# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fj01689.fasta.huge -Q ../query/KIAA2007.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA2007, 580 aa vs ./tmplib.25089 library 1986925 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6784+/-0.00594; mu= 15.4837+/- 0.404 mean_var=161.2762+/-41.536, 0's: 0 Z-trim: 80 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.100993 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1349 ( 752 res) fj00940 ( 752) 1699 260.3 3.8e-70 KIAA1611 ( 813 res) fj12627 ( 813) 1683 258.1 2e-69 KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 ( 766) 1571 241.7 1.6e-64 KIAA0065 ( 848 res) ha00946 ( 848) 1569 241.5 2e-64 KIAA1852 ( 948 res) fj01514 ( 948) 1555 239.5 8.7e-64 KIAA0412 ( 720 res) hg03242 ( 720) 1553 239.0 9.4e-64 KIAA1982 ( 599 res) fk06527(revised) ( 599) 1549 238.3 1.3e-63 KIAA1947 ( 608 res) fh23660 ( 608) 1543 237.5 2.4e-63 KIAA0798 ( 682 res) hk06584 ( 682) 1508 232.4 8.6e-62 KIAA1473 ( 574 res) fj03262 ( 574) 1502 231.4 1.5e-61 KIAA1431 ( 891 res) fj00022 ( 891) 1501 231.6 2e-61 KIAA1827 ( 469 res) fk01409 ( 469) 1484 228.7 8.1e-61 KIAA1559 ( 544 res) fh19195 ( 544) 1475 227.5 2.2e-60 KIAA0326 ( 927 res) hg00579 ( 927) 1456 225.1 1.9e-59 KIAA0961 ( 530 res) hj05830 ( 530) 1452 224.1 2.2e-59 KIAA1396 ( 551 res) hj08221 ( 551) 1440 222.4 7.5e-59 KIAA1956 ( 680 res) fk08713 ( 680) 1437 222.1 1.1e-58 KIAA1829 ( 557 res) hj00069 ( 557) 1426 220.3 3.1e-58 KIAA0628 ( 540 res) hh01433 ( 540) 1422 219.7 4.6e-58 KIAA1710 ( 515 res) fj18457 ( 515) 1416 218.8 8.2e-58 KIAA1948 ( 487 res) fh24556 ( 487) 1409 217.8 1.6e-57 KIAA1508 ( 573 res) hk06576 ( 573) 1385 214.4 2e-56 KIAA1969 ( 595 res) fk06944 ( 595) 1381 213.8 3e-56 KIAA1198 ( 553 res) fg01911 ( 553) 1370 212.2 8.8e-56 KIAA1588 ( 613 res) fj08823 ( 613) 1362 211.1 2.1e-55 KIAA1962 ( 746 res) hm00158 ( 746) 1286 200.2 4.9e-52 KIAA1615 ( 484 res) fj13419 ( 484) 1256 195.5 8.3e-51 KIAA2003 ( 460 res) ah02593 ( 460) 1206 188.1 1.3e-48 KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 ( 579) 1207 188.5 1.3e-48 KIAA1806 ( 481 res) fk00438 ( 481) 1198 187.0 2.9e-48 KIAA0972 ( 702 res) hj06859 ( 702) 1116 175.3 1.4e-44 KIAA1141 ( 914 res) hk01833 ( 914) 1072 169.1 1.3e-42 KIAA1871 ( 821 res) hj05256s1 ( 821) 996 158.0 2.7e-39 KIAA1015 ( 841 res) hk03609(revised) ( 841) 967 153.8 5.1e-38 KIAA0426 ( 613 res) hh01274 ( 613) 903 144.2 2.8e-35 KIAA1954 ( 468 res) fk02322 ( 468) 874 139.8 4.6e-34 KIAA0441 ( 702 res) hh00601s1 ( 702) 795 128.6 1.6e-30 KIAA1339 ( 409 res) fj00071 ( 409) 747 121.2 1.6e-28 KIAA1388 ( 599 res) fj06552 ( 599) 669 110.1 5.1e-25 KIAA1703 ( 1165 res) fj16891 (1165) 665 110.0 1e-24 KIAA1979 ( 309 res) fj09511 ( 309) 657 107.8 1.3e-24 KIAA0478 ( 1253 res) hh05955 (1253) 624 104.1 6.8e-23 KIAA1951 ( 679 res) fj05532 ( 679) 621 103.2 6.9e-23 KIAA0557 ( 