Jatropha Genome Database
- JcCA0066751.20
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0066751.20 + phase: 0
(912 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c00025 1800 0.0
KJC_c12471 1122 0.0
KJC_c09019 547 e-155
>KJC_c00025
Length = 4221
Score = 1800 bits (908), Expect = 0.0
Identities = 911/912 (99%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 atggccaaaaacggaccccatctaaaatcgggtcaagttataattgttcgcatggactcg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3151 atggccaaaaacggaccccatctaaaatcgggtcaagttataattgttcgcatggactcg 3092
Query: 61 gtagtaatacgatcagcaaagccctatttggccgctccaggagcaaccgttcatggccat 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3091 gtagtaatacgatcagcaaagccctatttggccgctccaggagcaaccgttcatggccat 3032
Query: 121 tatggagaaatcttttacgaaggagatacattagttacatttttatatgaaaaatcgaga 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3031 tatggagaaatcttttacgaaggagatacattagttacatttttatatgaaaaatcgaga 2972
Query: 181 tctggtgatataacgcagggtcttccaaaagtggaacaagtgttagaagtgcgctcaatt 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2971 tctggtgatataacgcagggtcttccaaaagtggaacaagtgttagaagtgcgctcaatt 2912
Query: 241 gattcaatatcgataagcctagaaaagagagttgagggttggaacgagtgtataacaaga 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2911 gattcaatatcgataagcctagaaaagagagttgagggttggaacgagtgtataacaaga 2852
Query: 301 attcttggaattccttggggattcttgattggtgctgaactaactatagtgcaaagtcgt 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2851 attcttggaattccttggggattcttgattggtgctgaactaactatagtgcaaagtcgt 2792
Query: 361 atctctttggttaataagattcaaaaggtttatcgatcccaaggagtgcagatacataat 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2791 atctctttggttaataagattcaaaaggtttatcgatcccaaggagtgcagatacataat 2732
Query: 421 aggcatatagaaattattgtacgtcaaataacatccaaagttttggtttcagaagacgga 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2731 aggcatatagaaattattgtacgtcaaataacatccaaagttttggtttcagaagacgga 2672
Query: 481 atgtcaaatgttttttcacccggagaactaattggattgttgcgagcggaacgaacggga 540
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2671 atgtcaaatgtttttttacccggagaactaattggattgttgcgagcggaacgaacggga 2612
Query: 541 cgcgctttagaagaagccatctgttatcgagccatattattaggaataacgagagcatct 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2611 cgcgctttagaagaagccatctgttatcgagccatattattaggaataacgagagcatct 2552
Query: 601 ctgaatactcaaagtttcatatccgaggccagttttcaagaaactgctcgcgttttagca 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2551 ctgaatactcaaagtttcatatccgaggccagttttcaagaaactgctcgcgttttagca 2492
Query: 661 aaagccgctctccgcggtcgtatcgattggttgaaaggcctgaaagaaaacgttgttcta 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2491 aaagccgctctccgcggtcgtatcgattggttgaaaggcctgaaagaaaacgttgttcta 2432
Query: 721 ggtggtatgatacccggtggtaccggattcaaaggattagtgcaaggctcaaggcaacat 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2431 ggtggtatgatacccggtggtaccggattcaaaggattagtgcaaggctcaaggcaacat 2372
Query: 781 aataacattcctttgaaaaccaaaaagaagaatttattcgagggggaatttagagataga 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2371 aataacattcctttgaaaaccaaaaagaagaatttattcgagggggaatttagagataga 2312
Query: 841 gatattttattccaccacagagagttatttgattcttgcatttcaaaaaatttctatgat 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2311 gatattttattccaccacagagagttatttgattcttgcatttcaaaaaatttctatgat 2252
Query: 901 acagcaaaataa 912
||||||||||||
Sbjct: 2251 acagcaaaataa 2240
>KJC_c12471
Length = 843
Score = 1122 bits (566), Expect = 0.0
Identities = 676/700 (96%), Gaps = 22/700 (3%)
Strand = Plus / Plus
