Jatropha Genome Database
- JcCA0063031.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0063031.10 - phase: 0 /partial
(790 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c01887 1461 0.0
>KJC_c01887
Length = 1009
Score = 1461 bits (737), Expect = 0.0
Identities = 756/763 (99%), Gaps = 1/763 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 28 caggtgcacatctctttggctggagacaagtacattcgagtctcatgggtcactgatgat 87
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 910 caggtgcacatctctttggctggagacaagtacattcgagtctcatgggtcactgatgat 851
Query: 88 aaatcttctccaacaattgttgaatatggaacttcacctggaagatatactgctatatca 147
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 850 aaatcttctccaacaattgttgaatatggaacttcacctggaagatatactgctatatca 791
Query: 148 gaaggggagagtacatcttatagttatctattttataactctggaaagatacaccacact 207
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 790 gaaggggagagtacatcttatagttatctattttataactctggaaagatacaccacact 731
Query: 208 gtcattggtccattggaacctaacacggtgtacttctaccgatgtggagggcaaggtgcc 267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 730 gtcattggtccattggaacctaacacggtgtacttctaccgatgtggagggcaaggtgcc 671
Query: 268 gagttccagctgagggctcctccagatcagttgccagttacttttgctgtggctggagat 327
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 670 gagttccagctgagggctcctccagatcagttgccagttacttttgctgtggctggagat 611
Query: 328 ttgggccaaactggctggactaaatcaactctagaccatatcgaccagtgtaaatatgat 387
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 610 ttgggccaaactggctggactaaatcaactctagaccatatcgaccagtgtaaatatgat 551
Query: 388 gtgcatctgctccctggagacctttcttatgcagattatatgcagcaccggtgggacaca 447
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 550 gtgcatctgctccctggagacctttcttatgcagattatatgcagcaccggtgggacaca 491
Query: 448 tttggcgagttggttgagcctcttgctagtgcaagaccatggatggtgacagaagggaac 507
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 490 tttggcgagttggttgagcctcttgctagtgcaagaccatggatggtgacagaagggaac 431
Query: 508 catgaaaaggaaagcataccnnnnnnnaaggatgggtttgaatcctataattctagatgg 567
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 430 catgaaaaggaaagcatacc-ttttttaaggatgggtttgaatcctataattctagatgg 372
Query: 568 aagatgccctttgaggagagcggttccagttcaaatctttattattcttttgaagttgca 627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 371 aagatgccctttgaggagagcggttccagttcaaatctttattattcttttgaagttgca 312
Query: 628 ggggctcatattatcatgcttggttcctatacagattatgatgaatactcggatcaatat 687
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 311 ggggctcatattatcatgcttggttcctatacagattatgatgaatactcggatcaatat 252
Query: 688 aactggctaaaggctgatctggctaaggtagatcgaaagaagacaccgtggttgcttgtg 747
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 251 aactggctaaaggctgatctggctaaggtagatcgaaagaagacaccgtggttgcttgtg 192
Query: 748 ctattccatgtgccatggtataacagtaaccatgctcatcaag 790
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 191 ctattccatgtgccatggtataacagtaaccatgctcatcaag 149