Jatropha Genome Database

JcCB0121691.10
Show Alignment:  
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= JcCB0121691.10 + phase: 2 /pseudo
         (1472 letters)

Database: JAT_13201ests 
           13,201 sequences; 6,040,684 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gi|268521547|gb|FM896755.1|FM896755 FM896755 Jatropha curcas emb...   995   0.0  

>gi|268521547|gb|FM896755.1|FM896755 FM896755 Jatropha curcas embryo
           71-95 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcpga0_004048,
           mRNA sequence
          Length = 513

 Score =  995 bits (502), Expect = 0.0
 Identities = 510/513 (99%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 102 ggagatccctcagaatgagaccagttagtgtgtcatcttgcttgagagatggttccacta 161
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   ggagatccctcagaatgagaccagttagtgtgtcatcttgcttgagagatggttccacta 60

                                                                       
Query: 162 ggtattttgattttgttgtcattggaagtggagttgctggccttcgctatgctcttgaag 221
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  ggtattttgattttgttgtcattggaagtggagttgctggccttcgctatgctcttgaag 120

                                                                       
Query: 222 ttgcaaaacatggaactgttgcagtgatcaccaaggctgagcctcatgagagcaatacaa 281
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ttgcaaaacatggaactgttgcagtgatcaccaaggctgagcctcatgagagcaatacaa 180

                                                                       
Query: 282 actatgcccaaggtggtgttagtgctgtgttgtgtcctttggattctgtggagagtcaca 341
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 actatgcccaaggtggtgttagtgctgtgttgtgtcctttggattctgtggagagtcaca 240

                                                                       
Query: 342 tgcaggacaccattgtagctggggctaatctatgtgatgaggagactgtcagagttgttt 401
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 tgcaggacaccattgtagctggggctaatctatgtgatgaggagactgtcagagttgttt 300

                                                                       
Query: 402 gtactgaaggacctgacagaatcagggaattgatagctatgggtgcaatgtttgatcatg 461
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gtactgaaggacctgacagaatcagggaattgatagctatgggtgcaatgtttgatcatg 360

                                                                       
Query: 462 gtgaggacggtaacctgcacctagcaagggaggggggtcactctcaccatagaattgtcc 521
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 361 gtgaggacggtaacctgcacctagcaagggaggggggtcactctcaccatanaattgtcc 420

                                                                       
Query: 522 atgctgccgatatgacaggaagggagattgagcgagctctgcttgaggcagttgttaatg 581
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 atgctgccgatatgacaggaagggagattgagcgagctctgcttgaggcagttgttaatg 480

                                            
Query: 582 atcctaaaatatccatgtttgaacaccactttg 614
           ||||  |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 atccctaaatatccatgtttgaacaccactttg 513