Jatropha Genome Database
- JcCA0311301.40
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= JcCA0311301.40 - phase: 0 /partial
(714 letters)
Database: JAT_13201ests
13,201 sequences; 6,040,684 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gi|218687254|gb|GH296534.1|GH296534 JCL984 Jatropha curcas total... 1352 0.0
gi|218687339|gb|GH295993.1|GH295993 JCL442 Jatropha curcas total... 1352 0.0
gi|218687552|gb|GH295599.1|GH295599 JCL48 Jatropha curcas total ... 1352 0.0
gi|237680575|gb|GO246787.1|GO246787 JcrME_RL0331 Expressed seque... 1316 0.0
gi|268522290|gb|FM894435.1|FM894435 FM894435 Jatropha curcas emb... 1213 0.0
gi|268525143|gb|FM895785.1|FM895785 FM895785 Jatropha curcas emb... 1193 0.0
gi|268523883|gb|FM890569.1|FM890569 FM890569 Jatropha curcas emb... 920 0.0
gi|268517803|gb|FM893178.1|FM893178 FM893178 Jatropha curcas emb... 878 0.0
gi|268521500|gb|FM894252.1|FM894252 FM894252 Jatropha curcas emb... 831 0.0
gi|268522766|gb|FM896209.1|FM896209 FM896209 Jatropha curcas emb... 567 e-162
gi|268525210|gb|FM895852.1|FM895852 FM895852 Jatropha curcas emb... 543 e-155
gi|268525602|gb|FM890857.1|FM890857 FM890857 Jatropha curcas emb... 406 e-113
gi|268523136|gb|FM894719.1|FM894719 FM894719 Jatropha curcas emb... 172 3e-43
gi|268518628|gb|FM888871.1|FM888871 FM888871 Jatropha curcas emb... 119 5e-27
gi|268524156|gb|FM894835.1|FM894835 FM894835 Jatropha curcas emb... 54 2e-07
>gi|218687254|gb|GH296534.1|GH296534 JCL984 Jatropha curcas total
leaf library Jatropha curcas cDNA, mRNA sequence
Length = 844
Score = 1352 bits (682), Expect = 0.0
Identities = 682/682 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 33 aagaagcgtacgcatagcatctttatctgcttctcttttaattgccaaggaatcatcttt 92
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 aagaagcgtacgcatagcatctttatctgcttctcttttaattgccaaggaatcatcttt 61
Query: 93 caattccaagcaaactcttttgcgatctcttcataagtcacctcttcctttggttcctcg 152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 caattccaagcaaactcttttgcgatctcttcataagtcacctcttcctttggttcctcg 121
Query: 153 ctcgatcagaacagggaattcaaggcctgtgctctattctttgagattcgatcatacaat 212
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 ctcgatcagaacagggaattcaaggcctgtgctctattctttgagattcgatcatacaat 181
Query: 213 ggctacccaatctgagcctaaatcagtccatgacttcactgttaaggatgctagggggaa 272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 ggctacccaatctgagcctaaatcagtccatgacttcactgttaaggatgctagggggaa 241
Query: 273 cgatgttgatctcagcacatacaagggaaaggttctcattattgttaatgttgcttcaca 332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 cgatgttgatctcagcacatacaagggaaaggttctcattattgttaatgttgcttcaca 301
Query: 333 atgtggcttgaccaattccaactacactgaactgactcagttataccagaagtacaagga 392
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 atgtggcttgaccaattccaactacactgaactgactcagttataccagaagtacaagga 361
Query: 393 tcaaggtttggagattctggcttttccatgcaatcaatttggatctcaggagccagggac 452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 tcaaggtttggagattctggcttttccatgcaatcaatttggatctcaggagccagggac 421
Query: 453 caatgaacagattgtggagtttgcctgcactcgcttcaaggctgagtatccaatattcga 512
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 caatgaacagattgtggagtttgcctgcactcgcttcaaggctgagtatccaatattcga 481
Query: 513 taagatcgatgtcaatggaaacaatgctgctgctctttacaagttcttgaagtccagcaa 572
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482 taagatcgatgtcaatggaaacaatgctgctgctctttacaagttcttgaagtccagcaa 541
