# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/pj01256.fasta.huge -Q ../query/KIAA2029.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA2029, 1021 aa vs ./tmplib.25089 library 1986484 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7354+/-0.00573; mu= 20.7113+/- 0.388 mean_var=136.3935+/-32.957, 0's: 0 Z-trim: 15 B-trim: 4 in 1/39 Lambda= 0.109819 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1312 ( 1471 res) fh11767 (1471) 1823 301.4 5.6e-82 KIAA0366 ( 1201 res) hh00124 (1201) 1362 228.2 4.9e-60 KIAA1346 ( 999 res) fj00671 ( 999) 1027 175.0 4.2e-44 KIAA0688 ( 849 res) hk03410 ( 849) 825 142.9 1.7e-34 KIAA0605 ( 1031 res) hg03238a (1031) 685 120.9 8.8e-28 KIAA0021 ( 703 res) ha00117(revised) ( 703) 307 60.7 7.7e-10 KIAA1233 ( 1023 res) fh08611 (1023) 307 61.0 9.3e-10 KIAA1445 ( 1202 res) fg03469b (1202) 279 56.7 2.2e-08 KIAA1777 ( 954 res) fh19201x1 ( 954) 226 48.1 6.6e-06 KIAA0550 ( 1524 res) hh15909 (1524) 200 44.3 0.00015 KIAA2036 ( 1322 res) pf06513 (1322) 193 43.1 0.00029 >>KIAA1312 ( 1471 res) fh11767 (1471 aa) initn: 1291 init1: 300 opt: 1823 Z-score: 1563.6 bits: 301.4 E(): 5.6e-82 Smith-Waterman score: 1953; 33.299% identity (60.206% similar) in 970 aa overlap (69-1003:121-1040) 40 50 60 70 80 90 KIAA20 LPQKQHFCGRRKKYMPQPPKEDLFILPDEYKSCLRHKRSLLRYHRNEELNVETLVVVDKK : :. . .: : : ::.:::.:.. KIAA13 NLAGDVAALNSGLATEAFSAYGNKTDNTREKRTHRRTKRFLSYPRF----VEVLVVADNR 100 110 120 130 140 100 110 120 130 140 150 KIAA20 MMQNHGHENITTYVLTILNMVSALFKDGTIGGNINIAIVGLILLEDEQPGLVISHHADHT :.. :: ::. :.::....:....:: .::. :::.::.::....:: : :: .:. : KIAA13 MVSYHG-ENLQHYILTLMSIVASIYKDPSIGNLINIVIVNLIVIHNEQDGPSISFNAQTT 150 160 170 180 190 200 160 170 180 190 200 210 KIAA20 LSSFCQWQSGLMGKDGTRHDHAILLTGLDICSWKNEPCDTLGFAPISGMCSKYRSCTINE :..::::: . . : .:: :.::: ::: .. :::::.: .. .:. ::::.:.: KIAA13 LKNFCQWQHSKNSPGGIHHDTAVLLTRQDICR-AHDKCDTLGLAELGTICDPYRSCSISE 210 220 230 240 250 260 220 230 240 250 260 270 KIAA20 DTGLGLAFTIAHESGHNFGMIHDGEGNMCK----KSEGNIMSPTLAGRNGVFSWSPCSRQ :.::. ::::::: :: :.: :: ..: :: :: ..:.::: .. . :: :::. KIAA13 DSGLSTAFTIAHELGHVFNMPHD-DNNKCKEEGVKSPQHVMAPTLNFYTNPWMWSKCSRK 270 280 290 300 310 320 280 290 300 310 320 330 KIAA20 YLHKFLSTAQAICLADQPKPVKEYKYPEKLPGELYDANTQCKWQFGEKAKLCMLDFKKDI :. .::.:. . :: ..:. . : : .::: ::..: ::. :: ...: .. KIAA13 YITEFLDTGYGECLLNEPES-RPYPLPVQLPGILYNVNKQCELIFGPGSQVCPYMMQ--- 330 340 350 360 370 340 350 360 370 380 390 KIAA20 CKALWCHRIG---RKCETKFMPAAEGTICGHDMWCRGGQCVKYGDEGPKPTHGHWSDWSS :. :::. .. . :.:. : :.:: : :. : :: . : : : :..:: KIAA13 CRRLWCNNVNGVHKGCRTQHTPWADGTECEPGKHCKYGFCVPKEMDVPV-TDGSWGSWSP 380 390 400 410 420 430 400 410 420 430 440 450 KIAA20 WSPCSRTCGGGVSHRSRLCTNPKPSHGGKFCEGSTRTLKLCNSQKCPRDSVDFRAAQCAE .. ::::::::.. : :. :.:..:::.: : .: ::.. : ... ::: :::. KIAA13 FGTCSRTCGGGIKTAIRECNRPEPKNGGKYCVGRRMKFKSCNTEPCLKQKRDFRDEQCAH 440 450 460 470 480 490 460 470 480 490 500 KIAA20 HNSRRFRGR----HYKWKP-YTQVEDQDLCKLYCIAEGFDFFFSLSNKVKDGTPCSEDSR ....: . .: : :. . .: :::.: . : ...: ..: :::::..:. KIAA13 FDGKHFNINGLLPNVRWVPKYSGILMKDRCKLFCRVAGNTAYYQLRDRVIDGTPCGQDTN 500 510 520 530 540 