493 res) hh01334 ( 493) 603 100.3 3.6e-22 KIAA0924 ( 617 res) hh02883 ( 617) 584 97.7 2.8e-21 KIAA0236 ( 1696 res) ha04654 (1696) 587 98.9 3.3e-21 KIAA1285 ( 785 res) hh11563(revised) ( 785) 506 86.6 8.2e-18 KIAA1020 ( 638 res) fg00473s1 ( 638) 485 83.3 6.2e-17 KIAA0287 ( 1523 res) fg06332 (1523) 467 81.4 5.7e-16 KIAA1231 ( 1061 res) fh08195s1 (1061) 446 78.0 4e-15 >>KIAA1349 ( 752 res) fj00940 (752 aa) initn: 7481 init1: 1582 opt: 1699 Z-score: 1351.3 bits: 260.3 E(): 3.8e-70 Smith-Waterman score: 1699; 48.441% identity (74.636% similar) in 481 aa overlap (103-577:213-693) 80 90 100 110 120 130 KIAA20 WKVQLKTKELALQQDVLGEPTSSGIQMIGSHNGGEVSDVKQCGDVSSEHSCLKTHVRTQN :.: . ..:: . : : .: : .. 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KIAA13 IVHQRTHTGEKPYKCNECEKAFTNTSQLTVHQRRHTGEKPYKCNECGKVFTSNSGFNTHQ 550 560 570 580 590 600 490 500 510 520 530 540 KIAA20 RTHSAKKPFTCMECGKAFKFPTCVNLHMRIHTGEKPYKCKQCGKSFSYSNSFQLHERTHT :::...::: : .:::::. . :. :..::.::::::: :::.: .. . .: :::: KIAA13 RTHTGEKPFKCNDCGKAFSQMVHVTEHQKIHSGEKPYKCDVCGKAFRRGSYLTVHWRTHT 610 620 630 640 650 660 550 560 570 580 KIAA20 GEKPYECKECGKAFSSSSSFRNHERRHADERLSA ::::: ::::::. . :.. :.: :. :: KIAA13 GEKPYTCKECGKGCITLSQLTLHQRIHTGERPYKCEECGKAFRTNSDFTVHLRMHTGEKP 670 680 690 700 710 720 KIAA13 YKCNECGKAFRSSSSLTVHQRIHQRETQLI 730 740 750 >>KIAA1611 ( 813 res) fj12627 (813 aa) initn: 11880 init1: 1561 opt: 1683 Z-score: 1338.4 bits: 258.1 E(): 2e-69 Smith-Waterman score: 1685; 47.609% identity (73.389% similar) in 481 aa overlap (103-577:302-782) 80 90 100 110 120 130 KIAA20 WKVQLKTKELALQQDVLGEPTSSGIQMIGSHNGGEVSDVKQCGDVSSEHSCLKTHVRTQN :.: . ..:: : ..: : :: : .. KIAA16 RIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNLTIHQVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHT 280 290 300 310 320 330 140 150 160 170 180 KIAA20 SENTFECYLYGVDF-----LTLHKKTSTGEQRSVFSQCGKAFSLNPDVVCQ-RTCTGEKA .:. ..: : : :: :. :::. ..::: :. : .. . : :::: KIAA16 GEKPYKCNECGKAFRGHSNLTTHQLIHTGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKP 340 350 360 370 380 390 190 200 210 220 230 240 KIAA20 FDCSDSGKSFINHSHLQGHLRTHNGESLHEWKECGRGFIHSTDLAVRIQTHRSEKPYKCK . :.. ::.: .: : : :.::. .. .:::. : ... :. . ..: .::::::. KIAA16 YKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHTGEKPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCN 400 410 420 430 440 450 250 260 270 280 290 300 KIAA20 ECGKGFRYSAYLNIHMGTHTGDNPYECKECGKAFTRSCQLTQHRKTHTGEKPYKCKDCGR ::::.: . . : :. ::: .:..:.::.:.::.. ::..::. :::::::::..::. KIAA16 ECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKPFKCNECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGK 460 470 480 490 500 510 310 320 330 340 350 360 KIAA20 AFTVSSCLSQHMKIHVGEKPYECKECGIAFTRSSQLTEHLKTHTAKDPFECKICGKSFRN ::.: : :. :. :: :::::.: ::: .::..:.: : :... :..:. ::: : . KIAA16 AFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCIECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQ 520 530 540 550 560 570 370 380 390 400 410 420 KIAA20 SSCLSDHFRIHTGIKPYKCKDCGKAFTQNSDLTKHARTHSGERPYECKECGKAFARSSRL .: :. :.:.::: :::::.:::.::.. :.:: : :.::.::.:.::::.: ..: : KIAA16 TSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYL 580 590 600 610 620 630 430 440 450 460 470 480 KIAA20 SEHTRTHTGEKPFECVKCGKAFAISSNLSGHLRIHTGEKPFECLECGKAFTHSSSLNNHM . : : ::::::..: .:::::.. :::. : :::::::..: .:::.::..: : ::. KIAA16 ATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQ 640 650 660 670 680 690 490 500 510 520 530 540 KIAA20 RTHSAKKPFTCMECGKAFKFPTCVNLHMRIHTGEKPYKCKQCGKSFSYSNSFQLHERTHT :::...::. : ::::::. . .. :. ::::.:::::..::: :. . . :.: :: KIAA16 RTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHT 700 710 720 730 740 750 550 560 570 580 KIAA20 GEKPYECKECGKAFSSSSSFRNHERRHADERLSA :::::.: :::::: ::. .: :. :. KIAA16 GEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKP 760 770 780 790 800 810 KIAA16 YK >>KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 (766 aa) initn: 7071 init1: 1492 opt: 1571 Z-score: 1250.4 bits: 241.7 E(): 1.6e-64 Smith-Waterman score: 1583; 37.768% identity (65.443% similar) in 654 aa overlap (3-577:28-680) 10 20 30 KIAA20 DSVTFDDLAVDFTPEEWTLLDPTQRNLYRDVMLEN .:: :.:..:. ::: :::.::.::::::::: KIAA20 RLLVLEEETRKRKRRAKESGMAFSQGLLTFRDVAIEFSQEEWKCLDPAQRTLYRDVMLEN 10 20 30 40 50 60 40 50 60 KIAA20 YKNLATV-----------------GYQLFKPSLISWLE---------QEESRTVQRGDFQ :.::... . ..:. . .. : :. .. .. .:: KIAA20 YRNLVSLDISSKCTMKEFLSTAQGNREVFHAGTLQIHESHHNGDFCYQDVDKDIHDYEFQ 70 80 90 100 110 120 70 80 90 KIAA20 ASEWKVQ------LKTKELALQ--------------QDVLGEPTSSGI------------ .: . . : :.:. . .: :: : . 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KIAA20 ILTRHHRLHTGEKPYKCNECGKTFSHKSSLTCHHRLHTGEKPYKCNECGKTFSHKSSLTC 360 370 380 390 400 410 320 330 340 350 360 370 KIAA20 HMKIHVGEKPYECKECGIAFTRSSQLTEHLKTHTAKDPFECKICGKSFRNSSCLSDHFRI : ..:.:::::.:.:: :.. :.. : : :: . ..:. :::.: .: :. : : KIAA20 HRRLHTGEKPYKCEECDKAYSFRSNFEIHRKIHTEDNAYKCNECGKTFSRTSSLTCHRRR 420 430 440 450 460 470 380 390 400 410 420 430 KIAA20 HTGIKPYKCKDCGKAFTQNSDLTKHARTHSGERPYECKECGKAFARSSRLSEHTRTHTGE ::: .::::..: ::: .:.: .: : :.::.::.:.::::.:.:.: :. : : :::: KIAA20 HTGEQPYKCEECDKAFRFKSNLERHRRIHTGEKPYKCNECGKTFSRKSYLTCHHRLHTGE 480 490 500 510 520 530 440 450 460 470 480 490 KIAA20 KPFECVKCGKAFAISSNLSGHLRIHTGEKPFECLECGKAFTHSSSLNNHMRTHSAKKPFT : ..: .:.:.:. .:.:. : :.:.::::..: ::::.:... .:. : : ::...:. 