Query: 573 aggaggaatttttggggatagcatcaagtggaatttcaccaagtttctggctgataaaga 632
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 542 aggaggaatttttggggatagcatcaagtggaatttcaccaagtttctggctgataaaga 601
Query: 633 tggcaatgttgtgaaccgatatgctcccactacttctcctcttagcatcgagaaagatgt 692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 602 tggcaatgttgtgaaccgatatgctcccactacttctcctcttagcatcgagaaagatgt 661
Query: 693 gaagaaactgctggggattgca 714
||||||||||||||||||||||
Sbjct: 662 gaagaaactgctggggattgca 683
>gi|218687339|gb|GH295993.1|GH295993 JCL442 Jatropha curcas total
leaf library Jatropha curcas cDNA, mRNA sequence
Length = 844
Score = 1352 bits (682), Expect = 0.0
Identities = 682/682 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 33 aagaagcgtacgcatagcatctttatctgcttctcttttaattgccaaggaatcatcttt 92
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 aagaagcgtacgcatagcatctttatctgcttctcttttaattgccaaggaatcatcttt 61
Query: 93 caattccaagcaaactcttttgcgatctcttcataagtcacctcttcctttggttcctcg 152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 caattccaagcaaactcttttgcgatctcttcataagtcacctcttcctttggttcctcg 121
Query: 153 ctcgatcagaacagggaattcaaggcctgtgctctattctttgagattcgatcatacaat 212
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 ctcgatcagaacagggaattcaaggcctgtgctctattctttgagattcgatcatacaat 181
Query: 213 ggctacccaatctgagcctaaatcagtccatgacttcactgttaaggatgctagggggaa 272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 ggctacccaatctgagcctaaatcagtccatgacttcactgttaaggatgctagggggaa 241
Query: 273 cgatgttgatctcagcacatacaagggaaaggttctcattattgttaatgttgcttcaca 332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 cgatgttgatctcagcacatacaagggaaaggttctcattattgttaatgttgcttcaca 301
Query: 333 atgtggcttgaccaattccaactacactgaactgactcagttataccagaagtacaagga 392
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 atgtggcttgaccaattccaactacactgaactgactcagttataccagaagtacaagga 361
Query: 393 tcaaggtttggagattctggcttttccatgcaatcaatttggatctcaggagccagggac 452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 tcaaggtttggagattctggcttttccatgcaatcaatttggatctcaggagccagggac 421
Query: 453 caatgaacagattgtggagtttgcctgcactcgcttcaaggctgagtatccaatattcga 512
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 caatgaacagattgtggagtttgcctgcactcgcttcaaggctgagtatccaatattcga 481
Query: 513 taagatcgatgtcaatggaaacaatgctgctgctctttacaagttcttgaagtccagcaa 572
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482 taagatcgatgtcaatggaaacaatgctgctgctctttacaagttcttgaagtccagcaa 541
Query: 573 aggaggaatttttggggatagcatcaagtggaatttcaccaagtttctggctgataaaga 632
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 542 aggaggaatttttggggatagcatcaagtggaatttcaccaagtttctggctgataaaga 601
Query: 633 tggcaatgttgtgaaccgatatgctcccactacttctcctcttagcatcgagaaagatgt 692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 602 tggcaatgttgtgaaccgatatgctcccactacttctcctcttagcatcgagaaagatgt 661
Query: 693 gaagaaactgctggggattgca 714
||||||||||||||||||||||
Sbjct: 662 gaagaaactgctggggattgca 683
>gi|218687552|gb|GH295599.1|GH295599 JCL48 Jatropha curcas total
leaf library Jatropha curcas cDNA, mRNA sequence
Length = 844
Score = 1352 bits (682), Expect = 0.0
Identities = 682/682 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 33 aagaagcgtacgcatagcatctttatctgcttctcttttaattgccaaggaatcatcttt 92
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2 aagaagcgtacgcatagcatctttatctgcttctcttttaattgccaaggaatcatcttt 61
