# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/pj01991.fasta.nr -Q ../query/KIAA2038.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA2038, 917 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7803055 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9060+/-0.000214; mu= 7.1839+/- 0.012 mean_var=165.6522+/-31.776, 0's: 38 Z-trim: 103 B-trim: 261 in 1/65 Lambda= 0.099650 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|190359325|sp|Q75VX8.2|FA59B_HUMAN RecName: Full ( 987) 6309 919.7 0 gi|168270826|dbj|BAG10206.1| FAM59B protein [synth ( 874) 6016 877.6 0 gi|109102293|ref|XP_001086318.1| PREDICTED: hypoth ( 911) 5631 822.2 0 gi|109478824|ref|XP_343128.3| PREDICTED: hypotheti (1008) 4062 596.7 1.7e-167 gi|190359326|sp|Q6PAJ3.2|FA59B_MOUSE RecName: Full ( 880) 3357 495.3 5e-137 gi|21748596|dbj|BAC03435.1| FLJ00375 protein [Homo ( 708) 3329 491.2 7e-136 gi|37805333|gb|AAH60268.1| Gm444 protein [Mus musc ( 840) 3079 455.3 5.2e-125 gi|109479085|ref|XP_001069822.1| PREDICTED: hypoth ( 923) 2767 410.5 1.8e-111 gi|148705314|gb|EDL37261.1| mCG11643 [Mus musculus ( 902) 2402 358.0 1.1e-95 gi|73980632|ref|XP_540115.2| PREDICTED: hypothetic ( 806) 2286 341.3 1.1e-90 gi|149050828|gb|EDM03001.1| hypothetical LOC362801 ( 263) 1509 229.1 2.1e-57 gi|6526803|dbj|BAA88120.1| HRIHFB2063 [Homo sapien ( 269) 1247 191.4 4.6e-46 gi|119621112|gb|EAX00707.1| hCG1783950 [Homo sapie ( 290) 1247 191.5 4.8e-46 gi|114672795|ref|XP_524002.2| PREDICTED: hypotheti ( 932) 1168 180.6 2.8e-42 gi|148664548|gb|EDK96964.1| mCG123161 [Mus musculu ( 876) 1154 178.6 1.1e-41 gi|10437739|dbj|BAB15094.1| unnamed protein produc ( 875) 1148 177.7 2e-41 gi|125991851|sp|Q9H706.2|FA59A_HUMAN RecName: Full ( 876) 1143 177.0 3.3e-41 gi|21740279|emb|CAD39149.1| hypothetical protein [ ( 877) 1143 177.0 3.3e-41 gi|123791251|sp|Q3UFT3.1|FA59A_MOUSE RecName: Full ( 876) 1142 176.9 3.6e-41 gi|126321150|ref|XP_001369275.1| PREDICTED: hypoth ( 876) 1126 174.6 1.8e-40 gi|118086922|ref|XP_419182.2| PREDICTED: similar t ( 883) 1117 173.3 4.4e-40 gi|51258471|gb|AAH80101.1| MGC84378 protein [Xenop ( 898) 995 155.7 8.4e-35 gi|149425218|ref|XP_001521649.1| PREDICTED: simila ( 233) 961 150.3 9.9e-34 gi|189545738|ref|XP_001345215.2| PREDICTED: simila ( 810) 935 147.1 3.1e-32 gi|194214596|ref|XP_001496762.2| PREDICTED: simila ( 807) 800 127.7 2.2e-26 gi|111307706|gb|AAI21068.1| FAM59A protein [Homo s ( 807) 799 127.5 2.4e-26 gi|47225190|emb|CAF98817.1| unnamed protein produc ( 640) 783 125.1 1e-25 gi|119936139|gb|ABM06078.1| hypothetical protein L ( 539) 772 123.5 2.7e-25 gi|194678050|ref|XP_583921.4| PREDICTED: hypotheti ( 826) 767 122.9 5.9e-25 gi|82188700|sp|Q7ZVU1|FA59A_BRARE Protein FAM59A ( 867) 763 122.4 9e-25 gi|149017056|gb|EDL76107.1| rCG49307 [Rattus norve ( 754) 752 120.7 2.5e-24 gi|109122021|ref|XP_001103392.1| PREDICTED: simila ( 618) 748 120.1 3.2e-24 gi|73961750|ref|XP_547618.2| PREDICTED: hypothetic ( 865) 747 120.1 4.4e-24 gi|194386984|dbj|BAG59858.1| unnamed protein produ ( 753) 743 119.4 6e-24 gi|13477219|gb|AAH05074.1| FAM59A protein [Homo sa ( 777) 743 119.5 6.1e-24 gi|82185209|sp|Q6NRE4.1|FA59A_XENLA RecName: Full= ( 876) 720 116.2 6.6e-23 gi|109730197|gb|AAI13784.1| Gm444 protein [Mus mus ( 170) 667 107.8 4.2e-21 gi|118089124|ref|XP_001234207.1| PREDICTED: simila ( 366) 648 105.5 4.7e-20 gi|47207031|emb|CAG05000.1| unnamed protein produc ( 604) 633 103.5 3e-19 gi|29612690|gb|AAH49983.1| Gm944 protein [Mus musc ( 658) 555 92.3 7.5e-16 gi|74189522|dbj|BAE36773.1| unnamed protein produc ( 374) 433 74.6 9.7e-11 gi|109122626|ref|XP_001115336.1| PREDICTED: hypoth ( 298) 422 72.9 2.5e-10 gi|97180301|sp|Q95JC9.2|PRP_PIG RecName: Full=Basi ( 676) 403 70.5 2.9e-09 gi|15145797|gb|AAK61383.1| basic proline-rich prot ( 676) 403 70.5 2.9e-09 gi|146404027|gb|ABQ32533.1| putative exported prot ( 727) 391 68.8 1e-08 gi|159164180|pdb|2DKZ|A Chain A, Solution Structur ( 84) 369 64.7 2e-08 gi|17945382|gb|AAL48746.1| RE17165p [Drosophila me ( 420) 370 65.6 5.6e-08 gi|41400381|gb|AAS07042.1| minus agglutinin [Chlam (3889) 384 68.6 6.4e-08 gi|41400384|gb|AAS07044.1| plus agglutinin [Chlamy (3409) 382 68.2 7.1e-08 gi|158276064|gb|EDP01838.1| cell wall protein pher ( 527) 368 65.4 8e-08 >>gi|190359325|sp|Q75VX8.2|FA59B_HUMAN RecName: Full=Pro (987 aa) initn: 6309 init1: 6309 opt: 6309 Z-score: 4909.3 bits: 919.7 E(): 0 Smith-Waterman score: 6309; 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