Jatropha Genome Database
- Jcr4S05943.70
BLASTN 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Jcr4S05943.70
(2865 letters)
Database: JAT_unigene
122,497 sequences; 49,272,789 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
contig08005 length=2342 numreads=44 gene=isogroup02914 statu... 4300 0.0
contig14775 length=804 numreads=9 gene=isogroup09684 status=... 1263 0.0
>contig08005 length=2342 numreads=44 gene=isogroup02914
status=isotig
Length = 2342
Score = 4300 bits (2169), Expect = 0.0
Identities = 2169/2169 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 atggcgtctccttcgctaatggatactcttttccagcgcacactagatgatataatcaaa 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2169 atggcgtctccttcgctaatggatactcttttccagcgcacactagatgatataatcaaa 2110
Query: 61 ggcctccgccaccaacaaaccggcgagtcggcattcatttccaaagttatggaagaaatt 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2109 ggcctccgccaccaacaaaccggcgagtcggcattcatttccaaagttatggaagaaatt 2050
Query: 121 cgacgagagatcaaatccaccgacttgcataccaaatccatagctctgcacaaactcaca 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 2049 cgacgagagatcaaatccaccgacttgcataccaaatccatagctctgcacaaactcaca 1990
Query: 181 tatctaaattcaattcattttattgacatttcatgggctgcttttcacgccattgagtgt 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1989 tatctaaattcaattcattttattgacatttcatgggctgcttttcacgccattgagtgt 1930
Query: 241 atatcttctcccaatttctctcacaagaagattggttaccttgcgatctctcagtccttc 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1929 atatcttctcccaatttctctcacaagaagattggttaccttgcgatctctcagtccttc 1870
Query: 301 aacgaatcaacaccagtaattttgttgatcacaaatcaattgaggaaagatcttaggagt 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1869 aacgaatcaacaccagtaattttgttgatcacaaatcaattgaggaaagatcttaggagt 1810
Query: 361 aataatgagtttgaggttagtttagctcttgaatgcttatctacaattggtactgttgat 420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1809 aataatgagtttgaggttagtttagctcttgaatgcttatctacaattggtactgttgat 1750
Query: 421 ttgtgtagagatcttactcctgaagtttttactttaatgtcaagttccaagctcttggtt 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1749 ttgtgtagagatcttactcctgaagtttttactttaatgtcaagttccaagctcttggtt 1690
Query: 481 agaaagaaagctttaggtgtgattttaagggtttttggtaaatacccagatgctgttagg 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1689 agaaagaaagctttaggtgtgattttaagggtttttggtaaatacccagatgctgttagg 1630
Query: 541 gtttgttttaagagattagttgaatgtttagatggtactgatcaacagattgcttctgca 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1629 gtttgttttaagagattagttgaatgtttagatggtactgatcaacagattgcttctgca 1570
Query: 601 gtaattggggtgttttgtgagcttgcttcgaaagacccaagatcatatcttcctttagca 660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1569 gtaattggggtgttttgtgagcttgcttcgaaagacccaagatcatatcttcctttagca 1510
Query: 661 cctgaattttacagggttttggttgattcgaggaacaattgggttttgattaaagtattg 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1509 cctgaattttacagggttttggttgattcgaggaacaattgggttttgattaaagtattg 1450
Query: 721 aagatttttgcaaagttggctcctttagagcctagattggctaagagagttgttgaacca 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1449 aagatttttgcaaagttggctcctttagagcctagattggctaagagagttgttgaacca 1390
Query: 781 atctgtgatatcatgaggagaactggagcaaaatcattgatgtttgagtgtatcaggact 840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1389 atctgtgatatcatgaggagaactggagcaaaatcattgatgtttgagtgtatcaggact 1330
