Jatropha Genome Database
- JcCA0068741.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0068741.10 - phase: 2 /partial
(1999 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c00456 3568 0.0
>KJC_c00456
Length = 2107
Score = 3568 bits (1800), Expect = 0.0
Identities = 1800/1800 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 200 tctaaacctactacccctgctccttctagcacttccatacctgaagcttctcctcctaga 259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2107 tctaaacctactacccctgctccttctagcacttccatacctgaagcttctcctcctaga 2048
Query: 260 tttgccactgatgaacctcgaaaaggagctgacatcctcgtcgaagcgctcgagcgccaa 319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2047 tttgccactgatgaacctcgaaaaggagctgacatcctcgtcgaagcgctcgagcgccaa 1988
Query: 320 ggggttactgacgtgttcgcttatcctggcggcgcatccatggagatccaccaagcccta 379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1987 ggggttactgacgtgttcgcttatcctggcggcgcatccatggagatccaccaagcccta 1928
Query: 380 actcgctctccaataatacgtaatgtccttcctcgccatgagcaaggtggagtcttcgct 439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1927 actcgctctccaataatacgtaatgtccttcctcgccatgagcaaggtggagtcttcgct 1868
Query: 440 gctgagggatacgcgcgcgcttcgggcaagcctggtgtctgcatcgccacctctggacct 499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1867 gctgagggatacgcgcgcgcttcgggcaagcctggtgtctgcatcgccacctctggacct 1808
Query: 500 ggcgccaccaatctcgttagcggcttagctgatgctctcctcgatagtgtccccattgtg 559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1807 ggcgccaccaatctcgttagcggcttagctgatgctctcctcgatagtgtccccattgtg 1748
Query: 560 gctatcactggccaagtccctcgccgcatgattggtactgatgcatttcaggagactcct 619
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1747 gctatcactggccaagtccctcgccgcatgattggtactgatgcatttcaggagactcct 1688
Query: 620 attgtcgaggtaactcggtcgataactaagcacaattacctggttcttgatgttgatgat 679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1687 attgtcgaggtaactcggtcgataactaagcacaattacctggttcttgatgttgatgat 1628
Query: 680 attcctagaattgtaagtgaagctttctttttagccacctctggacgtcctggcccagta 739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1627 attcctagaattgtaagtgaagctttctttttagccacctctggacgtcctggcccagta 1568
Query: 740 ctgattgatgtaccaaaagatatacagcaacaattagctgttcccaattggaattctcct 799
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1567 ctgattgatgtaccaaaagatatacagcaacaattagctgttcccaattggaattctcct 1508
Query: 800 attaaattgtcaggttatatgtcaaggttgcctaaagagcctagtgaatcacatttagag 859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1507 attaaattgtcaggttatatgtcaaggttgcctaaagagcctagtgaatcacatttagag 1448
Query: 860 cagattgtgaggttaatcttcgagtcaaagaaaccagtgttatatgtaggaggagggtgt 919
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1447 cagattgtgaggttaatcttcgagtcaaagaaaccagtgttatatgtaggaggagggtgt 1388
Query: 920 ttgaattcaagtgaggaattgaggaagtttgtagagttaacaggaattccagtggcgagt 979
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1387 ttgaattcaagtgaggaattgaggaagtttgtagagttaacaggaattccagtggcgagt 1328
Query: 980 actttaatgggacttggggcattccctgttgcccatgatttatcattgcaaatgcttgga 1039
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1327 actttaatgggacttggggcattccctgttgcccatgatttatcattgcaaatgcttgga 1268
Query: 1040 atgcatggaaccgtttatgcaaattattcaattgataatagtgatttattgcttgcgttt 1099
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1267 atgcatggaaccgtttatgcaaattattcaattgataatagtgatttattgcttgcgttt 1208
Query: 1100 ggtgtgaggtttgatgatcgtgtgacagggaagctcgaggcatttgcaagcagagccaag 1159
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1207 ggtgtgaggtttgatgatcgtgtgacagggaagctcgaggcatttgcaagcagagccaag 1148
Query: 1160 attgtccatatcgatattgattctgctgagattgggaagaataagcagcctcatgtgtct 1219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1147 attgtccatatcgatattgattctgctgagattgggaagaataagcagcctcatgtgtct 1088
Query: 1220 gtttgtacggatgtgaaattggccttacaaggtatgaacaaaattttggagagcaaaagt 1279
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1087 gtttgtacggatgtgaaattggccttacaaggtatgaacaaaattttggagagcaaaagt 1028
Query: 1280 gctaagagtaagctagattttcatgcatggagagaggagctgaatgagcaaaaagctaaa 1339
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1027 gctaagagtaagctagattttcatgcatggagagaggagctgaatgagcaaaaagctaaa 968
Query: 1340 tatccattgagttttaagacctttggagatgcaattcctccccagtatgcaattcaagtt 1399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 967 tatccattgagttttaagacctttggagatgcaattcctccccagtatgcaattcaagtt 908
Query: 1400 cttgatgaattgactgatgggaatgccattataagtactggggttgggcagcatcagatg 1459
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 907 cttgatgaattgactgatgggaatgccattataagtactggggttgggcagcatcagatg 848
Query: 1460 tggtctgctcagttttacaagtacaagagaccacggcaatggttgacatcagggggttta 1519
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 847 tggtctgctcagttttacaagtacaagagaccacggcaatggttgacatcagggggttta 788
Query: 1520 ggtgctatgggttttggattaccagctgctattggggctgctgttgctaatcctggtgca 1579
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 787 ggtgctatgggttttggattaccagctgctattggggctgctgttgctaatcctggtgca 728
Query: 1580 gttgttgtagatattgatggtgatggaagttttatcatgaatgttcaggagttggcaact 1639
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 727 gttgttgtagatattgatggtgatggaagttttatcatgaatgttcaggagttggcaact 668
Query: 1640 gttcgcgtggagaatctaccaatcaaaataatgcttctgaacaatcagcatttgggaatg 1699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 667 gttcgcgtggagaatctaccaatcaaaataatgcttctgaacaatcagcatttgggaatg 608
Query: 1700 gtggtgcaatgggaggatcggttctacaaggcaaatagagctcatacttatttaggggat 1759
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 607 gtggtgcaatgggaggatcggttctacaaggcaaatagagctcatacttatttaggggat 548
Query: 1760 ccatcaagagagactgagattttccccaatatgttgaagtttgctgaagcttgtggaata 1819
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 547 ccatcaagagagactgagattttccccaatatgttgaagtttgctgaagcttgtggaata 488
Query: 1820 cctgctgcccgtgtgacaaggaaaaaggatcttagagaagcaatcaaaacaatgttagat 1879
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 487 cctgctgcccgtgtgacaaggaaaaaggatcttagagaagcaatcaaaacaatgttagat 428
Query: 1880 actccgggaccatatttgttggatgtgattgtgccccatcaagagcatgttttgcccatg 1939
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 427 actccgggaccatatttgttggatgtgattgtgccccatcaagagcatgttttgcccatg 368
Query: 1940 atcccaagtggtggagcttttaaagatgtgataacagaaggtgatggaagaacaaagtac 1999
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 367 atcccaagtggtggagcttttaaagatgtgataacagaaggtgatggaagaacaaagtac 308