550 510 520 530 540 550 560 KIAA20 NVCIDGICERVGCDNVLGSDAVEDVCGVCNGNNSACTIHRGLYTKHHHTNQYYHMVTIPS ..:..:.:...:::.::.: : .: ::::.:.::.: : .. :. : .: ::. KIAA13 DICVQGLCRQAGCDHVLNSKARRDKCGVCGGDNSSCKTVAGTFNTVHY--GYNTVVRIPA 560 570 580 590 600 610 570 580 590 600 610 620 KIAA20 GARSIRIYEMNVS-----TSYISVRNALRRYYLNGHWTVDWPGR-YKFSGTTFDYRRSYN :: .: . . . : .:... .. .. :::...: : ...... .: : . KIAA13 GATNIDVRQHSFSGETDDDNYLALSSSKGEFLLNGNFVVTMAKREIRIGNAVVEYSGSET 620 630 640 650 660 670 630 640 650 660 670 KIAA20 EPENLIATGPTNETLIVELLFQGR--NPGVAWEYSMPRLGTEKQPPAQPSYTWAIVRSEC : . .: .. :....: :. :: : . ...: .: . : . : KIAA13 AVERINSTDRIEQELLLQVLSVGKLYNPDVRYSFNIPIEDKPQQFYWNSHGPW----QAC 680 690 700 710 720 730 680 690 700 710 720 730 KIAA20 SVSCGGGQMTVREGCYRDL-KFQVNMSFCNPKTRPVTGLVPCKVSACPPSWSVGNWSACS : : : . . : :. .. :. . :. .: :: .. : : :.. : :: KIAA13 SKPCQG-ERKRKLVCTRESDQLTVSDQRCDRLPQPGHITEPCGTD-CDLRWHVASRSECS 740 750 760 770 780 790 740 750 760 770 780 790 KIAA20 RTCGGGAQSRPVQCTRRVHYD--SEPVPASLCP-QPAPSSRQACNSQSCPPAWSAGPWAE :: : .. . :.. . : .: : ..: .: ::.:. :... .: . :.: KIAA13 AQCGLGYRTLDIYCAKYSRLDGKTEKVDDGFCSSHPKPSNREKCSGECNTGGWRYSAWTE 800 810 820 830 840 850 800 810 820 830 840 850 KIAA20 CSHTCGKGWRKRAVACKSTNPSARAQLLPDAVCTSEPKPRMHEACLLQRCHKPKKLQWLV ::..: : ..: . : .: : ..: :. :: . : .::: . :: KIAA13 CSKSCDGGTQRRRAICVNT----RNDVLDDSKCTHQEK------VTIQRCSEFPCPQWKS 860 870 880 890 900 860 870 880 890 900 910 KIAA20 SAWSQCSVTCERGTQKRFLKCAEKYVSGKYRELASKKCSHLPKPSLELERACAPLPCPRH . ::.: ::: .: ..: . : .. :. : : .. :. ::. ..: : KIAA13 GDWSECLVTCGKGHKHRQVWC--QF--GEDR-LNDRMCDPETKPTSM--QTCQQPEC--- 910 920 930 940 950 920 930 940 950 960 970 KIAA20 PPFAAAGPSRGSWFASPWSQCTASCGGGVQTRSVQCLAGGRPA----SGCLLHQKPSASL .:: :.::.::...:: : : :.:.:. : . . : .:. . KIAA13 ----------ASWQAGPWGQCSVTCGQGYQLRAVKCIIGTYMSVVDDNDCNAATRPTDTQ 960 970 980 990 1000 980 990 1000 1010 1020 KIAA20 ACNTHFC---PIAE--KKDAFCKDYFHWCY--LVPQHGMCSHKFYGKQCCKTCSKSNL :. : : : ..... .: . .: . : KIAA13 DCELPSCHPPPAAPETRRSTYSAPRTQWRFGSWTPCSATCGKGTRMRYVSCRDENGSVAD 1010 1020 1030 1040 1050 1060 KIAA13 ESACATLPRPVAKEECSVTPCGQWKALDWSSCSVTCGQGRATRQVMCVNYSDHVIDRSEC 1070 1080 1090 1100 1110 1120 >>KIAA0366 ( 1201 res) hh00124 (1201 aa) initn: 819 init1: 325 opt: 1362 Z-score: 1169.7 bits: 228.2 E(): 4.9e-60 Smith-Waterman score: 1700; 33.607% identity (59.719% similar) in 854 aa overlap (80-905:244-1062) 50 60 70 80 90 100 KIAA20 KKYMPQPPKEDLFILPDEYKSCLRHKRSLLRYHRNE-ELNVETLVVVDKKMMQNHGHENI : : .: . :.:.:. :: .... ::.:.. KIAA03 HYRESDLEGLDDLGTVYGNIHQQLNETMRRRRHAGENDYNIEVLLGVDDSVVRFHGKEHV 220 230 240 250 260 270 110 120 130 140 150 160 KIAA20 TTYVLTILNMVSALFKDGTIGGNINIAIVGLILLEDEQP-GLVISHHADHTLSSFCQWQS .:.::..:.:. ...: ..: .::...: .:.: . .:. . ...: . :.: : KIAA03 QNYLLTLMNIVNEIYHDESLGVHINVVLVRMIMLGYAKSISLIERGNPSRSLENVCRWAS 280 290 300 310 320 330 170 180 190 200 210 220 KIAA20 GLMGKD---GTRHDHAILLTGLDICSWKNEPCDTLGFAPISGMCSKYRSCTINEDTGLGL . .: . .:::::.:: :. : :.::..::: ::::.:.. :.. KIAA03 QQQRSDLNHSEHHDHAIFLTRQDF-----GPAGMQGYAPVTGMCHPVRSCTLNHEDGFSS 340 350 360 370 380 230 240 250 260 270 280 KIAA20 