Jatropha Genome Database
- JcCA0028681.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0028681.10 - phase: 0 /partial
(1404 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c00616 2583 0.0
>KJC_c00616
Length = 2026
Score = 2583 bits (1303), Expect = 0.0
Identities = 1303/1303 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 102 gtctgatttccattcaaatacctcattttcctttccatcctctaagtccctcctcagaac 161
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 gtctgatttccattcaaatacctcattttcctttccatcctctaagtccctcctcagaac 60
Query: 162 caccatttcctgctcccaatcatcctccgccgtaccatctccctctcccgccgcccctcg 221
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 caccatttcctgctcccaatcatcctccgccgtaccatctccctctcccgccgcccctcg 120
Query: 222 ccgccgccgtccagagtacatacctaaccacatcccagaccctttctatgttcgtgtctt 281
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ccgccgccgtccagagtacatacctaaccacatcccagaccctttctatgttcgtgtctt 180
Query: 282 tgatactactctccgcgatggcgaacagtctcccggcgccactctcacctccaaggaaaa 341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tgatactactctccgcgatggcgaacagtctcccggcgccactctcacctccaaggaaaa 240
Query: 342 gcttgacatcgctcgccatctttcgaagctcggcgtcgacataatagaagctggatttcc 401
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 gcttgacatcgctcgccatctttcgaagctcggcgtcgacataatagaagctggatttcc 300
Query: 402 tgcggcatctaatgatgattttgaggctgtgaaaaccattgctaaagaagtgggtaatgc 461
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 tgcggcatctaatgatgattttgaggctgtgaaaaccattgctaaagaagtgggtaatgc 360
Query: 462 ggtggatgatgagggatacgtaccggttatttgtggattgtcgaggtgcaatgagaagga 521
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 ggtggatgatgagggatacgtaccggttatttgtggattgtcgaggtgcaatgagaagga 420
Query: 522 catcaaaactgcctgggaggctgtgaagtatgccaagaggccgaggattcacacgttcat 581
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 catcaaaactgcctgggaggctgtgaagtatgccaagaggccgaggattcacacgttcat 480
Query: 582 tgcgacgagtgagatccatatgcagtacaagttgaggaagagtaaagaggaggtggtgga 641
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 tgcgacgagtgagatccatatgcagtacaagttgaggaagagtaaagaggaggtggtgga 540
Query: 642 gatcgctacaaatatggttaagtttgctaggagtttgggttgtgatgacgtcgaatttag 701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 gatcgctacaaatatggttaagtttgctaggagtttgggttgtgatgacgtcgaatttag 600
Query: 702 ccctgaagatgctggcagatctgacagagagttcttgtaccatattttgggtgaagttat 761
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 ccctgaagatgctggcagatctgacagagagttcttgtaccatattttgggtgaagttat 660
Query: 762 caaggccggtgctacaactcttaacattcctgatactgttggtataacgctgcctagtga 821
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 caaggccggtgctacaactcttaacattcctgatactgttggtataacgctgcctagtga 720
Query: 822 atttggacagttgattgctgatataagagctaatacgcctggaattgaaaatgtcattat 881
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 atttggacagttgattgctgatataagagctaatacgcctggaattgaaaatgtcattat 780
Query: 882 ttcaacacactgccaaaatgatcttggactttctacggctaacaccttagcagggacata 941
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 ttcaacacactgccaaaatgatcttggactttctacggctaacaccttagcagggacata 840
Query: 942 tgcaggtgccagacaagtggaagtaacagtcaatggaattggtgaaagagctggtaatgc 1001
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 tgcaggtgccagacaagtggaagtaacagtcaatggaattggtgaaagagctggtaatgc 900
Query: 1002 ttcattggaggaggttgtaatggctataaaatgtcgtggagagcatgttttaggaggtct 1061
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 ttcattggaggaggttgtaatggctataaaatgtcgtggagagcatgttttaggaggtct 960
Query: 1062 ttatactggaattaattctaaacacatcactatggcaagcaagatggtggaagaatatac 1121
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 ttatactggaattaattctaaacacatcactatggcaagcaagatggtggaagaatatac 1020
Query: 1122 tggtttgcacgtgcagccacacaaggcaattgttggagctaatgcttttgctcatgaaag 1181
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1021 tggtttgcacgtgcagccacacaaggcaattgttggagctaatgcttttgctcatgaaag 1080
Query: 1182 tggcatacatcaggatggaatgctaaaacataaaggtacttatgagattatgtcccctga 1241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 tggcatacatcaggatggaatgctaaaacataaaggtacttatgagattatgtcccctga 1140
Query: 1242 agatattgggcttgaacgagccaatgatgctgggattgtccttggaaaacttagtggtcg 1301
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 agatattgggcttgaacgagccaatgatgctgggattgtccttggaaaacttagtggtcg 1200
Query: 1302 ccatgctttgaaagatcgactcaaagagcttggttatgagttgagtgatgagcaacttgg 1361
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1201 ccatgctttgaaagatcgactcaaagagcttggttatgagttgagtgatgagcaacttgg 1260
Query: 1362 caatatcttttggcgcttcaagtctgttgctgaaaacaaaaag 1404
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1261 caatatcttttggcgcttcaagtctgttgctgaaaacaaaaag 1303