# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ff00951s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA2014.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA2014, 1032 aa vs ./tmplib.25089 library 1986473 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.8792+/-0.0106; mu= -15.3272+/- 0.721 mean_var=529.8374+/-125.996, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 5 in 1/39 Lambda= 0.055719 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1902 ( 1112 res) hj04383 (1112) 2478 214.7 5.5e-56 KIAA0381 ( 1114 res) ah04695 (1114) 868 85.3 5e-17 KIAA0666 ( 1085 res) hk02075 (1085) 835 82.6 3.1e-16 KIAA1727 ( 1130 res) pg00153 (1130) 596 63.4 1.9e-10 KIAA1695 ( 1199 res) fj11471 (1199) 375 45.7 4.5e-05 >>KIAA1902 ( 1112 res) hj04383 (1112 aa) initn: 4603 init1: 2417 opt: 2478 Z-score: 1097.0 bits: 214.7 E(): 5.5e-56 Smith-Waterman score: 4718; 69.792% identity (85.701% similar) in 1056 aa overlap (28-1017:39-1094) 10 20 30 40 50 KIAA20 GGPAAMGNLESAEGVPGEPPSVPLLLPPGKMPMPEPCELEERFALVLSSMNLPPDKA : :.::::: :::::::.::..:::::::: KIAA19 RSSPRPRRAADMGNAGSMDSQQTDFRAHNVPLKLPMPEPGELEERFAIVLNAMNLPPDKA 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 KIAA20 RLLRQYDNEKKWDLICDQERFQVKNPPHTYIQKLQSFLDPSVTRKKFRRRVQESTKVLRE ::::::::::::.:::::::::::::::::::::...:::.::::::::::::::.:::: KIAA19 RLLRQYDNEKKWELICDQERFQVKNPPHTYIQKLKGYLDPAVTRKKFRRRVQESTQVLRE 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 KIAA20 LEISLRTNHIGWVREFLNDENKGLDVLVDYLSFAQCSVMFDFEGLESGDDGAFDKLRSWS ::::::::::::::::::.:::::::::.:::::: .: ::::..:: ... :: . :: KIAA19 LEISLRTNHIGWVREFLNEENKGLDVLVEYLSFAQYAVTFDFESVESTVESSVDKSKPWS 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 KIAA20 RSIEDLQPPSALSAPFTNSLARSARQSVLRYSTLPGRRALKNSRLVSQKDDVHVCILCLR ::::::. : : .: ::..::.:.:.:::.:::.::.::::::::.::::::::.::: KIAA19 RSIEDLHRGSNLPSPVGNSVSRSGRHSALRYNTLPSRRTLKNSRLVSKKDDVHVCIMCLR 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 KIAA20 AIMNYQYGFNLVMSHPHAVNEIALSLNNKNPRTKALVLELLAAVCLVRGGHEIILAAFDN ::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::: KIAA19 AIMNYQYGFNMVMSHPHAVNEIALSLNNKNPRTKALVLELLAAVCLVRGGHEIILSAFDN 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 KIAA20 FKEVCKELHRFEKLMEYFRNEDSNIDFMVACMQFINIVVHSVEDMNFRVHLQYEFTKLGL ::::: : .:::::::.:::::.::::::: ::::::::::::::::::::::::::::: KIAA19 FKEVCGEKQRFEKLMEHFRNEDNNIDFMVASMQFINIVVHSVEDMNFRVHLQYEFTKLGL 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 KIAA20 