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KIAA00 VMLENYSNLVSVGYCVHKPEVIFRLQQGEEPWKQEEEFPSQSFPVWTADHLKERSQENQS 80 90 100 110 120 130 80 90 100 KIAA20 ---WKVQLKTKELAL--QQDVLGEP-----------------TSSGI------QMIGSHN :.: . ..:. : ::.: : : :. ... :. KIAA00 KHLWEVVFINNEMLTKEQGDVIGIPFNVDVSSFPSRKMFCQCDSCGMSFNTVSELVISKI 140 150 160 170 180 190 110 120 130 KIAA20 G--GEVSD-VKQCG-----------------------DVSSEHSCLKTHVRTQNSENTFE . :. :: . :: .. :.: : . :. :..:: KIAA00 NYLGKKSDEFNACGKLLLNIKHDETHTQEKNEVLKNRNTLSHHEETLQHEKIQTLEHNFE 200 210 220 230 240 250 140 150 160 KIAA20 ---CY-------LYGV-----------DF------------LTLHKKTSTGEQRSVFSQC : .... :. : .:. . . ... ::.: KIAA00 YSICQETLLEKAVFNTQKRENAEENNCDYNEFGRTLCDSSSLLFHQISPSRDNHYEFSDC 260 270 280 290 300 310 170 180 190 KIAA20 GKAFSLN-----PDVV------C--------QRTCT--------GEKAFDCSDSGKSFIN : . .. : : : .. : ::: :.:.. ::.: . KIAA00 EKFLCVKSTLSKPHGVSMKHYDCGESGNNFRRKLCLSHLQKGDKGEKHFECNECGKAFWE 320 330 340 350 360 370 200 210 220 230 240 250 KIAA20 HSHLQGHLRTHNGESLHEWKECGRGFIHSTDLAVRIQTHRSEKPYKCKECGKGFRYSAYL .::: : :.:.:.. . .:: ..: ...:. . ..: .:::..:.::::.: ... : KIAA00 KSHLTRHQRVHTGQKPFQCNECEKAFWDKSNLTKHQRSHTGEKPFECNECGKAFSHKSAL 380 390 400 410 420 430 260 270 280 290 300 310 KIAA20 NIHMGTHTGDNPYECKECGKAFTRSCQLTQHRKTHTGEKPYKCKDCGRAFTVSSCLSQHM ..:. ::::..::.:. :::.: .. .::.:..:::: :::.: .::..: :.: :. :. KIAA00 TLHQRTHTGEKPYQCNACGKTFCQKSDLTKHQRTHTGLKPYECYECGKSFRVTSHLKVHQ 440 450 460 470 480 490 320 330 340 350 360 370 KIAA20 KIHVGEKPYECKECGIAFTRSSQLTEHLKTHTAKDPFECKICGKSFRNSSCLSDHFRIHT . :.::::.:: ::: .:...:.::.: . : . .::. :::.: ..: :. : ::: KIAA00 RTHTGEKPFECLECGKSFSEKSNLTQHQRIHIGDKSYECNACGKTFYHKSLLTRHQIIHT 500 510 520 530 540 550 380 390 400 410 420 430 KIAA20 GIKPYKCKDCGKAFTQNSDLTKHARTHSGERPYECKECGKAFARSSRLSEHTRTHTGEKP : :::.: .:::.: .:::: : :::.:..:. : :::: :...: ::.: :::::::: KIAA00 GWKPYECYECGKTFCLKSDLTVHQRTHTGQKPFACPECGKFFSHKSTLSQHYRTHTGEKP 560 570 580 590 600 610 440 450 460 470 480 490 KIAA20 FECVKCGKAFAISSNLSGHLRIHTGEKPFECLECGKAFTHSSSLNNHMRTHSAKKPFTCM .:: .::: : .: :. : : ::::::.:: :::::: ..:.:..:.: : ..::. : KIAA00 YECHECGKIFYNKSYLTKHNRTHTGEKPYECNECGKAFYQKSQLTQHQRIHIGEKPYKCN 620 630 640 650 660 670 500 510 520 530 540 550 KIAA20 ECGKAFKFPTCVNLHMRIHTGEKPYKCKQCGKSFSYSNSFQLHERTHTGEKPYECKECGK :::::: . . .:.: :: ::::::..::::: .... .::: :::::::::.:::: KIAA00 ECGKAFCHKSALIVHQRTHTQEKPYKCNECGKSFCVKSGLIFHERKHTGEKPYECNECGK 680 690 700 710 720 730 560 570 580 KIAA20 AFSSSSSFRNHERRHADERLSA : .::. :.: :. :. KIAA00 FFRHKSSLTVHHRAHTGEKSCQCNECGKIFYRKSELAQHQRSHTGEKPYECNTCRKTFSQ 740 750 760 770 780 790 >>KIAA1852 ( 948 res) fj01514 (948 aa) initn: 6407 init1: 1481 opt: 1555 Z-score: 1237.0 bits: 239.5 E(): 8.7e-64 Smith-Waterman score: 1587; 40.976% identity (60.947% similar) in 676 aa overlap (1-577:216-890) 10 20 30 KIAA20 DSVTFDDLAVDFTPEEWTLLDPTQRNLYRD . ::: :.::::: ::: :: .::.:::: KIAA18 ALCPQYPAWHVEGSLEEGRRATGLPAAQVQEPVTFKDVAVDFTQEEWGQLDLVQRTLYRD 190 200 210 220 230 240 40 50 60 70 80 KIAA20 VMLENYKNLATVGYQLFKPSLISWLEQ-EESRTVQRGDFQAS--EWKVQLKTKELALQQD ::::.: .: .:: :. :: .:: ::: :: .:... : . :: .:..: : :. KIAA18 VMLETYGHLLSVGNQIAKPEVISLLEQGEEPWSVEQACPQRTCPEWVRNLESKALIPAQS 