Jatropha Genome Database
- JcCB0456101.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0456101.10 + phase: 2 /partial
(796 letters)
Database: JAT_13201ests
13,201 sequences; 6,040,684 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gi|268521752|gb|FM894348.1|FM894348 FM894348 Jatropha curcas emb... 1213 0.0
gi|268525651|gb|FM890906.1|FM890906 FM890906 Jatropha curcas emb... 906 0.0
gi|268524326|gb|FM895006.1|FM895006 FM895006 Jatropha curcas emb... 894 0.0
gi|268517061|gb|FM892613.1|FM892613 FM892613 Jatropha curcas emb... 874 0.0
gi|268516977|gb|FM892529.1|FM892529 FM892529 Jatropha curcas emb... 492 e-139
>gi|268521752|gb|FM894348.1|FM894348 FM894348 Jatropha curcas embryo
71-95 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcpga0_004681,
mRNA sequence
Length = 642
Score = 1213 bits (612), Expect = 0.0
Identities = 612/612 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 gttattggggaaaatagcattggtcacaggtggagccaccggaataggagagagcattgt 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 31 gttattggggaaaatagcattggtcacaggtggagccaccggaataggagagagcattgt 90
Query: 61 ccgtctattccacaagcacggtgcaaaagtttgtatacttgatttgcaagacaaccttgg 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 91 ccgtctattccacaagcacggtgcaaaagtttgtatacttgatttgcaagacaaccttgg 150
Query: 121 tcagagtgtctgcgaatcccttggtggtgactcaaacacttgttatttccatggtaatgt 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 151 tcagagtgtctgcgaatcccttggtggtgactcaaacacttgttatttccatggtaatgt 210
Query: 181 cacaatagaagatgaggtccaacgtgccattgttttcaccgttgaaaaatttggaacact 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 211 cacaatagaagatgaggtccaacgtgccattgttttcaccgttgaaaaatttggaacact 270
Query: 241 ggatattctggtcaacaatgctgggttatcaggtccaccctgttcagacatacgaaatgt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 271 ggatattctggtcaacaatgctgggttatcaggtccaccctgttcagacatacgaaatgt 330
Query: 301 aaatttatcagatttcgaagaggtgtttgatgtaaatgtgaagggtgcatttattggaat 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 331 aaatttatcagatttcgaagaggtgtttgatgtaaatgtgaagggtgcatttattggaat 390
Query: 361 gaagcatgcagcacggattatgatcccgctaaataagggttcgattgtttctatctgcag 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 391 gaagcatgcagcacggattatgatcccgctaaataagggttcgattgtttctatctgcag 450
Query: 421 tgtcagcggtgtaataggaggcctgggtccccatgcatatacagggtccaagcatgctct 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 451 tgtcagcggtgtaataggaggcctgggtccccatgcatatacagggtccaagcatgctct 510
Query: 481 tttggggctgaccagaaatgttgcagctgaactaggaaaatatgggatacgtgtcaactg 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 511 tttggggctgaccagaaatgttgcagctgaactaggaaaatatgggatacgtgtcaactg 570
Query: 541 tgtttctccttatgcagttctaaccgacctggccttagctcacttgcccgaggacgagag 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 571 tgtttctccttatgcagttctaaccgacctggccttagctcacttgcccgaggacgagag 630
Query: 601 aacagaagatgc 612
||||||||||||
Sbjct: 631 aacagaagatgc 642
>gi|268525651|gb|FM890906.1|FM890906 FM890906 Jatropha curcas embryo
56-70 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcaeb0_000866,
mRNA sequence
Length = 596
Score = 906 bits (457), Expect = 0.0
Identities = 457/457 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 340 gaagggtgcatttattggaatgaagcatgcagcacggattatgatcccgctaaataaggg 399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 596 gaagggtgcatttattggaatgaagcatgcagcacggattatgatcccgctaaataaggg 537
Query: 400 ttcgattgtttctatctgcagtgtcagcggtgtaataggaggcctgggtccccatgcata 459
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 536 ttcgattgtttctatctgcagtgtcagcggtgtaataggaggcctgggtccccatgcata 477
Query: 460 tacagggtccaagcatgctcttttggggctgaccagaaatgttgcagctgaactaggaaa 519
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 476 tacagggtccaagcatgctcttttggggctgaccagaaatgttgcagctgaactaggaaa 417
Query: 520 atatgggatacgtgtcaactgtgtttctccttatgcagttctaaccgacctggccttagc 579
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 416 atatgggatacgtgtcaactgtgtttctccttatgcagttctaaccgacctggccttagc 357
Query: 580 tcacttgcccgaggacgagagaacagaagatgcaatggcaggtttccgagcctttgctgc 639
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 356 tcacttgcccgaggacgagagaacagaagatgcaatggcaggtttccgagcctttgctgc 297
Query: 640 aaagaatgctaatttgcaaggggtggaattgacgcctaatgatgtggctaatgttgtact 699
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 296 aaagaatgctaatttgcaaggggtggaattgacgcctaatgatgtggctaatgttgtact 237
Query: 700 cttcttggcaagtgaagaagcaaggtacattagtggggctaatctaatggtcgacggggg 759
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 236 cttcttggcaagtgaagaagcaaggtacattagtggggctaatctaatggtcgacggggg 177
Query: 760 cttcactgctgcaaatcactcttttaaggtcttcaga 796
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 176 cttcactgctgcaaatcactcttttaaggtcttcaga 140
>gi|268524326|gb|FM895006.1|FM895006 FM895006 Jatropha curcas embryo
71-95 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcpga0_001335,
mRNA sequence
Length = 538