EEFLQKSRHTESEKLQVQIQAYLDNVFDVGGLLEDAETKNVALEKVEELEEHVSHLTEKL .:.:.: .::::.:::::::::::::::::.:::::::::.:::.::::::..:::.::: KIAA19 DEYLDKLKHTESDKLQVQIQAYLDNVFDVGALLEDAETKNAALERVEELEENISHLSEKL 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 KIAA20 LDLENENMMRVAELEKQLLQREKELESIKETYENTSHQVHTLRRLIKEKEEAFQRRCHLE : ::: : ...::::::.::.:::. ..: :.... ::::::...::::::.::. :: KIAA19 QDTENEAMSKIVELEKQLMQRNKELDVVREIYKDANTQVHTLRKMVKEKEEAIQRQSTLE 430 440 450 460 470 480 480 490 500 KIAA20 PNVRGLE--------------------------SVDSEALA--RVGP---AELSEGMPP- ... :: :. ::..: ::: : : .:: KIAA19 KKIHELEKQGTIKIQKKGDGDIAILPVVASGTLSMGSEVVAGNSVGPTMGAASSGPLPPP 490 500 510 520 530 540 510 520 530 540 KIAA20 -------SDLD-------LLAPAPPPEEVLPLPPPPAPPLPPPPP---------PLPDKC :: . : ::: : :::: :: ::::: : : KIAA19 PPPLPPSSDTPETVQNGPVTPPMPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPPLPGPASETVPAPPLA 550 560 570 580 590 600 550 560 570 580 590 KIAA20 PP---APPLPG-AAPSVVLTVGLSAIRIKKPIKTKFRLPVFNWTALKPNQISGTVFSELD :: :::::: ..:.::.. ::.:..::::::::::.:::::.:::::::.::::.:.: KIAA19 PPLPSAPPLPGTSSPTVVFNSGLAAVKIKKPIKTKFRMPVFNWVALKPNQINGTVFNEID 610 620 630 640 650 660 600 610 620 630 640 650 KIAA20 DEKILEDLDLDKFEELFKTKAQGPALDLICSKNKTAQKAASKVTLLEANRAKNLAITLRK ::.:::::..:.:::.:::::::::.:: ::.: ::...::::::::::::::::::: KIAA19 DERILEDLNVDEFEEIFKTKAQGPAIDLSSSKQKIPQKGSNKVTLLEANRAKNLAITLRK 670 680 690 700 710 720 660 670 680 690 700 710 KIAA20 AGRSAEEICRAIHTFDLQTLPVDFVECLMRFLPTEAEVKLLRQYERERQPLEELAAEDRF ::..:.:::.:::.:::.::::::::::::::::: :::.:: :::::.:::.:. :::: KIAA19 AGKTADEICKAIHVFDLKTLPVDFVECLMRFLPTENEVKVLRLYERERKPLENLSDEDRF 730 740 750 760 770 780 720 730 740 750 760 770 KIAA20 MLLFSKVERLTQRMAGMAFLGNFQDNLQMLTPQLNAIIAASASVKSSQKLKQMLEIILAL :. :::.::: :.:. :::.::: ...:::::::.::::::.:.:::::::..::::::: KIAA19 MMQFSKIERLMQKMTIMAFIGNFAESIQMLTPQLHAIIAASVSIKSSQKLKKILEIILAL 790 800 810 820 830 840 780 790 800 810 820 830 KIAA20 GNYMNSSKRGAVYGFKLQSLDLLLDTKSTDRKMTLLHFIALTVKEKYPDLANFWHELHFV ::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:. .::::: ... :..:::.: KIAA19 GNYMNSSKRGAVYGFKLQSLDLLLDTKSTDRKQTLLHYISNVVKEKYHQVSLFYNELHYV 850 860 870 880 890 900 840 850 860 870 880 890 KIAA20 EKAAAVSLENVLLDVKELGRGMELIRRECSIHD-NSVLRNFLSTNEGKLDKLQRDAKTAE :::::::::::::::::: :::.: .:: ..:: :..:..:. .::::: ::: ::: :. KIAA19 EKAAAVSLENVLLDVKELQRGMDLTKREYTMHDHNTLLKEFILNNEGKLKKLQDDAKIAQ 910 920 930 940 950 960 900 910 920 930 940 950 KIAA20 EAYNAVVRYFGESPKTTPPSVFFPVFVRFIRSYKEAEQENEARKKQEEVMREKQLAQEA- .:.. ::.::::.::::::::::::::::...::.::.::: :::::... :: : ::: KIAA19 