250 260 270 280 290 300 90 100 110 120 130 KIAA20 VLGEPTSSGIQM---IGSHNGGEVSDVKQCGDV-----SSEHSCLKTHVRTQN---SENT .. : : :... : . .: : : .. . .. : :. :. . KIAA18 IFEEEQSHGMKLERYIWDDPWFSRLEVLGCKDQLEMYHMNQSTAMRQMVFMQKQVLSQRS 310 320 330 340 350 360 140 150 160 170 KIAA20 FE-CYLYGVDF-----LTLHKKTSTGE---QRSVFSQ---CGKAFSLNPDVVCQ------ : : : :..: .. ...: : . .. .: : .:. :.:. KIAA18 SEFCGL-GAEFSQNLNFVPSQRVSQIEHFYKPDTHAQSWRCDSAIMYADKVTCENNDYDK 370 380 390 400 410 420 180 190 200 210 220 KIAA20 ------------RTCTGEKAFDCSDSGKSFINHSHLQGHLRTHNGESLHEWKECGRGFIH : ::.. : :.:. ::: . :. : :.::.:.:.::: . : . KIAA18 TVYQSIQPIYPARIQTGDNLFKCTDAVKSFNHIIHFGDHKGIHTGEKLYEYKECHQIFNQ 430 440 450 460 470 480 230 KIAA20 STD-------------------------------------------------------LA : . :. KIAA18 SPSFNEHPRLHVGENQYNYKEYENIFYFSSFMEHQKIGTVEKAYKYNEWEKVFGYDSFLT 490 500 510 520 530 540 240 250 260 270 280 290 KIAA20 VRIQTHRSEKPYKCKECGKGFRYSAYLNIHMGTHTGDNPYECKECGKAFTRSCQLTQHRK . .:. .:::: .::: .: .:.:: : ::::..:::: .:::.: ::.:.. KIAA18 QHTSTYTAEKPYDYNECGTSFIWSSYLIQHKKTHTGEKPYECDKCGKVFRNRSALTKHER 550 560 570 580 590 600 300 310 320 330 340 350 KIAA20 THTGEKPYKCKDCGRAFTVSSCLSQHMKIHVGEKPYECKECGIAFTRSSQLTEHLKTHTA :::: :::.:. ::.::. .: : : .::.::::: :.::: .:. .:.: : .:::. KIAA18 THTGIKPYECNKCGKAFSWNSHLIVHKRIHTGEKPYVCNECGKSFNWNSHLIGHQRTHTG 610 620 630 640 650 660 360 370 380 390 400 410 KIAA20 KDPFECKICGKSFRNSSCLSDHFRIHTGIKPYKCKDCGKAFTQNSDLTKHARTHSGERPY . :::: ::::: :: : :.:.::: ::.:: .: ::: . : :.:: ::::: .:: KIAA18 EKPFECTECGKSFSWSSHLIAHMRMHTGEKPFKCDECEKAFRDYSALSKHERTHSGAKPY 670 680 690 700 710 720 420 430 440 450 460 470 KIAA20 ECKECGKAFARSSRLSEHTRTHTGEKPFECVKCGKAFAISSNLSGHLRIHTGEKPFECLE .: ::::.:. ::.: : ::::::::..: .::::: : :. : ::.: ::.:: . KIAA18 KCTECGKSFSWSSHLIAHQRTHTGEKPYNCQECGKAFRERSALTKHEIIHSGIKPYECNK 730 740 750 760 770 780 480 490 500 510 520 530 KIAA20 CGKAFTHSSSLNNHMRTHSAKKPFTCMECGKAFKFPTCVNLHMRIHTGEKPYKCKQCGKS :::. .. . : :.:::...::. : .:::.:. . : :::::::::::.:: .: KIAA18 CGKSCSQMAHLVRHQRTHTGEKPYECNKCGKSFSQSCHLVAHRRIHTGEKPYKCNQCERS 790 800 810 820 830 840 540 550 560 570 580 KIAA20 FSYSNSFQLHERTHTGEKPYECKECGKAFSSSSSFRNHERRHADERLSA :. :. . :.:::::::::.:.::::::. :::. : : :. :. KIAA18 FNCSSHLIAHRRTHTGEKPYRCNECGKAFNESSSLIVHLRNHTGEKPYKCNHCEKAFCKN 850 860 870 880 890 900 KIAA18 SSLIIHQRMHSGEKRFICSECGKAFSGHSALLQHQRNHSEEKLN 910 920 930 940 >>KIAA0412 ( 720 res) hg03242 (720 aa) initn: 3824 init1: 1398 opt: 1553 Z-score: 1236.5 bits: 239.0 E(): 9.4e-64 Smith-Waterman score: 1553; 42.513% identity (67.126% similar) in 581 aa overlap (2-565:106-674) 10 20 30 KIAA20 DSVTFDDLAVDFTPEEWTLLDPTQRNLYRDV ::::::.:: :: ::: :: .::.::..: KIAA04 VRPPGAPLSQLCGPGGDVMAAAVLTDRAQVSVTFDDVAVTFTKEEWGQLDLAQRTLYQEV 80 90 100 110 120 130 40 50 60 70 80 KIAA20 MLENYKNLATVGYQLFKPSLISWLEQEESRTVQRGDFQASEW---KVQLKTKELALQQDV :::: :...: . : :: ::. . ... :.. . : . :: : . . . KIAA04 MLENCGLLVSLGCPVPKAELICHLEHGQEPWTRKEDLSQDTCPGDKGKPKTTEPTTCEPA 140 150 160 170 180 190 90 100 110 120 130 KIAA20 LGEPTSSGIQMIGSHNGGEVSDVK--QCGDVSSEHSCLKTHVRT-----QNSENTF--EC :.: ::.. :. . :. : . : : .. . : : ..: . . :: KIAA04 LSE----GISLQGQVTQGNSVDSQLGQAEDQDGLSEMQEGHFRPGIDPQEKSPGKMSPEC 200 210 220 230 240 250 140 150 160 170 180 190 KIAA20 YLYGV-DFLTL---HKKTSTGEQRSVFSQCGKAFSLNPDVVCQRTCTGEKAFDCSDSGKS :. : . ....: :.. ..: .. : . :. :. : ::. :: KIAA04 DGLGTADGVCSRIGQEQVSPGDRVRSHNSCESG----KDPMIQEE---ENNFKCSECGKV 260 270 280 290 300 200 210 220 230 240 250 KIAA20 FINHSHL-QGHLRTHNGESLHEWKECGRGFIHSTDLAVRIQTHRSEKPYKCKECGKGFRY : :..:: :: . :.: . .: :::. ::.:: : . . : .:.::.: ::::.: KIAA04 F-NKKHLLAGHEKIHSGVKPYECTECGKTFIKSTHLLQHHMIHTGERPYECMECGKAFNR 310 320 330 340 350 360 260 270 280 290 300 310 KIAA20 SAYLNIHMGTHTGDNPYECKECGKAFTRSCQLTQHRKTHTGEKPYKCKDCGRAFTVSSCL ..::. :. :.:..::.:.:::::::. ... : . ::::: . : .::..: . KIAA04 KSYLTQHQRIHSGEKPYKCNECGKAFTHRSNFVLHNRRHTGEKSFVCTECGQVFRHRPGF 370 380 390 400 410 420 320 330 340 350 360 370 KIAA20 SQHMKIHVGEKPYECKECGIAFTRSSQLTEHLKTHTAKDPFECKICGKSFRNSSCLSDHF .:. .: ::.:::: ::: .: . : : : .:::.. :.::. ::: : .:. : :. KIAA04 LRHYVVHSGENPYECLECGKVFKHRSYLMWHQQTHTGEKPYECSECGKVFLESAALIHHY 430 440 450 460 470 480 380 390 400 410 420 430 KIAA20 RIHTGIKPYKCKDCGKAFTQNSDLTKHARTHSGERPYECKECGKAFARSSRLSEHTRTHT :::: ::..: .:::::.. : : .: : :.::.:. :.::::::.. : . : :.:: KIAA04 VIHTGEKPFECLECGKAFNHRSYLKRHQRIHTGEKPFVCSECGKAFTHCSTFILHKRAHT 490 500 510 520 530 540 440 450 460 470 480 490 KIAA20 GEKPFECVKCGKAFAISSNLSGHLRIHTGEKPFECLECGKAFTHSSSLNNHMRTHSAKKP ::::::: .:::::. ..: :. :::::::.::.:::::::. :.:. : : ::..:: KIAA04 GEKPFECKECGKAFSNRKDLIRHFSIHTGEKPYECVECGKAFTRMSGLTRHKRIHSGEKP 550 560 570 580 590 600 500 510 520 530 540 550 KIAA20 FTCMECGKAFKFPTCVNLHMRIHTGEKPYKCKQCGKSFSYSNSFQLHERTHTGEKPYECK . :.::::.: . : . : ::::::::::..:::.:: :.:. :.: :::..: KIAA04 YECVECGKSFCWSTNLIRHAIIHTGEKPYKCSECGKAFSRSSSLTQHQRMHTGKNPISVT 610 620 630 640 650 660 560 570 580 KIAA20 ECGKAFSSSSSFRNHERRHADERLSA . :. :.:... KIAA04 DVGRPFTSGQTSVTLRELLLGKDFLNVTTEANILPEETSSSASDQPYQRETPQVSSL 670 680 690 700 710 720 >>KIAA1982 ( 599 res) fk06527(revised) (599 aa) initn: 11238 init1: 1503 opt: 1549 Z-score: 1234.0 bits: 238.3 E(): 1.3e-63 Smith-Waterman score: 1581; 45.322% identity (72.141% similar) in 481 aa overlap (103-577:3-483) 80 90 100 110 120 130 KIAA20 WKVQLKTKELALQQDVLGEPTSSGIQMIGSHNGGEVSDVKQCGDVSSEHSCLKTHVRTQN :.: . .:: . . . : .: : .. KIAA19 RIHTGEKPYTCGECGKTFRQSANLYVHRRIHT 10 20 30 140 150 160 170 180 KIAA20 SENTFECYLYGVDF-----LTLHKKTSTGEQRSVFSQCGKAFSLNPDVVC-QRTCTGEKA .:. ..: : : :. ::: :::. .:::::. . ... .: : :: KIAA19 GEKPYKCEDCGKAFGRYTALNQHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNSSTNLTAHKRIHTREKP 40 50 60 70 80 90 190 200 210 220 230 240 KIAA20 