Jatropha Genome Database
- JcCA0029531.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0029531.10 + phase: 0 /partial
(1452 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c03917 1532 0.0
>KJC_c03917
Length = 827
Score = 1532 bits (773), Expect = 0.0
Identities = 806/817 (98%), Gaps = 2/817 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 637 gttgactctggtttctggtggatcattctgcttcgtgcttacaccaaatctacaggggat 696
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gttgactctggtttctggtggatcattctgcttcgtgcttacaccaaatctacaggggat 60
Query: 697 ttatctctagcggagactccagagtgtcaaaagggaatgaggcttatattgactttgtgc 756
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 ttatctctagcggagactccagagtgtcaaaagggaatgaggcttatattgactttgtgc 120
Query: 757 ttgtcggagggatttgatacattcccgactcttctttgtgctgatggttgctctatgatt 816
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ttgtcggagggatttgatacattcccgactcttctttgtgctgatggttgctctatgatt 180
Query: 817 gatcgcagaatgggcatttacggttatcctattgaaattcaagcacnnnnnnnnatggca 876
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 181 gatcgcagaatgggcatttacggttatcctattgaaattcaagcacttttttttatggca 240
Query: 877 ttgagatgtgcgttgtctatgttgaaacatgatgccgaaggaaaagaatgcattgagaga 936
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 241 ttgagatgtgcgttgtctatgttgaaacatgatgccgaaggaaa-gaatgcattgagaga 299
Query: 937 attgttaaacgtttacatgccttgagctatcacatgcgaagttacttttggttagatttt 996
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 300 attgttaaacgtttacatgccttgagctatcacatgcgaagttacttttggttagatttt 359
Query: 997 caacaactaaatgacatatacagatataaaactgaggagtactcacacactgcagtaaat 1056
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 360 caacaactaaatgacatatacagatataaaactgaggagtactcacacactgcagtaaat 419
Query: 1057 aagtttaatgtcattcctgattcaattccggattgggtatttgactttatgccaacccgt 1116
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 420 aagtttaatgtcattcctgattcaattccggattgggtatttgactttatgccaacccgt 479
Query: 1117 ggtggttattttattggcaatgttagtcctgcaaggatggattttcgatggtttgcttta 1176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 480 ggtggttattttattggcaatgttagtcctgcaaggatggattttcgatggtttgcttta 539
Query: 1177 ggaaattgtgttgccattctctcatctcttgcaactcctgagcaatcaatggctatcatg 1236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 540 ggaaattgtgttgccattctctcatctcttgcaactcctgagcaatcaatggctatcatg 599
Query: 1237 gatcttattgaagctcgctgggaggagctggttggagaaatgcctttgaaaatagcttat 1296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 600 gatcttattgaagctcgctgggaggagctggttggagaaatgcctttgaaaatagcttat 659
Query: 1297 cctgcaatagaaagtcatgaatggcgaattgtaactggttgcgatcccaagaataccaga 1356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 660 cctgcaatagaaagtcatgaatggcgaattgtaactggttgcgatcccaagaataccaga 719
Query: 1357 tggagttaccataatggaggatcttggccagtgcttttatggctgctaactgccgcatgc 1416
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 720 tggagttaccataatggaggatcttggccagtgcttttatggctgctaactgccgcatgc 779
Query: 1417 ataaaactggacgaccacaaattg-caagacgagcaa 1452
|| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 780 attaaactggacgaccacaaattgacaagacgagcaa 816