Jatropha Genome Database
- JcCA0027761.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0027761.10 - phase: 0
(1236 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c01173 1582 0.0
>KJC_c01173
Length = 921
Score = 1582 bits (798), Expect = 0.0
Identities = 798/798 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgccaggaggagtgaattcacctgtacgggcttttaaatctgtcggcggacaaccaata 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 124 atgccaggaggagtgaattcacctgtacgggcttttaaatctgtcggcggacaaccaata 183
Query: 61 gtgatggattctgtgaagggctctcggatgtgggatattgatggcaatgagtacattgac 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 184 gtgatggattctgtgaagggctctcggatgtgggatattgatggcaatgagtacattgac 243
Query: 121 tatgttggttcttgggggccagctataattggtcatgcagatgatcaggtgcttgcagct 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 244 tatgttggttcttgggggccagctataattggtcatgcagatgatcaggtgcttgcagct 303
Query: 181 ttggctgaaacaatgaagaaagggacgagctttggtgccccctgtcttctagagaatgtg 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 304 ttggctgaaacaatgaagaaagggacgagctttggtgccccctgtcttctagagaatgtg 363
Query: 241 ctagcggagatggtcatcaaagcagttccatctatagaaatggtacgatttgtcaattca 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 364 ctagcggagatggtcatcaaagcagttccatctatagaaatggtacgatttgtcaattca 423
Query: 301 ggcacggaggcttgcatgggtgtgcttcgcctggcccgtgcttacactagacgagagaag 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 424 ggcacggaggcttgcatgggtgtgcttcgcctggcccgtgcttacactagacgagagaag 483
Query: 361 cttatcaagtttgagggctgttaccatggccatgctgatcctttcctcgtcaaggcagga 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 484 cttatcaagtttgagggctgttaccatggccatgctgatcctttcctcgtcaaggcagga 543
Query: 421 agtggtgttgcaacactagggttgccagactcccctggtgtcccgaaggcagcaacctat 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 544 agtggtgttgcaacactagggttgccagactcccctggtgtcccgaaggcagcaacctat 603
Query: 481 gaaactttaacagcccctttcaatgacttggctgcagtggaaaaactttttgagacaaac 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 604 gaaactttaacagcccctttcaatgacttggctgcagtggaaaaactttttgagacaaac 663
Query: 541 aagggagagattgcagcaataatccttgaacctgttgtaggaaattcaggttttgttcca 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 664 aagggagagattgcagcaataatccttgaacctgttgtaggaaattcaggttttgttcca 723
Query: 601 cctaaaccagaattcctcaatgctatccgcaaggttaccaaagaaaatgatgcccttcta 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 724 cctaaaccagaattcctcaatgctatccgcaaggttaccaaagaaaatgatgcccttcta 783
Query: 661 atctttgatgaagttatgactggattccgtttgtcatatggaggcgctcaggagtacttt 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 784 atctttgatgaagttatgactggattccgtttgtcatatggaggcgctcaggagtacttt 843
Query: 721 ggcattactcctgatctaacaacacttgggaagattattggtggtggcttgccagtaggt 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 844 ggcattactcctgatctaacaacacttgggaagattattggtggtggcttgccagtaggt 903
Query: 781 gcttatggtggaaggagg 798
||||||||||||||||||
Sbjct: 904 gcttatggtggaaggagg 921