FDCSDSGKSFINHSHLQGHLRTHNGESLHEWKECGRGFIHSTDLAVRIQTHRSEKPYKCK . : : :..: ..:. . . :.:.. .. ::::..:::: : . . : ..:::::: KIAA19 YTCEDRGRAFGLSTNLNEYKKIHTGDKPYKCKECGKAFIHSLHLNKHEKIHTGKKPYKCK 100 110 120 130 140 150 250 260 270 280 290 300 KIAA20 ECGKGFRYSAYLNIHMGTHTGDNPYECKECGKAFTRSCQLTQHRKTHTGEKPYKCKDCGR .::: . :. . : :::..:.:: ::::::: : ::.::. ::::::: :. ::. KIAA19 QCGKVITSSSSFAKHKRIHTGEKPFECLECGKAFTSSTTLTKHRRIHTGEKPYTCEVCGK 160 170 180 190 200 210 310 320 330 340 350 360 KIAA20 AFTVSSCLSQHMKIHVGEKPYECKECGIAFTRSSQLTEHLKTHTAKDPFECKICGKSFRN :: :. : : .::.::::: :.::: .: .:..: : . ::.. :..:. :::.: KIAA19 AFRQSAILYVHRRIHTGEKPYTCEECGKTFRQSANLYVHRRIHTGEKPYKCEECGKAFGR 220 230 240 250 260 270 370 380 390 400 410 420 KIAA20 SSCLSDHFRIHTGIKPYKCKDCGKAFTQNSDLTKHARTHSGERPYECKECGKAFARSSRL . :..: .:::: : :::..::: :. .::... . ..::.::.:.::::::: :. : KIAA19 YTDLNQHKKIHTGEKLYKCEECGKDFVWYTDLNQQKKIYTGEKPYKCEECGKAFAPSTDL 280 290 300 310 320 330 430 440 450 460 470 480 KIAA20 SEHTRTHTGEKPFECVKCGKAFAISSNLSGHLRIHTGEKPFECLECGKAFTHSSSLNNHM ..::. :::. ..: .:::::. : :. : .:::::::..: ::::::..: .:..: KIAA19 NQHTKILTGEQSYKCEECGKAFGWSIALNQHKKIHTGEKPYKCEECGKAFSRSRNLTTHR 340 350 360 370 380 390 490 500 510 520 530 540 KIAA20 RTHSAKKPFTCMECGKAFKFPTCVNLHMRIHTGEKPYKCKQCGKSFSYSNSFQLHERTHT :.:. .::. : . :..: . : .: . .::::.: ::::.::: :. :. .. ::. :: KIAA19 RVHTREKPYKCEDRGRSFGWSTNLNEYKKIHTGDKLYKCKECGKVFKQSSHLNRHEKIHT 400 410 420 430 440 450 550 560 570 580 KIAA20 GEKPYECKECGKAFSSSSSFRNHERRHADERLSA :.:::.::::::...::::: .:.: :. :. KIAA19 GKKPYKCKECGKVITSSSSFAKHKRIHTGEKPFKCLECGKAFTSSTTLTKHRRIHTGEKP 460 470 480 490 500 510 KIAA19 YTCEECGKAFRQSAILYVHRRIHTGEKPYTCGECGKTFRQSANLYAHKKIHTGEKPYTCG 520 530 540 550 560 570 >>KIAA1947 ( 608 res) fh23660 (608 aa) initn: 2770 init1: 1456 opt: 1543 Z-score: 1229.2 bits: 237.5 E(): 2.4e-63 Smith-Waterman score: 1557; 43.340% identity (68.986% similar) in 503 aa overlap (84-573:108-606) 60 70 80 90 100 KIAA20 WLEQEESRTVQRGDFQASEWKVQLKTKELALQQDVLG---EP--TSSGIQMIGSHNGGEV :::..: .: . :.. . : : . KIAA19 RPSFVNDSVHLAKRNLTCMQGGKDFTGDSDLQQQALHSGWKPHRDTHGVEAFQS--GQNN 80 90 100 110 120 130 110 120 130 140 150 160 KIAA20 SDVKQCG-DVSSEHSCLKTHVRTQNSENTFEC------YLYGVDFLTLHKKTSTGEQRSV . ::: : .:. : : . .. : .:: . :. :.. :... :::. KIAA19 YSCTQCGKDFCHQHT-LFEHQKIHTEERPYECSECGKLFRYNSDLIK-HQRNHTGERPYK 140 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 220 KIAA20 FSQCGKAFSLNPDVVC-QRTCTGEKAFDCSDSGKSFINHSHLQGHLRTHNGESLHEWKEC :.:::::::. .:: :. :::. ..::. ::.:. .::: : : :. . .:: KIAA19 CSECGKAFSLKYNVVQHQKIHTGERPYECSECGKAFLRKSHLLQHQRIHTRPRPYVCSEC 200 210 220 230 240 250 230 240 250 260 270 280 KIAA20 GRGFIHSTDLAVRIQTHRSEKPYKCKECGKGFRYSAYLNIHMGTHTGDNPYECKECGKAF :..:. .. :. . . : .:.:: :.:::: : ::. : :. .:::. :. : :::: : KIAA19 GKAFLTQAHLVGHQKIHTGERPYGCNECGKYFMYSSALIRHQKVHTGERPFYCCECGKFF 260 270 280 290 300 310 290 