Jatropha Genome Database
- JcCA0078541.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0078541.10 + phase: 0 /partial
(837 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c00915 1518 0.0
KJC_s19606 414 e-115
KJC_s20134 240 4e-63
>KJC_c00915
Length = 885
Score = 1518 bits (766), Expect = 0.0
Identities = 766/766 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggctgctgccacggataagcttactcctcttaagtctgctgtggctggactcaatcaa 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 115 atggctgctgccacggataagcttactcctcttaagtctgctgtggctggactcaatcaa 174
Query: 61 atcagtgagaatgagaaaaatggatttattagcctcgttgctcgctatctcagcggggaa 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 175 atcagtgagaatgagaaaaatggatttattagcctcgttgctcgctatctcagcggggaa 234
Query: 121 gcacagcacgtggactggagcaagattcaaacaccaactgatgaagtagtggttccttat 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 235 gcacagcacgtggactggagcaagattcaaacaccaactgatgaagtagtggttccttat 294
Query: 181 gacactttggcgcctgttcctgatgatccagcagagactaagaagcttttggacaaactt 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 295 gacactttggcgcctgttcctgatgatccagcagagactaagaagcttttggacaaactt 354
Query: 241 gtcgttttgaagcttaatggaggattggggacaacaatgggctgcacgggacccaagtcc 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 355 gtcgttttgaagcttaatggaggattggggacaacaatgggctgcacgggacccaagtcc 414
Query: 301 gtcattgaagttcgtaatggattgacattccttgaccttattgtcatccagattgagcat 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 415 gtcattgaagttcgtaatggattgacattccttgaccttattgtcatccagattgagcat 474
Query: 361 ctcaattccaaatatggatgcaatgttcctttgcttctaatgaactccttcaacactcat 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 475 ctcaattccaaatatggatgcaatgttcctttgcttctaatgaactccttcaacactcat 534
Query: 421 gacgatactcagaagattatagagaagtactcaaagtcaaacgttgagattcacactttc 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 535 gacgatactcagaagattatagagaagtactcaaagtcaaacgttgagattcacactttc 594
Query: 481 aaccagagccagtatcctcgtatagttgttgaagattttactcccttgccatgcaaagga 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 595 aaccagagccagtatcctcgtatagttgttgaagattttactcccttgccatgcaaagga 654
Query: 541 cagacgggcaaggatggatggtatcctcctggacatggtgatgtgttcccatccttgaag 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 655 cagacgggcaaggatggatggtatcctcctggacatggtgatgtgttcccatccttgaag 714
Query: 601 aatagtggcaaacttgatactttgctatcgcagggcaaagagtacgtgtttgttgccaat 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 715 aatagtggcaaacttgatactttgctatcgcagggcaaagagtacgtgtttgttgccaat 774
Query: 661 tcagataaccttggtgctattgttgatttgaaaatcctaagtcatctgatcagaaacaag 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 775 tcagataaccttggtgctattgttgatttgaaaatcctaagtcatctgatcagaaacaag 834
Query: 721 aatgaatactgcatggaggtgacacccaaaaccctagctgatgtaa 766
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 835 aatgaatactgcatggaggtgacacccaaaaccctagctgatgtaa 880
>KJC_s19606
Length = 477
Score = 414 bits (209), Expect = e-115
Identities = 222/225 (98%), Gaps = 1/225 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggctgctgccacggataagcttactcctcttaagtctgctgtggctggactcaatcaa 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 254 atggctgctgccacggataagcttactcctcttaagtctgctgtggctggactcaatcaa 313
Query: 61 atcagtgagaatgagaaaaatggatttattagcctcgttgctcgctatctcagcggggaa 120
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 314 atcagtgagaatgagaaaa-tggatttattagcctcgttgctcgctatctcagcggggaa 372
Query: 121 gcacagcacgtggactggagcaagattcaaacaccaactgatgaagtagtggttccttat 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 373 gcacagcacgtggactggagcaagattcaaacaccaactgatgaagtagtggttccttat 432
Query: 181 gacactttggcgcctgttcctgatgatccagcagagactaagaag 225
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 433 gacactttggcgctagttcctgatgatccagcagagactaagaag 477
>KJC_s20134
Length = 480
Score = 240 bits (121), Expect = 4e-63
Identities = 121/121 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 170 tggttccttatgacactttggcgcctgttcctgatgatccagcagagactaagaagcttt 229
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 tggttccttatgacactttggcgcctgttcctgatgatccagcagagactaagaagcttt 62
Query: 230 tggacaaacttgtcgttttgaagcttaatggaggattggggacaacaatgggctgcacgg 289
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tggacaaacttgtcgttttgaagcttaatggaggattggggacaacaatgggctgcacgg 2
Query: 290 g 290
|
Sbjct: 1 g 1