AFTIAHESGHNFGMIHDGEGNMC--KKSEGNIMSPTLAGRNGVFSWSPCSRQYLHKFLST ::..:::.:: .:: :::.:: : . . :..:.: . . . :: :: : :.... . KIAA03 AFVVAHETGHVLGMEHDGQGNRCGDETAMGSVMAPLVQAAFHRYHWSRCSGQELKRYIHS 390 400 410 420 430 440 290 300 310 320 330 340 KIAA20 AQAICLADQPKPVKEYKYPEKLPGELYDANTQCKWQFGEKAKLCMLDFKKDICKALWCHR . :: :.: : :: ::: :. . ::...:: :.: : :: ::: . KIAA03 YD--CLLDDPFDHDWPKLPE-LPGINYSMDEQCRFDFGVGYKMCTAFRTFDPCKQLWCSH 450 460 470 480 490 500 350 360 370 380 390 400 KIAA20 IGRK--CETKFMPAAEGTICGHDMWCRGGQCVKYGDEGPKPTHGHWSDWSSWSPCSRTCG :.:: : .:: :. :: :.:. . . . . :.:..:.... :::::: KIAA03 PDNPYFCKTKKGPPLDGTECAAGKWCYKGHCM-WKNANQQKQDGNWGSWTKFGSCSRTCG 510 520 530 540 550 560 410 420 430 440 450 KIAA20 GGVSHRSRLCTNPKPSHGGKFCEGSTRTLKLCNSQKCPRDSVDFRAAQCAEHNSR-RFRG :: :.: :.:: : .::. : : . .:::...: . :::: :: ..::. .... KIAA03 TGVRFRTRQCNNPMPINGGQDCPGVNFEYQLCNTEECQKHFEDFRAQQCQQRNSHFEYQN 570 580 590 600 610 620 460 470 480 490 500 510 KIAA20 RHYKWKPYTQVEDQDLCKLYCIAEGFDFFFSLSNKVKDGTPCS-EDSRNVCIDGICERVG ...: :: . . . :.::: .. ... :.::: :: .: ..:. : : .:: KIAA03 TKHHWLPYEHPDPKKRCHLYCQSKETGDVAYMKQLVHDGTHCSYKDPYSICVRGECVKVG 630 640 650 660 670 680 520 530 540 550 560 570 KIAA20 CDNVLGSDAVEDVCGVCNGNNSACTIHRGLYTKHHHTNQYYHMVTIPSGARSIRIYEMNV ::. .::. ::: ::::.:.:: : .: .:. . : .: :: ::: . : : .. KIAA03 CDKEIGSNKVEDKCGVCGGDNSHCRTVKGTFTRTPRKLGYLKMFDIPPGARHVLIQEDEA 690 700 710 720 730 740 580 590 600 610 620 630 KIAA20 STSYISVRN-ALRRYYLNGHWTVDWPGRYKFSGTTFDYRRSYNEPENLIATGPTNETLIV : ....: : .: :::. . :. .:: .. :.: . :: .. .:: KIAA03 SPHILAIKNQATGHYILNGKGEEAKSRTFIDLGVEWDYNIE-DDIESLHTDGPLHDPVIV 750 760 770 780 790 800 640 650 660 670 680 KIAA20 ELLFQGRNP--GVAWEY-----SMPRLGTEKQPPAQ-PSYTWAIVR-SECSVSCGGGQMT .. : . .....: :.: ..... . .. ::. :. : :::: . KIAA03 LIIPQENDTRSSLTYKYIIHEDSVPTINSNNVIQEELDTFEWALKSWSQVSKPCGGGFQY 810 820 830 840 850 860 690 700 710 720 730 740 KIAA20 VREGCYR--DLKFQVNMSFC--NPKTRPVTGLVPCKVSACP-PSWSVGNWSACSRTCGG- .. :: : : :. :. ::: : : .:. . :... : : : . .: :..:::. KIAA03 TKYGCRRKSDNKM-VHRSFCEANKKPKPIRRM--CNIQECTHPLWVAEEWEHCTKTCGSS 870 880 890 900 910 920 750 760 770 780 790 800 KIAA20 GAQSRPVQCTRRV-HYDSEPVPASLCPQPAPSSRQACNSQSCPPAWSAGPWAECSHTCGK : : : :.: . . .. : .. : : ::. :: :: :..:::.::: :::. KIAA03 GYQLRTVRCLQPLLDGTNRSVHSKYCMGDRPESRRPCNRVPCPAQWKTGPWSECSVTCGE 930 940 950 960 970 980 810 820 830 840 850 860 KIAA20 GWRKRAVACKSTNPSARAQLLPDAVCTSEPKPRMHEACLLQRCHKPKKLQWLVSAWSQCS : . : : :.. . : .: ::. .:: : :. : .. : KIAA03 GTEVRQVLCRAGDH-----------CDGE-KPESVRACQLPPCNDEPCL-------GDKS 990 1000 1010 1020 870 880 890 900 910 920 KIAA20 VTCERGTQKRFLKCAEKYVSGKYRELASKKCSHLPKPSLELERACAPLPCPRHPPFAAAG . :. . :. :. . : ::. : :: : : :: : KIAA03 IFCQMEVLARY--CSIPGYNKLCCESCSKRSSTLPPPYL-LEAAETHDDVISNPSDLPRS 1030 1040 1050 1060 1070 930 940 950 960 970 980 KIAA20 PSRGSWFASPWSQCTASCGGGVQTRSVQCLAGGRPASGCLLHQKPSASLACNTHFCPIAE KIAA03 LVMPTSLVPYHSETPAKKMSLSSISSVGGPNAYAAFRPNSKPDGANLRQRSAQQAGSKTV 1080 1090 1100 1110 1120 1130 >>KIAA1346 ( 999 res) fj00671 (999 aa) initn: 1125 init1: 283 opt: 1027 Z-score: 883.6 bits: 175.0 E(): 4.2e-44 Smith-Waterman score: 1563; 35.033% identity (60.915% similar) in 765 aa overlap (51-783:260-998) 30 40 50 60 70 80 KIAA20 RTWELAHQPLHSSDLRLGLPQKQHFCGRRKKYMPQPPKEDLFILPDEYKSCLRHKRSLLR .. :: : . : : .:.:: .. KIAA13 CGVVDDEPRPTGKAETEDEDEGTEGEDEGPQWSPQDPALQGVGQPTGTGS-IRKKR-FVS 230 240 250 260 270 280 90 100 110 120 130 140 KIAA20 YHRNEELNVETLVVVDKKMMQNHGHENITTYVLTILNMVSALFKDGTIGGNINIAIVGLI :: :::..:.:..: . :: .. :.::...... :.: .: .......: .. KIAA13 SHRY----VETMLVADQSMAEFHGS-GLKHYLLTLFSVAARLYKHPSIRNSVSLVVVKIL 290 300 310 320 330 340 150 160 170 180 190 KIAA20 LLEDEQPGLVISHHADHTLSSFCQWQSGLM---GKDGTRHDHAILLTGLDICSWKNEPCD ...::: : .. .: :: .::.::. .:. ..: :::.: :.:. .. :: KIAA13 VIHDEQKGPEVTSNAALTLRNFCNWQKQHNPPSDRDAEHYDTAILFTRQDLCG--SQTCD 350 360 370 380 390 400 200 210 220 230 240 250 KIAA20 TLGFAPISGMCSKYRSCTINEDTGLGLAFTIAHESGHNFGMIHDGEGNMCKKSEG----- :::.: .. .:. :::.. :: :: ::: ::: :: :.: :: ....: . .: KIAA13 TLGMADVGTVCDPSRSCSVIEDDGLQAAFTTAHELGHVFNMPHD-DAKQCASLNGVNQDS 410 420 430 440 450 260 270 280 290 300 310 KIAA20 NIMSPTLAGRNGVFSWSPCSRQYLHKFLSTAQAICLADQPK-PVKEYKYPEKLPGELYDA ..:. :.. . ::::: .. .::..... :: :.:. :. . : ::: ::: KIAA13 HMMASMLSNLDHSQPWSPCSAYMITSFLDNGHGECLMDKPQNPI---QLPGDLPGTSYDA 460 470 480 490 500 510 320 330 340 350 360 KIAA20 NTQCKWQFGEKAKLCMLDFKKDICKALWCHRIGRK---CETKFMPAAEGTICGHDMWCRG : ::.. ::: .: : : . :..::: . :.:: .: :.:: ::. :: . KIAA13 NRQCQFTFGEDSKHCP-D-AASTCSTLWCTGTSGGVLVCQTKHFPWADGTSCGEGKWCIN 520 530 540 550 560 570 370 380 390 400 410 420 KIAA20 GQCVKYGDEG--PKPTHGHWSDWSSWSPCSRTCGGGVSHRSRLCTNPKPSHGGKFCEGST :.::. :. : :: :. :. :. :::::::::.. : : :: :..:::.:::. KIAA13 GKCVNKTDRKHFDTPFHGSWGMWGPWGDCSRTCGGGVQYTMRECDNPVPKNGGKYCEGKR 580 590 600 610 620 630 430 440 450 460 470 480 KIAA20 RTLKLCNSQKCPRDS-VDFRAAQCAEHN--SR-RF-RGRHYKWKP-YTQVEDQDLCKLYC . :: . :: .. :: :: :: :. : : .: : :. : .: ::: : KIAA13 VRYRSCNLEDCPDNNGKTFREEQCEAHNEFSKASFGSGPAVEWIPKYAGVSPKDRCKLIC 640 650 660 670 680 690 490 500 510 520 530 540 KIAA20 IAEGFDFFFSLSNKVKDGTPCSEDSRNVCIDGICERVGCDNVLGSDAVEDVCGVCNGNNS :.:. .:: :. :: :::::: :: .::..: : ..::: .. : : ::::.::.: KIAA13 QAKGIGYFFVLQPKVVDGTPCSPDSTSVCVQGQCVKAGCDRIIDSKKKFDKCGVCGGNGS 700 710 720 730 740 750 550 560 570 580 590 KIAA20 ACTIHRGLYTKHHHTNQYYHMVTIPSGARSIRIYEMNV-----STSYISVRNALRRYYLN .: : :. . :. ..:::.:: .:.. . : . :..... : : :: KIAA13 TCKKISGSVTSAKPG--YHDIITIPTGATNIEVKQRNQRGSRNNGSFLAIKAADGTYILN 760 770 780 790 800 810 600 610 620 630 640 650 KIAA20 GHWTVD-WPGRYKFSGTTFDYRRSYNEPENLIATGPTNETLIVELLFQGRN--PGVAWEY : .:.. ..:... : : : . . .: .: : ...: : : . . : KIAA13 GDYTLSTLEQDIMYKGVVLRYSGSSAALERIRSFSPLKEPLTIQVLTVGNALRPKIKYTY 820 830 840 850 860 870 660 670 680 690 700 710 KIAA20 SMPRLGTEKQPPAQPSYT-WAIVR-SECSVSCGGGQMTVREGCYRDLKFQVNMSFCNPKT . . ... : :... :.: . .::: :: : . : ::.. : : : .. KIAA13 FVKK--KKESFNAIPTFSAWVIEEWGECSKSCELGWQRRLVEC-RDINGQ-PASECAKEV 880 890 900 910 920 720 730 740 750 760 KIAA20 RPVTGLVPCKVSACPPSWSVGNWSACSRTCGGGAQSRPVQCTRRVHYDSEPVPASLC-PQ .:.. :: :: .:..:.::.::.::: : ..: ..: . .:. . : : KIAA13 KPAS-TRPCADHPCP-QWQLGEWSSCSKTCGKGYKKRSLKC---LSHDGGVLSHESCDPL 930 940 950 960 970 980 770 780 790 800 810 820 KIAA20 