Jatropha Genome Database
- JcCA0020761.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0020761.10 + phase: 2 /partial
(2053 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c02482 2537 0.0
KJC_c01811 646 0.0
KJC_c04184 145 5e-34
KJC_c01079 123 2e-27
KJC_c02519 109 3e-23
KJC_c08959 54 1e-06
>KJC_c02482
Length = 1460
Score = 2537 bits (1280), Expect = 0.0
Identities = 1287/1288 (99%), Gaps = 1/1288 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 766 tttgaaagtggaaagaagctctcctgttaggccttctccaattcttaatggagttgattc 825
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 tttgaaagtggaaagaagctctcctgttaggccttctccaattcttaatggagttgattc 60
Query: 826 catgaatagaaacatggaaaagcccagagctgtggatgatgtaattgataaaacaaagcc 885
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 catgaatagaaacatggaaaagcccagagctgtggatgatgtaattgataaaacaaagcc 120
Query: 886 atggcagttggctgaaattttggattctggcgagtgccgattagttaccttgcctgacag 945
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 atggcagttggctgaaattttggattctggcgagtgccgattagttaccttgcctgacag 180
Query: 946 cagagatacttccagcaaggttgttcgacttctgtacacaaattctggtgttggcatttt 1005
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 cagagatacttccagcaaggttgttcgacttctgtacacaaattctggtgttggcatttt 240
Query: 1006 ggcacttgggtcaaatggtattcagaagctctggaagtggacacgcaacgaccagaatcc 1065
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ggcacttgggtcaaatggtattcagaagctctggaagtggacacgcaacgaccagaatcc 300
Query: 1066 aacaggaaaggccactgctagtgctgttccgcagcattggcaaccaaacagtggtcttct 1125
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 aacaggaaaggccactgctagtgctgttccgcagcattggcaaccaaacagtggtcttct 360
Query: 1126 tatggccaatgatgtggcaggcgttaaccttgaagaagcagtcccatgcatagcactttc 1185
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 tatggccaatgatgtggcaggcgttaaccttgaagaagcagtcccatgcatagcactttc 420
Query: 1186 aaagaatgactcatatgtaatgtctgctgctggaggaaaggtttcactgtttaacatgat 1245
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 aaagaatgactcatatgtaatgtctgctgctggaggaaaggtttcactgtttaacatgat 480
Query: 1246 gacgttcaaggtaatgacaacattcatgtctcctcctcctgcttcaactttcctagcatt 1305
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 gacgttcaaggtaatgacaacattcatgtctcctcctcctgcttcaactttcctagcatt 540
Query: 1306 ccatcctcaggataataatataattgccatcggaatggaggattcagctatccacattta 1365
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 ccatcctcaggataataatataattgccatcggaatggaggattcagctatccacattta 600
Query: 1366 taatgttagagtggatgaggtgaaatcaaaattgaggggtcatcagaagagaataactgg 1425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 taatgttagagtggatgaggtgaaatcaaaattgaggggtcatcagaagagaataactgg 660
Query: 1426 tttagctttttccaccaatcttaatatcttggtttcttcaggcgctgatgctcaactttg 1485
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 tttagctttttccaccaatcttaatatcttggtttcttcaggcgctgatgctcaactttg 720
Query: 1486 tgtatggagtattgatacatgggagaaaaggaaatcagttgcaattcaaattccagtagg 1545
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 tgtatggagtattgatacatgggagaaaaggaaatcagttgcaattcaaattccagtagg 780
Query: 1546 gaaggcacctgttggggaaacccgagtacagttccactctgatcagacccgattattggt 1605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 gaaggcacctgttggggaaacccgagtacagttccactctgatcagacccgattattggt 840
Query: 1606 agttcatgagacccaattggcaatatatgatgcatcaaagatggaacgtgtccgacagtg 1665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 agttcatgagacccaattggcaatatatgatgcatcaaagatggaacgtgtccgacagtg 900
Query: 1666 gttaccacaggatacattgtctgcacccctatcttatgcggcgtactcttgcaacagcca 1725
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 gttaccacaggatacattg-ctgcacccctatcttatgcggcgtactcttgcaacagcca 959
Query: 1726 attaatttacgctaccttttgtgatggtaacattggagtgtttgatgctgatagcctgag 1785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 960 attaatttacgctaccttttgtgatggtaacattggagtgtttgatgctgatagcctgag 1019
Query: 1786 actaaggtgccgtattgcttcatcagcatacttatctcaggcggtcctgaatggaagtca 1845
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1020 actaaggtgccgtattgcttcatcagcatacttatctcaggcggtcctgaatggaagtca 1079
Query: 1846 atcagtctaccctctcgtcgttgctgcacatccgcaagaacccaaccaattatcaatagg 1905
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1080 atcagtctaccctctcgtcgttgctgcacatccgcaagaacccaaccaattatcaatagg 1139
Query: 1906 gttgacggatggatcagtgaaggtgatggaacccacagaatcggaaggaaaatggggaac 1965
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1140 gttgacggatggatcagtgaaggtgatggaacccacagaatcggaaggaaaatggggaac 1199
Query: 1966 aactccacctgtagataatggtgtgctaaatgggaggacgacatcatcatccactacaag 2025
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1200 aactccacctgtagataatggtgtgctaaatgggaggacgacatcatcatccactacaag 1259
Query: 2026 caaccacacgccggatcagttacagaga 2053
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1260 caaccacacgccggatcagttacagaga 1287
