Jatropha Genome Database
- JcCA0004811.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0004811.10 + phase: 2 /partial
(2731 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c11653 1558 0.0
>KJC_c11653
Length = 801
Score = 1558 bits (786), Expect = 0.0
Identities = 800/802 (99%), Gaps = 2/802 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 989 ggtcgaatgaaagaaaaaagtta-tgatccttatcagaatgtatcaactcttcattctaa 1047
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 801 ggtcgaatgaa-gaaaaaagttaatgatccttatcagaatgtatcaactcttcattctaa 743
Query: 1048 ctgggtgtcgaaagcaagtgcaaggcagcgcgaaggacgtgcaggccgctgtcagcctgg 1107
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 742 ctgggtgtcgaaagcaagtgcaaggcagcgcgaaggacgtgcaggccgctgtcagcctgg 683
Query: 1108 gatatgctatcatctttattcaaaactccgagcagcttctttgccagatttccaagttcc 1167
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 682 gatatgctatcatctttattcaaaactccgagcagcttctttgccagatttccaagttcc 623
Query: 1168 tgaaattaagagaatgccaattgaggaactttgtttgcaagtgaagttacttgatcccaa 1227
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 622 tgaaattaagagaatgccaattgaggaactttgtttgcaagtgaagttacttgatcccaa 563
Query: 1228 ttacaagatagaagatttcttgcggaagactctggaccctccagttccagagaccattca 1287
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 562 ttacaagatagaagatttcttgcggaagactctggaccctccagttccagagaccattca 503
Query: 1288 taatgcaattactgttcttcaggatattggagctttatcattagacgaacaactgacaga 1347
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 502 taatgcaattactgttcttcaggatattggagctttatcattagacgaacaactgacaga 443
Query: 1348 actaggagagaagctaggctgcctacctgttcatccattgacaagcaagatgcttttctt 1407
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 442 actaggagagaagctaggctgcctacctgttcatccattgacaagcaagatgcttttctt 383
Query: 1408 tgcaatattgatgaattgccttgatccagctttgacattggcatgtgcctctgactatag 1467
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 382 tgcaatattgatgaattgccttgatccagctttgacattggcatgtgcctctgactatag 323
Query: 1468 agatccatttacccttcctgtgttgccaaatgaaaagaagagagctattgcagctaaatt 1527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 322 agatccatttacccttcctgtgttgccaaatgaaaagaagagagctattgcagctaaatt 263
Query: 1528 tgagattgcttcactgtatggtggctacagtgatcaactagcagttatagcagcctttga 1587
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 262 tgagattgcttcactgtatggtggctacagtgatcaactagcagttatagcagcctttga 203
Query: 1588 gtgttggaaaaatgctaaagcaaggggtcaagaactgcagttttgttctcaatactttat 1647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 202 gtgttggaaaaatgctaaagcaaggggtcaagaactgcagttttgttctcaatactttat 143
Query: 1648 atctcctggtatcatgaatatgctggatggtatgcgtaaacagcttcaggcagaactaat 1707
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 142 atctcctggtatcatgaatatgctggatggtatgcgtaaacagcttcaggcagaactaat 83
Query: 1708 ccgtaatgggttcattgaggatggtgtctcatgttgtaatctgaatgcgcatgaccaagg 1767
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 82 ccgtaatgggttcattgaggatggtgtctcatgttgtaatctgaatgcgcatgaccaagg 23
Query: 1768 aatactccattctgtccttgtt 1789
||||||||||||||||||||||
Sbjct: 22 aatactccattctgtccttgtt 1