PAPSSR-QACNSQSCPPAWSAGPWAECSHTCGKGWRKRAVACKSTNPSARAQLLPDAVCT :. . :. : KIAA13 KKPKHFIDFCTMAECS 990 >>KIAA0688 ( 849 res) hk03410 (849 aa) initn: 1089 init1: 291 opt: 825 Z-score: 711.3 bits: 142.9 E(): 1.7e-34 Smith-Waterman score: 1322; 35.571% identity (58.000% similar) in 700 aa overlap (12-677:159-835) 10 20 30 40 KIAA20 LYKRSTEPHAPGASEVLVTSRTWELAHQPLHS-SDLRLGLP :: .. : :: :::.. . : : KIAA06 ELLGGAEPGTYLTGTINGDPESVASLHWDGGALLGVLQYRGAELHLQPLEGGTPNSAGGP 130 140 150 160 170 180 50 60 70 80 90 KIAA20 QKQHFCGRRKKYMPQPPKEDLFI-LPDEYKSCLRHKR--SLLRYHRNEELNVETLVVVDK :. :.. : : .. : . : :: :: :. ::::::.: KIAA06 GA-HILRRKSPASGQGPMCNVKAPLGSPSPRPRRAKRFASLSRF-------VETLVVADD 190 200 210 220 230 240 100 110 120 130 140 150 KIAA20 KMMQNHGHENITTYVLTILNMVSALFKDGTIGGNINIAIVGLILLEDEQPGLVISHHADH :: :: .. :.::.. .. :: .: . ...... :..: . . : .. : . KIAA06 KMAAFHG-AGLKRYLLTVMAAAAKAFKHPSIRNPVSLVVTRLVILGSGEEGPQVGPSAAQ 250 260 270 280 290 160 170 180 190 200 210 KIAA20 TLSSFCQWQSGLMGKDGTRHDH---AILLTGLDICSWKNEPCDTLGFAPISGMCSKYRSC :: ::: :: :: . . :: :::.: :.:. .. :::::.: .. .:. ::: KIAA06 TLRSFCAWQRGLNTPEDSDPDHFDTAILFTRQDLCGVST--CDTLGMADVGTVCDPARSC 300 310 320 330 340 350 220 230 240 250 260 KIAA20 TINEDTGLGLAFTIAHESGHNFGMIHDGEGNMCKKSEG------NIMSPTLAGRNGVFSW .: :: :: ::: ::: :: :.:.::. .. : . .: ..:.:..: . : KIAA06 AIVEDDGLQSAFTAAHELGHVFNMLHDN-SKPCISLNGPLSTSRHVMAPVMAHVDPEEPW 360 370 380 390 400 410 270 280 290 300 310 320 KIAA20 SPCSRQYLHKFLSTAQAICLADQPK-PVKEYKYPEKLPGELYDANTQCKWQFGEKAKLCM :::: ... ::... . :: :.:. :.. : .::. :::. ::. :: .. : KIAA06 SPCSARFITDFLDNGYGHCLLDKPEAPLH---LPVTFPGKDYDADRQCQLTFGPDSRHCP 420 430 440 450 460 470 330 340 350 360 370 380 KIAA20 LDFKKDICKALWC--HRIGRK-CETKFMPAAEGTICGHDMWCRGGQCVKYGD--EGPKPT : :::: : :. :.:: : :.:: :: . : ::.:... . . : KIAA06 Q--LPPPCAALWCSGHLNGHAMCQTKHSPWADGTPCGPAQACMGGRCLHMDQLQDFNIPQ 480 490 500 510 520 530 390 400 410 420 430 440 KIAA20 HGHWSDWSSWSPCSRTCGGGVSHRSRLCTNPKPSHGGKFCEGSTRTLKLCNSQKCPRDS- : :. :. :. :::::::::. :: :: : : .:::.::: .. ::.. :: : KIAA06 AGGWGPWGPWGDCSRTCGGGVQFSSRDCTRPVPRNGGKYCEGRRTRFRSCNTEDCPTGSA 540 550 560 570 580 590 450 460 470 480 490 KIAA20 VDFRAAQCAEHNSRR-----FRGRHYKWKP-YTQVEDQDLCKLYCIAEGFDFFFSLSNKV . :: ::: .: : : : . : : :: : :: ::: : :... ... : .: KIAA06 LTFREEQCAAYNHRTDLFKSFPG-PMDWVPRYTGVAPQDQCKLTCQARALGYYYVLEPRV 600 610 620 630 640 650 500 510 520 530 540 550 KIAA20 KDGTPCSEDSRNVCIDGICERVGCDNVLGSDAVEDVCGVCNGNNSACTIHRGLYTKHHHT :::::: :: .::..: : ..::: ..:: : : ::.:..:.:. . : . : .. KIAA06 VDGTPCSPDSSSVCVQGRCIHAGCDRIIGSKKKFDKCMVCGGDGSGCSKQSGSFRKFRY- 660 670 680 690 700 560 570 580 590 600 610 KIAA20 NQYYHMVTIPSGARSIRIYEMNVSTSYISVRNALR----RYYLNGHWTV-DWPGRYKFSG : ..::::.:: : . ... . .. :. ::. : :::..:. : . : KIAA06 -GYNNVVTIPAGATHILVRQQG-NPGHRSIYLALKLPDGSYALNGEYTLMPSPTDVVLPG 710 720 730 740 750 760 620 630 640 650 660 KIAA20 T-TFDYRRSYNEPENLIATGPTNETLIVELLFQGRNPGVAWEYS--MPRLGTEKQPPAQP . .. : . :.: . :: . : ...: : . .:: .:: : . : : KIAA06 AVSLRYSGATAASETLSGHGPLAQPLTLQVLVAGNPQDTRLRYSFFVPR-PTPSTPRPTP 770 780 790 800 810 820 670 680 690 700 710 720 KIAA20 SYTWAIVRSECSVSCGGGQMTVREGCYRDLKFQVNMSFCNPKTRPVTGLVPCKVSACPPS . : :.. KIAA06 Q-DWLHRRAQILEILRRRPWAGRK 830 840 >>KIAA0605 ( 1031 res) hg03238a (1031 aa) initn: 1160 init1: 303 opt: 685 Z-score: 590.7 bits: 120.9 E(): 8.8e-28 Smith-Waterman score: 914; 25.027% identity (43.179% similar) in 931 aa overlap (378-1016:122-1026) 350 360 370 380 390 400 KIAA20 ETKFMPAAEGTICGHDMWCRGGQCVKYGDEGPKPTHGHWSDWSSWSPCSRTCGGGVSHRS : : :..:..:. ::.:::::. . KIAA06 WFLLVLAVVAGDTVSTGSTDNSPTSNSLEGGTDATAFWWGEWTKWTAFSRSCGGGVTSQE 100 110 120 130 140 150 410 420 430 440 450 460 KIAA20 RLCTNPK----PSHGGKFCEGSTRTLKLCNSQKCPRDSVDFRAAQCAEHNSRRFRGRHYK : : . . :. :.. : :... .:: :.:: :. .:: ::. ::. . :: .. KIAA06 RHCLQQRRKSVPGPGNRTCTGTSKRYQLCRVQECPPDGRSFREEQCVSFNSHVYNGRTHQ 160 170 180 190 200 210 470 480 490 500 510 KIAA20 WKP-----YTQVEDQDLCKLYCIAEGFDFFFSLSNKVKDGTPCS-EDSRNVCIDGICERV ::: :... .. : :.: . : .: ..::: :. : :.::..: :: . KIAA06 WKPLYPDDYVHISSKP-CDLHCTT--VDGQRQLMVPARDGTSCKLTDLRGVCVSGKCEPI 220 230 240 250 260 520 530 540 550 560 570 KIAA20 GCDNVLGSDAVEDVCGVCNGNNSACTIHRGLYTKHHHTNQYYHMVT-IPSGARSIRIYEM :::.:: : . : ::.:.:..:.:: : : : . .. : .:: ::.:::.:.: : KIAA06 GCDGVLFSTHTLDKCGICQGDGSSCTHVTGNYRKGN-AHLGYSLVTHIPAGARDIQIVER 270 280 290 300 310 320 580 590 600 610 620 630 KIAA20 NVSTSYISVRNALRRYYLNGHWTVDWPGRYKFSGTTFDYRRSYNEPEN----LIATGPTN . :.. ... . :..::.. :: : ....::. ::: .. :. ..: :::: KIAA06 KKSADVLALADEAGYYFFNGNYKVDSPKNFNIAGTVVKYRRPMDVYETGIEYIVAQGPTN 330 340 350 360 370 380 640 650 KIAA20 ETLIVELLFQ-GRNPGVAWEYSM--P---------------------------------- . : : . : :..:....::.. : KIAA06 QGLNVMVWNQNGKSPSITFEYTLLQPPHESRPQPIYYGFSESAESQGLDGAGLMGFIPHN 390 400 410 420 430 440 660 KIAA20 ----------RLGTEKQ---------------------------------PP-------- ::: ... :: KIAA06 GSLYGQASSERLGLDNRLFGHPGLDMELGPSQGQETNEVCEQAGGGACEGPPRGKGFRDR 450 460 470 480 490 500 KIAA20 -------------------------------------------------------AQ--- :: KIAA06 NVTGTPLTGDKDDEEVDTHFASQEFFSANAISDQLLGAGSDLKDFTLNETVNSIFAQGAP 510 520 530 540 550 560 KIAA20 --------------------------------------------PS-------------- :. KIAA06 RSSLAESFFVDYEENEGAGPYLLNGSYLELSSDRVANSSSEAPFPNVSTSLLTSAGNRTH 570 580 590 600 610 620 670 680 690 700 KIAA20 ------------------YTWAIVRSE-CSVSCGGGQMTVREGCYRDLKFQVNMSFCNPK : : . : ::..: : :.. : : .:. :.:. KIAA06 KARTRPKARKQGVSPADMYRWKLSSHEPCSATCTTGVMSAYAMCVRYDGVEVDDSYCDAL 630 640 650 660 670 680 710 720 730 740 750 760 KIAA20 TRPVTGLVPCKVSACPPSWSVGNWSACSRTCGGGAQSRPVQCTRRVH--YDSEPVPASLC ::: : : : : ...:: :::::: : : : :.: . . .:: : ..:: KIAA06 TRPEPVHEFCAGRECQPRWETSSWSECSRTCGEGYQFRVVRCWKMLSPGFDSS-VYSDLC 690 700 710 720 730 740 770 780 790 800 810 KIAA20 PQPA---PSSRQACNSQSCPPAWSAGPWAECSHTCG-KGWRKRAVAC----KSTNPSAR- : :..: . .: : : . :.::. :: .. : . : : .:..: KIAA06 EAAEAVRPEERKTCRNPACGPQWEMSEWSECTAKCGERSVVTRDIRCSEDEKLCDPNTRP 750 760 770 780 790 800 820 830 KIAA20 ------------------------------------------AQLLPDAVCTSEPKPRMH ....:.. : : :: KIAA06 VGEKNCTGPPCDRQWTVSDWGPCSGSCGQGRTIRHVYCKTSDGRVVPESQCQMETKPLAI 810 820 830 840 850 860 840 850 860 870 880 890 KIAA20 EACLLQRCHKPKKLQWLVSAWSQCSVTCERGTQKRFLKCAEKYVSGKYRELASKKCSHLP . : . : : .::.. : .:..:: ::..::.. : : ..:: . .. .:. KIAA06 HPCGDKNC--PA--HWLAQDWERCNTTCGRGVKKRLVLCME-LANGKPQTRSGPECGLAK 870 880 890 900 910 920 900 910 920 930 940 950 KIAA20 KPSLELERACAPLPCPRHPPFAAAGPSRGSWFASPWSQCTASCGGGVQTRSVQCLAGGRP :: : .: :: . :..::::.:: .:: ::. :.:.: : KIAA06 KPPE--ESTCFERPCFK-------------WYTSPWSECTKTCGVGVRMRDVKCYQGTDI 930 940 950 960 960 970 980 990 1000 1010 KIAA20 ASGCLLHQKPSASLACNTHFCPIAEKKDAFCKDYFHW-CYLVPQHGMCSHKFYGKQCCKT . :: :: . ::. . :: .: : :.: : :. . ..:.: .:.: ::.. KIAA06 VRGCDPLVKPVGRQACDLQPCP-TEPPDDSCQDQPGTNCALAIKVNLCGHWYYSKACCRS 970 980 990 1000 1010 1020 1020 KIAA20 CSKSNL : KIAA06 CRPPHS 1030 >>KIAA0021 ( 703 res) ha00117(revised) (703 aa) initn: 340 init1: 84 opt: 307 Z-score: 268.6 bits: 60.7 E(): 7.7e-10 Smith-Waterman score: 341; 23.100% identity (50.373% similar) in 671 aa overlap (46-670:59-682) 20 30 40 50 60 70 KIAA20 VLVTSRTWELAHQPLHSSDLRLGLPQKQHFCGRRKKYMPQPPKEDLFILPDEYKSCLRHK :: .: . . .: : . . ::.. KIAA00 ASYGIEPLQNSSHFEHIIYRMDDVYKEPLKCGVSNKDIEKETAKDEEEEPPSMTQLLRRR 30 40 50 60 70 80 80 90 100 110 120 130 KIAA20 RSLLRYHRNEELNVETLVVVDKKM--MQNHGHENITTYVLTILNMVSALFKDGTIGGNIN :..: : :: ..::::. :..... . .. . :...... : :: KIAA00 RAVLPQTRY----VELFIVVDKERYDMMGRNQTAVREEMILLANYLDSMY----IMLNIR 90 100 110 120 130 140 140 150 160 170 180 190 KIAA20 IAIVGLILLEDEQPGLVISHHADHTLSSFCQWQSGLMGKDGTRHDHAILLTGLDICSWKN :..::: . . . ... .: .:..: ::. .. ::: : :. :. KIAA00 IVLVGLEIWTNGNLINIVGGAGD-VLGNFVQWREKFL-ITRRRHDSAQLVL-------KK 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 KIAA20 EPCDTLGFAPISGMCSKYRSCTIN---EDTGLGLAFTIAHESGHNFGMIHDGEGNMCK-K : :.: .. .::. .. :: . : .: .::: :::.:: :: .: :. KIAA00 GFGGTAGMAFVGTVCSRSHAGGINVFGQITVETFASIVAHELGHNLGMNHD-DGRDCSCG 200 210 220 230 240 250 250 260 270 280 290 300 KIAA20 SEGNIMSPTLAGRNGVFSWSPCSRQYLHKFLSTAQAICLADQPKPVKEYKYPEKLPGELY ... ::. .: .: ..: :: . ..:. . . :: . ::: . :. : . ..: KIAA00 AKSCIMN---SGASGSRNFSSCSAEDFEKLTLNKGGNCLLNIPKPDEAYSAP-SCGNKLV 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 KIAA20 DANTQCKWQFGEKAKLCMLD--FKKDICK--ALWCHRIGRKC-ETKFMPAAEGTIC-GHD ::. .: . : : : :: . . :: .. : : . .:.:. ::.: :. KIAA00 DAGEEC--DCGTP-KECELDPCCEGSTCKLKSFAECAYGDCCKDCRFLPG--GTLCRGKT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 KIAA20 MWCRGGQCVKYGDEGPKPTHGHWSDWSSWSPCSRT---CGGGV-SHRSRLC-----TNPK : . . ... .: . . ::. . : .:. .. . : .. : KIAA00 SECDVPEYCNGSSQFCQPDVFIQNGY----PCQNNKAYCYNGMCQYYDAQCQVIFGSKAK 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 KIAA20 PSHGGKFCEGSTRTLKLCNSQKCPRDSVDFRAAQCAEHNSR--RFRGRHYKWKPYTQVED . : : ... .. : : .. ... .:: :. ... .. . : . KIAA00 AAPKDCFIEVNSKGDRFGN---CGFSGNEYK--KCATGNALCGKLQCENVQEIPVFGIVP 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 KIAA20 QDLCKLYCIAEGFDFFFSLSNKVKDGTPCSEDSRNVCIDG-ICERVGC-D-NVLGSDA-V . .. . :.:.. : : .: .. : : ::. : : .::. : : KIAA00 AIIQTPSRGTKCWGVDFQLGSDVPDPGMVNEGTK--CGAGKICRNFQCVDASVLNYDCDV 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 KIAA20 EDVC---GVCNGNNSACTIHRGLYTKHHHTNQYYHMV-TIPSGAR---SIR--------- . : ::::.:.. : . : . .:. : : . :. . ..: KIAA00 QKKCHGHGVCNSNKN-CHCENGWAPPNCETKGYGGSVDSGPTYNEMNTALRDGLLVFFFL 