Jatropha Genome Database
- JcCA0005391.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0005391.10 - phase: 0 /pseudo
(4062 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c01609 1713 0.0
KJC_c02339 1655 0.0
KJC_c05700 1148 0.0
KJC_c06062 1146 0.0
>KJC_c01609
Length = 1093
Score = 1713 bits (864), Expect = 0.0
Identities = 936/952 (98%), Gaps = 6/952 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 901 gatgggactggtattgaaattggggcagctgtgactattttcaaagttattgaagcttt- 959
|||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct: 1093 gatgggactggtattgaaattgggtcaactgtgactatttccaaagttattgaagctttt 1034
Query: 960 gagggaactaaataaaa-gtgaatgtgaatttagctctgaaagtaagatagttttcaaca 1018
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 1033 gagggaactaaataaaaagtgaatgtgaatttagctctgaaagtaagatggttttcaaca 974
Query: 1019 aaattgcagatcatctggagaaagttgctaacaaatttgttagaaatacaggcagcattg 1078
||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 973 aaaaggcagatcatctggagaaagttgcaaacaaatttgttagaaatacaggcagcattg 914
Query: 1079 gtggcaatttggtgatggcacagaggaaaagttttccttcagatattgccacaatacttc 1138
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 913 ggggcaatttggtgatggcacagaggaaaagttttccttcagatattgccacaatacttc 854
Query: 1139 ttgcagctggttcctatgttcatgtaataagtggcacggtgcatgaaaagcttactctgg 1198
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 853 ttgcagctggttcctatgttcatgtaataagtggcccggtgcatgaaaagcttactctgg 794
Query: 1199 aggagtttttagaaaggcctcccttggattccaaaagcattctctcaaccgttaaaattc 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 793 aggagtttttagaaaggcctcccttggattccaaaagcattctctcaactgttaaaattc 734
Query: 1259 caaattttgaagtaattaaggacaaatctcgtgaaagaaattgtaatctgatatttgaaa 1318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 733 caaattttgaagtaattaaggacaaatctcgtgaaagaaattgtaatctgatatttgaaa 674
Query: 1319 cctatcgagctgcaccaaggcccttaggaagtgctttagcttatctgaatgctgctttct 1378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 673 cctatcgagctgcaccaaggcccttaggaagtgctttagcttatctgaatgctgctttct 614
Query: 1379 tggctcaagtttccagctcaaaatcatctggtggaattgtgttgaatagctgtcagttgg 1438
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 613 tggctcaagtttccagctc-aaatcatctggtggaattgtgttgaatagctgtcagttgg 555
Query: 1439 cttttggtgcttttcggaaccaaacatgccattagggcaaggaaagttgaagaattttta 1498
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 554 cttttggtgc-tttcggaaccaaacatgccattagggcaaggaaagttgaagaattttta 496
Query: 1499 actggaaagctgttaaccattggtgttatatatgaagctattaaattagttagagctaca 1558
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 495 actggaaagctgttaaccattggtgttatatatgaagctattaaattagttagagctaca 436
Query: 1559 gtggtacctgaacatgggactccaaatcctgaatataggtcaagcttggctgtcagtttt 1618
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 435 gtggtacctgaacatgggactccaaatcctgaatataggtcaagcttggctgtcagtttt 376
Query: 1619 ctttttgactttcttggccctttaagaaatatcggctctaagggtttgctgaatggacac 1678
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 375 ctttttgactttcttggccctttaagaaatatcggctctaagggtttgctgaatggacac 316
Query: 1679 gatgatatttcaatgtctgaggaaattaaattaaaggagaaccatgataagctggatcat 1738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 315 gatgatatttcaatgtctgaggaaattaaattaaaggagaaccatgataagctggatcat 256
Query: 1739 gttaaatccccctctttgctgttatcatccaagcaggtgatccaattaaacaagcagtat 1798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 255 gttaaatccccctctttgctgttatcatccaagcaggtgatccaatt-aacaagcagtat 197
Query: 1799 gatcctgttgggaagccgattgcaaaaactggagcttttcttcaagcttctg 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 196 gatcctgttgggaagccgattgcaaaaactggagc-tttcttcaagcttctg 146
Score = 204 bits (103), Expect = 1e-51
Identities = 103/103 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1849 tgtctacatggagcattcatttatagcacaaagccttttgcaaaggtaaagagtataaag 1908
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 103 tgtctacatggagcattcatttatagcacaaagccttttgcaaaggtaaagagtataaag 44
