Jatropha Genome Database
- JcCA0070561.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0070561.10 + phase: 0 /partial
(1647 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c00379 3257 0.0
KJC_c10699 924 0.0
KJC_c11705 218 3e-56
KJC_s17846 167 1e-40
KJC_s18130 103 1e-21
KJC_c00785 68 7e-11
>KJC_c00379
Length = 2209
Score = 3257 bits (1643), Expect = 0.0
Identities = 1646/1647 (99%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 atgaattatttcccagatgaggtactagagcatgtgttcgattttgtgacatcgcataga 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1921 atgaattatttcccagatgaggtactagagcatgtgttcgattttgtgacatcgcataga 1862
Query: 61 gaccgaaactcagtgtctcaagtatgtaaatcatggtacaggattgaaagctatagcaga 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1861 gaccgaaactcagtgtctcaagtatgtaaatcatggtacaggattgaaagctatagcaga 1802
Query: 121 gagaaggttttcataggaaattgttatgcgatcagtccggagagagtgattgggagattc 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1801 gagaaggttttcataggaaattgttatgcgatcagtccggagagagtgattgggagattc 1742
Query: 181 ccaggtctgaagtctattactttgaagggaaagcctcattttgctgatttcaatctggtc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1741 ccaggtctgaagtctattactttgaagggaaagcctcattttgctgatttcaatctggtc 1682
Query: 241 ccaaatgattggggaggctttgtttacccgtggatcgaagcttttgttcgcaaccgggtt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1681 ccaaatgattggggaggctttgtttacccgtggatcgaagcttttgttcgcaaccgggtt 1622
Query: 301 gggttggaggagctccggcttaagagaatggttgtatccgatgacagcttggacctacta 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1621 gggttggaggagctccggcttaagagaatggttgtatccgatgacagcttggacctacta 1562
Query: 361 tcaaggtcttttgtgaattttaagtctctggttcttgtcagttgtgaagggtttactact 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1561 tcaaggtcttttgtgaattttaagtctctggttcttgtcagttgtgaagggtttactact 1502
Query: 421 gatggccttgctgctgtagctgctaattgtaggaatcttagggagctggacctgcaagaa 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1501 gatggccttgctgctgtagctgctaattgtaggaatcttagggagctggacctgcaagaa 1442
Query: 481 gatgaagttgaggatcatagaggccattggcttagttgtttccctgatagctgtacatct 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1441 gatgaagttgaggatcatagaggccattggcttagttgtttccctgatagctgtacatct 1382
Query: 541 ctcgtgtcacttaactttgcttgccttaaaggagatattaatttaggagttctcgagaga 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1381 ctcgtgtcacttaactttgcttgccttaaaggagatattaatttaggagttctcgagaga 1322
Query: 601 cttgtagcaagatctccaaatctcaggagtttgaggttaaaccgtgcagtaccacttgat 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1321 cttgtagcaagatctccaaatctcaggagtttgaggttaaaccgtgcagtaccacttgat 1262
Query: 661 acacttcaaaaaatattgatgcaatcacctcagttagtggatttgggtgtagggtcttat 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1261 acacttcaaaaaatattgatgcaatcacctcagttagtggatttgggtgtagggtcttat 1202
Query: 721 gtacatgatccagattctgagacctataataaattagtgactgctattcaaaagtgtaaa 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1201 gtacatgatccagattctgagacctataataaattagtgactgctattcaaaagtgtaaa 1142
Query: 781 tcagtcaggagtttgtctgggtttttggaagttgctccccactgcctaccagcttttcac 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 tcagtcaggagtttgtctgggtttttggaagttgctccccactgcctaccagcttttcac 1082
Query: 841 ttgatttgcccgaccctgacctccttgaacctgagttatgctccaggaattcaaggtagt 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 ttgatttgcccgaccctgacctccttgaacctgagttatgctccaggaattcaaggtagt 1022
Query: 901 gagcttacaaagctaattcgccactgtaggaaacttcagcgcctttggatacttgactgc 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 gagcttacaaagctaattcgccactgtaggaaacttcagcgcctttggatacttgactgc 962
Query: 961 attggtgataaagggctagaagttgtggcatccacttgtaaggacttgcaggaattgaga 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 attggtgataaagggctagaagttgtggcatccacttgtaaggacttgcaggaattgaga 902
Query: 1021 gttttcccttctgatccatatgttggaaatgcagcagtgactgaagaaggtctggtcgcc 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 gttttcccttctgatccatatgttggaaatgcagcagtgactgaagaaggtctggtcgcc 842
Query: 1081 atttccagtggttgtcccaagcttcattcaattttatacttctgtcagcagatgaccaat 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 atttccagtggttgtcccaagcttcattcaattttatacttctgtcagcagatgaccaat 782
Query: 1141 gcagctcttattacagtagccaagaactgccccaacttcactcgcttcaggttgtgcatc 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 gcagctcttattacagtagccaagaactgccccaacttcactcgcttcaggttgtgcatc 722
Query: 1201 ctcgatcccacaaaaccagacgctgtgaccatgcagccattggatgaaggttttggggca 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 ctcgatcccacaaaaccagacgctgtgaccatgcagccattggatgaaggttttggggca 662
Query: 1261 attgttcattcttgtaagggtctcaggcggttgtcacttactggtcttttgactgaccaa 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 attgttcattcttgtaagggtctcaggcggttgtcacttactggtcttttgactgaccaa 602
Query: 1321 gttttcctttatattgggatgtatgctgagcagctagaaatgctttcaattgcatttgct 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 gttttcctttatattgggatgtatgctgagcagctagaaatgctttcaattgcatttgct 542
