Jatropha Genome Database
- JcCA0079711.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0079711.10 + phase: 0
(1131 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c00907 2242 0.0
>KJC_c00907
Length = 1470
Score = 2242 bits (1131), Expect = 0.0
Identities = 1131/1131 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 atgggaagcaatgatggaaccaactatggagcgtacacttatgaaagccttgagagagaa 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1411 atgggaagcaatgatggaaccaactatggagcgtacacttatgaaagccttgagagagaa 1352
Query: 61 ccttactggccagctgagaaactccgaatttccatcactggagctggtggttttattgcc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1351 ccttactggccagctgagaaactccgaatttccatcactggagctggtggttttattgcc 1292
Query: 121 tctcacattgcacgtcgtttgaagagtgagggccatttcatcattgcttctgattggaag 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1291 tctcacattgcacgtcgtttgaagagtgagggccatttcatcattgcttctgattggaag 1232
Query: 181 aagaatgagcacatgacagaagatatgttctgtcacgaattccatcttgcggatctacga 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1231 aagaatgagcacatgacagaagatatgttctgtcacgaattccatcttgcggatctacga 1172
Query: 241 gtcatggataattgcttgagggtaacaaaggaagtagaccatgtgtttaaccttgctgct 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1171 gtcatggataattgcttgagggtaacaaaggaagtagaccatgtgtttaaccttgctgct 1112
Query: 301 gacatgggtgggatgggcttcatccagtccaaccactctgtcattatgtataacaacaca 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1111 gacatgggtgggatgggcttcatccagtccaaccactctgtcattatgtataacaacaca 1052
Query: 361 atgatcagctttaacatgcttgaggccgctaggatcaatggagcgaagaggttcttctat 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1051 atgatcagctttaacatgcttgaggccgctaggatcaatggagcgaagaggttcttctat 992
Query: 421 gcctctagtgcttgtatttaccctgaatttaagcagctggacactaatgttagcttgaag 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 991 gcctctagtgcttgtatttaccctgaatttaagcagctggacactaatgttagcttgaag 932
Query: 481 gagtctgatgcatggcctgcagagcctcaagatgcttatggcttggagaaacttgctaca 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 931 gagtctgatgcatggcctgcagagcctcaagatgcttatggcttggagaaacttgctaca 872
Query: 541 gaggagttgtgcaagcactacactaaggactttggcattgaatgccgtattggaaggttc 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 871 gaggagttgtgcaagcactacactaaggactttggcattgaatgccgtattggaaggttc 812
Query: 601 cataacatttatggtcctttcggaacttggaaaggtggcagggagaaggcacctgctgct 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 811 cataacatttatggtcctttcggaacttggaaaggtggcagggagaaggcacctgctgct 752
Query: 661 ttttgtagaaaggctatcacttccactgataagtttgagatgtggggagatggacttcaa 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 751 ttttgtagaaaggctatcacttccactgataagtttgagatgtggggagatggacttcaa 692
Query: 721 acccgatccttcacctttattgatgaatgtgtggaaggtgtgctcagattgaccaagtca 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 691 acccgatccttcacctttattgatgaatgtgtggaaggtgtgctcagattgaccaagtca 632
Query: 781 gacttccgcgagcccgtaaacattggaagtgatgaaatggttagcatgaatgagatggct 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 631 gacttccgcgagcccgtaaacattggaagtgatgaaatggttagcatgaatgagatggct 572
Query: 841 gagattgttcttagcttcgaggataagaagctccccatccatcacattcctggtccagaa 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 571 gagattgttcttagcttcgaggataagaagctccccatccatcacattcctggtccagaa 512
Query: 901 ggtgttcgtggccgtaactctgacaacaccctgatcaaagagaagcttggttgggctcct 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 511 ggtgttcgtggccgtaactctgacaacaccctgatcaaagagaagcttggttgggctcct 452
Query: 961 acaatgaagctcaaggatggactgagaatcacatacttctggatcaaggatcagattgaa 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 451 acaatgaagctcaaggatggactgagaatcacatacttctggatcaaggatcagattgaa 392
Query: 1021 aaagagaaggtccaaggagttgatttatcgatttatggatcatctaaagtggtgggaact 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 391 aaagagaaggtccaaggagttgatttatcgatttatggatcatctaaagtggtgggaact 332
Query: 1081 caagcgcctgtccaattgggctcacttcgcgccgcagatggcaaagaatga 1131
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 331 caagcgcctgtccaattgggctcacttcgcgccgcagatggcaaagaatga 281