# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg02843mrp1.fasta.nr -Q ../query/KIAA2027.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA2027, 802 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7818444 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3409+/-0.0002; mu= 8.0470+/- 0.011 mean_var=124.3527+/-23.454, 0's: 32 Z-trim: 57 B-trim: 0 in 0/64 Lambda= 0.115013 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|115502242|sp|Q6ZVF9.2|GRIN3_HUMAN RecName: Full ( 776) 5104 858.6 0 gi|119626437|gb|EAX06032.1| hypothetical protein L ( 776) 5099 857.8 0 gi|116497207|gb|AAI26372.1| GPRIN family member 3 ( 776) 5093 856.8 0 gi|34530450|dbj|BAC85902.1| unnamed protein produc ( 776) 5089 856.2 0 gi|109074975|ref|XP_001101149.1| PREDICTED: hypoth ( 776) 4805 809.0 0 gi|74002238|ref|XP_544978.2| PREDICTED: similar to ( 823) 3251 551.2 6.1e-154 gi|81897855|sp|Q8BWS5.1|GRIN3_MOUSE RecName: Full= ( 763) 2126 364.5 9e-98 gi|149033220|gb|EDL88021.1| rCG52360 [Rattus norve ( 762) 1497 260.1 2.4e-66 gi|126330868|ref|XP_001375758.1| PREDICTED: simila ( 789) 1191 209.4 4.7e-51 gi|50746821|ref|XP_426298.1| PREDICTED: hypothetic ( 746) 999 177.5 1.7e-41 gi|220678804|emb|CAX13499.1| novel protein [Danio ( 586) 437 84.1 1.7e-13 gi|47211323|emb|CAF96188.1| unnamed protein produc ( 488) 424 81.9 6.7e-13 gi|118097390|ref|XP_425207.2| PREDICTED: similar t ( 386) 346 68.9 4.5e-09 gi|134073236|emb|CAM71958.1| proteophosphoglycan p (5967) 356 71.6 1e-08 gi|70905641|gb|AAZ14280.1| proteophosphoglycan ppg (7194) 357 71.9 1.1e-08 gi|109079842|ref|XP_001085023.1| PREDICTED: simila (1013) 343 68.8 1.3e-08 gi|134065503|emb|CAM43270.1| proteophosphoglycan p (4324) 348 70.2 2.1e-08 gi|70905643|gb|AAZ14282.1| proteophosphoglycan ppg (2425) 342 68.9 2.7e-08 gi|5901688|gb|AAD55371.1| GRIN1 [Mus musculus] ( 827) 320 64.9 1.5e-07 gi|97051843|sp|Q3UNH4.2|GRIN1_MOUSE RecName: Full= ( 932) 320 64.9 1.7e-07 gi|74188195|dbj|BAE25773.1| unnamed protein produc ( 932) 317 64.4 2.4e-07 gi|70905642|gb|AAZ14281.1| proteophosphoglycan 5 [ (17392) 331 67.9 4e-07 gi|126291564|ref|XP_001380934.1| PREDICTED: simila ( 820) 309 63.0 5.4e-07 gi|220972438|gb|EED90770.1| predicted protein [Tha (1524) 309 63.3 8.5e-07 gi|209585698|gb|ACI64383.1| predicted protein [Tha (3283) 310 63.7 1.3e-06 gi|149264149|ref|XP_001476403.1| PREDICTED: simila ( 779) 298 61.2 1.9e-06 gi|109504667|ref|XP_344572.3| PREDICTED: similar t ( 914) 297 61.1 2.3e-06 gi|119605471|gb|EAW85065.1| G protein-regulated in (1008) 292 60.3 4.5e-06 gi|74738655|sp|Q7Z2K8.1|GRIN1_HUMAN RecName: Full= (1008) 292 60.3 4.5e-06 gi|194180578|gb|EDW94189.1| GE20182 [Drosophila ya (1247) 291 60.2 5.9e-06 gi|193908040|gb|EDW06907.1| GI15442 [Drosophila mo (2834) 293 60.9 8.5e-06 gi|190654217|gb|EDV51460.1| GG13891 [Drosophila er (1010) 276 57.6 2.8e-05 gi|220967737|gb|EED86119.1| predicted protein [Tha ( 494) 270 56.4 3.3e-05 gi|70905640|gb|AAZ14279.1| proteophosphoglycan ppg (1435) 274 57.4 4.6e-05 gi|81704939|sp|Q7A362.1|SRAP_STAAN RecName: Full=S (2271) 275 57.8 5.7e-05 gi|82177691|sp|Q9PWA3|GRIN2_CHICK GRIN2-like prote ( 518) 264 55.4 6.9e-05 gi|121889921|gb|EAX95321.1| flocculin, putative [T (1737) 269 56.7 9.4e-05 gi|189515091|ref|XP_001920404.1| PREDICTED: hypoth (1129) 265 55.9 0.00011 gi|123722336|sp|Q2FDK5.1|SRAP_STAA3 RecName: Full= (2271) 269 56.8 0.00011 gi|194677475|ref|XP_588451.4| PREDICTED: similar t (1914) 265 56.1 0.00016 gi|212511571|gb|EEB14506.1| carbonic anhydrase, pu (1823) 264 55.9 0.00017 gi|150375565|dbj|BAF68825.1| conserved hypothetica (2271) 265 56.1 0.00018 gi|81761908|sp|Q8NUJ3.1|SRAP_STAAW RecName: Full=S (2275) 262 55.6 0.00025 gi|81648528|sp|Q6G620.1|SRAP_STAAS RecName: Full=S (2275) 262 55.6 0.00025 gi|17566006|ref|NP_505150.1| hypothetical protein (1079) 257 54.5 0.00026 gi|123003413|sp|Q2FUW1.1|SRAP_STAA8 RecName: Full= (2271) 261 55.5 0.00029 gi|167871932|gb|EDS35315.1| aggrecan core protein (2531) 260 55.3 0.00035 gi|194218864|ref|XP_001916050.1| PREDICTED: simila (1104) 253 53.9 0.00042 gi|81693597|sp|Q5HCP3.1|SRAP_STAAC RecName: Full=S (2261) 255 54.5 0.00057 gi|47216459|emb|CAG02110.1| unnamed protein produc ( 856) 248 52.9 0.00063 >>gi|115502242|sp|Q6ZVF9.2|GRIN3_HUMAN RecName: Full=G p (776 aa) initn: 5104 init1: 5104 opt: 5104 Z-score: 4582.0 bits: 858.6 E(): 0 Smith-Waterman score: 5104; 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