Query: 222 gttagaagtgcgctcaattgattc----aatatcgataagcctagaaaagagagttgagg 277
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gttagaagtgcgctcaattgattcggggaatatcgataagcctagaaaagagagttgagg 60
Query: 278 gttggaacgagtgtataacaagaattcttggaattccttggggattcttgattggtgctg 337
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gttggaacgagtgtataacaagaattcttggaattccttggggattcttgattggtgctg 120
Query: 338 aactaactatagtgcaaagtcgtatctctttggttaataagattcaaaaggtttatcgat 397
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 aactaactatagtgcaaagtcgtatctctttggttaataagattcaaaaggtttatcgat 180
Query: 398 cccaaggagtgcagatacataataggcatatagaaattattgtacgtcaaat-aacatcc 456
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 181 cccaaggagtgcagatacataataggcatatagaaattattgtacgtcaaataaacatcc 240
Query: 457 aaagttttggtttcagaagacggaatgtcaaatgttttttcacccggagaactaattgga 516
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 241 aaagttttggtttcagaagacggaatgtcaaatgtttttt-acccggagaactaattgga 299
Query: 517 ttgttgcgagcggaacgaacgggacgcgctttagaagaagccatctgttatcgagccata 576
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 300 ttgttgcgagcggaacgaacgggacgcgctttagaagaagccatctgttatcgagccata 359
Query: 577 ttattaggaataacgagagcatctctgaatactcaaagtttcatatccgaggccagtttt 636
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||
Sbjct: 360 ttattaggaataacgagagcatctctgaatactcaaag-ttcatatccgaggccag-ttt 417
Query: 637 caagaaactgctcgcgttttagcaaaagccgctctccgcggtcgtatcgattggttgaaa 696
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 418 caagaaactgctcgcgttttagcaaaagccgctctccgcggtcgtatcgattggttgaaa 477
Query: 697 ggcctgaaagaaaacgttgttctaggtggtatgatacccggtggtaccggattcaaagga 756
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 478 ggcctgaaagaaaacgttgttctaggtggtatgatacccggtggtaccggattcaaagga 537
Query: 757 ttagtgcaaggctcaaggcaacataa--taacattcctttgaaaaccaaaaagaagaatt 814
|||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| ||| |
Sbjct: 538 ttagtgcaaggctcaaggcaacataaggtaacagtc--ttgaaa--caaagaga-----t 588
Query: 815 tattcgagggggaatttagagatagagata-ttttattccaccacagagagttatttgat 873
|| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 589 ta-tcgagggggaatttagagatagagatatttttattccaccacagagagttatttgat 647
Query: 874 tcttgcatttc-aaaaaatttctatgatacagcaaaataa 912
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 648 tcttgcatttcaaaaaaatttctatgatacagcaaaataa 687
>KJC_c09019
Length = 366
Score = 547 bits (276), Expect = e-155
Identities = 299/303 (98%), Gaps = 4/303 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 610 caaagtttcatatccgaggccagttttcaagaaactgctcgcgttttagcaaaagccgct 669
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 caaagtttcatatccgaggccagttttcaagaaactgctcgcgttttagcaaaagccgct 60
Query: 670 ctccgcggtcgtatcgattggttgaaaggcctgaaagaaaacgttgttctaggtggtatg 729
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 ctccgcggtcgtatcgattggttgaaaggcctgaa-gaaaacgttgttctaggtggtatg 119
Query: 730 atacccggtggtaccggattcaaaggattagtgcaaggctcaaggcaacataataacatt 789
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 120 atacccggtggtaccggattcaaaggattagtgcaaggctcaaggcaacataataacatt 179
Query: 790 cctttgaaaaccaaaaagaagaatttattcgagggggaatttagagatagagatatttta 849
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 180 cctttgaaaacc-aaaagaagaatttattcgagggggaatttagagatagagatatttta 238
Query: 850 ttccaccacagagagttatttgattcttgcatttcaaaaaatttctatgatacagcaaaa 909
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 239 ttccaccacagagagttatttgattcttgcatttc--aaaatttctatgatacagcaaaa 296
Query: 910 taa 912
|||
Sbjct: 297 taa 299