Jatropha Genome Database
- JcCA0074811.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0074811.10 - phase: 0
(1299 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c02334 1655 0.0
KJC_c07497 182 1e-45
>KJC_c02334
Length = 851
Score = 1655 bits (835), Expect = 0.0
Identities = 849/851 (99%), Gaps = 2/851 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 276 acaacttactcatcttggaacaggctcatttcggccatcag-aggatgtggctcagggag 334
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 1 acaacttactcatcttggaacaggctcatttcggccatcagtaggatgtggctcagggag 60
Query: 335 aacaagaaccagattttgt-atctgcatttgctgcttgcaaatctttagtttgcctatct 393
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 aacaagaaccagattttgttatctgcatttgctgcttgcaaatctttagtttgcctatct 120
Query: 394 ggatttagggatatacttccggattacttaccagcaatttaccctgtttgtgccattctc 453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ggatttagggatatacttccggattacttaccagcaatttaccctgtttgtgccattctc 180
Query: 454 acttctctaaacttaagctatgcaaatgttactgctgaacagattaaaccaataataagc 513
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 acttctctaaacttaagctatgcaaatgttactgctgaacagattaaaccaataataagc 240
Query: 514 aattgctataagcttcagattttctgggtccttgattcaatatgtgatgaaggactacag 573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 aattgctataagcttcagattttctgggtccttgattcaatatgtgatgaaggactacag 300
Query: 574 gctgtggctgcaacgtgcaaggaactccgagagctgcgggtcttccctattgatgctcgg 633
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gctgtggctgcaacgtgcaaggaactccgagagctgcgggtcttccctattgatgctcgg 360
Query: 634 gaggatagtgaaggccctgtttctgaagtgggccttcaagcaatttcagagggttgtaga 693
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gaggatagtgaaggccctgtttctgaagtgggccttcaagcaatttcagagggttgtaga 420
Query: 694 aagctccaatctattttgtatttttgccaaaggatgacgaatgcagctgtgattgccatg 753
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 aagctccaatctattttgtatttttgccaaaggatgacgaatgcagctgtgattgccatg 480
Query: 754 tctaagaactgcccagatctagtggtgttccgtctttgtataatggggcgccacaggcct 813
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 tctaagaactgcccagatctagtggtgttccgtctttgtataatggggcgccacaggcct 540
Query: 814 gatcatgtcactggagaacctatggatgaaggctttggagctattgtcatgaattgtaag 873
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gatcatgtcactggagaacctatggatgaaggctttggagctattgtcatgaattgtaag 600
Query: 874 aaactcacacggcttgctgtatcaggtttattgactgatagagctttcaattatattgga 933
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 aaactcacacggcttgctgtatcaggtttattgactgatagagctttcaattatattgga 660
Query: 934 aaatatgggaaaacagtaagaaccctgtctgttgcttttgctggggacagtgacatgggg 993
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 aaatatgggaaaacagtaagaaccctgtctgttgcttttgctggggacagtgacatgggg 720
Query: 994 cttaagtatgtgcttgagggctgccctagattacagaagcttgagattagagatagtcca 1053
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 cttaagtatgtgcttgagggctgccctagattacagaagcttgagattagagatagtcca 780
Query: 1054 tttggggatgcagccctgctttctggtctacaccactattacaatatgagattcctgtgg 1113
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 tttggggatgcagccctgctttctggtctacaccactattacaatatgagattcctgtgg 840
Query: 1114 atgtcttcttg 1124
|||||||||||
Sbjct: 841 atgtcttcttg 851
>KJC_c07497
Length = 586
Score = 182 bits (92), Expect = 1e-45
Identities = 92/92 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 36 cagacaactgagagtgcttgatctgattgaatctgaggtatcagatgatgaagttgattg 95
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 92 cagacaactgagagtgcttgatctgattgaatctgaggtatcagatgatgaagttgattg 33
Query: 96 gatttcgtgttttccagagagtgaaatgtgcc 127
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 32 gatttcgtgttttccagagagtgaaatgtgcc 1