Query: 1909 ttcaattcagaatctcttccagatggagtcactgcagtcattt 1951
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 43 ttcaattcagaatctcttccagatggagtcactgcagtcattt 1
>KJC_c02339
Length = 1002
Score = 1655 bits (835), Expect = 0.0
Identities = 905/923 (98%), Gaps = 4/923 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 atggaagaagaaagagaaactggaaataagaacagtttggtttttgctgttaatggaaag 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 919 atggaagaagaaagagaaactggaaataagaacagtttggtttttgctgttaatggaaag 860
Query: 61 agatttgagctttctagtgttgatccttctacgactttgcttgaattcctgcgtacacag 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 859 agatttgagctttctagtgttgatccttctacgactttgcttgaattcctgcgtacacag 800
Query: 121 actagtttcaaaagcgtcaagctcggttgcggtgaaggtggttgtggtgcttgtgtcgtt 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 799 actagtttcaaaagcgtcaagctcggttgcggtgaaggtggttgtggtgcttgtgtcgtt 740
Query: 181 ttgctctccaagtacaatccagtgcttgaccaagttgaggatcttacagtgagctcatgt 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 739 ttgctctccaagtacaatccagtgcttgaccaagttgaggatcttacggtgagctcatgt 680
Query: 241 cttacgctcctctgcagcataaatggagcctcaatcacaacaagtgaaggccttggtaat 300
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 679 cttacgctcctctgcagcataaatagagcctcaatcacaacaagtgaaggccttggtaat 620
Query: 301 agtaaagatggtttccactcaattcaccaaaggttcagtggattccatgcttcccaatgt 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 619 agtaaagatggtttccactcaattcaccaaaggttcagtggattccatgcttcccaatgt 560
Query: 361 ggcttttgtactcctggaatgtgcatgtccttgtttggagcccttgttaaagctgaaaaa 420
||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 559 ggc-tttgtact-ctggaatgtgcatgtccttctttggagcccttgttaaagctgaaaaa 502
Query: 421 actgatagaccagagccttctccgggtttctccaagcttacagtcaatgaagctgaaaaa 480
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct: 501 actgatagaccagagccctctccggggttctccaagcttacagtcaatgaagctg-aaaa 443
Query: 481 gctattgcaggaaatctgtgtagatgtaccggatatcgacccattgctgatgcatgtaaa 540
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 442 gctattgcaggaaatctgtgtcgatgtaccggatatcgacccattgctgatgcatgtaaa 383
Query: 541 agttttgcagcagatgttgatatggaggacttgggacttaattctttttggaaaaaggga 600
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 382 agttttgcagctgatgttgatatggaggacttgggacttaattctttttggaaaaaggga 323
Query: 601 gagccgcaggaagtaaagataggtaggatgcctccatataatcaagagatttgcactttc 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 322 gagccgcaggaagtaaagataggtaggatgcctccatataatcaagagatttgcactttc 263
Query: 661 cctgaatttttaaaaacagaagttaaatttcccctgcttttggattctaaaagatgctct 720
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 262 cctgaattttt-aaaacagaagttaaatttcccctgcttttggattctaaaagatgctct 204
Query: 721 tggcatcaaccttgtagctttgaggagctccaaagcttattaaaaacctttggcaatggc 780
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 203 tggcaccaaccttgtagctttgaggagctccaaagcttattaaaaacctttggcaatggc 144
Query: 781 cctgaattccggatgaaactagtggttggaaatacgggtacgggttattacaaggaagta 840
|| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 143 cccgaattccagatgaaactagtggttgggaatacaggtacgggttattacaaggaagta 84
Query: 841 gaacactgtgataaatatattgatctcaggtatattcctgagctctcaaggattaggagg 900
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 83 gaacactatgataaatatattgatctcaggtatattcctgagctctcaacgattaggagg 24
Query: 901 gatgggactggtattgaaattgg 923
|||||||||||||||||||||||
Sbjct: 23 gatgggactggtattgaaattgg 1
>KJC_c05700
Length = 608
Score = 1148 bits (579), Expect = 0.0
Identities = 607/611 (99%), Gaps = 4/611 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2815 ggagacgtgcaaggatcatatatcgcagaagctataattgaaaatgtagcggctttt-ct 2873
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 1 ggagacgtgcaaggatcatatatcgcagaagctataattgaaaatgtagcggctttttct 60
Query: 2874 ttttatcagttcggattctgttagagccataaatctccatacgtataatacccttaagtt 2933
