Jatropha Genome Database
- JcCB0582061.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0582061.10 + phase: 1 /partial
(620 letters)
Database: JAT_13201ests
13,201 sequences; 6,040,684 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gi|268524920|gb|FM895618.1|FM895618 FM895618 Jatropha curcas emb... 1162 0.0
gi|268524753|gb|FM895451.1|FM895451 FM895451 Jatropha curcas emb... 757 0.0
gi|268521798|gb|FM894394.1|FM894394 FM894394 Jatropha curcas emb... 729 0.0
gi|268523147|gb|FM894730.1|FM894730 FM894730 Jatropha curcas emb... 660 0.0
gi|268524071|gb|FM894750.1|FM894750 FM894750 Jatropha curcas emb... 478 e-135
gi|268522447|gb|FM894592.1|FM894592 FM894592 Jatropha curcas emb... 454 e-128
gi|268523759|gb|FM890445.1|FM890445 FM890445 Jatropha curcas emb... 430 e-121
gi|237679839|gb|GO247144.1|GO247144 JcrME_RL0688 Expressed seque... 82 9e-16
>gi|268524920|gb|FM895618.1|FM895618 FM895618 Jatropha curcas embryo
71-95 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcpga0_002569,
mRNA sequence
Length = 613
Score = 1162 bits (586), Expect = 0.0
Identities = 593/594 (99%), Gaps = 1/594 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 28 agaatgcgaatgggttggctaggtatgccatcatctgccaggagaatggcttggtaccaa 87
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 613 agaatgcgaatgggttggctaggtatgccatcatctgccaggagaatggcttggtaccaa 554
Query: 88 ttgtggagcctgagattttggttgatggacctcatgacattaagaagtgcgctgatgtaa 147
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 553 ttgtggagcctgagattttggttgatggacctcatgacattaagaagtgcgctgatgtaa 494
Query: 148 ctgagcgggttcttgctgcttgctacaaggctctcaatgaccaccatgttttgcttgagg 207
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 493 ctgagcgggttcttgctgcttgctacaaggctctcaatgaccaccatgttttgcttgagg 434
Query: 208 gaactcttttgaaacccaacatggtgactccaggatcagaatccgccaaggttgcaccag 267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 433 gaactcttttgaaacccaacatggtgactccaggatcagaatccgccaaggttgcaccag 374
Query: 268 aggtgattgctgagtacacggtccgtgccctccaatgcactgtgcctgccgctgttcctg 327
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 373 aggtgattgctgagtacacggtccgtgccctccaatgcactgtgcctgccgctgttcctg 314
Query: 328 ctgttgtgttcttgtctggtgggcagagtgaggaggaagctaccgtcaacctgaatgcga 387
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 313 ctgttgtgttcttgtctggtgggcagagtgaggaggaagctaccgtcaacctgaatgcga 254
Query: 388 tgaacaagctcaagaccaagaagccatggtccctttccttctcatttggacgtgcacttc 447
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 253 tgaacaagctcaagaccaagaagccatggtccctttccttctcatttggacgtgcacttc 194
Query: 448 aacaaagtaccctcaaggcttgggcaggtaagccagagaatgtgcagaaggctcaagctg 507
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 193 aacaaagtaccctcaaggcttgggcaggtaagccagagaatgtgcagaaggctcaagctg 134
Query: 508 cattcctggtcagggctaaggccaactcagaggcaactcttggaacttac-cagggtaat 566
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 133 cattcctggtcagggctaaggccaactcagaggcaactcttggaacttacncagggtaat 74
Query: 567 gctactcttggtgagggtgcctcagagagtctccatgtcaaggactacaaatac 620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 73 gctactcttggtgagggtgcctcagagagtctccatgtcaaggactacaaatac 20
>gi|268524753|gb|FM895451.1|FM895451 FM895451 Jatropha curcas embryo
71-95 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcpga0_002373,
mRNA sequence
Length = 636
Score = 757 bits (382), Expect = 0.0
Identities = 382/382 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 239 aggatcagaatccgccaaggttgcaccagaggtgattgctgagtacacggtccgtgccct 298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 636 aggatcagaatccgccaaggttgcaccagaggtgattgctgagtacacggtccgtgccct 577
Query: 299 ccaatgcactgtgcctgccgctgttcctgctgttgtgttcttgtctggtgggcagagtga 358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 576 ccaatgcactgtgcctgccgctgttcctgctgttgtgttcttgtctggtgggcagagtga 517