Query: 93 caattccaagcaaactcttttgcgatctcttcataagtcacctcttcctttggttcctcg 152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 62 caattccaagcaaactcttttgcgatctcttcataagtcacctcttcctttggttcctcg 121
Query: 153 ctcgatcagaacagggaattcaaggcctgtgctctattctttgagattcgatcatacaat 212
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 122 ctcgatcagaacagggaattcaaggcctgtgctctattctttgagattcgatcatacaat 181
Query: 213 ggctacccaatctgagcctaaatcagtccatgacttcactgttaaggatgctagggggaa 272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 182 ggctacccaatctgagcctaaatcagtccatgacttcactgttaaggatgctagggggaa 241
Query: 273 cgatgttgatctcagcacatacaagggaaaggttctcattattgttaatgttgcttcaca 332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 242 cgatgttgatctcagcacatacaagggaaaggttctcattattgttaatgttgcttcaca 301
Query: 333 atgtggcttgaccaattccaactacactgaactgactcagttataccagaagtacaagga 392
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 302 atgtggcttgaccaattccaactacactgaactgactcagttataccagaagtacaagga 361
Query: 393 tcaaggtttggagattctggcttttccatgcaatcaatttggatctcaggagccagggac 452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 362 tcaaggtttggagattctggcttttccatgcaatcaatttggatctcaggagccagggac 421
Query: 453 caatgaacagattgtggagtttgcctgcactcgcttcaaggctgagtatccaatattcga 512
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 422 caatgaacagattgtggagtttgcctgcactcgcttcaaggctgagtatccaatattcga 481
Query: 513 taagatcgatgtcaatggaaacaatgctgctgctctttacaagttcttgaagtccagcaa 572
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 482 taagatcgatgtcaatggaaacaatgctgctgctctttacaagttcttgaagtccagcaa 541
Query: 573 aggaggaatttttggggatagcatcaagtggaatttcaccaagtttctggctgataaaga 632
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 542 aggaggaatttttggggatagcatcaagtggaatttcaccaagtttctggctgataaaga 601
Query: 633 tggcaatgttgtgaaccgatatgctcccactacttctcctcttagcatcgagaaagatgt 692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 602 tggcaatgttgtgaaccgatatgctcccactacttctcctcttagcatcgagaaagatgt 661
Query: 693 gaagaaactgctggggattgca 714
||||||||||||||||||||||
Sbjct: 662 gaagaaactgctggggattgca 683
>gi|237680575|gb|GO246787.1|GO246787 JcrME_RL0331 Expressed sequence
tags from Jatropha curcas root cDNA library Jatropha
curcas cDNA, mRNA sequence
Length = 700
Score = 1316 bits (664), Expect = 0.0
Identities = 692/696 (99%), Gaps = 4/696 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 1 atgctctgtacttcaattcgcatttgccctctaagaagcgtacgcatagcatctttatct 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 9 atgctctgtacttcaattcgcatttgccctctaagaagcgtacgcatagcatctttatct 68
Query: 61 gcttctcttttaattgccaaggaatcatctttcaattccaagcaaactcttttgcgatct 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69 gcttctcttttaattgccaaggaatcatctttcaattccaagcaaactcttttgcgatct 128
Query: 121 cttcataagtcacctcttcctttggttcctcgctcgatcagaacagggaattcaaggcct 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 129 cttcataagtcacctcttcctttggttcctcgctcgatcagaacagggaattcaaggcct 188
Query: 181 gtgctctattctttgagattcgatcatacaatggctacccaatctgagcctaaatcagtc 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 189 gtgctctattctttgagattcgatcatacaatggctacccaatctgagcctaaatcagtc 248
Query: 241 catgacttcactgttaaggatgctagggggaacgatgttgatctcagcacatacaaggga 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 249 catgacttcactgttaaggatgctagggggaacgatgttgatctcagcacatacaaggga 308
