Jatropha Genome Database
- JcCA0029371.20
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0029371.20 + phase: 0 /TE
(1272 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c06895 1255 0.0
KJC_c01965 837 0.0
>KJC_c06895
Length = 844
Score = 1255 bits (633), Expect = 0.0
Identities = 691/709 (97%), Gaps = 1/709 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 564 gttcaaacaaggccacttgcttagcggttctgatgatgctcaaatttgcttgtgggacat 623
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 844 gttcaaacaaggccacttgcttagcggttctgatgatgctcaaatttgcttgtgggacat 785
Query: 624 cgattccactcccaagaacaggaccctagatgctatgcaaacctttaaagttcatgaagg 683
| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||
Sbjct: 784 caattccactcccaagaacaaggccctggatgctatgctaacttttaaggttcatgaagg 725
Query: 684 cgttgtagaagatgtagcatggcatcttagacatgaatacttatttggctctgttgggga 743
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 724 cgttgtagaagatgtagcatggcatcttagacatgaatacttatttggctctgtcgggga 665
Query: 744 tgatcaatacctactcatatgggatctcagaactccagcagtcaccaagcctgtccaatc 803
|||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 664 tgatcaatacctgcttatatgggatctcagaactccagcagccaccaagcctgtccaatc 605
Query: 804 agtagtcgctcaccagagtgaggttaattgcttagcttttaatcctttcaatgaatgggt 863
|| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 604 cgttgttgcgcaccagagtgaggttaattgcttagcttttaatcctttcaatgaatgggt 545
Query: 864 tgttgcaacgggatccactgataaaactgtgaagttatttgatatacgtaagatcaacac 923
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 544 tgttgcaacgggatccactgataaaactgtgaagttatttgatatacgtaagatcaacac 485
Query: 924 agcgcttcacacatttgactgtcacaaggaggaggttttccaagttggatggaatcctaa 983
||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 484 agcgcttcacacaattgactgtcacaaggaggagg-tttccaagttggatggaatcctaa 426
Query: 984 gaatgaaactatcttagcttcttgttgcctcggtagaaggctcatggtgtgggatcttag 1043
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 425 gaatgaaactatcttagcttcttgttgcctcggtagaaggctcatggtgtgggatcttag 366
Query: 1044 caggattgatgaagaacagacaccagaagatgctgaagatggtcctccagaactgctttt 1103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 365 caggattgatgaagaacagacaccagaagatgctgaagatggtcctccagaactgctttt 306
Query: 1104 tattcatggtggtcacacaagtaaaatatcagatttttcgtggaatccttgtgaagactg 1163
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 305 tattcatggtggtcacacaagtaaaatatcagaattttcgtggaatccttgtgaagactg 246
Query: 1164 ggttattgcaagtgtggctgaagataacatccttcagatatggcaaatggcagagaatat 1223
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 245 ggttattgcaagtgtggctgaagataacatccttcagatatggcaaatggcagagaatat 186
Query: 1224 ctaccacgatgaagatgacatgcctggggatgaatccacaaaaggttcc 1272
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 185 ctaccacgatgaagatgacatgcctggggatgaatccacaaaaggttcc 137
>KJC_c01965
Length = 715
Score = 837 bits (422), Expect = 0.0
Identities = 521/554 (94%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggggaaagacgaagaggaaatgagaggggagatagaggagaggctcataaacgaagaa 60
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 162 atggggaaagacgaagaggagatgagaggggagatagaggagaggctcataaacgaagaa 221
Query: 61 tacaaaatatggaaaaagaacactccttttctttacgatctggttatcacccatgccctc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||
Sbjct: 222 tacaaaatatggaaaaagaacactccttttctttacgatctggttataactcatgccctc 281
Query: 121 gaatggccttcccttacagtcgagtggttaccggaccgcgaggagcctccgggcaaggac 180
||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||
Sbjct: 282 gaatggccttcccttaccgtcgagtggttacccgaccgcgaagagcctcctggcaaggac 341
Query: 181 tactccaaccagaagatgattctcggcactcacacctctgagaatgagcccaactacctc 240
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 342 tactctgtccagaagatgattctcggcactcacacctctgagaatgagcccaactacctt 401
Query: 241 atgctcgcccaggtccagcttcccctcggtgatgctgagaacgatgcccgccactacgac 300
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 402 atgctcgcccaggtccagcttcccctcgatgatgccgagaatgatgcccgccactacgac 461
Query: 301 gatgatcgctctgatttcggtggctttggagctgccaacggcaaggtccaaataattcag 360
|||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 462 gatgatcgctctgaatttggtggctttggagccgccaacggcaaggtgcaaataattcag 521
Query: 361 cagattaatcacgatggagaagttaaccgggctcgttatatgcctcaaaacccttttata 420
|| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 522 caaatcaatcacgatggagaggttaacagggctcgttatatgcctcaaaacccttttata 581
Query: 421 attgccaccaagactgtgagtgctgaagtttatgtctttgactacagcaagcacccatct 480
||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 582 attgccaccaagactgttagtgctgaagtttatgtttttgactacagcaagcacccatct 641
Query: 481 aagccgcctctcgacggtacctgtaatcccgatttgaggctgaggggtcacagcactgaa 540
||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||
Sbjct: 642 aagccgcctcttgacggtgcttgttctcccgatttgagattgaggggccacagcactgaa 701
Query: 541 ggttatggattgtc 554
|||||||| |||||
Sbjct: 702 ggttatggtttgtc 715