Jatropha Genome Database

JcCB0703531.10
Show Alignment:  
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= JcCB0703531.10 - phase: 0 /partial
         (786 letters)

Database: JAT_13201ests 
           13,201 sequences; 6,040,684 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gi|268522242|gb|FM893875.1|FM893875 FM893875 Jatropha curcas emb...  1090   0.0  

>gi|268522242|gb|FM893875.1|FM893875 FM893875 Jatropha curcas embryo
           56-70 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcaeb0_004810,
           mRNA sequence
          Length = 558

 Score = 1090 bits (550), Expect = 0.0
 Identities = 553/554 (99%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 176 cttgggatcagtcaaacccatcaacagtgtctcaaatgcctcagcaaatgactggatatg 235
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5   cttgggatcagtcaaacccatcaacagtgtctcaaatgcctcagcaaatgactggatatg 64

                                                                       
Query: 236 gttactatggacaaccaccccaaatgggatctgctcctagctataactacaatcagaaga 295
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 65  gttactatggacaaccaccccaaatgggatctgctcctagctataactacaatcagaaga 124

                                                                       
Query: 296 ctcatgttacaagcaacacttacgatcacagctacagtcagcaggcaccaagttatgggt 355
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 125 ctcatgttacaagcaacacttacgatcacagctacagtcagcaggcaccaagttatgggt 184

                                                                       
Query: 356 cagctgctgtgtcatctcaaccagatggggcaattccttcccaatccactcaagcagccc 415
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 185 cagctgctgtgtcatctcaaccagatggggcaattccttcccaatccactcaagcagccc 244

                                                                       
Query: 416 ctgcatacccacctccttataatcaaccagtgaccaaccctcaaacatactggactcaac 475
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 245 ctgcatacccacctccttataatcaaccagtgaccaaccctcaaacatactggactcaac 304

                                                                       
Query: 476 aaccaccccaaacaggatatgatcaaacagggtactcccaaattgcttatggaggtctac 535
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 305 aaccaccccaaacaggatatgatcaaacagggtactcccaaattgcttatggaggtctac 364

                                                                       
Query: 536 aaccagtccagttcatgccctcatcaactcagccagtttatggaccaggtggttatcctc 595
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 365 aaccagtccagttcatgccctcatcaactcagccagtttatggaccaggtggttatcctc 424

                                                                       
Query: 596 ttgagccatctcctgcaactgcaaattctgttcaggggacacatcctcttacttacgggc 655
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 425 ttgagccatctcctgcaactgcaaattctgttcaggagacacatcctcttacttacgggc 484

                                                                       
Query: 656 aggcacaggtggagacacaaccccagtcacagcagccaaacaatggccattcacagtcat 715
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 485 aggcacaggtggagacacaaccccagtcacagcagccaaacaatggccattcacagtcat 544

                         
Query: 716 tggcttatggtgct 729
           ||||||||||||||
Sbjct: 545 tggcttatggtgct 558