DAFDDVVKYFGENPKTTPPSVFFPVFVRFVKAYKQAEEENELRKKQEQALMEKLLEQEAL 970 980 990 1000 1010 1020 960 970 980 990 1000 1010 KIAA20 -KKLDAKTPSQRNKWQQQELIAELRRRQAKEHRPVYEGKDGTIEDIITGLHCQPM----V .. : :.::...: :::::::::::::.:..: :::::::.:::::: :. ::. . KIAA19 MEQQDPKSPSHKSKRQQQELIAELRRRQVKDNRHVYEGKDGAIEDIITDLRNQPYRRADA 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1020 1030 KIAA20 VRHQARSAAPPSGPPRAPGPH ::...: KIAA19 VRRSVRRRFDDQNLRSVNGAEITM 1090 1100 1110 >>KIAA0381 ( 1114 res) ah04695 (1114 aa) initn: 987 init1: 303 opt: 868 Z-score: 397.5 bits: 85.3 E(): 5e-17 Smith-Waterman score: 1150; 27.049% identity (55.009% similar) in 1098 aa overlap (23-1005:78-1076) 10 20 30 40 50 KIAA20 GGPAAMGNLESAEGVPGEPPSVPLLLPPGKMPMPEPCELEERFALVLSSMNL :: . . :.:. ::. ::: ... ..: KIAA03 APRKRSHHGLGFLCCFGGSDIPEINLRDNHPLQFMEFSSPIPNAEELNIRFAELVDELDL 50 60 70 80 90 100 60 70 80 90 100 KIAA20 PPDKAR-LLRQYDNEKKWDLICDQERFQVKNP-------PHTYIQKLQSFLDPSVTRKKF :: : . ::::.. :.... : ..: : ::....:. . KIAA03 T-DKNREAMFALPPEKKWQIYCSKKKEQ-EDPNKLATSWPDYYIDRINSMAAMQSLYAFD 110 120 130 140 150 160 110 120 130 140 150 160 KIAA20 RRRVQESTKVLRELEISLRTNHIGWVREFLNDENKGLDVLVDYLSFAQCSVMFDFEGLES ..... ..:...:. .:::. . .: .:. : .:: :...: KIAA03 EEETEMRNQVVEDLKTALRTQPMRFVTRFI--ELEGLTCLLNFL---------------- 170 180 190 200 170 180 190 200 210 220 KIAA20 GDDGAFDKLRSWSRSIEDLQPPSALSAPFTNSLARSARQSVLRYSTLPGRRALKNSRLVS ::.. .: .:: KIAA03 -------------RSMD---------------------------------HATCESR--- 210 230 240 250 260 270 280 KIAA20 QKDDVHVCIL-CLRAIMNYQYGFNLVMSHPHAVNEIALSLNNKNPRTKALVLELLAAVCL .:. .. :..:.:: . : :...:.:.. :: :: ..: .::. :::.:.:::: KIAA03 ----IHTSLIGCIKALMNNSQGRAHVLAQPEAISTIAQSLRTENSKTKVAVLEILGAVCL 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 KIAA20 VRGGHEIILAAFDNFKEVCKELHRFEKLMEYF-----RNEDSNIDFMVACMQFINIVVHS : :::. .: :. ... : ::. :.. . : .: .... .: :.::: :... KIAA03 VPGGHKKVLQAMLHYQVYAAERTRFQTLLNELDRSLGRYRD-EVNLKTAIMSFINAVLNA 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 KIAA20 ---VEDMNFRVHLQYEFTKLGLEEFLQKSRHTESEKLQVQIQAY----------LDNVFD ....::.::.::: ::.. ..: :. :. :. ... . : :: KIAA03 GAGEDNLEFRLHLRYEFLMLGIQPVIDKLRQHENAILDKHLDFFEMVRNEDDLELARRFD 340 350 360 370 380 390 390 400 410 KIAA20 VGGLLEDAETKNVAL--EKVEELE---------EHVSHLTEK----------LLD----- . . . .. : .:.. : .: .. : ::: KIAA03 MVHIDTKSASQMFELIHKKLKYTEAYPCLLSVLHHCLQMPYKRNGGYFQQWQLLDRILQQ 400 410 420 430 440 450 420 430 440 KIAA20 ---------------LENENMMRVA------------------------ELEKQLLQREK ::: :. .. :: ..: ..:. KIAA03 IVLQDERGVDPDLAPLENFNVKNIVNMLINENEVKQWRDQAEKFRKEHMELVSRLERKER 460 470 480 490 500 510 450 460 470 480 490 KIAA20 ELESIKETYENTSHQVHTLR-RLIKEKEEAFQRRCHLEPNVRGLESVDSEALARV----G : :. :. . .. .. .: .:..: : : .. : : ... .. : KIAA03 ECETKTLEKEEMMRTLNKMKDKLARESQELRQARGQVAELVAQLSELSTGPVSSPPPPGG 520 530 540 550 560 570 500 510 520 530 540 550 KIAA20 PAELSEGMPPSDLDLLAPAPPPEEVLPLPPPPAPPLPPPPPPLPDKCPP----APPLPGA : :: .: .:: : ::: :::: ::::: :: : :: . ::: KIAA03 PLTLSSSMTTNDLP---PPPPPLPFACCPPPPPPPLPPGGPPTPPGAPPCLGMGLPLP-Q 580 590 600 610 620 560 570 580 590 600 610 KIAA20 APSVVLTVGLSAIRIKKPIKTKFRLPVFNWTALKPNQISGTVFSELDDEKILEDLDLDKF : : : :. .: . : :::. :. ... :::..:.:: .... :::. : KIAA03 DPYPSSDVPLRKKRVPQP---SHPLKSFNWVKLNEERVPGTVWNEIDDMQVFRILDLEDF 630 640 650 660 670 680 620 630 640 650 660 670 KIAA20 EELFKTKAQGPALDLICSKN-KTAQKAASKVTLLEANRAKNLAITLRKAGRSAEEICRAI :..: . : .: ... :.. ......... ::.: : : : : ::: .:: KIAA03 EKMF-SAYQRHQKELGSTEDIYLASRKVKELSVIDGRRAQNCIILLSKLKLSNEEIRQAI 690 700 710 720 730 740 680 690 700 710 720 KIAA20 HTFDLQT-LPVDFVECLMRFLPTEAEVKLLRQYERERQPLEELAAEDRFMLLFSKVERLT .: : : :..: :..:.: .... ::.....: .:..: :::. .:.... KIAA03 LKMDEQEDLAKDMLEQLLKFIPEKSDIDLLEEHKHE---IERMARADRFLYEMSRIDHYQ 750 760 770 780 790 800 730 740 750 760 770 780 KIAA20 QRMAGMAFLGNFQDNLQMLTPQLNAIIAASASVKSSQKLKQMLEIILALGNYMNSSKRGA ::. .. : .::. : :...::. :: . :..:.::::.:::.::.::...::. KIAA03 QRLQALFFKKKFQERLAEAKPKVEAILLASRELVRSKRLRQMLEVILAIGNFMNKGQRGG 810 820 830 840 850 860 790 800 810 820 830 840 KIAA20 VYGFKLQSLDLLLDTKST-DRKMTLLHFIALTVKEKYPDLANFWHELHFVEKAAAVSLEN .:::.. ::. . ::::. ::...:::.. . .....::. :. ::. . .:: :.: . KIAA03 AYGFRVASLNKIADTKSSIDRNISLLHYLIMILEKHFPDILNMPSELQHLPEAAKVNLAE 870 880 890 900 910 920 850 860 870 880 890 KIAA20 VLLDVKELGRGMELIR----------RECSIHDNSVLRNFLSTNEGKLDKLQRDAKTAEE . .: .: ::.. .. :: : . :. .:.... ....:. . . :.. KIAA03 LEKEVGNLRRGLRAVEVELEYQRRQVREPSDKFVPVMSDFITVSSFSFSELEDQLNEARD 930 940 950 960 970 980 900 910 920 930 940 950 KIAA20 AYNAVVRYFGESPKTTPPSVFFPVFVRFIRSYKEAEQENEA-RKKQEEVMREKQLAQEAK . .. .::: . :. :: .: :.....::.:. :: :...:: .:.. .:: KIAA03 KFAKALMHFGEHDSKMQPDEFFGIFDTFLQAFSEARQDLEAMRRRKEE--EERRARMEAM 990 1000 1010 1020 1030 1040 960 970 980 990 1000 1010 KIAA20 KLDAKTPSQRNKWQQQELIAELRRRQAKEHRPVYEGKDGTIEDIITGLHCQPMVVRHQAR : .:..::.: :. . :: : ..:....: KIAA03 ---LKEQRERERWQRQ-------RKVLAAGSSLEEG--GEFDDLVSALRSGEVFDKDLCK 1050 1060 1070 1080 