Query: 301 aaggttctcattattgttaatgttgcttcacaatgtggcttgaccaattccaactacact 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 309 aaggttctcattattgttaatgttgcttcacaatgtggcttgaccaattccaactacact 368
Query: 361 gaactgactcagttataccagaagtacaaggatcaaggtttggagattctggcttttcca 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 369 gaactgactcagttataccagaagtacaaggatcaaggtttggagattctggcttttcca 428
Query: 421 tgcaatcaatttggatctcaggagccagggaccaatgaacagattgtggagtttgcctgc 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 429 tgcaatcaatttggatctcaggagccagggaccaatgaacagattgtggagtttgcctgc 488
Query: 481 actcgcttcaaggctgagtatccaatattcgataagatcgatgtcaatggaaacaatgct 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 489 actcgcttcaaggctgagtatccaatattcgataagatcgatgtcaatggaaacaatgct 548
Query: 541 gctgctctttacaagttcttgaagtccagcaaaggaggaatttttggggatagcatcaag 600
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 549 gctgctctttacaagttcttgaagtccagc-aaggaggaatttttggggatagcatcaag 607
Query: 601 tggaatttcaccaagtttctggctgataaagatggcaatgttgtgaaccgatatgctccc 660
|||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 608 tggaatttcacc-agtttctggctgat-aagatggcaatgttgtgaaccgatatgctccc 665
Query: 661 actacttctcctcttagcatcgagaaagatgtgaag 696
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 666 actacttct-ctcttagcatcgagaaagatgtgaag 700
>gi|268522290|gb|FM894435.1|FM894435 FM894435 Jatropha curcas embryo
71-95 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcpga0_004787,
mRNA sequence
Length = 640
Score = 1213 bits (612), Expect = 0.0
Identities = 634/640 (99%), Gaps = 1/640 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 17 ttcgcatttgccctctaagaagcgtacgcatagcatctttatctgcttctcttttaattg 76
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ttcgcatttgccctctaagaagcgtacgcatagcatctttatctgcttctcttttaattg 60
Query: 77 ccaaggaatcatctttcaattccaagcaaactcttttgcgatctcttcataagtcacctc 136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 ccaaggaatcatctttcaattccaagcaaactcttttgcgatctcttcataagtcacctc 120
Query: 137 ttcctttggttcctcgctcgatcagaacagggaattcaaggcctgtgctctattctttga 196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ttcctttggttcctcgctcgatcagaacagggaattcaaggcctgtgctctattctttga 180
Query: 197 gattcgatcatacaatggctacccaatctgagcctaaatcagtccatgacttcactgtta 256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 gattcgatcatacaatggctacccaatctgagcctaaatcagtccatgacttcactgtta 240
Query: 257 aggatgctagggggaacgatgttgatctcagcacatacaagggaaaggttctcattattg 316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 aggatgctagggggaacgatgttgatctcagcacatacaggggaaaggttctcattattg 300
Query: 317 ttaatgttgcttcacaatgtggcttgaccaattccaactacactgaactgactcagttat 376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ttaatgttgcttcacaatgtggcttgaccaattccaactacactgaactgactcagttat 360
Query: 377 accagaagtacaaggatcaaggtttggagattctggcttttccatgcaatcaatttggat 436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 accagaagtacaaggatcaaggtttggagattctggcttttccatgcaatcaatttggat 420
Query: 437 ctcaggagccagggaccaatgaacagattgtggagtttgcctgcactcgcttcaaggctg 496
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ctcaggagccagagaccaatgaacagattgtggagtttgcctgcactcgcttcaaggctg 480
Query: 497 agtatccaatattcgataagatcgatgtcaatggaaacaatgctgctgctctttacaagt 556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 agtatccaatattcgataagatcgatgtcaatggaaacaatgctgctgctctttacaagt 540
Query: 557 tcttgaagtccagcaaaggaggaatttttggggatagcatcaagtggaatttcaccaagt 616
