Jatropha Genome Database
- JcCB0249431.10
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCB0249431.10 + phase: 0 /partial
(588 letters)
Database: JAT_13201ests
13,201 sequences; 6,040,684 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gi|268517110|gb|FM892662.1|FM892662 FM892662 Jatropha curcas emb... 1023 0.0
gi|268517829|gb|FM893204.1|FM893204 FM893204 Jatropha curcas emb... 777 0.0
gi|268523539|gb|FM893862.1|FM893862 FM893862 Jatropha curcas emb... 763 0.0
>gi|268517110|gb|FM892662.1|FM892662 FM892662 Jatropha curcas embryo
56-70 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcaeb0_003269,
mRNA sequence
Length = 584
Score = 1023 bits (516), Expect = 0.0
Identities = 546/557 (98%), Gaps = 1/557 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggctgctcatacaatccttgcagcctctccatcctctcatcctctcctctatccattc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 29 atggctgctcatacaatccttgcagcctctccatcctctcatcctctcctctatccattc 88
Query: 61 ccaaaccctatcctttcccactcttcacctctgcattcctcattccatggtgtttctctc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 89 ccaaaccctatcctttcccactcttcacctctgcattcctcattccatggtgtttctctc 148
Query: 121 aaacttcctcgtcaatcgctacctctttctcttaccaccgccgccgccccnnnnnnnccc 180
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 149 aaacttcctcgtcaatcgctacctctttctcttaccaccgccgccgccccaaaaaaaccc 208
Query: 181 cttgctgtcgttgctgctaccaaaaaggccgtcgctgtccttaagggtacctccaatgtt 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 209 cttgctgtcgttgctgctaccaaaaaggccgtcgctgtccttaagggtacctccaatgtt 268
Query: 241 gaaggcgttgtcactttgacccaggaagacgatggtcccacaacagtgaatgttcgtgtc 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 269 gaaggcgttgtcactttgacccaggaagacgatggtcccacaacagtgaatgttcgtgtc 328
Query: 301 actggccttactccagggcctcatggattccacctacatgagtatggtgacacaacaaat 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 329 actggccttactccagggcctcatggattccacctacatgagtatggtgacacaacaaat 388
Query: 361 ggatgcatttctacaggagctcatttcaatccgaacaacaagacacatggtgctcctgaa 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 389 ggatgcatttctacaggagctcatttcaatccgaacaacaagacacatggtgctcctgaa 448
Query: 421 gatgaaatccgtcatgcgggtgacctgggaaacatagttgctaacgctgatggggtggca 480
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 449 gatgaaatccgtcatgcgggtgaccttggaaacatagttgctaacgctgatggggtggca 508
Query: 481 gaagcaacaattgtggataaccagataccattgagtggtccaaatgcagtagtcggaaga 540
||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 509 gaagccacacttgtggataaccagata-cattgagtggtccaaatgcagtagtcggaaga 567
Query: 541 gcacttgttgtccatga 557
|||||||||||||||||
Sbjct: 568 gcacttgttgtccatga 584
>gi|268517829|gb|FM893204.1|FM893204 FM893204 Jatropha curcas embryo
56-70 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcaeb1_003965,
mRNA sequence
Length = 657
Score = 777 bits (392), Expect = 0.0
Identities = 395/396 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 187 gtcgttgctgctaccaaaaaggccgtcgctgtccttaagggtacctccaatgttgaaggc 246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5 gtcgttgctgctaccaaaaaggccgtcgctgtccttaagggtacctccaatgttgaaggc 64
Query: 247 gttgtcactttgacccaggaagacgatggtcccacaacagtgaatgttcgtgtcactggc 306
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 65 gttgtcactttgacccaggaagacgatggtcccacaacagtgaatgttcgtgttactggc 124
Query: 307 cttactccagggcctcatggattccacctacatgagtatggtgacacaacaaatggatgc 366
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 125 cttactccagggcctcatggattccacctacatgagtatggtgacacaacaaatggatgc 184
Query: 367 atttctacaggagctcatttcaatccgaacaacaagacacatggtgctcctgaagatgaa 426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 185 atttctacaggagctcatttcaatccgaacaacaagacacatggtgctcctgaagatgaa 244
Query: 427 atccgtcatgcgggtgacctgggaaacatagttgctaacgctgatggggtggcagaagca 486
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 245 atccgtcatgcgggtgacctgggaaacatagttgctaacgctgatggggtggcagaagca 304
Query: 487 acaattgtggataaccagataccattgagtggtccaaatgcagtagtcggaagagcactt 546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 305 acaattgtggataaccagataccattgagtggtccaaatgcagtagtcggaagagcactt 364
Query: 547 gttgtccatgagcttgaagatgaccttggaaagggt 582
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 365 gttgtccatgagcttgaagatgaccttggaaagggt 400
>gi|268523539|gb|FM893862.1|FM893862 FM893862 Jatropha curcas embryo
56-70 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcaeb0_004792,
mRNA sequence
Length = 485
Score = 763 bits (385), Expect = 0.0
Identities = 408/418 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atggctgctcatacaatccttgcagcctctccatcctctcatcctctcctctatccattc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 68 atggctgctcatacaatccttgcagcctctccatcctctcatcctctcctctatccattc 127
Query: 61 ccaaaccctatcctttcccactcttcacctctgcattcctcattccatggtgtttctctc 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 128 ccaaaccctatcctttcccactcttcacctctgcattcctcattccatggtgtttctctc 187
Query: 121 aaacttcctcgtcaatcgctacctctttctcttaccaccgccgccgccccnnnnnnnccc 180
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct: 188 aaacttcctcgtcaatcgctacctctttctcttaccaccgccgccgccccaaaaaaaccc 247
Query: 181 cttgctgtcgttgctgctaccaaaaaggccgtcgctgtccttaagggtacctccaatgtt 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 248 cttgctgtcgttgctgctaccaaaaaggccgtcgctgtccttaagggtacctccaatgtt 307
Query: 241 gaaggcgttgtcactttgacccaggaagacgatggtcccacaacagtgaatgttcgtgtc 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 308 gaaggcgttgtcactttgacccaggaagacgatggtcccacaacagtgaatgttcgtgtc 367
Query: 301 actggccttactccagggcctcatggattccacctacatgagtatggtgacacaacaaat 360
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 368 actggccttactccagggcctcatggattccaactacatgagtatggtgacacaacaaat 427
Query: 361 ggatgcatttctacaggagctcatttcaatccgaacaacaagacacatggtgctcctg 418
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 428 ggatgcatttctacaggagctcataacaatccgaacaacaagacacatggtgctcctg 485