1020 1030 KIAA20 SAAPPSGPPRAPGPH KIAA03 LKRSRKRSGSQALEVTRERAINRLNY 1090 1100 1110 >>KIAA0666 ( 1085 res) hk02075 (1085 aa) initn: 807 init1: 286 opt: 835 Z-score: 383.3 bits: 82.6 E(): 3.1e-16 Smith-Waterman score: 1148; 26.874% identity (56.216% similar) in 1094 aa overlap (31-1005:52-1047) 10 20 30 40 50 60 KIAA20 GGPAAMGNLESAEGVPGEPPSVPLLLPPGKMPMPEPCELEERFALVLSSMNLPPDKARLL .::: ::. :. ... ..: . . . KIAA06 FCCFRNNDHPEITYRLRNDSNFALQTMEPALPMPPVEELDVMFSELVDELDLTDKHREAM 30 40 50 60 70 80 70 80 90 100 110 KIAA20 RQYDNEKKWDLICDQERFQVKNP-----PHTYIQKLQSFLDPSVTRKKFRRRVQESTKVL ::::.. :.... : .: :. ::..:.:. . ... .: .:.. KIAA06 FALPAEKKWQIYCSKKKDQEENKGATSWPEFYIDQLNSMAARKSLLALEKEEEEERSKTI 90 100 110 120 130 140 120 130 140 150 160 170 KIAA20 RELEISLRTNHIGWVREFLNDENKGLDVLVDYLSFAQCSVMFDFEGLESGDDGAFDKLRS . :. .:::. . .: .:.. . ::. ....:. .:.: :: .. KIAA06 ESLKTALRTKPMRFVTRFIDLD--GLSCILNFLK------TMDYETSES-------RI-- 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 KIAA20 WSRSIEDLQPPSALSAPFTNSLARSARQSVLRYSTLPGRRALKNSRLVSQKDDVHVCILC ...: : : KIAA06 --------------------------------HTSLIG---------------------C 190 240 250 260 270 280 290 KIAA20 LRAIMNYQYGFNLVMSHPHAVNEIALSLNNKNPRTKALVLELLAAVCLVRGGHEIILAAF ..:.:: . : :..: ...: :: ::...: .::. :::.:.::::: :::. .: :. KIAA06 IKALMNNSQGRAHVLAHSESINVIAQSLSTENIKTKVAVLEILGAVCLVPGGHKKVLQAM 200 210 220 230 240 250 300 310 320 330 340 KIAA20 DNFKEVCKELHRFEKLMEYF-----RNEDSNIDFMVACMQFINIVVHS---VEDMNFRVH .... .: ::. :.. . : .: .... .: :.::: :. . ::...::.: KIAA06 LHYQKYASERTRFQTLINDLDKSTGRYRD-EVSLKTAIMSFINAVLSQGAGVESLDFRLH 260 270 280 290 300 310 350 360 370 380 390 KIAA20 LQYEFTKLGLEEFLQKSRHTESEKLQVQIQAY--LDNV--------FDVGGLLEDAETKN :.::: ::.. ..: :. :. :. ... . : : :.. . . :. KIAA06 LRYEFLMLGIQPVIDKLREHENSTLDRHLDFFEMLRNEDELEFAKRFELVHIDTKSATQM 320 330 340 350 360 370 400 410 KIAA20 VALEKVE-----------ELEEHVSHLTEK----------LLD----------------- : . . . .: .. : ::: KIAA06 FELTRKRLTHSEAYPHFMSILHHCLQMPYKRSGNTVQYWLLLDRIIQQIVIQNDKGQDPD 380 390 400 410 420 430 420 430 440 450 460 KIAA20 ---LENENMMRVAEL---EKQLLQREKELESIKETYENTSHQVHTLRRL----IKEKEEA ::: :. :... :... : ... :.... ... ..... .: .:::: KIAA06 STPLENFNIKNVVRMLVNENEVKQWKEQAEKMRKEHNELQQKLEKKERECDAKTQEKEEM 440 450 460 470 480 490 470 480 490 500 510 520 KIAA20 FQRRCHLEPNVRGLESVDSEALARVGP--AELSE-------GMPPSDLDLLAPAPPPEEV .: ... ... . ... .:. :.: : . :. . ::. : KIAA06 MQTLNKMKEKLEKETTEHKQVKQQVADLTAQLHELSRRAVCASIPGGPSPGAPGGPFPSS 500 510 520 530 540 550 530 540 