>KJC_c01811
Length = 787
Score = 646 bits (326), Expect = 0.0
Identities = 339/342 (99%), Gaps = 1/342 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 attgatgctcacgtttgtgggtgttaatgacttggcttttgctcatccaaacaaacaact 60
||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 341 attgatgctcacgttgg-gggtgttaatgacttggcttttgctcatccaaacaaacaact 283
Query: 61 gtgtgttgtaacctgtggagatgataagctaataaaggtttgggatttagggggacggaa 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 282 gtgtgttgtaacctgtggagatgataagctaataaaggtttgggatttagggggacggaa 223
Query: 121 attatttaattttgaaggtcacgaggctccagtttattctatatgtcctcaccataaaga 180
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 222 attatttaattttgaaggtcacgaggccccagtttattctatatgtcctcaccataaaga 163
Query: 181 aagcattcagtttatattcgcaactgctattgatggaaagataaaggcctggctatatga 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 162 aagcattcagtttatattcgcaactgctattgatggaaagataaaggcctggctatatga 103
Query: 241 taatgtgggacctagagttgattatgatgcaccaggccgctggtgcactacaatgcttta 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 102 taatgtgggacctagagttgattatgatgcaccaggccgctggtgcactacaatgcttta 43
Query: 301 cagtgctgatggtagtagattattctcttgtggaacaagtaa 342
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 42 cagtgctgatggtagtagattattctcttgtggaacaagtaa 1
>KJC_c04184
Length = 596
Score = 145 bits (73), Expect = 5e-34
Identities = 166/197 (84%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1190 aatgactcatatgtaatgtctgctgctggaggaaaggtttcactgtttaacatgatgacg 1249
||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||| || |||| |||||||||||
Sbjct: 203 aatgattcatatgtcatgtctgcttctggtgggaaggtatctttgttcaacatgatgacc 144
Query: 1250 ttcaaggtaatgacaacattcatgtctcctcctcctgcttcaactttcctagcattccat 1309
|| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| | || || |||| ||||||
Sbjct: 143 tttaaggtcatgacgacatttatgtcccctcctcctgctgccacatttttagcgttccat 84
Query: 1310 cctcaggataataatataattgccatcggaatggaggattcagctatccacatttataat 1369
||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | || |||||||||
Sbjct: 83 cctcaggataataatattattgccattggcatggaggattcttctgtgcaaatttataat 24
Query: 1370 gttagagtggatgaggt 1386
|| ||||| ||||||||
Sbjct: 23 gtcagagttgatgaggt 7
>KJC_c01079
Length = 2440
Score = 123 bits (62), Expect = 2e-27
Identities = 206/254 (81%)
Strand = Plus / Plus
Query: 131 tttgaaggtcacgaggctccagtttattctatatgtcctcaccataaagaaagcattcag 190
|||||||| || |||||||| ||||||||| | |||||||| |||| |||| |||||||
Sbjct: 1624 tttgaaggacatgaggctcctgtttattctgtctgtcctcattataaggaaaacattcag 1683
Query: 191 tttatattcgcaactgctattgatggaaagataaaggcctggctatatgataatgtggga 250
||||| ||| |||| || | ||||| |||||||| || ||| | ||||| ||| |||||
Sbjct: 1684 tttatcttctcaacagcattggatggtaagataaaagcttggttgtatgacaatttggga 1743
Query: 251 cctagagttgattatgatgcaccaggccgctggtgcactacaatgctttacagtgctgat 310
|| ||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||| |||||||||||||
Sbjct: 1744 tctcgagttgattatgaggctcctggccgctggtgcacaaccatggcttacagtgctgat 1803
Query: 311 ggtagtagattattctcttgtggaacaagtaaagagggggattctttcctagttgaatgg 370
|||| || | || || ||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||
Sbjct: 1804 ggtacaaggctcttttcatgtgggacaagtaaagatggggagtcacatattgttgaatgg 1863
Query: 371 aacgaaagtgaagg 384
|| |||||||||||
Sbjct: 1864 aatgaaagtgaagg 1877
>KJC_c02519
Length = 773
Score = 109 bits (55), Expect = 3e-23
Identities = 130/155 (83%)
Strand = Plus / Plus
Query: 124 atttaattttgaaggtcacgaggctccagtttattctatatgtcctcaccataaagaaag 183
||||| |||||| ||||| || || || || |||||| | ||||| || |||||||||||
Sbjct: 112 atttacttttgagggtcatgatgcacctgtatattctgtttgtccacatcataaagaaag 171
Query: 184 cattcagtttatattcgcaactgctattgatggaaagataaaggcctggctatatgataa 243
||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||| ||| | |||||| |
Sbjct: 172 tattcagtttatcttttcaacggctactgatggaaagataaaggcatggttgtatgatca 231
Query: 244 tgtgggacctagagttgattatgatgcaccaggcc 278
|| ||| |||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 232 tgggggttctagagttgactatgatgcaccaggcc 266
>KJC_c08959
Length = 231
Score = 54.0 bits (27), Expect = 1e-06
Identities = 114/143 (79%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1190 aatgactcatatgtaatgtctgctgctggaggaaaggtttcactgtttaacatgatgacg 1249
||||| || ||||| ||||| || ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||
Sbjct: 195 aatgattcttatgttatgtcagcatctggagggaagatttcactatttaatatgatgaca 136
Query: 1250 ttcaaggtaatgacaacattcatgtctcctcctcctgcttcaactttcctagcattccat 1309
|| ||| |||||| || |||||| | || || ||||| |||| || || || ||||||
Sbjct: 135 tttaagacaatgacgactttcatgccgccgccacctgcagcaacgtttcttgctttccat 76
Query: 1310 cctcaggataataatataattgc 1332
||||| |||||||| || |||||
Sbjct: 75 cctcaagataataacattattgc 53