Jatropha Genome Database
- JcCA0020831.30
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0020831.30 - phase: 0
(1359 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c02737 2416 0.0
KJC_c00592 86 3e-16
>KJC_c02737
Length = 1233
Score = 2416 bits (1219), Expect = 0.0
Identities = 1233/1235 (99%), Gaps = 2/1235 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 93 ctctaagaggttagaagtagctgaattttctgggcttcgagccacttctcatgtaagtta 152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ctctaagaggttagaagtagctgaattttctgggcttcgagccacttctcatgtaagtta 60
Query: 153 tgccaagaatgctactgagggatccttctttgatgtggtggctgctcaaatgactcccaa 212
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tgccaagaatgctactgagggatccttctttgatgtggtggctgctcaaatgactcccaa 120
Query: 213 ggtagcagcatcaactccaatcagagcagaaacagtagcaaaactcaaggtagcaatcaa 272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ggtagcagcatcaactccaatcagagcagaaacagtagcaaaactcaaggtagcaatcaa 180
Query: 273 tggattcggacgcattggcaggaacttcctcagatgctggcatggccgcaaggactctcc 332
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 tggattcggacgcattggcaggaact-cctcagatgctggcatggccgcaaggactctcc 239
Query: 333 ccttgaagtgatcgttgtcaatgacagtgctggtgtcaagaacgctgctcacttgctgaa 392
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 240 ccttgaagtgatcgttgtcaatgacagtgctggtgtcaagaacgctgctcacttgctgaa 299
Query: 393 atatgattccatgcttggaacatttaaagcagacgtgaaaattgtggatgatagcaccat 452
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
Sbjct: 300 atatgattccatgcttggaacatttaaagcagacgtgaaa-ttgtggatgatagcaccat 358
Query: 453 cagtgtggatgggaagcacatcaaggttgtctccaacagagaccctcttaagcttccatg 512
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 359 cagtgtggatgggaagcacatcaaggttgtctccaacagagaccctcttaagcttccatg 418
Query: 513 ggctgaacttggaatagacattgtcattgagggaacaggagtatttgtggatggccctgg 572
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 419 ggctgaacttggaatagacattgtcattgagggaacaggagtatttgtggatggccctgg 478
Query: 573 tgctgggaaacatatccaagctggtgccaagaaagtcatcatcactgctccagctaaagg 632
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 479 tgctgggaaacatatccaagctggtgccaagaaagtcatcatcactgctccagctaaagg 538
Query: 633 tgctgatattccaacctatgttgttggtgttaatgaaaaggattacagtcaccaggttgc 692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 539 tgctgatattccaacctatgttgttggtgttaatgaaaaggattacagtcaccaggttgc 598
Query: 693 caacattgtaagcaatgcttcctgtactacgaactgtctggctccatttgtaaagatcat 752
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 599 caacattgtaagcaatgcttcctgtactacgaactgtctggctccatttgtaaagatcat 658
Query: 753 agatgaggaatttggcattgtcaagggaacaatgactaccactcactcctacactggaga 812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 659 agatgaggaatttggcattgtcaagggaacaatgactaccactcactcctacactggaga 718
Query: 813 tcagagactcttggatgcttcacaccgtgacttgagaagagccagagcagcagcactgaa 872
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 719 tcagagactcttggatgcttcacaccgtgacttgagaagagccagagcagcagcactgaa 778
Query: 873 cattgtgccaacgagcaccggtgcagcgaaggctgtctctcttgtgttgcctcagctcaa 932
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 779 cattgtgccaacgagcaccggtgcagcgaaggctgtctctcttgtgttgcctcagctcaa 838
Query: 933 aggaaagctcaatggcattgccctccgtgtcccaacaccaaatgtctcagttgtggactt 992
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 839 aggaaagctcaatggcattgccctccgtgtcccaacaccaaatgtctcagttgtggactt 898
Query: 993 ggttgtgaacgttgagaagaagggtattacagctgaagatgtcaatgcagctttcaggaa 1052
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 899 ggttgtgaacgttgagaagaagggtattacagctgaagatgtcaatgcagctttcaggaa 958
Query: 1053 agcagcagatgggccattgaagggcatattggatgtctgtgatgttcctcttgtgtctgt 1112
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 959 agcagcagatgggccattgaagggcatattggatgtctgtgatgttcctcttgtgtctgt 1018
Query: 1113 tgacttccgatgcactgatgtttcttccaccattgactcttcattgaccatggtcatggg 1172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1019 tgacttccgatgcactgatgtttcttccaccattgactcttcattgaccatggtcatggg 1078
Query: 1173 agatgacatggtcaaggtagttgcctggtacgacaatgaatggggatacagccaaagggt 1232
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1079 agatgacatggtcaaggtagttgcctggtacgacaatgaatggggatacagccaaagggt 1138
Query: 1233 tgttgatttggcacatttggtggccaacgagtggccaggcgtggctgcaactggaagtgg 1292
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1139 tgttgatttggcacatttggtggccaacgagtggccaggcgtggctgcaactggaagtgg 1198
Query: 1293 agatccattggaggagttctgtgagaaaaacccag 1327
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1199 agatccattggaggagttctgtgagaaaaacccag 1233
>KJC_c00592
Length = 1386
Score = 85.7 bits (43), Expect = 3e-16
Identities = 118/143 (82%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1102 cttgtgtctgttgacttccgatgcactgatgtttcttccaccattgactcttcattgacc 1161
||||| || ||||||||| | ||||| |||||||| || || ||||||| || || ||
Sbjct: 1086 cttgtttcagttgacttcaggtgcacagatgtttcatcaacagttgactcatccttaaca 1145
Query: 1162 atggtcatgggagatgacatggtcaaggtagttgcctggtacgacaatgaatggggatac 1221
||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| || ||||||||||||||
Sbjct: 1146 atggtgatgggagatgatatggtgaaggtgattgcttggtatgataatgaatggggatat 1205
Query: 1222 agccaaagggttgttgatttggc 1244
||||||||||||||||||||
Sbjct: 1206 tctcaaagggttgttgatttggc 1228