550 560 KIAA20 LP---LPPPPAPPLP-----PPPPPLPDKCPPAPPLP---GAA---PSVVLTVGLSAIRI .: ::::: :::: ::::::: :: :: : :: :.. . ..:. : KIAA06 VPGSLLPPPPPPPLPGGMLPPPPPPLPPGGPPPPPGPPPLGAIMPPPGAPMGLALKKKSI 560 570 580 590 600 610 570 580 590 600 610 620 KIAA20 KKPIKTKFRLPVFNWTALKPNQISGTVFSELDDEKILEDLDLDKFEELFKTKAQGPALDL .: .. : :::. : :.. :::..:.:: :... :::. .:. : .: :. KIAA06 PQPTNA---LKSFNWSKLPENKLEGTVWTEIDDTKVFKILDLEDLERTF--SAYQRQQDF 620 630 640 650 660 630 640 650 660 670 KIAA20 ICSKNKTAQKA-------ASKV-----TLLEANRAKNLAITLRKAGRSAEEICRAIHTFD . ..:. ..: .::. ..... ::.: : : . : .:: ::: :.: KIAA06 FVNSNSKQKEADAIDDTLSSKLKVKELSVIDGRRAQNCNILLSRLKLSNDEIKRAILTMD 670 680 690 700 710 720 680 690 700 710 720 730 KIAA20 LQT-LPVDFVECLMRFLPTEAEVKLLRQYERERQPLEELAAEDRFMLLFSKVERLTQRMA : :: :..: :..:.: .... ::.....: :...: :::.. .:.... ::. KIAA06 EQEDLPKDMLEQLLKFVPEKSDIDLLEEHKHE---LDRMAKADRFLFEMSRINHYQQRLQ 730 740 750 760 770 780 740 750 760 770 780 790 KIAA20 GMAFLGNFQDNLQMLTPQLNAIIAASASVKSSQKLKQMLEIILALGNYMNSSKRGAVYGF .. : .: . . . :...:: ..: : : :::.::..::.:::::...:: .::: KIAA06 SLYFKKKFAERVAEVKPKVEAIRSGSEEVFRSGALKQLLEVVLAFGNYMNKGQRGNAYGF 790 800 810 820 830 840 800 810 820 830 840 850 KIAA20 KLQSLDLLLDTKST-DRKMTLLHFIALTVKEKYPDLANFWHELHFVEKAAAVSLENVLLD :..::. . ::::. :...::::.. :..:::.. :. .::. . .:: :.. .. . KIAA06 KISSLNKIADTKSSIDKNITLLHYLITIVENKYPSVLNLNEELRDIPQAAKVNMTELDKE 850 860 870 880 890 900 860 870 880 890 900 KIAA20 VKELGRGMELIRRECSIHDN----------SVLRNFLSTNEGKLDKLQRDAKTAEEAYNA .. : :.. .. : . . ::. .:... ... .. :.. .. KIAA06 ISTLRSGLKAVETELEYQKSQPPQPGDKFVSVVSQFITVASFSFSDVEDLLAEAKDLFTK 910 920 930 940 950 960 910 920 930 940 950 960 KIAA20 VVRYFGESPKTTPPSVFFPVFVRFIRSYKEAEQENEA-RKKQEEVMREKQLAQEAKKLDA .:..::: :. :: .: .:... .::.:::: :::.:: :. ...: KIAA06 AVKHFGEEAGKIQPDEFFGIFDQFLQAVSEAKQENENMRKKKEEEERRA-------RMEA 970 980 990 1000 1010 970 980 990 1000 1010 1020 KIAA20 KTPSQRNKWQQQELIAELRRRQAKEHRPVYEGKDGTIEDIITGLHCQPMVVRHQARSAAP . ::.. : . :.:::. ..: ..:....: KIAA06 QLKEQRER--------ERKMRKAKENSE----ESGEFDDLVSALRSGEVFDKDLSKLKRN 1020 1030 1040 1050 1060 1030 KIAA20 PSGPPRAPGPH KIAA06 RKRITNQMTDSSRERPITKLNF 1070 1080 >>KIAA1727 ( 1130 res) pg00153 (1130 aa) initn: 772 init1: 164 opt: 596 Z-score: 279.3 bits: 63.4 E(): 1.9e-10 Smith-Waterman score: 611; 28.731% identity (56.530% similar) in 536 aa overlap (513-1023:19-522) 490 500 510 520 530 KIAA20 LESVDSEALARVGPAELSEGMPPSDLDLLAPAPPPEEVLPLPPPPAPPL----------- ::::: : ::::.:: KIAA17 