggaagctgga 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 536 tctgttgtggaagacactaatggaactatatctgaggagttgttagcattggaagctgga 595
Query: 361 tctgaaataaatttaccaaagtctgttgaaattgaagatatgattgaagatagccaaatc 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 596 tctgaaataaatttaccaaagtctgttgaaattgaagatatgattgaagatagccaaatc 655
Query: 421 attgctaaggctatcattgtggagtcatcaaatgaggtgcaggtgccgacggctaaactc 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 656 attgctaaggctatcattgtggagtcatcaaatgaggtgcaggtgccgacggctaaactc 715
Query: 481 ctcatagcagcagtgagcccaaatgcagacatcactgatggctctgagttaagggcctcc 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 716 ctcatagcagcagtgagcccaaatgcagacatcactgatggctctgagttaagggcctcc 775
Query: 541 gcagtggttcttaagttgcccagtgagagcaatctcagtaagggaacttcccgtagtgta 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 776 gcagtggttcttaagttgcccagtgagagcaatctcagtaagggaacttcccgtagtgta 835
Query: 601 tttgagattgattgcgtacctctttggggttctgtctctatttgcggaagaagaccagaa 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 836 tttgagattgattgcgtacctctttggggttctgtctctatttgcggaagaagaccagaa 895
Query: 661 atggaagactctcttgcggctgttcctcggtttgcaaaaattcctataaaaatgctcatt 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 896 atggaagactctcttgcggctgttcctcggtttgcaaaaattcctataaaaatgctcatt 955
Query: 721 ggcgatcatgtcgtcaacggattaaatgagagtttgacccatctaacaagtcattttttc 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 956 ggcgatcatgtcgtcaacggattaaatgagagtttgacccatctaacaagtcattttttc 1015
Query: 781 ggtgtttatgatggccatggg 801
|||||||||||||||||||||
Sbjct: 1016 ggtgtttatgatggccatggg 1036