Jatropha Genome Database
- JcCA0097961.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0097961.10 + phase: 0 /partial
(1235 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c03683 1697 0.0
KJC_c07159 813 0.0
KJC_s20133 369 e-101
>KJC_c03683
Length = 1027
Score = 1697 bits (856), Expect = 0.0
Identities = 873/878 (99%), Gaps = 3/878 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 353 aacggatcagtggttttgatatggctcctcctccatctgcaatgttggctggtgcagctg 412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 955 aacggatcagtggttttgatatggctcctcctccatctgcaatgttggctggtgcagctg 896
Query: 413 cagcagctgctgctgcaggtcagattcctgggacaaatcctgctatttctggaatgtttc 472
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 895 cagcagctgctgctgcaggtcagattcctgggacaaatcctgctatttctggaatgtttc 836
Query: 473 caaatatgttccctttaggaactggtcagcagtttggtgctcttcctgttatgccagttc 532
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 835 caaatatgttccctttaggaactggtcag---tttggtgctcttcctgttatgccagttc 779
Query: 533 aagcaatgacacaacaggctaccaggcatgctcggcgggtatatgttggaggacttcccc 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 778 aagcaatgacacaacaggctaccaggcatgctcggcgggtatatgttggaggacttcccc 719
Query: 593 ctactgctaacgaacagtccgtagcaaccttttttagccaagttatggctgcaattgggg 652
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 718 ctactgctaacgaacagtccgtagcaaccttttttagccaagttatggctgcaattgggg 659
Query: 653 gaaacactgctggtcctggtgatgctgttgtgaatgtctatattaatcatgaaaagaagt 712
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 658 gaaacactgctggtcctggtgatgctgttgtgaatgtctatattaatcatgaaaagaagt 599
Query: 713 ttgcatttgtggagatgagatctgttgaggaggccagtaatgcaatggctttggatggga 772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 598 ttgcatttgtggagatgagatctgttgaggaggccagtaatgcaatggctttggatggga 539
Query: 773 ttatttttgagggggcacctgtcaaggtgaggagacctagtgactataatccttctcttg 832
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 538 ttatttttgagggggcacctgtcaaggtgaggagacctagtgactataatccttctcttg 479
Query: 833 ctgcaacacttggtccaagccagcccaatcccaatctgaacctggctgcagttggtttaa 892
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 478 ctgcaacacttggtccaagccagcccaatcccaatctgaacctggctgcagttggtttaa 419
Query: 893 ccccaggctcggctggtggactcgagggtccagaccgcatatttgtcggtggacttcctt 952
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 418 ccccaggctcggctggtggactcgagggtccagaccgcatatttgtcggtggacttcctt 359
Query: 953 attacttcacagaggcacaaatcagagagttattggaatcttttgggcctctacggggtt 1012
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 358 attacttcacagaggcacaaatcagagagttattggaatcttttgggcctctacggggtt 299
Query: 1013 ttgatctagttaaagacagagaaactgggaactcaaaaggatacgcattttgtgtttacc 1072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 298 ttgatctagttaaagacagagaaactgggaactcaaaaggatacgcattttgtgtttacc 239
Query: 1073 aagatctttcagttacagacatagcttgcgctgcccttaatggaatcaaaatgggtgata 1132
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 238 aagatctttcagttacagacatagcttgcgctgcccttaatggaatcaaaatgggtgata 179
Query: 1133 aaactctcacagtcaggcgtgccaaccagggtgctaaccaacctaagcctgagcaagaga 1192
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 178 aaactctcacagtcaggcgtgccaaccagggtgctaaccaacctaagcctgagcaagaga 119
Query: 1193 atgtactattgcatgcacaacagcaaattgccttgcag 1230
||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||
Sbjct: 118 atgtactattgcatgcacaacagcagagtgccttgcag 81
>KJC_c07159
Length = 564
Score = 813 bits (410), Expect = 0.0
Identities = 431/434 (99%), Gaps = 3/434 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 351 caaacggatcagtggtttt-gatatggctcctcctccatctgcaatgttggctggtgcag 409
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 478 caaacggatcagtggtttttgatatggctcctcctccatctgcaatgttggctggtgcag 419
Query: 410 ctgcagcagctgctgctgcaggtcagattcctgggacaaatcctgctatttctggaatgt 469
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 418 ctgcagcagctgctgctgcaggtcagattcctgggacaaatcctgctatttctggaatgt 359
Query: 470 ttccaaatatgttccctttaggaactggtcagcagtttggtgctcttcctgttatgccag 529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 358 ttccaaatatgttccctttaggaactggtcagcagtttggtgctcttcctgttatgccag 299
Query: 530 ttcaagcaatgacacaacaggctaccaggcatgctcggcgggtatatgttggaggacttc 589
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 298 ttcaagcaatgacacaacaggctaccaggcatgctcggcgggtatatgttggaggactt- 240
Query: 590 cccctactgctaacgaacagtccgtagcaaccttttttagccaagttatggctgcaattg 649
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 239 cccctactgctaacgaacagtccgtagcaaccttttttagccaagttatggctgcaattg 180
Query: 650 ggggaaacactgctggtcctggtgatgctgttgtgaatgtctatattaatcatgaaaaga 709
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 179 gggg-aacactgctggtcctggtgatgctgttgtgaatgtctatattaatcatgaaaaga 121
Query: 710 agtttgcatttgtggagatgagatctgttgaggaggccagtaatgcaatggctttggatg 769
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 120 agtttgcatttgtggagatgagatctgttgaggaggccagtaatgcaatggctttggatg 61
Query: 770 ggattatttttgag 783
||||||||||||||
Sbjct: 60 ggattatttttgag 47
>KJC_s20133
Length = 377
Score = 369 bits (186), Expect = e-101
Identities = 186/186 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 431 gtcagattcctgggacaaatcctgctatttctggaatgtttccaaatatgttccctttag 490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 192 gtcagattcctgggacaaatcctgctatttctggaatgtttccaaatatgttccctttag 251
Query: 491 gaactggtcagcagtttggtgctcttcctgttatgccagttcaagcaatgacacaacagg 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 252 gaactggtcagcagtttggtgctcttcctgttatgccagttcaagcaatgacacaacagg 311
Query: 551 ctaccaggcatgctcggcgggtatatgttggaggacttccccctactgctaacgaacagt 610
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 312 ctaccaggcatgctcggcgggtatatgttggaggacttccccctactgctaacgaacagt 371
Query: 611 ccgtag 616
||||||
Sbjct: 372 ccgtag 377