ENGNIATAPGFMIGQTPPPAPPPP---PPPPPPSPPCSCSREECPSSP 10 20 30 40 540 550 560 570 580 590 KIAA20 -PPPPPPLPDKCPPAPPLPGAAPSVVLTVGLSAIRIKKPIKTKFRLPVFNWTALKPNQIS :::::::: . : :: :: :.. .. : : . :: :. : : .. .:. KIAA17 PPPPPPPLPGEPPIPPPPPGLPPTTHMN-GYSHLGKKK------RMRSFFWKTIPEEQVR 50 60 70 80 90 600 610 620 630 640 KIAA20 G--TVFSELDDEKILEDLDLDKFEELF-----KTKAQGPALDLICSKNKTAQKAASKVTL : .... .. ..: .:::: ::.. : . :.. ..: ..:. KIAA17 GKTNIWTLAARQEHHYQIDTKTIEELFGQQEDTTKSSLPRRGR--TLNSSFREAREEITI 100 110 120 130 140 150 650 660 670 680 690 700 KIAA20 LEANRAKNLAITLRKAGRSAEEICRAIHTFDLQTLPVDFVECLMRFLPTEAEVKLLRQYE :.:.:. :..: :.. .: . : . :: . . .. ...::: ::: :. . KIAA17 LDAKRSMNIGIFLKQFKKSPRSIVEDIHQGKSEHYGSETLREFLKFLPESEEVKKLKAFS 160 170 180 190 200 210 710 720 730 740 750 760 KIAA20 RERQPLEELAAEDRFMLLFSKVERLTQRMAGMAFLGNFQDNLQMLTPQLNAIIAASASVK . . .:. : :. . .: . :. .:.. .: . . : ..... .: . KIAA17 GD---VSKLSLADSFLYGLIQVPNYSLRIEAMVLKKEFLPSCSSLYTDITVLRTAIKELM 220 230 240 250 260 270 770 780 790 800 810 820 KIAA20 SSQKLKQMLEIILALGNYMNSSKR-GAVYGFKLQSLDLLLDTKSTDRKMTLLHFIALTVK : ..:...:...: :: ::.. : . ::::.:: : :::.. :.::::.: .. KIAA17 SCEELHSILHLVLQAGNIMNAGGYAGNAVGFKLSSLLKLADTKANKPGMNLLHFVAQEAQ 280 290 300 310 320 330 830 840 850 860 870 KIAA20 EKYPDLANFWHELHFVEKAAAVSLENVLLDVKEL---GRGM-ELIRRECSIHDNSVLRNF .: : :: ..:: :.:.: .::::. ... : ... : :.:. . .. ...: KIAA17 KKDTILLNFSEKLHHVQKTARLSLENTEAELHLLFVRTKSLKENIQRDGELCQQ--MEDF 340 350 360 370 380 390 880 890 900 910 920 930 KIAA20 LSTNEGKLDKLQ-RDAKTAEEAYNAVVRYFGESPKTTPPSVFFPVFVRFIRSYKEAEQEN :. :: .:. . .:::. .. .: :. :: . : .: : ....: ..: KIAA17 LQFAIEKLRELECWKQELQDEAYT-LIDFFCEDKKTMKLDECFQIFRDFCTKFNKAVKDN 400 410 420 430 440 450 940 950 960 970 980 990 KIAA20 EARKKQEEVMREKQLAQEAKKLDAKTPSQRNKWQQQELIAELRRRQAKEHRPVYEGKDGT . :. :: .:. : .: . .::. : :: : :...:. : :. KIAA17 HDREAQE--LRQLQ------RLKEQEQKQRS-WATGELGA--FGRSSSENDVELLTKKGA 460 470 480 490 1000 1010 1020 1030 KIAA20 IEDIITGLHCQPMVVRHQARSAAPPSGPPRAPGPH : .. :: .: . .. : ::. KIAA17 -EGLLPFLHPRP--ISPSSPSYRPPNTRRSRLSLGPSADRELLTFLESSTGSPEEPNKFH 500 510 520 530 540 550 >>KIAA1695 ( 1199 res) fj11471 (1199 aa) initn: 122 init1: 122 opt: 375 Z-score: 183.0 bits: 45.7 E(): 4.5e-05 Smith-Waterman score: 438; 21.739% identity (55.797% similar) in 552 aa overlap (493-1005:576-1108) 470 480 490 500 510 520 KIAA20 IKEKEEAFQRRCHLEPNVRGLESVDSEALARVGPAELSEGMPPSDLDLLAPAPPPEEVLP :. .... .:.:.: .:. : KIAA16 NDKVPETAPVQPKTESDYIWDQLMANPRELRIQDMDFTDLGEEDDIDVLDVDLGHREA-P 550 560 570 580 590 600 