||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 tcttgaagtccagcacaggaggacttttaggggatagcatcaagtggaatttcaccaagt 600
Query: 617 ttctggctgataaagatggcaatgttgtg-aaccgatatg 655
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 601 ttctggctgataaagatggcaatgttgtgaaaccgatatg 640
>gi|268525143|gb|FM895785.1|FM895785 FM895785 Jatropha curcas embryo
71-95 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcpga0_002771,
mRNA sequence
Length = 650
Score = 1193 bits (602), Expect = 0.0
Identities = 633/638 (99%), Gaps = 4/638 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 17 ttcgcatttgccctctaagaagcgtacgcatagcatctttatctgcttctcttttaattg 76
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ttcgcatttgccctctaagaagcgtacgcatagcatctttatctgcttctcttttaattg 60
Query: 77 ccaaggaatcatctttcaattccaagcaaactcttttgcgatctcttcataagtcacctc 136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 ccaaggaatcatctttcaattccaagcaaactcttttgcgatctcttcataagtcacctc 120
Query: 137 ttcctttggttcctcgctcgatcagaacagggaattcaaggcctgtgctctattctttga 196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 ttcctttggttcctcgctcgatcagaacagggaattcaaggcctgtgctctattctttga 180
Query: 197 gattcgatcatacaatggctacccaatctgagcctaaatcagtccatgacttcactgtta 256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 gattcgatcatacaatggctacccaatctgagcctaaatcagtccatgacttcactgtta 240
Query: 257 aggatgctagggggaacgatgttgatctcagcacatacaagggaaaggttctcattattg 316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 aggatgctagggggaacgatgttgatctcagcacatacaagggaaaggttctcattattg 300
Query: 317 ttaatgttgcttcacaatgtggcttgaccaattccaactacactgaactgactcagttat 376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 ttaatgttgcttcacaatgtggcttgaccaattccaactacactgaactgactcagttat 360
Query: 377 accagaagtacaaggatcaaggtttggagattctggcttttccatgcaatcaatttggat 436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 accagaagtacaaggatcaaggtttggagattctggcttttccatgcaatcaatttggat 420
Query: 437 ctcaggagccagggaccaatgaacagattgtggagtttgcctgcactcgcttcaaggctg 496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 ctcaggagccagggaccaatgaacagattgtggagtttgcctgcactcgcttcaaggctg 480
Query: 497 agtatccaatattcgataagatcgatgtcaatggaaacaatgctgctgc-tcttta-caa 554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
Sbjct: 481 agtatccaatattcgataagatcgatgtcaatggaaacaatgctgctgcttctttaccaa 540
Query: 555 gttc-ttgaagtccagcaaaggaggaatttttggggatagcatcaagtggaatttcacca 613
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 541 gttctttgaagtccagcaaaggaggaatttttggggatagcatcaagtggaatttc-ccc 599
Query: 614 agtttctggctgataaagatggcaatgttgtgaaccga 651
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 600 agtttctggctgataaagatggcaatgttgtgaaccga 637
>gi|268523883|gb|FM890569.1|FM890569 FM890569 Jatropha curcas embryo
56-70 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcaeb0_000457,
mRNA sequence
Length = 480
Score = 920 bits (464), Expect = 0.0
Identities = 474/476 (99%), Gaps = 1/476 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 23 tttgccctctaagaagcgtacgcatagcatctttatctgcttctcttttaattgccaagg 82
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5 tttgccctctaagaagcgtacgcatagcatctttatctgcttctcttttaattgccaagg 64
Query: 83 -aatcatctttcaattccaagcaaactcttttgcgatctcttcataagtcacctcttcct 141
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 65 gaatcatctttcaattccaagcaaactcttttgcgatctcttcataagtcacctcttcct 124