540 550 560 570 580 580 590 600 610 620 KIAA20 IYEMNVSTSYISV-RNALRRYYLNGH--WTVDWPGRYKFSGTTFDYRRSYNEPENLIATG : . : . .: . :. : : :. . : . :. . . . :. . :... . KIAA00 IVPLIVCAIFIFIKRDQLWRSYFRKKRSQTYESDGKNQANPS----RQPGSVPRHVSPVT 590 600 610 620 630 640 630 640 650 660 670 680 KIAA20 PTNETLIVELLFQGRNPGVAWEYSMPRLGTEKQPPAQPSYTWAIVRSECSVSCGGGQMTV : :. : . .: .. ..:. . :: ::. . KIAA00 PPREVPI----YANRFAVPTYAAKQPQQFPSRPPPPQPKVSSQGNLIPARPAPAPPLYSS 650 660 670 680 690 700 690 700 710 720 730 740 KIAA20 REGCYRDLKFQVNMSFCNPKTRPVTGLVPCKVSACPPSWSVGNWSACSRTCGGGAQSRPV KIAA00 LT >>KIAA1233 ( 1023 res) fh08611 (1023 aa) initn: 737 init1: 233 opt: 307 Z-score: 267.0 bits: 61.0 E(): 9.3e-10 Smith-Waterman score: 519; 36.620% identity (55.869% similar) in 213 aa overlap (701-913:12-214) 680 690 700 710 720 730 KIAA20 WAIVRSECSVSCGGGQMTVREGCYRDLKFQVNMSFCNPKTRPVTGLVPCKVSACPPSWSV :: :.:. :: . :.. ::: : : KIAA12 AVCLHIQTQQTVNDSLCDMVHRPPAMSQACNTEPCPPRWHV 10 20 30 40 740 750 760 770 780 790 KIAA20 GNWSACSRTCGGGAQSRPVQCTRRVHYDSEPVPASLCPQPAPSSRQACNSQSCPPAWSAG :.:. :: ::: : :.: : : .: :.: : . : . ::::. .:::.: KIAA12 GSWGPCSATCGVGIQTRDVYC---LHPGETPAPPEECRDEKPHALQACNQFDCPPGWHIE 50 60 70 80 90 800 810 820 830 840 850 KIAA20 PWAECSHTCGKGWRKRAVACKSTNPSARAQLLPDAVCTSEPKPRMHEACLLQRCHKPKKL : .::.::: : ..: :.:.. .. : : .: . :: :..: : : .: KIAA12 EWQQCSRTCGGGTQNRRVTCRQLLTDGSFLNLSDELCQG-PKASSHKSCARTDC--PPHL 100 110 120 130 140 150 860 870 880 890 900 910 KIAA20 QWLVSAWSQCSVTCERGTQKRFLKCAEKYVSGKYRELASKKCSHLPKPSLELERACAPLP :. ::.:::.: : :.: : . ..:. :. : : :.: : :.: KIAA12 A--VGDWSKCSVSCGVGIQRRKQVCQRLAAKGRRIPLSEMMCRDL--PGLPLVRSCQMPE 160 170 180 190 200 210 920 930 940 950 960 970 KIAA20 CPRHPPFAAAGPSRGSWFASPWSQCTASCGGGVQTRSVQCLAGGRPASGCLLHQKPSASL : . KIAA12 CSKIKSEMKTKLGEQGPQILSVQRVYIQTREEKRINLTIGSRAYLLPNTSVIIKCPVRRF 220 230 240 250 260 270 >>KIAA1445 ( 1202 res) fg03469b (1202 aa) initn: 460 init1: 251 opt: 279 Z-score: 242.4 bits: 56.7 E(): 2.2e-08 Smith-Waterman score: 325; 23.412% identity (41.742% similar) in 551 aa overlap (315-819:624-1049) 290 300 310 320 330 340 KIAA20 AICLADQPKPVKEYKYPEKLPGELYDANTQCKWQFGEKAKLCMLDFKKDICKALWCHRIG : :. :.. . :. .... .:: . : KIAA14 GLRDGVLRVPLERCAAYRSQGACLGARDPYCGWD-GKQQRCSTLEDSSNM--SLWTQNI- 600 610 620 630 640 350 360 370 380 KIAA20 RKCETK-------FMPAAEGTICGHDMWCRGGQCVKYGD--EGPKPT------------- : .. : : . : : .:.:. . ..:.: KIAA14 TACPVRNVTRDGGFGPWSPWQPCEHLDGDNSGSCLCRARSCDSPRPRCGGLDCLGPAIHI 650 660 670 680 690 700 390 400 410 420 430 KIAA20 -----HGHWSDWSSWSPCSRTCGGGVSHRSRLCTNPKPSHGGKFCEGSTRTLKLCN-SQK .: :. ::::. :: .:: : . :.: :.:: : :::..: :..: ..:: . KIAA14 ANCSRNGAWTPWSSWALCSTSCGIGFQVRQRSCSNPAPRHGGRICVGKSREERFCNENTP 710 720 730 740 750 760 440 450 460 470 480 490 KIAA20 CPRDSVDFRAAQCAEHNSRRFRGRHYKWKPYTQVEDQDLCKLYCIAEGFDFFFSLSNKVK :: : :. : ... :. : . :. KIAA14 CPVPI--FWAS----------------WGSWSK------CSSNC-GGGM----------- 770 780 790 500 510 520 530 540 550 KIAA20 DGTPCSEDSRNVCIDGICERVGCDNVLGSDAVEDVCGV----CNGNNSACTIHRGLYTKH .. : .: .: .. :: ::: :: . .: : .. 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