Query: 1381 ggagacagtgataagggaatgcagtacgtgttaaatggttgcaaaagacttcgcaagtta 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 ggagacagtgataagggaatgcagtacgtgttaaatggttgcaaaagacttcgcaagtta 482
Query: 1441 gagataagggatagcccttttggtaatgcggcacttctaatggacgtgggaaagtatgaa 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gagataagggatagcccttttggtaatgcggcacttctaatggacgtgggaaagtatgaa 422
Query: 1501 acaatgcgatccctttggatgtcgtcctgtgaagtaactcttggaggctgcaagaccctt 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 acaatgcgatccctttggatgtcgtcctgtgaagtgactcttggaggctgcaagaccctt 362
Query: 1561 gcgaagaagatgccaaggctcaatgtagagatcatgaatgagaatgagcaggcagaattt 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gcgaagaagatgccaaggctcaatgtagagatcatgaatgagaatgagcaggcagaattt 302
Query: 1621 ggtgttgatgatagccagaaagtagat 1647
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ggtgttgatgatagccagaaagtagat 275
>KJC_c10699
Length = 720
Score = 924 bits (466), Expect = 0.0
Identities = 496/503 (98%), Gaps = 5/503 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 636 gttaaaccgtgcagtaccacttgatacacttcaaaaaatattgatgcaatcacctcagtt 695
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 503 gttaaaccgtgcagtaccacttgatacacttcaaaaaatattgatgcaatcacctcagtt 444
Query: 696 agtggatttgggtgtagggtcttatgtacatgatccagattctgagacctataataaatt 755
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 443 agtggatttgggtgtagggtcttatgtacatgatccagattctgagacctataataaatt 384
Query: 756 agtgactgctattcaaaagtgtaaatcagtcaggagtttgtctgggtttttggaagttgc 815
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 383 agtgactgctattcaaaagtgtaaatcagtcaggagtttgtctgggtttttggaagttgc 324
Query: 816 tccccactgcctaccagcttttcacttgatttgcccgaccctgacctccttgaacctgag 875
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 323 tccccactgcctaccagcttttcacttgatttgcccgaccctgacctccttgaacctgag 264
Query: 876 ttatgctccaggaattcaaggtagtgagcttacaaagctaattcgccactgtaggaaact 935
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 263 ttatgctccaggaattcaaggtagtgagcttacaaagctaattcgccactgtaggaaact 204
Query: 936 tcagcgcctttggatacttgactgcattggtgataaagggctagaagttgtggcatccac 995
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 203 tcagcgcctttggatacttgactgcattggtgataaagggctagaagttgtggcatccac 144
Query: 996 ttgtaaggacttgcaggaattgagagttttcccttctgatccatatgttggaaatgcagc 1055
||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 143 ttgtaaggacttgcaggaattgagagttt---cctntgatccatatgttggaaatgcagc 87
Query: 1056 agtgactgaagaaggtctggtcgccatttccagtggttgtcccaag-cttcattcaattt 1114
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 86 agtgactgaag-aggtctggtcgccatttccagtggttgtcccaagtcttcattcaattt 28
Query: 1115 tatacttctgtcagcagatgacc 1137
|||||||||||||||||||||||
Sbjct: 27 tatacttctgtcagcagatgacc 5
>KJC_c11705
Length = 266
Score = 218 bits (110), Expect = 3e-56
Identities = 110/110 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 9 tttcccagatgaggtactagagcatgtgttcgattttgtgacatcgcatagagaccgaaa 68
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 157 tttcccagatgaggtactagagcatgtgttcgattttgtgacatcgcatagagaccgaaa 216
Query: 69 ctcagtgtctcaagtatgtaaatcatggtacaggattgaaagctatagca 118
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 217 ctcagtgtctcaagtatgtaaatcatggtacaggattgaaagctatagca 266
>KJC_s17846
Length = 139
Score = 167 bits (84), Expect = 1e-40
Identities = 129/138 (93%), Gaps = 7/138 (5%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1349 agcagctagaaatgctttcaa-ttgcatttgctggagacagt--gataagggaat--gca 1403
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||
Sbjct: 136 agcagctagaaatgctttcaacttgcatttgctggagacaggtggataagggaactggca 77
Query: 1404 gtacgtgttaaatggttgcaaaagacttcgcaagttagagataagggatagcccttttgg 1463
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 76 gtacgtgttaaatggttgcaaa-gacttcgcaagttagagataagggatag-ccttttgg 19
Query: 1464 taatgcggcacttctaat 1481
||||||||||||||||||
Sbjct: 18 taatgcggcacttctaat 1
>KJC_s18130
Length = 70
Score = 103 bits (52), Expect = 1e-21
Identities = 55/56 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1524 gtcctgtgaagtaactcttggaggctgcaagacccttgcgaagaagatgccaaggc 1579
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gtcctgtgaagtgactcttggaggctgcaagacccttgcgaagaagatgccaaggc 56
>KJC_c00785
Length = 1357
Score = 67.9 bits (34), Expect = 7e-11
Identities = 61/70 (87%)
Strand = Plus / Plus
Query: 208 ggaaagcctcattttgctgatttcaatctggtcccaaatgattggggaggctttgtttac 267
||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||| || | |||||||
Sbjct: 418 ggaaagcctcactttgctgacttcaatctggtgcctgatggttggggtggttatgtttac 477
Query: 268 ccgtggatcg 277
||||||||||
Sbjct: 478 ccgtggatcg 487
Score = 54.0 bits (27), Expect = 1e-06
Identities = 48/55 (87%)
Strand = Plus / Plus
Query: 416 ctactgatggccttgctgctgtagctgctaattgtaggaatcttagggagctgga 470
|||||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct: 626 ctactgatggacttgctgccattgctgccaattgcaggaatctaagggagctgga 680