Jatropha Genome Database
- JcCA0000831.30
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0000831.30 + phase: 0
(1509 letters)
Database: jatropha cDNA leaf/callus assembly
(MIRA3.0.5:c=standard,s=non-debris singleton) 2010/06/09
21,225 sequences; 12,776,988 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
KJC_c00221 2878 0.0
KJC_s15593 906 0.0
KJC_s17006 468 e-131
>KJC_c00221
Length = 2305
Score = 2878 bits (1452), Expect = 0.0
Identities = 1466/1473 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgagaatcaatcctactacttctggtccgggagttcccgcgcttgnnnnnnngaacctg 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 321 atgagaatcaatcctactacttctggtccgggagttcccgcgcttgaaaaaaagaacctg 380
Query: 61 gggcgtatcgctcaaatcattgggccagtactagatgtagctttttccccgggcaagatg 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 381 gggcgtatcgctcaaatcattgggccagtactagatgtagctttttccccgggcaagatg 440
Query: 121 cctaatatttacaacgctctggtagttaagggtcgagatactgtcgggcaagaaattaat 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 441 cctaatatttacaacgctctggtagttaagggtcgagatactgtcgggcaagaaattaat 500
Query: 181 gtgacttgtgaagtacaacaattattaggaaataatcgagttcgggctgtagctatgagt 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 501 gtgacttgtgaagtacaacaattattaggaaataatcgagttcgggctgtagctatgagt 560
Query: 241 gctacagatggtctaacgcgaggaatggaagtgattgacacaggagctcctctaagtgtt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 561 gctacagatggtctaacgcgaggaatggaagtgattgacacaggagctcctctaagtgtt 620
Query: 301 ccagttggtggggcgactctaggacgaattttcaacgtgcttggagaacctgttgatgat 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 621 ccagttggtggggcgactctaggacgaattttcaacgtgcttggagaacctgttgatgat 680
Query: 361 ttaggtcctgtagatactcgcgcaacatcacctattcatagatctgcacctgcttttata 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 681 ttaggtcctgtagatactcgcgcaacatcacctattcatagatctgcacctgcttttata 740
Query: 421 caattagatacaaaattatctatttttgaaacaggaattaaagtagtagatcttttagcc 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 741 caattagatacaaaattatctatttttgaaacaggaattaaagtagtagatcttttagcc 800
Query: 481 ccttatcgccgtggaggaaaaatcggactattcgggggagctggagtgggtaaaacagta 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 801 ccttatcgccgtggaggaaaaatcggactattcgggggagctggagtgggtaaaacagta 860
Query: 541 cttattatggaattaatcaacaacatcgcgaaagctcatggaggcgtatccgtatttggc 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 861 cttattatggaattaatcaacaacatcgcgaaagctcatggaggcgtatccgtatttggc 920
Query: 601 ggagtaggcgaacgaactcgtgaaggaaatgatctttacatggaaatgaaagaatctgga 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 921 ggagtaggcgaacgaactcgtgaaggaaatgatctttacatggaaatgaaagaatctgga 980
Query: 661 gtaattaatcaagaaaatattgcagaatcaaaagtggctctagtctatggtcagatgaac 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 981 gtaattaatcaagaaaatattgcagaatcaaaagtggctctagtctatggtcagatgaac 1040
Query: 721 gaaccgccgggagctcgtatgagagttggtttgactgccctaactatggcggaatatttc 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1041 gaaccgccgggagctcgtatgagagttggtttgactgccctaactatggcggaatatttc 1100
Query: 781 cgagatgttaatgaacaagacgtacttctatttatcgacaatatcttccgtttcgtccaa 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1101 cgagatgttaatgaacaagacgtacttctatttatcgacaatatcttccgtttcgtccaa 1160
Query: 841 gcaggatccgaagtatccgccttattgggtagaatgccttctgctgtgggttatcaacct 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1161 gcaggatccgaagtatccgccttattgggtagaatgccttctgctgtgggttatcaacct 1220
Query: 901 acccttagtaccgaaatgggttctttacaagaaagaattacttccaccaaagaggggtcc 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1221 acccttagtaccgaaatgggttctttacaagaaagaattacttccaccaaagaggggtcc 1280
Query: 961 ataacttctattcaagcagtttatgtacctgcggacgatttgactgaccctgctcctgcc 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1281 ataacttctattcaagcagtttatgtacctgcggacgatttgactgaccctgctcctgcc 1340
Query: 1021 acgacatttgcacatttagatgcgactactgtactatcaagaggattagctgctaaaggt 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1341 acgacatttgcacatttagatgcgactactgtactatcaagaggattagctgctaaaggt 1400
Query: 1081 atctatccagcagtagatcctttagattcaacatcaactatgctccaacctcagatcgtt 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1401 atctatccagcagtagatcctttagattcaacatcaactatgctccaacctcagatcgtt 1460
