Jatropha Genome Database
- JcCA0080681.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0080681.10 - phase: 0 /partial
(1275 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c02099 1721 0.0
KJC_c10495 127 7e-29
>KJC_c02099
Length = 889
Score = 1721 bits (868), Expect = 0.0
Identities = 889/892 (99%), Gaps = 3/892 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 179 ctcatgtcacattagccaaaatgtccaaaaaatacggtcctgtcatgtacttaaaaatgg 238
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Sbjct: 889 ctcatgtcacattagccaaaatgtccaaaaaatacggtcctgtcatgtacttaaaaatgg 830
Query: 239 gtacgtgcaatatggtagtggcttccactccagatgcagcacgagcatttttaaaaaccc 298
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Sbjct: 829 gtacgtgcaatatggtagtggcttccactccagatgcagcacgagcatttttaaaaaccc 770
Query: 299 tggacttgaatttctcgaaccgaccacctaatgcaggcgcaacccatttagcatataatg 358
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Sbjct: 769 tggacttgaatttctcgaaccgaccacctaatgcaggcgcaacccatttagcatataatg 710
Query: 359 cacaggacatggtgtttgctgattatggacctagatggaaacttttacggaaactaagta 418
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Sbjct: 709 cacaggacatggtgtttgctgattatggacctagatggaaacttttacggaaactaagta 650
Query: 419 atcttcatatgttaggtggtaaagccctagaagattgggaaaacgttagagctgtggaat 478
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Sbjct: 649 atcttcatatgttaggtggtaaagccctagaagattgggaaaacgttagagctgtggaat 590
Query: 479 taggtcaaatgcttcgagccatgtgtgatgctagccaaagaaatgaaccggtcgtagttc 538
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Sbjct: 589 taggtcaaatgcttcgagccatgtgtgatgctagccaaagaaatgaaccggtcgtagttc 530
Query: 539 cagaaatgttaacatatgcaatggctaatatgattggtcaaatcatactgagtcgacgag 598
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Sbjct: 529 cagaaatgttaacatatgcaatggctaatatgattggtcaaatcatactgagtcgacgag 470
Query: 599 ttttcgttacaaaaggtagcgagtctaacgagttcaaggatatggttgtggagttaatga 658
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Sbjct: 469 ttttcgttacaaaaggtagcgagtctaacgagttcaaggatatggttgtggagttaatga 410
Query: 659 cttctgctgggttttttaacattggtgattttataccttccatcgcatggatggatttgc 718
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Sbjct: 409 cttctgctgggttttttaacattggtgattttataccttccatcgcatggatggatttgc 350
Query: 719 aaggaatagaaagaggtatgaagaaattgcataagaagtttgatgttttattgacgaaaa 778
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Sbjct: 349 aaggaatagaaagaggtatgaagaaattgcataagaagtttgatgttttattgacgaaaa 290
Query: 779 tgatcgaggaacatatggctactactcatctacgtaaaggaaagcctgatttccttgatg 838
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Sbjct: 289 tgatcgaggaacatatggctactactcatctacgtaaaggaaagcctgatttccttgatg 230
Query: 839 tgattatggctaccagagaaaattctgatggcgaaaggcttagtataacaaatattaaag 898
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Sbjct: 229 tgattatggctaccagagaaaattctgatggcgaaaggcttagtataacaaatattaaag 170
Query: 899 ctcttcttctgaatttattcactgcaggcactgatacctcatcaagcataattgaatggt 958
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Sbjct: 169 ctcttcttctgaatttattcactgcaggcactgatacctcatcaagcataattgaatggt 110
Query: 959 cacttgctgaaatgttaaaaaaccctaacattcttaaacgtgctcatgatgagatggatc 1018
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Sbjct: 109 cacttgctgaaatgtta-aaaaccct-acattc-taaacgtgctcatgatgagatggatc 53
Query: 1019 aagtaattggccggaaccggcgacttcaagaatccgacttattgaaacttcc 1070
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Sbjct: 52 aagtaattggccggaaccggcgacttcaagaatccgacttattgaaacttcc 1
>KJC_c10495
Length = 376
Score = 127 bits (64), Expect = 7e-29
Identities = 64/64 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1212 aataggtcgggaccccgatgtatgggaaaatccattggattttatgccagaaagattttt 1271
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Sbjct: 376 aataggtcgggaccccgatgtatgggaaaatccattggattttatgccagaaagattttt 317
Query: 1272 atcc 1275
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Sbjct: 316 atcc 313