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 ttttatcagttcggattctgttagagccataaatctccatacgtataatacccttaagtt 120
Query: 2934 atactatgatcttagcgcaggagaacctctagaatatactttaacttcaatatggaataa 2993
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 atactatgatcttagcgcaggagaacctctagaatatactttaacttcaatatggaataa 180
Query: 2994 gttagccacaagttcgagctttgaacaaaggactgagctgataaaagagtttaataggtc 3053
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 gttagccacaagttcgagctttgaacaaaggactgagctgataaaagagtttaataggtc 240
Query: 3054 aaatgtgtggaagaaaagaggtatttctcgaatacctgtagtgtatgaagtcggaacaag 3113
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 aaatgtgtggaagaaaagaggtatttctcgaatacctgtagtgtatgaagtcggaacaag 300
Query: 3114 accaactgctggaaaagtgagcattctaaacgatgggtctattgttgttgaagttggagg 3173
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 accaactgctggaaaagtgagcattctaaacgatgggtctattgttgttgaagttggagg 360
Query: 3174 acttgaaattggccagggcctctggacaaaggtaaaacagatggttgcttttgctcttag 3233
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 acttg-aattggccagggcctctggacaaaggtaaaacagatggttgcttttgctcttag 419
Query: 3234 ttccatcaaatgtgatggagcaggagacctcttggataaagttcgagtcatacaatctga 3293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 420 ttccatcaaatgtgatggagcaggagacctcttggataaagttcgagtcatacaatctga 479
Query: 3294 taccttgagtttaactcaaggggggttgactggtggcagcactacatctgagtcgagctg 3353
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 480 taccttgagtttaactcaaggggggttgactggtggcagcactacatctgagtcgagctg 539
Query: 3354 tgaagcagttagactttgctgtaatgttctggttgagagactgatggctgtgaaggaaag 3413
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 540 tg-agcagttagactttgctgtaatgttctggttgagagactgatggctgtgaagg-aag 597
Query: 3414 gttgctggcgc 3424
|||||||||||
Sbjct: 598 gttgctggcgc 608
>KJC_c06062
Length = 578
Score = 1146 bits (578), Expect = 0.0
Identities = 578/578 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1998 tgcatttggtcctgaaccattgtttgctgaggagcttactcagtatgctggagagcctct 2057
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 578 tgcatttggtcctgaaccattgtttgctgaggagcttactcagtatgctggagagcctct 519
Query: 2058 ggcattcgtgcttgcagatacacaaagaaatgcagatatagcatcgaagctcgctgtggt 2117
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 518 ggcattcgtgcttgcagatacacaaagaaatgcagatatagcatcgaagctcgctgtggt 459
Query: 2118 agattatgacctggaaaatctacagccacccattctgactgtagaagaggctattgagag 2177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 458 agattatgacctggaaaatctacagccacccattctgactgtagaagaggctattgagag 399
Query: 2178 atctagcatttttgaggtgccgccaattatctaccccaaacaaattggtgatgtatctaa 2237
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 398 atctagcatttttgaggtgccgccaattatctaccccaaacaaattggtgatgtatctaa 339
Query: 2238 gggaatggctgaagcagataacaagattctatctgccgagataaaacttggttcacaata 2297
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 338 gggaatggctgaagcagataacaagattctatctgccgagataaaacttggttcacaata 279
Query: 2298 ttacttctatatggagaatcaaactgctcttgctgtccctgatgaagacaattgcatggt 2357
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 278 ttacttctatatggagaatcaaactgctcttgctgtccctgatgaagacaattgcatggt 219
Query: 2358 ggtttacagttctaatcaagcccccgaatatgcacacactgcaattgcaaaatgtctcgg 2417
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 218 ggtttacagttctaatcaagcccccgaatatgcacacactgcaattgcaaaatgtctcgg 159
Query: 2418 tgttcctgagcacaatgtgcgtgtgcttacaaggagggttggaggaggttttggtggaaa 2477
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 158 tgttcctgagcacaatgtgcgtgtgcttacaaggagggttggaggaggttttggtggaaa 99
Query: 2478 gggcttaaaagccatgcctgttgctacagtttgtgcacttgcagcgcacaagttacaacg 2537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 98 gggcttaaaagccatgcctgttgctacagtttgtgcacttgcagcgcacaagttacaacg 39
Query: 2538 tcctgtgaggctatatctcaatcgccacactgatatga 2575
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 38 tcctgtgaggctatatctcaatcgccacactgatatga 1