Query: 142 ttggttcctcgctcgatcagaacagggaattcaaggcctgtgctctattctttgagattc 201
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 125 ttggttcctcgctcgatcagaacagggaattcaaggcctgtgctctattctttgagattc 184
Query: 202 gatcatacaatggctacccaatctgagcctaaatcagtccatgacttcactgttaaggat 261
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 185 gatcatacaatggctacccaatctgagcctaaatcagtccatgacttcactgttaaggat 244
Query: 262 gctagggggaacgatgttgatctcagcacatacaagggaaaggttctcattattgttaat 321
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 245 gctagggggaacgatgttgatctcagcacatacaagggaaaggttctcattattgttaat 304
Query: 322 gttgcttcacaatgtggcttgaccaattccaactacactgaactgactcagttataccag 381
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 305 gttgcttcacaatgtggcttgaccaattccaactacactgaactgactcagttataccag 364
Query: 382 aagtacaaggatcaaggtttggagattctggcttttccatgcaatcaatttggatctcag 441
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 365 aagtacaaggatcaaagtttggagattctggcttttccatgcaatcaatttggatctcag 424
Query: 442 gagccagggaccaatgaacagattgtggagtttgcctgcactcgcttcaaggctga 497
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 425 gagccagggaccaatgaacagattgtggagtttgcctgcactcgcttcaaggctga 480
>gi|268517803|gb|FM893178.1|FM893178 FM893178 Jatropha curcas embryo
56-70 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcaeb1_003910,
mRNA sequence
Length = 612
Score = 878 bits (443), Expect = 0.0
Identities = 448/450 (99%)
Strand = Plus / Minus
Query: 265 agggggaacgatgttgatctcagcacatacaagggaaaggttctcattattgttaatgtt 324
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 612 agggggaacgatgttgatctcagcacatacaagtgaaaggttctcattattgttaatgtt 553
Query: 325 gcttcacaatgtggcttgaccaattccaactacactgaactgactcagttataccagaag 384
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
Sbjct: 552 gcttcacaatgtggcttgaccaattccaactacactgaactgactcagntataccagaag 493
Query: 385 tacaaggatcaaggtttggagattctggcttttccatgcaatcaatttggatctcaggag 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 492 tacaaggatcaaggtttggagattctggcttttccatgcaatcaatttggatctcaggag 433
Query: 445 ccagggaccaatgaacagattgtggagtttgcctgcactcgcttcaaggctgagtatcca 504
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 432 ccagggaccaatgaacagattgtggagtttgcctgcactcgcttcaaggctgagtatcca 373
Query: 505 atattcgataagatcgatgtcaatggaaacaatgctgctgctctttacaagttcttgaag 564
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 372 atattcgataagatcgatgtcaatggaaacaatgctgctgctctttacaagttcttgaag 313
Query: 565 tccagcaaaggaggaatttttggggatagcatcaagtggaatttcaccaagtttctggct 624
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 312 tccagcaaaggaggaatttttggggatagcatcaagtggaatttcaccaagtttctggct 253
Query: 625 gataaagatggcaatgttgtgaaccgatatgctcccactacttctcctcttagcatcgag 684
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 252 gataaagatggcaatgttgtgaaccgatatgctcccactacttctcctcttagcatcgag 193
Query: 685 aaagatgtgaagaaactgctggggattgca 714
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 192 aaagatgtgaagaaactgctggggattgca 163
>gi|268521500|gb|FM894252.1|FM894252 FM894252 Jatropha curcas embryo
71-95 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcpga0_004557,
mRNA sequence
Length = 670
Score = 831 bits (419), Expect = 0.0
Identities = 454/462 (98%), Gaps = 3/462 (0%)
Strand = Plus / Minus
Query: 254 ttaaggatgctagggggaacgatgttg-atctcagcacatacaagggaaaggttctcatt 312
|||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 670 ttaaggatgctagggg-aacgaggttgtatctcagcacatacaagggaaaggttctcatt 612