Score = 894 bits (451), Expect = 0.0
Identities = 522/539 (96%), Gaps = 5/539 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 220 cgttgaaaaatttggaacactggatattctgg-tcaacaatgctgggtt-atcaggtcca 277
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||
Sbjct: 1 cgttgaaaaatttggaacactggatattctggatcaacaatgctgggtttatcag-tcca 59
Query: 278 ccctgttcagacatacgaaatgtaaatttatcagatttcgaagaggtgtttgatgtaaat 337
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 60 ccctgttcagacatacgaaatgtaaatttatcacatttcgaacaggtgtttgatgtaaat 119
Query: 338 gtgaagggtgcatttattggaatgaagcatgcagcacggattatgatcccgctaaataag 397
||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 120 gtgaatggtgcatttattggaatgaagcatgcaccacggattatgatcccgctaaataac 179
Query: 398 ggttcgattgtttctatctgcagtgtcagcggtgtaataggaggcctgggtccccatgca 457
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||
Sbjct: 180 ggttcgattgtttctatctgcagtgtcagcggtgtaatatgaggcctgagtccccatgca 239
Query: 458 tatacagggtccaagcatgctcttttggggctgaccagaaatgttgcagctgaactagga 517
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 240 tatacaggctccaagcatgctcttttggggctgaccagaaatgttgcagctgaactacga 299
Query: 518 aaatatgggatacgtgtcaactgtgtttctccttatgcagttctaaccgacctg-gcctt 576
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 300 aaatatgggatacgtgtcaactgtgtttctccttatgcagttctaaccgacctgtgcctt 359
Query: 577 agctcacttgcccgaggacga-gagaacagaagatgcaatggcaggtttccgagcctttg 635
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 360 agctcacttgcccgaggacgacgagaacagaagatgcaatggcaggtttccgagcctttg 419
Query: 636 ctgcaaagaatgctaatttgcaaggggtggaattgacgcctaatgatgtggctaatgttg 695
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 420 ctgcaaagaatgctaatttgccaggggtggaattgacgcctaatgatgtggctaatgttg 479
Query: 696 tactcttcttggcaagtgaagaagcaaggtacattagtggggctaatctaatggtcgac 754
|||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 480 tactcttcttggcaagtgaagaagcaaggtacataactggggctaatctaatggtcgac 538
>gi|268517061|gb|FM892613.1|FM892613 FM892613 Jatropha curcas embryo
56-70 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcaeb0_003216,
mRNA sequence
Length = 482
Score = 874 bits (441), Expect = 0.0
Identities = 441/441 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 gttattggggaaaatagcattggtcacaggtggagccaccggaataggagagagcattgt 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 42 gttattggggaaaatagcattggtcacaggtggagccaccggaataggagagagcattgt 101
Query: 61 ccgtctattccacaagcacggtgcaaaagtttgtatacttgatttgcaagacaaccttgg 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 102 ccgtctattccacaagcacggtgcaaaagtttgtatacttgatttgcaagacaaccttgg 161
Query: 121 tcagagtgtctgcgaatcccttggtggtgactcaaacacttgttatttccatggtaatgt 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 162 tcagagtgtctgcgaatcccttggtggtgactcaaacacttgttatttccatggtaatgt 221
Query: 181 cacaatagaagatgaggtccaacgtgccattgttttcaccgttgaaaaatttggaacact 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 222 cacaatagaagatgaggtccaacgtgccattgttttcaccgttgaaaaatttggaacact 281
Query: 241 ggatattctggtcaacaatgctgggttatcaggtccaccctgttcagacatacgaaatgt 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 282 ggatattctggtcaacaatgctgggttatcaggtccaccctgttcagacatacgaaatgt 341
Query: 301 aaatttatcagatttcgaagaggtgtttgatgtaaatgtgaagggtgcatttattggaat 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 342 aaatttatcagatttcgaagaggtgtttgatgtaaatgtgaagggtgcatttattggaat 401
Query: 361 gaagcatgcagcacggattatgatcccgctaaataagggttcgattgtttctatctgcag 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 402 gaagcatgcagcacggattatgatcccgctaaataagggttcgattgtttctatctgcag 461
Query: 421 tgtcagcggtgtaataggagg 441
|||||||||||||||||||||
Sbjct: 462 tgtcagcggtgtaataggagg 482
>gi|268516977|gb|FM892529.1|FM892529 FM892529 Jatropha curcas embryo
56-70 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcaeb0_003104,
mRNA sequence
Length = 277
Score = 492 bits (248), Expect = e-139
Identities = 272/276 (98%), Gaps = 3/276 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 440 ggcctgggtccccatgcatatacagggtccaagcatgctcttttggggctgaccagaaat 499
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5 ggcctgggtccccatgcatatacagg-tccaagcatgctcttttggggctgaccagaaat 63
Query: 500 gttgcagctgaactaggaaaatatgggatacgtgtcaactgtgtttctccttatgcagtt 559
|||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 64 gttgcagctgaactag-aaaatatgggatacgtgt-aactgtgtttctccttatgcagtt 121
Query: 560 ctaaccgacctggccttagctcacttgcccgaggacgagagaacagaagatgcaatggca 619
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 ctaaccgacctggccttaactcacttgcccgaggacgagagaacagaagatgcaatggca 181
Query: 620 ggtttccgagcctttgctgcaaagaatgctaatttgcaaggggtggaattgacgcctaat 679
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 ggtttccgagcctttgctgcaaagaatgctaatttgcaaggggtggaattgacgcctaat 241
Query: 680 gatgtggctaatgttgtactcttcttggcaagtgaa 715
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 gatgtggctaatgttgtactcttcttggcaagtgaa 277