Jatropha Genome Database
- JcCA0020831.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0020831.10 - phase: 0
(1377 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c01982 1211 0.0
>KJC_c01982
Length = 611
Score = 1211 bits (611), Expect = 0.0
Identities = 611/611 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 404 agaacttgcatgccgtgctagtggcacgtggacttgaccggaaaatcaaggtcacaacac 463
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 611 agaacttgcatgccgtgctagtggcacgtggacttgaccggaaaatcaaggtcacaacac 552
Query: 464 cacatagtatggctgttcttgcttcctcatttcctccttcagcttccacttttgctacta 523
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 551 cacatagtatggctgttcttgcttcctcatttcctccttcagcttccacttttgctacta 492
Query: 524 ctcttatgcctaccatgacctccatagtggggttcttagctgacactggtgctcctttca 583
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 491 ctcttatgcctaccatgacctccatagtggggttcttagctgacactggtgctcctttca 432
Query: 584 tggtcaatgcgtatccatatttcgcttacagagacaaccctggttctgttaacctacaat 643
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 431 tggtcaatgcgtatccatatttcgcttacagagacaaccctggttctgttaacctacaat 372
Query: 644 atgccttactaggtaatgctactggagtacgtgatcccatggggtatgtctacaacaata 703
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 371 atgccttactaggtaatgctactggagtacgtgatcccatggggtatgtctacaacaata 312
Query: 704 tgttagatgcacaaattgatgctgttagatcagccatcaatgctctagggtatggaaatc 763
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 311 tgttagatgcacaaattgatgctgttagatcagccatcaatgctctagggtatggaaatc 252
Query: 764 agacagttcagattacagtgtcagaatccggttggccgtccaagggtgatcctggtgatg 823
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 251 agacagttcagattacagtgtcagaatccggttggccgtccaagggtgatcctggtgatg 192
Query: 824 atgcggccacgcccgacaatgcaaagacttataatacaagattgatagaacgtgcacagt 883
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 191 atgcggccacgcccgacaatgcaaagacttataatacaagattgatagaacgtgcacagt 132
Query: 884 ccaataaaggaacacccatgaagcctaaggataatatagagatatttgtgtttgctttgt 943
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 131 ccaataaaggaacacccatgaagcctaaggataatatagagatatttgtgtttgctttgt 72
Query: 944 ttaatgagaacaaaaaggatggtagtgttagtgagagaaattttgggatatttaatggag 1003
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 71 ttaatgagaacaaaaaggatggtagtgttagtgagagaaattttgggatatttaatggag 12
Query: 1004 atggatctaaa 1014
|||||||||||
Sbjct: 11 atggatctaaa 1