Query: 313 attgttaatgttgcttcacaatgtggcttgaccaattccaactacactgaactgactcag 372
|| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 611 at-gttaatgtgctttcacaatgtggcttgaccaattccaactacactgaactgactcag 553
Query: 373 ttataccagaagtacaaggatcaaggtttggagattctggcttttccatgcaatcaattt 432
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 552 ttataccagaagtacaaggatcaaggtttggagattctggcttttccatgcaatcaatnt 493
Query: 433 ggatctcaggagccagggaccaatgaacagattgtggagtttgcctgcactcgcttcaag 492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 492 ggatctcaggagccagggaccaatgaacagattgtggagtttgcctgcactcgcttcaag 433
Query: 493 gctgagtatccaatattcgataagatcgatgtcaatggaaacaatgctgctgctctttac 552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 432 gctgagtatccaatattcgataagatcgatgtcaatggaaacaatgctgctgctctttac 373
Query: 553 aagttcttgaagtccagcaaaggaggaatttttggggatagcatcaagtggaatttcacc 612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 372 aagttcttgaagtccagcaaaggaggaatttttggggatagcatcaagtggaatttcacc 313
Query: 613 aagtttctggctgataaagatggcaatgttgtgaaccgatatgctcccactacttctcct 672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 312 aagtttctggctgataaagatggcaatgttgtgaaccgatatgctcccactacttctcct 253
Query: 673 cttagcatcgagaaagatgtgaagaaactgctggggattgca 714
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 252 cttagcatcgagaaagatgtgaagaaactgctggggattgca 211
>gi|268522766|gb|FM896209.1|FM896209 FM896209 Jatropha curcas embryo
71-95 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcpga0_003384,
mRNA sequence
Length = 318
Score = 567 bits (286), Expect = e-162
Identities = 312/318 (98%), Gaps = 2/318 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 17 ttcgcatttgccctctaagaagcgtacgcatagcatctttatctg-cttctcttttaatt 75
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||
Sbjct: 1 ttcgcatttgccctctaagaagcgtacgcatagcatcttgatctggcttctctttgaatt 60
Query: 76 gccaaggaatcatctttcaattccaagcaaactcttttgcgatctcttcataagtcacct 135
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 gccaaggaatcatctttcaattccaagcaaactcttttgcgatctcttcataagtcacct 120
Query: 136 cttcctttggttcctcgctcgatcagaacagggaattcaaggcctgtgctctattctttg 195
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 cttcctttggttcctcgctcgatcagaacagggaattcaaggcctgtgctctattctttg 180
Query: 196 agattcgatcatacaatggctacccaatctgagcctaaatcagtc-catgacttcactgt 254
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||
Sbjct: 181 agattcgatcatacaatggctacccaatctgagcctaaatcaatcgcatgacttcactgt 240
Query: 255 taaggatgctagggggaacgatgttgatctcagcacatacaagggaaaggttctcattat 314
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 taaggatgctagggggaacgatgttgatctcagcacgtacaagggaaaggttctcattat 300
Query: 315 tgttaatgttgcttcaca 332
||||||||||||||||||
Sbjct: 301 tgttaatgttgcttcaca 318
>gi|268525210|gb|FM895852.1|FM895852 FM895852 Jatropha curcas embryo
71-95 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcpga0_002848,
mRNA sequence
Length = 454
Score = 543 bits (274), Expect = e-155
Identities = 342/354 (96%), Gaps = 8/354 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 368 ctcagttataccagaagtacaaggatcaaggtttggagattctggcttttccatgcaatc 427
||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 5 ctcagttataccagaagtacaag-atcagagtttggagattctggcctttccatgcaatc 63
Query: 428 aatttggatctcaggagccagggaccaat-gaacagat-tgtggagtttgcct-gcac-t 483
|||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |
