Jatropha Genome Database
- JcCA0113151.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0113151.10 + phase: 1 /partial
(891 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c00328 1766 0.0
KJC_c03413 428 e-119
KJC_c02466 283 4e-76
KJC_c03780 62 2e-09
>KJC_c00328
Length = 2495
Score = 1766 bits (891), Expect = 0.0
Identities = 891/891 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 gatggttcctcttttacaggggtagaattcttgaggtgttgaggaactggcctgagaaga 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 876 gatggttcctcttttacaggggtagaattcttgaggtgttgaggaactggcctgagaaga 935
Query: 61 atattcaagttattgttgtgactgatggtgaacggattttagggctgggggaccttggct 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 936 atattcaagttattgttgtgactgatggtgaacggattttagggctgggggaccttggct 995
Query: 121 gtcagggcatggggatacctgtggggaaacttgctttatatacagcacttggtggagttc 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 996 gtcagggcatggggatacctgtggggaaacttgctttatatacagcacttggtggagttc 1055
Query: 181 gtccttcagcttgcttgcctgtgaccatcgatgtgggtaccaacaatgagaagctgttaa 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1056 gtccttcagcttgcttgcctgtgaccatcgatgtgggtaccaacaatgagaagctgttaa 1115
Query: 241 atgatgagttctacatagggcttaggcagagacgagctactggacaggagtattctgaac 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1116 atgatgagttctacatagggcttaggcagagacgagctactggacaggagtattctgaac 1175
Query: 301 tgctacatgaattcatgactgcagtcaagaagaactatggtgagagaatccttgttcagt 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1176 tgctacatgaattcatgactgcagtcaagaagaactatggtgagagaatccttgttcagt 1235
Query: 361 ttgaagactttgcaaatcacaatgcttttgatctgctcgctaaatatggtacaacacatc 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1236 ttgaagactttgcaaatcacaatgcttttgatctgctcgctaaatatggtacaacacatc 1295
Query: 421 ttgttttcaatgatgatattcagggcacagcatctgtggtccttgcagggcttattgcag 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1296 ttgttttcaatgatgatattcagggcacagcatctgtggtccttgcagggcttattgcag 1355
Query: 481 cactgaaattacttggtggaactctagctgaccataaatttttatttcttggtgctggag 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1356 cactgaaattacttggtggaactctagctgaccataaatttttatttcttggtgctggag 1415
Query: 541 aggctggcactggaattgcagaactcattgcccttgagatgtccaaagagaacaacatgc 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1416 aggctggcactggaattgcagaactcattgcccttgagatgtccaaagagaacaacatgc 1475
Query: 601 cagtggaagagactcgcaagaagatttggcttgtggactcaaagggtttaattgttagtt 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1476 cagtggaagagactcgcaagaagatttggcttgtggactcaaagggtttaattgttagtt 1535
Query: 661 ctcgtatggactcgctacaacattttaagaagccctgggctcatgaccatgaacctatga 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1536 ctcgtatggactcgctacaacattttaagaagccctgggctcatgaccatgaacctatga 1595
Query: 721 agacacttctggatgctgtcaatgacattaagccaacagtgttgattggaacatctggag 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1596 agacacttctggatgctgtcaatgacattaagccaacagtgttgattggaacatctggag 1655
Query: 781 taggaagaacatttactaaagaagtggttgaggctatggcctccttctatgaaagaccca 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1656 taggaagaacatttactaaagaagtggttgaggctatggcctccttctatgaaagaccca 1715
Query: 841 taattcttgctctatccaatccaacttcacagtctgaatgtactgctgaag 891
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1716 taattcttgctctatccaatccaacttcacagtctgaatgtactgctgaag 1766
>KJC_c03413
Length = 536
Score = 428 bits (216), Expect = e-119
Identities = 216/216 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 20 gggtagaattcttgaggtgttgaggaactggcctgagaagaatattcaagttattgttgt 79