530 540 550 560 570 KIAA20 LPPPPAPPL-----PPPPPPLPDKCPPAPPLPG---AAPSVVLT----VGLSAIRIKKPI :::: :: ::::::: :. :: ::.:: . : :.. .: : . .: KIAA16 GPPPPPPPTFLGLPPPPPPPLLDSIPP-PPVPGNLLVPPPPVFNAPQGLGWSQVPRGQPT 610 620 630 640 650 660 580 590 600 610 620 KIAA20 KTKFRLPV---------FNWTALKPNQISGTVFSELDDEKILEDLDLDKFEELFKTKAQG :: . . :.: . . ..:.:. :. : ...:.::..:.. KIAA16 FTKKKKTIRLFWNEVRPFDWPCKNNRRCREFLWSKLEPIKV----DTSRLEHLFESKSK- 670 680 690 700 710 630 640 650 660 670 KIAA20 PALDLICSKNKTAQKAASKVTLLEANR--AKNLAITLRKAGRSAEEICRAIHTFDLQTLP .: ::. .:. ... .:...: : :...:. :. : :: .:: .: KIAA16 ---ELSVSKKTAADGKRQEIIVLDSKRSNAINIGLTVLPPPRT---IKIAILNFDEYALN 720 730 740 750 760 770 680 690 700 710 720 730 KIAA20 VDFVECLMRFLPTEAEVKLLRQYERERQPLEELAAEDRFMLLFSKVERLTQRMAGMAFLG . .: .. ..::. : . . : . .: :.. ..:.: .:.. .:. :. :: KIAA16 KEGIEKILTMIPTDEEKQKI-QEAQLANPEIPLGSAEQFLLTLSSISELSARLHLWAFKM 780 790 800 810 820 830 740 750 760 770 780 790 KIAA20 NFQDNLQMLTPQLNAIIAASASVKSSQKLKQMLEIILALGNYMNSSKRGAVYGFKLQSLD ... . . .. : . . ...... : .: .::.::..:... : :.:. :. KIAA16 DYETTEKEVAEPLLDLKEGIDQLENNKTLGFILSTLLAIGNFLNGTNAKA---FELSYLE 840 850 860 870 880 800 810 820 830 840 850 KIAA20 LLLDTKSTDRKMTLLHFIALTVKEKYPDLANFWHELHFVEKAAAVSLENVLLDVKELGRG . ..:.: .:..::: . : :..:: .... :. . ..: :..... .. .. : KIAA16 KVPEVKDTVHKQSLLHHVCTMVVENFPDSSDLYSEIGAITRSAKVDFDQLQDNLCQMERR 890 900 910 920 930 940 860 870 880 890 900 910 KIAA20 ME--------LIRRECSIHDNSVLRNFLSTNEGKLDKLQRDAKTAEEAYNAVVRYFGESP . . ..: . .. . .::. .. :. . . ... . ..:. : KIAA16 CKASWDHLKAIAKHEMKPVLKQRMSEFLKDCAERIIILKIVHRRIINRFHSFLLFMGHPP 950 960 970 980 990 1000 920 930 940 950 960 KIAA20 ---KTTPPSVFFPVFVRFIRSYKEAEQENEARKKQEEVMREK-----QLAQEAKKLDAKT . . . : .. .: :. .... .:... ::. .. .. :..... KIAA16 YAIREVNINKFCRIISEFALEYRTTRERVLQQKQKRANHRERNKTRGKMITDSGKFSGSS 1010 1020 1030 1040 1050 1060 970 980 990 1000 1010 1020 KIAA20 PSQRNKWQQQELIAELRRRQAKEHRPVYEGKDGTIEDIITGLHCQPMVVRHQARSAAPPS :. . : : : . .. . : . .. ..:: .: KIAA16 PAPPS--QPQGLSYAEDAAEHENMKAVLKTSSPSVEDATPALGVRTRSRASRGSTSSWTM 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1030 KIAA20 GPPRAPGPH KIAA16 GTDDSPNVTDDAADEIMDRIVKSATQVPSQRVVPRERKRSRANRKSLRRTLKSGLTPEEA 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1032 residues in 1 query sequences 1986473 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:25:36 2008 done: Thu Dec 18 15:25:37 2008 Total Scan time: 0.710 Total Display time: 0.270 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]