Jatropha Genome Database

JcCA0144801.10
Show Alignment: 
BLASTN 2.2.23 [Feb-03-2010]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= JcCA0144801.10 + phase: 0 
         (750 letters)

Database: JAT_13201ests 
           13,201 sequences; 6,040,684 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gi|218686920|gb|GH295888.1|GH295888 JCL337 Jatropha curcas total...   787   0.0  
gi|218687084|gb|GH296468.1|GH296468 JCL918 Jatropha curcas total...   787   0.0  
gi|218687715|gb|GH296282.1|GH296282 JCL731 Jatropha curcas total...   787   0.0  

>gi|218686920|gb|GH295888.1|GH295888 JCL337 Jatropha curcas total
           leaf library Jatropha curcas cDNA, mRNA sequence
          Length = 655

 Score =  787 bits (397), Expect = 0.0
 Identities = 400/401 (99%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 350 cttccaccatccacttgcatcgcacagtaaatcagataaaagatcttggagctaaagctg 409
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   cttccaccatccacttgcatcgcacagtaaatcagataaaagatcttggagctaaagctg 60

                                                                       
Query: 410 gagtcgtcttgaaccctgctactccattgagtgctatagaatatgttcttgatgtggttg 469
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  gagtcgtcttgaaccctgctactccattgagtgctatagaatatgttcttgatgtggttg 120

                                                                       
Query: 470 atcttgtcttgattatgtctgtcaaccctggttttggtggtcaaggctttattgagagtc 529
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 atcttgtcttgattatgtctgtcaaccctggttttggtggtcaaggctttattgagagtc 180

                                                                       
Query: 530 aagtgaagaaaatctcagatttgagaagactgtgtgcagagaagggggtaaatccatgga 589
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 aagtgaagaaaatctcagatttgagaagactgtgtgcagagaagggggtaaatccatgga 240

                                                                       
Query: 590 ttgaggtagatggtggagttggtcccaagaatgcatataaggttattgaggctggggcta 649
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 241 ttgaggtagatggtggagttggtcccaagaatgcatataaggttatttaggctggggcta 300

                                                                       
Query: 650 atgctttggttgctggttcagcagtttttggagctaaagattatgctgaagctataaaag 709
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 atgctttggttgctggttcagcagtttttggagctaaagattatgctgaagctataaaag 360

                                                    
Query: 710 gaatcaaaaccagcaaaaggccagtagcagtgccagcatga 750
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gaatcaaaaccagcaaaaggccagtagcagtgccagcatga 401


>gi|218687084|gb|GH296468.1|GH296468 JCL918 Jatropha curcas total
           leaf library Jatropha curcas cDNA, mRNA sequence
          Length = 655

 Score =  787 bits (397), Expect = 0.0
 Identities = 400/401 (99%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 350 cttccaccatccacttgcatcgcacagtaaatcagataaaagatcttggagctaaagctg 409
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   cttccaccatccacttgcatcgcacagtaaatcagataaaagatcttggagctaaagctg 60

                                                                       
Query: 410 gagtcgtcttgaaccctgctactccattgagtgctatagaatatgttcttgatgtggttg 469
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  gagtcgtcttgaaccctgctactccattgagtgctatagaatatgttcttgatgtggttg 120

                                                                       
Query: 470 atcttgtcttgattatgtctgtcaaccctggttttggtggtcaaggctttattgagagtc 529
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 atcttgtcttgattatgtctgtcaaccctggttttggtggtcaaggctttattgagagtc 180

                                                                       
Query: 530 aagtgaagaaaatctcagatttgagaagactgtgtgcagagaagggggtaaatccatgga 589
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 aagtgaagaaaatctcagatttgagaagactgtgtgcagagaagggggtaaatccatgga 240

                                                                       
Query: 590 ttgaggtagatggtggagttggtcccaagaatgcatataaggttattgaggctggggcta 649
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 241 ttgaggtagatggtggagttggtcccaagaatgcatataaggttatttaggctggggcta 300

                                                                       
Query: 650 atgctttggttgctggttcagcagtttttggagctaaagattatgctgaagctataaaag 709
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 atgctttggttgctggttcagcagtttttggagctaaagattatgctgaagctataaaag 360

                                                    
Query: 710 gaatcaaaaccagcaaaaggccagtagcagtgccagcatga 750
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gaatcaaaaccagcaaaaggccagtagcagtgccagcatga 401


>gi|218687715|gb|GH296282.1|GH296282 JCL731 Jatropha curcas total
           leaf library Jatropha curcas cDNA, mRNA sequence
          Length = 655

 Score =  787 bits (397), Expect = 0.0
 Identities = 400/401 (99%)
 Strand = Plus / Plus

                                                                       
Query: 350 cttccaccatccacttgcatcgcacagtaaatcagataaaagatcttggagctaaagctg 409
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1   cttccaccatccacttgcatcgcacagtaaatcagataaaagatcttggagctaaagctg 60

                                                                       
Query: 410 gagtcgtcttgaaccctgctactccattgagtgctatagaatatgttcttgatgtggttg 469
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61  gagtcgtcttgaaccctgctactccattgagtgctatagaatatgttcttgatgtggttg 120

                                                                       
Query: 470 atcttgtcttgattatgtctgtcaaccctggttttggtggtcaaggctttattgagagtc 529
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 atcttgtcttgattatgtctgtcaaccctggttttggtggtcaaggctttattgagagtc 180

                                                                       
Query: 530 aagtgaagaaaatctcagatttgagaagactgtgtgcagagaagggggtaaatccatgga 589
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 aagtgaagaaaatctcagatttgagaagactgtgtgcagagaagggggtaaatccatgga 240

                                                                       
Query: 590 ttgaggtagatggtggagttggtcccaagaatgcatataaggttattgaggctggggcta 649
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 241 ttgaggtagatggtggagttggtcccaagaatgcatataaggttatttaggctggggcta 300

                                                                       
Query: 650 atgctttggttgctggttcagcagtttttggagctaaagattatgctgaagctataaaag 709
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 atgctttggttgctggttcagcagtttttggagctaaagattatgctgaagctataaaag 360

                                                    
Query: 710 gaatcaaaaccagcaaaaggccagtagcagtgccagcatga 750
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gaatcaaaaccagcaaaaggccagtagcagtgccagcatga 401