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 216 gggtagaattcttgaggtgttgaggaactggcctgagaagaatattcaagttattgttgt 157
Query: 80 gactgatggtgaacggattttagggctgggggaccttggctgtcagggcatggggatacc 139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 156 gactgatggtgaacggattttagggctgggggaccttggctgtcagggcatggggatacc 97
Query: 140 tgtggggaaacttgctttatatacagcacttggtggagttcgtccttcagcttgcttgcc 199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 96 tgtggggaaacttgctttatatacagcacttggtggagttcgtccttcagcttgcttgcc 37
Query: 200 tgtgaccatcgatgtgggtaccaacaatgagaagct 235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 36 tgtgaccatcgatgtgggtaccaacaatgagaagct 1
>KJC_c02466
Length = 1174
Score = 283 bits (143), Expect = 4e-76
Identities = 494/607 (81%), Gaps = 3/607 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 285 caggagtattctgaactgctacatgaattcatgactgcagtcaagaagaactatggtgag 344
||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| | |||||||| ||
Sbjct: 1114 caggaatactctgaacttctacatgagttcatgactgctgtaaagcaaaactatggagaa 1055
Query: 345 agaatccttgttcagtttgaagactttgcaaatcacaatgcttttgatctgctcgctaaa 404
| | ||||| | |||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| || |||
Sbjct: 1054 aaagtccttatacagtttgaggattttgctaaccacaatgctttcgagctgcttgc-aaa 996
Query: 405 tatggtacaacacatcttgttttcaatgatgatattcagggcacagcatctgtggtcctt 464
||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||
Sbjct: 995 tatggtacaactcatctggtcttcaacgatgatatacaggg-acagcatctgttgttctt 937
Query: 465 gcagggcttattgcagcactgaaattacttggtggaactctagctgaccataaattttta 524
|||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||| |||| || |||
Sbjct: 936 gcaggggttattgcagcactgaagttgcttggtggttctctggctgatcatactttctta 877
Query: 525 tttcttggtgctggagaggctggcactggaattgcagaactcattgcccttgagatgtcc 584
|| ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| || ||||| | |||||||||
Sbjct: 876 ttccttggtgctggggaagctggaactggtatagcagagct-attgctcatgagatgtca 818
Query: 585 aaagagaacaacatgccagtggaagagactcgcaagaagatttggcttgtggactcaaag 644
||| | || || |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||
Sbjct: 817 aaacgggctaatgctcctttggaagagactcgcaagaagatttggttggtggattcaaag 758
Query: 645 ggtttaattgttagttctcgtatggactcgctacaacattttaagaagccctgggctcat 704
|| || |||||||| ||||||| ||| || || ||||| || ||||| |||||||||||
Sbjct: 757 gggttgattgttagctctcgtaaggattcacttcaacacttcaagaaaccctgggctcac 698
Query: 705 gaccatgaacctatgaagacacttctggatgctgtcaatgacattaagccaacagtgttg 764
|| ||||||||| |||||| || | ||||| ||||| | || || |||||||| ||
Sbjct: 697 gagcatgaacctgtgaagaatctcttagatgcagtcaaggcaatcaaaccaacagtttta 638
Query: 765 attggaacatctggagtaggaagaacatttactaaagaagtggttgaggctatggcctcc 824
|||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||
Sbjct: 637 attggatcgtctggagtaggaagaacatttacaaaggaagtggttgaagccatggcttcc 578
Query: 825 ttctatgaaagacccataattcttgctctatccaatccaacttcacagtctgaatgtact 884
|| |||| | ||| |||| | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||
Sbjct: 577 ttaaatgagaaacctgtaatcatggctctctccaacccaacctcacaatcagaatgtaca 518
Query: 885 gctgaag 891
|||||||
Sbjct: 517 gctgaag 511
>KJC_c03780
Length = 850
Score = 61.9 bits (31), Expect = 2e-09
Identities = 60/67 (89%), Gaps = 2/67 (2%)
Strand = Plus / Minus
Query: 26 aattcttgaggtgttgaggaactggcctgagaagaa-tattcaagttattgttgtgactg 84
||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 69 aattcttgatgtgctgaaaaactggcctga-aagaagtattcaagttattgttgtgacag 11
Query: 85 atggtga 91
|||||||
Sbjct: 10 atggtga 4