Sbjct: 64 aatttggatctcaggagccaggaaccaatagaacagatatgtggagtttgcctagcacat 123
Query: 484 cgcttcaaggc-tgagtatccaatattc-gataagatcgatgtcaatgga-aacaatgct 540
||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct: 124 cgcttcaaggcgtgagtatccaatattcagataagatcgatgtcaatgganaacaatgct 183
Query: 541 gctgctctttacaagttcttgaagtccagcaaaggaggaatttttggggatagcatcaag 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 184 gctgctctttacaagttcttgaagtccagcaaaggaggaatttttggggatagcatcaag 243
Query: 601 tggaatttcaccaagtttctggctgataaagatggcaatgttgtgaaccgatatgctccc 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 244 tggaatttcaccaagtttctggctgataaagatggcaatgttgtgaaccgatatgctccc 303
Query: 661 actacttctcctcttagcatcgagaaagatgtgaagaaactgctggggattgca 714
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 304 actacttctcctcttagcatcgagaaagatgtgaagaaactgctggggattgca 357
>gi|268525602|gb|FM890857.1|FM890857 FM890857 Jatropha curcas embryo
56-70 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcaeb0_000812,
mRNA sequence
Length = 513
Score = 406 bits (205), Expect = e-113
Identities = 205/205 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 510 cgataagatcgatgtcaatggaaacaatgctgctgctctttacaagttcttgaagtccag 569
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 5 cgataagatcgatgtcaatggaaacaatgctgctgctctttacaagttcttgaagtccag 64
Query: 570 caaaggaggaatttttggggatagcatcaagtggaatttcaccaagtttctggctgataa 629
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 65 caaaggaggaatttttggggatagcatcaagtggaatttcaccaagtttctggctgataa 124
Query: 630 agatggcaatgttgtgaaccgatatgctcccactacttctcctcttagcatcgagaaaga 689
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 125 agatggcaatgttgtgaaccgatatgctcccactacttctcctcttagcatcgagaaaga 184
Query: 690 tgtgaagaaactgctggggattgca 714
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 185 tgtgaagaaactgctggggattgca 209
>gi|268523136|gb|FM894719.1|FM894719 FM894719 Jatropha curcas embryo
71-95 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcpga0_000563,
mRNA sequence
Length = 307
Score = 172 bits (87), Expect = 3e-43
Identities = 94/95 (98%), Gaps = 1/95 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 620 tggctgataaagatggcaatgttgtgaaccgatatgctcccactacttctcctcttagca 679
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 250 tggctgataaagatggcaatgttg-gaaccgatatgctcccactacttctcctcttagca 192
Query: 680 tcgagaaagatgtgaagaaactgctggggattgca 714
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 191 tcgagaaagatgtgaagaaactgctggggattgca 157
>gi|268518628|gb|FM888871.1|FM888871 FM888871 Jatropha curcas embryo
35-55 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcfea0_002376,
mRNA sequence
Length = 228
Score = 119 bits (60), Expect = 5e-27
Identities = 60/60 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 648 ccgatatgctcccactacttctcctcttagcatcgagaaagatgtgaagaaactgctggg 707
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 3 ccgatatgctcccactacttctcctcttagcatcgagaaagatgtgaagaaactgctggg 62
>gi|268524156|gb|FM894835.1|FM894835 FM894835 Jatropha curcas embryo
71-95 (DAF) Jatropha curcas cDNA clone rjcpga0_000721,
mRNA sequence
Length = 602
Score = 54.0 bits (27), Expect = 2e-07
Identities = 45/51 (88%)
Strand = Plus / Plus
Query: 382 aagtacaaggatcaaggtttggagattctggcttttccatgcaatcaattt 432
||||||||||| |||||| | || || |||||||||||||||||||||||
Sbjct: 269 aagtacaaggaccaaggtcttgaaatcttggcttttccatgcaatcaattt 319