Query: 359 ggaggaagctaccgtcaacctgaatgcgatgaacaagctcaagaccaagaagccatggtc 418
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 516 ggaggaagctaccgtcaacctgaatgcgatgaacaagctcaagaccaagaagccatggtc 457
Query: 419 cctttccttctcatttggacgtgcacttcaacaaagtaccctcaaggcttgggcaggtaa 478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 456 cctttccttctcatttggacgtgcacttcaacaaagtaccctcaaggcttgggcaggtaa 397
Query: 479 gccagagaatgtgcagaaggctcaagctgcattcctggtcagggctaaggccaactcaga 538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 396 gccagagaatgtgcagaaggctcaagctgcattcctggtcagggctaaggccaactcaga 337
Query: 539 ggcaactcttggaacttaccagggtaatgctactcttggtgagggtgcctcagagagtct 598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 336 ggcaactcttggaacttaccagggtaatgctactcttggtgagggtgcctcagagagtct 277
Query: 599 ccatgtcaaggactacaaatac 620
||||||||||||||||||||||
Sbjct: 276 ccatgtcaaggactacaaatac 255
>gi|268521798|gb|FM894394.1|FM894394 FM894394 Jatropha curcas embryo
71-95 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcpga0_004736,
mRNA sequence
Length = 633
Score = 729 bits (368), Expect = 0.0
Identities = 368/368 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 253 ccaaggttgcaccagaggtgattgctgagtacacggtccgtgccctccaatgcactgtgc 312
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 633 ccaaggttgcaccagaggtgattgctgagtacacggtccgtgccctccaatgcactgtgc 574
Query: 313 ctgccgctgttcctgctgttgtgttcttgtctggtgggcagagtgaggaggaagctaccg 372
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 573 ctgccgctgttcctgctgttgtgttcttgtctggtgggcagagtgaggaggaagctaccg 514
Query: 373 tcaacctgaatgcgatgaacaagctcaagaccaagaagccatggtccctttccttctcat 432
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 513 tcaacctgaatgcgatgaacaagctcaagaccaagaagccatggtccctttccttctcat 454
Query: 433 ttggacgtgcacttcaacaaagtaccctcaaggcttgggcaggtaagccagagaatgtgc 492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 453 ttggacgtgcacttcaacaaagtaccctcaaggcttgggcaggtaagccagagaatgtgc 394
Query: 493 agaaggctcaagctgcattcctggtcagggctaaggccaactcagaggcaactcttggaa 552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 393 agaaggctcaagctgcattcctggtcagggctaaggccaactcagaggcaactcttggaa 334
Query: 553 cttaccagggtaatgctactcttggtgagggtgcctcagagagtctccatgtcaaggact 612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 333 cttaccagggtaatgctactcttggtgagggtgcctcagagagtctccatgtcaaggact 274
Query: 613 acaaatac 620
||||||||
Sbjct: 273 acaaatac 266
>gi|268523147|gb|FM894730.1|FM894730 FM894730 Jatropha curcas embryo
71-95 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcpga0_000577,
mRNA sequence
Length = 598
Score = 660 bits (333), Expect = 0.0
Identities = 333/333 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 288 gtccgtgccctccaatgcactgtgcctgccgctgttcctgctgttgtgttcttgtctggt 347
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 598 gtccgtgccctccaatgcactgtgcctgccgctgttcctgctgttgtgttcttgtctggt 539
Query: 348 gggcagagtgaggaggaagctaccgtcaacctgaatgcgatgaacaagctcaagaccaag 407
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 538 gggcagagtgaggaggaagctaccgtcaacctgaatgcgatgaacaagctcaagaccaag 479
Query: 408 aagccatggtccctttccttctcatttggacgtgcacttcaacaaagtaccctcaaggct 467
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 478 aagccatggtccctttccttctcatttggacgtgcacttcaacaaagtaccctcaaggct 419
Query: 468 tgggcaggtaagccagagaatgtgcagaaggctcaagctgcattcctggtcagggctaag 527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 418 tgggcaggtaagccagagaatgtgcagaaggctcaagctgcattcctggtcagggctaag 359
Query: 528 gccaactcagaggcaactcttggaacttaccagggtaatgctactcttggtgagggtgcc 587
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 358 gccaactcagaggcaactcttggaacttaccagggtaatgctactcttggtgagggtgcc 299
Query: 588 tcagagagtctccatgtcaaggactacaaatac 620
