Jatropha Genome Database
- JcCB0510081.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0510081.10 - phase: 0
(357 letters)
Database: JAT_13201ests
13,201 sequences; 6,040,684 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
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gi|268516713|gb|FM890420.1|FM890420 FM890420 Jatropha curcas emb... 446 e-126
gi|268517876|gb|FM893251.1|FM893251 FM893251 Jatropha curcas emb... 313 7e-86
gi|268524026|gb|FM890712.1|FM890712 FM890712 Jatropha curcas emb... 250 9e-67
>gi|268522476|gb|FM894621.1|FM894621 FM894621 Jatropha curcas embryo
71-95 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcpga0_000427,
mRNA sequence
Length = 549
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Identities = 342/342 (100%)
Strand = Plus / Minus
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>gi|268519814|gb|FM888281.1|FM888281 FM888281 Jatropha curcas embryo
35-55 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcfea0_001663,
mRNA sequence
Length = 509
Score = 666 bits (336), Expect = 0.0
Identities = 341/343 (99%)
Strand = Plus / Plus
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>gi|268524550|gb|FM895230.1|FM895230 FM895230 Jatropha curcas embryo
71-95 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcpga0_002019,
mRNA sequence
Length = 555
Score = 630 bits (318), Expect = 0.0
Identities = 321/322 (99%)
Strand = Plus / Minus
Query: 36 taagatcaagaattatggcatttggttgcgttaccaaagccgaactggctatcacaacat 95
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Query: 96 gtacaaggaatacagagataccactttgaatggtgctgtggaacagatgtacactgagat 155
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Query: 156 ggcttcccgacacagagtaaggttcccatgcattcagataatcaagactggcaccattcc 215
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Query: 216 agctaagctctgcaaaagagaaagcagcaagcaattccacaactcgaagatcaagttccc 275
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Query: 276 attggtgttcaagaaggttaggccaccaaccaggaagcttaggacaacatacaaggcatc 335
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Query: 336 caggcccaacctatttatgtaa 357
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>gi|237681002|gb|GO247638.1|GO247638 JcrME_RL1182 Expressed sequence
tags from Jatropha curcas root cDNA library Jatropha
curcas cDNA, mRNA sequence
Length = 676
Score = 563 bits (284), Expect = e-161
Identities = 337/348 (96%), Gaps = 5/348 (1%)
Strand = Plus / Plus
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Query: 75 ccgaactggctatcacaacatgtacaaggaatacagagataccactttgaatggtgctgt 134
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Query: 135 ggaacagatgtacactgagatggcttcccgacacagagtaaggttcccatgcattcagat 194
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Query: 195 aatcaagactggcaccattccagctaagctctgcaaaagagaaagcagcaagcaattcca 254
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Query: 255 caactcgaagatcaagttcccattggtgttcaagaaggttaggcc-accaacca-ggaag 312
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Query: 313 ctt-aggacaacata-caaggcatccaggcccaacct-atttatgtaa 357
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>gi|268519535|gb|FM888002.1|FM888002 FM888002 Jatropha curcas embryo
35-55 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcfea0_001309,
mRNA sequence
Length = 470
Score = 533 bits (269), Expect = e-152
Identities = 309/317 (97%), Gaps = 4/317 (1%)
Strand = Plus / Minus
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Query: 105 atacagagataccactttgaatggtgc-tgtggaacagatgtacactgagatggcttccc 163
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Query: 224 tctgcaaaagagaaagcagcaagcaattccacaactcgaagatcaagtt-cccattggtg 282
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Query: 283 ttcaagaaggttaggccaccaaccaggaa-gcttaggacaacatacaaggcatcca-ggc 340
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Query: 341 ccaacctatttatgtaa 357
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>gi|268516713|gb|FM890420.1|FM890420 FM890420 Jatropha curcas embryo
35-55 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcfea0_004275,
mRNA sequence
Length = 297
Score = 446 bits (225), Expect = e-126
Identities = 225/225 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 133 gtggaacagatgtacactgagatggcttcccgacacagagtaaggttcccatgcattcag 192
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Query: 193 ataatcaagactggcaccattccagctaagctctgcaaaagagaaagcagcaagcaattc 252
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Query: 253 cacaactcgaagatcaagttcccattggtgttcaagaaggttaggccaccaaccaggaag 312
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Query: 313 cttaggacaacatacaaggcatccaggcccaacctatttatgtaa 357
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Sbjct: 181 cttaggacaacatacaaggcatccaggcccaacctatttatgtaa 225
>gi|268517876|gb|FM893251.1|FM893251 FM893251 Jatropha curcas embryo
56-70 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcaeb2_004031,
mRNA sequence
Length = 629
Score = 313 bits (158), Expect = 7e-86
Identities = 158/158 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 200 agactggcaccattccagctaagctctgcaaaagagaaagcagcaagcaattccacaact 259
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Query: 260 cgaagatcaagttcccattggtgttcaagaaggttaggccaccaaccaggaagcttagga 319
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Query: 320 caacatacaaggcatccaggcccaacctatttatgtaa 357
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Sbjct: 124 caacatacaaggcatccaggcccaacctatttatgtaa 161
>gi|268524026|gb|FM890712.1|FM890712 FM890712 Jatropha curcas embryo
56-70 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcaeb0_000657,
mRNA sequence
Length = 378
Score = 250 bits (126), Expect = 9e-67
Identities = 142/146 (97%), Gaps = 1/146 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 15 gatctttgagaagaacccaactaagatcaagaattatggcatttggttgcgttaccaaag 74
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Query: 135 ggaacagatgtac-actgagatggct 159
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Sbjct: 349 ggaacagatgtacaactgagatggct 374