Jatropha Genome Database
- JcCA0020761.30
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0020761.30 + phase: 0 /partial
(929 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c01553 1376 0.0
KJC_c00774 573 e-163
>KJC_c01553
Length = 729
Score = 1376 bits (694), Expect = 0.0
Identities = 701/702 (99%), Gaps = 1/702 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggcgacttatgccaaaccggagaacgctttaaagcgagcggaagaattgataaatgtg 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 28 atggcgacttatgccaaaccggagaacgctttaaagcgagcggaagaattgataaatgtg 87
Query: 61 gggcagaagcaagatgctttgcaagctctgcatgatctgataacttctaagagatatcga 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 88 gggcagaagcaagatgctttgcaagctctgcatgatctgataacttctaagagatatcga 147
Query: 121 gcatggcaaaagccattggaaaaaattatgttcaaatatgttgagctatgtgttgatatg 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 148 gcatggcaaaagccattggaaaaaattatgttcaaatatgttgagctatgtgttgatatg 207
Query: 181 cgaaggggaagatttgcaaaggatggtttgatacagtaccgtatagtctgccaacaagta 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 208 cgaaggggaagatttgcaaaggatggtttgatacagtaccgtatagtctgccaacaagta 267
Query: 241 aatgtgaattctttggaggaggtgattaagcatttcatgcatctctccactgagaaagct 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 268 aatgtgaattctttggaggaggtgattaagcatttcatgcatctctccactgagaaagct 327
Query: 301 gaacaagcacgaagtcaggcacaagctttagaagatgctcttgatgttgatgaccttgaa 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 328 gaacaagcacgaagtcaggcacaagctttagaagatgctcttgatgttgatgaccttgaa 387
Query: 361 gcagataagaggccagaagatctgatgcttagttatgtcagtggagagaaaggaaaggat 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 388 gcagataagaggccagaagatctgatgcttagttatgtcagtggagagaaaggaaaggat 447
Query: 421 agatctgatcgtgaacttgttaccccttggttcaagtttttgtgggagacatatagaacg 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 448 agatctgatcgtgaacttgttaccccttggttcaagtttttgtgggagacatatagaacg 507
Query: 481 gtgcttgagatcttacgaaacaactcaaagttggaggcactatatgcgatgacagcacat 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 508 gtgcttgagatcttacgaaacaactcaaagttggaggcactatatgcgatgacagcacat 567
Query: 541 cgagctttccaattctgcaaacagtacaaaaggacaactgaatttagaaggctatgtgag 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 568 cgagctttccaattctgcaaacagtacaaaaggacaactgaatttagaaggctatgtgag 627
Query: 601 attatcaggaaccatttagcaaacctcaacaaatatagagatcaaagggaccggcctgat 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 628 attatcaggaaccatttagcaaacctcaacaaatatagagatcaaagggaccggcctgat 687
Query: 661 ctgtcagccccagagagcttg-cagctgtaccttgatacccg 701
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 688 ctgtcagccccagagagcttgccagctgtaccttgatacccg 729
>KJC_c00774
Length = 1318
Score = 573 bits (289), Expect = e-163
Identities = 303/305 (99%), Gaps = 2/305 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 627 caacaaata-tagagatcaaagggaccggcctgatctgtcagccccagagagcttgcagc 685
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 caacaaataatagagatcaaagggaccggcctgatctgtcagccccagagagcttgcagc 60
Query: 686 tgtaccttgatacccgatttgagcaactaaaaatt-gctactgagcttgaactctggcag 744
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 tgtaccttgatacccgatttgagcaactaaaaattagctactgagcttgaactctggcag 120
Query: 745 gaagcttttcggtccattgaggatatccatggattaatgtgcatggtcaaaaagactcct 804
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 gaagcttttcggtccattgaggatatccatggattaatgtgcatggtcaaaaagactcct 180
Query: 805 aagccatctttgatggtggtttactatgcgaagctaactgagattttctggatttcatcg 864
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 aagccatctttgatggtggtttactatgcgaagctaactgagattttctggatttcatcg 240
Query: 865 agtcatctttatcatgcttatgcatggttcaaactttttacacttcagaaaagcttcaat 924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 agtcatctttatcatgcttatgcatggttcaaactttttacacttcagaaaagcttcaat 300
Query: 925 aaaaa 929
|||||
Sbjct: 301 aaaaa 305