Query: 841 gtggcaactagtttcactgattatgaatctgcagtagagctagctgttgcaaaaaatggt 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1329 gtggcaactagtttcactgattatgaatctgcagtagagctagctgttgcaaaaaatggt 1270
Query: 901 gagtttttgacagacgatgatccaaaccttaaatatcttggattgcatgtgctatcaatt 960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1269 gagtttttgacagacgatgatccaaaccttaaatatcttggattgcatgtgctatcaatt 1210
Query: 961 atagcgccaaagcatttgtgggcagtgttgcagaataaagaggttgtgattatgtctttg 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1209 atagcgccaaagcatttgtgggcagtgttgcagaataaagaggttgtgattatgtctttg 1150
Query: 1021 agtgatgctgatcctaatataaaacttgagtcattgcggctagttatggcaatggtgtct 1080
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1149 agtgatgctgatcctaatataaaacttgagtcattgcggctagttatggcaatggtgtct 1090
Query: 1081 gagagtaatgtggtggaattttgcagggttttggtcaactattcacttaaatctgatcct 1140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1089 gagagtaatgtggtggaattttgcagggttttggtcaactattcacttaaatctgatcct 1030
Query: 1141 gagttctgcaatgagattcttggttcaattttgtccaggtgtcgccagaatttttatgag 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1029 gagttctgcaatgagattcttggttcaattttgtccaggtgtcgccagaatttttatgag 970
Query: 1201 attatagttgactttgattggtatgtgtcacttcttggggaaatatcaaggattccacat 1260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 969 attatagttgactttgattggtatgtgtcacttcttggggaaatatcaaggattccacat 910
Query: 1261 tgccaaaagggggaagaaattgagaatcaacttattgacataggtatgagggttaaggat 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 909 tgccaaaagggggaagaaattgagaatcaacttattgacataggtatgagggttaaggat 850
Query: 1321 gttagactaccgcttgttcatgttggtcgtgacctgctgattgatcctgcgttacttggg 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 849 gttagactaccgcttgttcatgttggtcgtgacctgctgattgatcctgcgttacttggg 790
Query: 1381 aatcctttcttgcacaggatattatctgctgctgcttgggtgtgtggcgagtatgtgaaa 1440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 789 aatcctttcttgcacaggatattatctgctgctgcttgggtgtgtggcgagtatgtgaaa 730
Query: 1441 ttttcaaagaacccagtggaacttgtggaagcactactgcagcctcgcactagtctcttg 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 729 ttttcaaagaacccagtggaacttgtggaagcactactgcagcctcgcactagtctcttg 670
Query: 1501 cctccatcagtcagaactgtttacatgcaatctgcttttaaaatcttaatattttgccta 1560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 669 cctccatcagtcagaactgtttacatgcaatctgcttttaaaatcttaatattttgccta 610
Query: 1561 catttttacctcttacaaaggggatgtattgctgatgataaggcgtcagaagttatggat 1620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 609 catttttacctcttacaaaggggatgtattgctgatgataaggcgtcagaagttatggat 550
Query: 1621 ttggcatcccaaagggaatgctcaggaatgtctgatttggcaacacacaaagcatctgcc 1680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 549 ttggcatcccaaagggaatgctcaggaatgtctgatttggcaacacacaaagcatctgcc 490
Query: 1681 tgttatgaacaggaggaaggattcaatccaagggattcgaatagatcatatgaagatctt 1740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 489 tgttatgaacaggaggaaggattcaatccaagggattcgaatagatcatatgaagatctt 430
Query: 1741 tctattatagatggtggagatgatcaaacaacttcttctcctgggaaaagtctcacacat 1800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 429 tctattatagatggtggagatgatcaaacaacttcttctcctgggaaaagtctcacacat 370
Query: 1801 gaatctttttctaacctgttaaccttaattgaattggccttgaatccactatctagaaat 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 369 gaatctttttctaacctgttaaccttaattgaattggccttgaatccactatctagaaat 310