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 298 tcagagagtctccatgtcaaggactacaaatac 266
>gi|268524071|gb|FM894750.1|FM894750 FM894750 Jatropha curcas embryo
71-95 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcpga0_000616,
mRNA sequence
Length = 514
Score = 478 bits (241), Expect = e-135
Identities = 247/249 (99%)
Strand = Plus / Minus
Query: 372 gtcaacctgaatgcgatgaacaagctcaagaccaagaagccatggtccctttccttctca 431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 514 gtcaacctgaatgcgatgaacaagctcaagaccaagaagccatggtccctttccttctca 455
Query: 432 tttggacgtgcacttcaacaaagtaccctcaaggcttgggcaggtaagccagagaatgtg 491
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 454 tttgtacgtgcacttcaacaaagtaccctcaaggcttgggcaggtaagccagagaatgtg 395
Query: 492 cagaaggctcaagctgcattcctggtcagggctaaggccaactcagaggcaactcttgga 551
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 394 cagaaggctcaagctgcattcctggtcagggctaaggccaactcagaggcaactcttggt 335
Query: 552 acttaccagggtaatgctactcttggtgagggtgcctcagagagtctccatgtcaaggac 611
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 334 acttaccagggtaatgctactcttggtgagggtgcctcagagagtctccatgtcaaggac 275
Query: 612 tacaaatac 620
|||||||||
Sbjct: 274 tacaaatac 266
>gi|268522447|gb|FM894592.1|FM894592 FM894592 Jatropha curcas embryo
71-95 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcpga0_000385,
mRNA sequence
Length = 486
Score = 454 bits (229), Expect = e-128
Identities = 229/229 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 392 caagctcaagaccaagaagccatggtccctttccttctcatttggacgtgcacttcaaca 451
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 486 caagctcaagaccaagaagccatggtccctttccttctcatttggacgtgcacttcaaca 427
Query: 452 aagtaccctcaaggcttgggcaggtaagccagagaatgtgcagaaggctcaagctgcatt 511
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 426 aagtaccctcaaggcttgggcaggtaagccagagaatgtgcagaaggctcaagctgcatt 367
Query: 512 cctggtcagggctaaggccaactcagaggcaactcttggaacttaccagggtaatgctac 571
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 366 cctggtcagggctaaggccaactcagaggcaactcttggaacttaccagggtaatgctac 307
Query: 572 tcttggtgagggtgcctcagagagtctccatgtcaaggactacaaatac 620
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 306 tcttggtgagggtgcctcagagagtctccatgtcaaggactacaaatac 258
>gi|268523759|gb|FM890445.1|FM890445 FM890445 Jatropha curcas embryo
56-70 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcaeb0_000110,
mRNA sequence
Length = 467
Score = 430 bits (217), Expect = e-121
Identities = 217/217 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 404 caagaagccatggtccctttccttctcatttggacgtgcacttcaacaaagtaccctcaa 463
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 467 caagaagccatggtccctttccttctcatttggacgtgcacttcaacaaagtaccctcaa 408
Query: 464 ggcttgggcaggtaagccagagaatgtgcagaaggctcaagctgcattcctggtcagggc 523
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 407 ggcttgggcaggtaagccagagaatgtgcagaaggctcaagctgcattcctggtcagggc 348
Query: 524 taaggccaactcagaggcaactcttggaacttaccagggtaatgctactcttggtgaggg 583
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 347 taaggccaactcagaggcaactcttggaacttaccagggtaatgctactcttggtgaggg 288
Query: 584 tgcctcagagagtctccatgtcaaggactacaaatac 620
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 287 tgcctcagagagtctccatgtcaaggactacaaatac 251
>gi|237679839|gb|GO247144.1|GO247144 JcrME_RL0688 Expressed sequence
tags from Jatropha curcas root cDNA library Jatropha
curcas cDNA, mRNA sequence
Length = 654
Score = 81.8 bits (41), Expect = 9e-16
Identities = 62/65 (95%), Gaps = 3/65 (4%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgaaccatctcagctttccattaatgagaatgcgaatgggttggctaggtatgccatca 60
||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 518 atgaaccatctcagctttc-atta-tgaga-tgcgaatgggttggctaggtatgccatca 574
Query: 61 tctgc 65
|||||
Sbjct: 575 tctgc 579