Query: 1141 ggtgaggaacattatgaaactgcgcaaagagttaagcaaactttacaacgttacaaagaa 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1461 ggtgaggaacattatgaaactgcgcaaagagttaagcaaactttacaacgttacaaagaa 1520
Query: 1201 cttcaggacattatagctatccttgggctggacgaattatccgaagaggatcgtttaact 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1521 cttcaggacattatagctatccttgggctggacgaattatccgaagaggatcgtttaact 1580
Query: 1261 gtagcaagagcacgaaaaattgagcgtttcttatcacaaccctttttcgtagcagaagta 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1581 gtagcaagagcacgaaaaattgagcgtttcttatcacaaccctttttcgtagcagaagta 1640
Query: 1321 tttaccggttctccgggtaaatatgtcggtctagcagaaactattagagggtttaaattg 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1641 tttaccggttctccgggtaaatatgtcggtctagcagaaactattagagggtttaaattg 1700
Query: 1381 atcctttccggagaattagatagtctccctgaacaggccttttatttggtaggtaatatt 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1701 atcctttccggagaattagatagtctccctgaacaggccttttatttggtaggtaatatt 1760
Query: 1441 gatgaagctactgcgaaggctacaaacttagaa 1473
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1761 gatgaagctactgcgaaggctacaaacttagaa 1793
>KJC_s15593
Length = 535
Score = 906 bits (457), Expect = 0.0
Identities = 507/522 (97%), Gaps = 7/522 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgagaatcaatcctactacttctggtccgggagttcccgcgcttgnnnnnnngaacctg 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 13 atgagaatcaatcctactacttctggtccgggagttcccgcgcttgaaaaaaagaacctg 72
Query: 61 gggcgtatcgctc----aaatcattgggccagtactagatgtagctttttccccgggcaa 116
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 73 gggcgtatcgctcgtttaaatcattgggccagtactagatgtagctttttccccgggcaa 132
Query: 117 gatgcctaatatttacaacgctctggtagttaagggtcgagatactgtcgggcaagaaat 176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 133 gatgcctaatatttacaacgctctggtagttaagggtcgagatactgtcgggcaagaaat 192
Query: 177 taatgtgacttgtgaagtacaacaattattaggaaataatcgagttcgggctgtagctat 236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 193 taatgtgacttgtgaagtacaacaattattaggaaataatcgagttcgggctgtagctat 252
Query: 237 gagtgctacagatggtctaacgcgaggaatggaagtgattgacacaggagctcctctaag 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 253 gagtgctacagatggtctaacgcgaggaatggaagtgattgacacaggagctcctctaag 312
Query: 297 tgttccagttggtggggcgactc-taggacgaattttcaacgtgcttggagaacctgttg 355
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 313 tgttccagttggtggggcgactcgtaggacgaattttcaacgtgcttggagaacctgttg 372
Query: 356 atgatttaggtcctgtagatactcgcgcaacatcacctattcatagatctgcacctgctt 415
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
Sbjct: 373 atgatttaggtcctgtagatactcgcgcaacatcacctattcat-gatctgcacctgc-t 430
Query: 416 ttatacaattagatacaaaattatctatttttgaaacaggaattaaagtagtagatcttt 475
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 431 ttatacaattagatanaaaattatctatttttgaaacaggaattaaagtagtagatcttt 490
Query: 476 tagccccttatcgccgtggaggaaaaatcggactattcgggg 517
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 491 tagccccttatcgccgtggaggaaaaatcggactattcgggg 532
>KJC_s17006
Length = 412
Score = 468 bits (236), Expect = e-131
Identities = 257/265 (96%), Gaps = 1/265 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgagaatcaatcctactacttctggtccgggagttcccgcgcttgnnnnnnngaacctg 60
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct: 149 atgagaatcaatcctactacttctggtccgggagttcccgcgcttgaaaaaaagaacctg 208
Query: 61 gggcgtatcgctcaaatcattgggccagtactagatgtagctttttccccgggcaagatg 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 209 gggcgtatcgctcaaatcattgggccagtactagatgtagctttttccccgggcaagatg 268
Query: 121 cctaatatttacaacgctctggtagttaagggtcgagatactgtcgggcaagaaattaat 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 269 cctaatatttacaacgctctggtagttaagggtcgagatactgtcgggcaagaaattaat 328
Query: 181 gtgacttgtgaagtacaacaattattaggaaataatcgagttcgggctgtagctatgagt 240
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 329 gtgacttgtgaagtacaac-attattaggaaataatcgagttcgggctgtagctatgagt 387
Query: 241 gctacagatggtctaacgcgaggaa 265
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 388 gctacagatggtctaacgcgaggaa 412