Jatropha Genome Database
- JcCA0073821.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0073821.10 + phase: 0
(1017 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c00965 2016 0.0
>KJC_c00965
Length = 1328
Score = 2016 bits (1017), Expect = 0.0
Identities = 1017/1017 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgccggctgacagctcttcactctccggtcatggccaaactgtttgcgtcaccggcgcc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 104 atgccggctgacagctcttcactctccggtcatggccaaactgtttgcgtcaccggcgcc 163
Query: 61 ggtggtttcatcgcttcatggatcgtaaaacttcttctcgagaaaggttatactgtcaaa 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 164 ggtggtttcatcgcttcatggatcgtaaaacttcttctcgagaaaggttatactgtcaaa 223
Query: 121 ggaactgtcaggaatccagaggatccgaaaaatgctcatttgagagagcttgaaggtgct 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 224 ggaactgtcaggaatccagaggatccgaaaaatgctcatttgagagagcttgaaggtgct 283
Query: 181 aaggagagattaaagctatgcaaagctgatcttcttgactatgaaggacttagagaggcc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 284 aaggagagattaaagctatgcaaagctgatcttcttgactatgaaggacttagagaggcc 343
Query: 241 attatgggatgtgatggcgttttccatactgcttctcctgttactgatgatcctgaacaa 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 344 attatgggatgtgatggcgttttccatactgcttctcctgttactgatgatcctgaacaa 403
Query: 301 atggtggagccagcagtgaatgggactaaaaatgtgatcattgccgcagcagaggcaaaa 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 404 atggtggagccagcagtgaatgggactaaaaatgtgatcattgccgcagcagaggcaaaa 463
Query: 361 attaggcgagtggtatttacgtcatcaattggtgctgtttacatggatcccaataggaac 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 464 attaggcgagtggtatttacgtcatcaattggtgctgtttacatggatcccaataggaac 523
Query: 421 cctgatgcaattgttgatgaatcttgctggagcgatctcgagttttgcaagaacactaag 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 524 cctgatgcaattgttgatgaatcttgctggagcgatctcgagttttgcaagaacactaag 583
Query: 481 aactggtactgctatggaaaggctgtggcagagcaggcagcatgggaagtggccaaggag 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 584 aactggtactgctatggaaaggctgtggcagagcaggcagcatgggaagtggccaaggag 643
Query: 541 aaaggggcggacctagtggtggtgaacccagttctggtgcttggaccactgctgcaatcc 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 644 aaaggggcggacctagtggtggtgaacccagttctggtgcttggaccactgctgcaatcc 703
Query: 601 actgtcaatgcaagcattattcacatccttaagtacctaactggctcagccaagacttat 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 704 actgtcaatgcaagcattattcacatccttaagtacctaactggctcagccaagacttat 763
Query: 661 gccaattccgttcaagcttatgtgcatgttaaggatgttgcagttgcccacattcttgtt 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 764 gccaattccgttcaagcttatgtgcatgttaaggatgttgcagttgcccacattcttgtt 823
Query: 721 tacgagacaccctcggcctctggccgatacctctgtgctgagagcgtcctccaccgtgga 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 824 tacgagacaccctcggcctctggccgatacctctgtgctgagagcgtcctccaccgtgga 883
Query: 781 gacgtggtggaaattcttgctaagttctttcctgagtatcctatccccacaaggtgttca 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 884 gacgtggtggaaattcttgctaagttctttcctgagtatcctatccccacaaggtgttca 943
Query: 841 gatgagaagaatccaagagcaaaaccttacaagttctctaaccaaaagctgaaggacctt 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 944 gatgagaagaatccaagagcaaaaccttacaagttctctaaccaaaagctgaaggacctt 1003
Query: 901 ggcatggaatttactccagtgaagcaatgcctatatgaaactgttaaaagcttgcaagaa 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1004 ggcatggaatttactccagtgaagcaatgcctatatgaaactgttaaaagcttgcaagaa 1063
Query: 961 aggggtcaccttccaatcccagaacagcctgaagactctgttaggattcaatcctaa 1017
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1064 aggggtcaccttccaatcccagaacagcctgaagactctgttaggattcaatcctaa 1120