Query: 1861 tatgatgttgaagtacaggagcgagcacggaatatactgggatttgttgaattgataaag 1920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 309 tatgatgttgaagtacaggagcgagcacggaatatactgggatttgttgaattgataaag 250
Query: 1921 caacaaatatccgattgtttcttccccaaggacgtgaatttgaagaaggaagatgtgaaa 1980
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 249 caacaaatatccgattgtttcttccccaaggacgtgaatttgaagaaggaagatgtgaaa 190
Query: 1981 gtattcaaatttgttgagttggtgtatgatgctttcgcggaggagcttggtccagtgtct 2040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 189 gtattcaaatttgttgagttggtgtatgatgctttcgcggaggagcttggtccagtgtct 130
Query: 2041 gtaaatgctcaagagagagttcctgtaccagatgggttaatgcttaaggagaatctttcg 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 129 gtaaatgctcaagagagagttcctgtaccagatgggttaatgcttaaggagaatctttcg 70
Query: 2101 gacttggaagcaatttgtggagatgtacaactaccttcatcaagttcgttttctctggga 2160
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 69 gacttggaagcaatttgtggagatgtacaactaccttcatcaagttcgttttctctggga 10
Query: 2161 agtccttat 2169
|||||||||
Sbjct: 9 agtccttat 1
>contig14775 length=804 numreads=9 gene=isogroup09684
status=isotig
Length = 804
Score = 1263 bits (637), Expect = 0.0
Identities = 643/645 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 2221 ccatcaagtgagtccacttcattgcttgctgaacatcgtaagcgacatggattatattat 2280
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 ccatcaagtgagtccacttcattgcttgctgaacatcgtaagcgacatggattatattat 60
Query: 2281 cttccttcagagaaaaatgaaatcttagcaaatgattatccaccggccaatgaccttaaa 2340
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 cttccttcagagaagaatgaaatcttagcaaatgattatccaccggccaatgaccttaaa 120
Query: 2341 tccagtattgacacccatgatgatgctcaagatctagttaagcttgctgaccaatcactt 2400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 tccagtattgacacccatgatgatgctcaagatctagttaagcttgctgaccaatcactt 180
Query: 2401 gtatcaaagagaaagtcaagccttgcaaagcctcggccggtggtggtgaagttggatgag 2460
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 gtatcaaagagaaggtcaagccttgcaaagcctcggccggtggtggtgaagttggatgag 240
Query: 2461 ggagatgtacccctaactgccaagaaaccagatagacaagatggtttactttctggtgct 2520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 ggagatgtacccctaactgccaagaaaccagatagacaagatggtttactttctggtgct 300
Query: 2521 gttcgagatattcttttagctaatccatctgatgagacatctagtaatagaaaagggaag 2580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 gttcgagatattcttttagctaatccatctgatgagacatctagtaatagaaaagggaag 360
Query: 2581 gagaaacagaatgttgatcctcttgaatcgagagaaatattgggtggagaaaagcctgac 2640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 gagaaacagaatgttgatcctcttgaatcgagagaaatattgggtggagaaaagcctgac 420
Query: 2641 cttggaaatccaagttctagaagaagcaaacaccggagccatggtaaagagaaaggcacg 2700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 cttggaaatccaagttctagaagaagcaaacaccggagccatggtaaagagaaaggcacg 480
Query: 2701 aaaagtgtagagaagaagaatgccgatgaaaatgatgatcatggagagaaagaaaagcat 2760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aaaagtgtagagaagaagaatgccgatgaaaatgatgatcatggagagaaagaaaagcat 540
Query: 2761 aagagtagacatcgccatggcaggcataaaactcgacaaagagctgatgcgccaacctta 2820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 aagagtagacatcgccatggcaggcataaaactcgacaaagagctgatgcgccaacctta 600
Query: 2821 actgtggtcacacaaacaccagtaattcctgatttccttctatag 2865
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 actgtggtcacacaaacaccagtaattcctgatttccttctatag 645