300 310 320 330 340 KIAA20 TRSCQLTQHRKTHTGEKPYKCKDCGRAFTVSSCLSQHMKIHVGEKPYECKECGIAFTRSS :: : :...:::::::.:..::. : : : .:.:.:.:::::::.::: : .: KIAA19 MDSCTLIIHQRVHTGEKPYECNECGKFFRYRSTLIRHQKVHTGEKPYECSECGKFFMDTS 320 330 340 350 360 370 350 360 370 380 390 400 KIAA20 QLTEHLKTHTAKDPFECKICGKSFRNSSCLSDHFRIHTGIKPYKCKDCGKAFTQNSDLTK : : ..::.. :.::. ::: :: :. : :.:.: .::.:..::: :... : . KIAA19 TLIIHQRVHTGEKPYECNKCGKFFRYCFTLNRHQRVHSGERPYECSECGKFFVDSCTLKS 380 390 400 410 420 430 410 420 430 440 450 460 KIAA20 HARTHSGERPYECKECGKAFARSSRLSEHTRTHTGEKPFECVKCGKAFAISSNLSGHLRI : :.:.::::.::. :::.: : :. : : ::::.:.:: .::: : .:: : : KIAA19 HQRVHTGERPFECSICGKSFRCRSTLDTHQRIHTGERPYECSECGKFFRHNSNHIRHRRN 440 450 460 470 480 490 470 480 490 500 510 520 KIAA20 HTGEKPFECLECGKAFTHSSSLNNHMRTHSAKKPFTCMECGKAFKFPTCVNLHMRIHTGE : ::. ::: :::..:...: : :...:. .. . : .::: : . . : :.:::: KIAA19 HFGERSFECTECGRVFSQNSHLIRHQKVHTRERTYKCSKCGKFFMDSSTLISHERVHTGE 500 510 520 530 540 550 530 540 550 560 570 580 KIAA20 KPYKCKQCGKSFSYSNSFQLHERTHTGEKPYECKECGKAFSSSSSFRNHERRHADERLSA :::.:..::: : :..:. :.: ::::.::.:.:::..:...: . .:.. : KIAA19 KPYECSECGKVFRYNSSLIKHRRIHTGERPYQCSECGRVFNQNSHLIQHQKVHTR 560 570 580 590 600 >>KIAA0798 ( 682 res) hk06584 (682 aa) initn: 2762 init1: 1426 opt: 1508 Z-score: 1201.2 bits: 232.4 E(): 8.6e-62 Smith-Waterman score: 1621; 41.304% identity (65.373% similar) in 644 aa overlap (3-577:38-681) 10 20 30 KIAA20 DSVTFDDLAVDFTPEEWTLLDPTQRNLYRDVM .:..:..:.:: ::: :: : :..:::::: KIAA07 LRQIQRRQRQSIPGAGHFPQQKKMINAQELLTLEDVTVEFTWEEWQLLGPFQKDLYRDVM 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 KIAA20 LENYKNLATVGYQLFKPSLISWLEQ-EESRTVQR-------------GDFQASEWKVQ-- :: :.:: ..:::. ::. .: ::. :: :.. : .. . : KIAA07 LEIYSNLLSMGYQVSKPDALSKLERGEEPWTMEDERHSRICPENNEVDDHLQDHLENQRM 70 80 90 100 110 120 80 90 100 110 KIAA20 LKTKELALQQDVLGEPTS-----------------------SGIQMIGSHNGGEVSD-VK ::. : .....:. .: :.......... :... .: KIAA07 LKSVEQYHEHNAFGNTASQTKSLCLFRENHDTFELYIKTLKSNLSLVNQNKSCEINNSTK 130 140 150 160 170 180 120 130 140 KIAA20 QCGD-------------------VSSEHSCLKT----HVRTQNSENTFECYLYGVDF--- :: ::.. . :. : ::.. :.. : : : KIAA07 FSGDGKSFLHGNYEELYSAAKFSVSTKANSTKSQVSKHQRTHEIEKNHVCSECGKAFVKK 190 200 210 220 230 240 150 160 170 180 190 200 KIAA20 --LTLHKKTSTGEQRSVFSQCGKAFSLNPDVVC-QRTCTGEKAFDCSDSGKSFINHSHLQ :: :... :::. . :.:.:: . . :: ::.: ::. :: : .:.: KIAA07 SQLTDHERVHTGEKPYGCTLCAKVFSRKSRLNEHQRIHKREKSFICSECGKVFTMKSRLI 250 260 270 280 290 300 210 220 230 240 250 260 KIAA20 GHLRTHNGESLHEWKECGRGFIHSTDLAVRIQTHRSEKPYKCKECGKGFRYSAYLNIHMG : :::.::. . .:::.:: . .: :. ..: .:: : :.:::::: ...: ::. KIAA07 EHQRTHTGEKPYICNECGKGFPGKRNLIVHQRNHTGEKSYICSECGKGFTGKSMLIIHQR 310 320 330 340 350 360 270 280 290 300 310 320 KIAA20 THTGDNPYECKECGKAFTRSCQLTQHRKTHTGEKPYKCKDCGRAFTVSSCLSQHMKIHVG ::::..:: :.::::.:: . . :...::::::: :..::..::..: . .:.. :.: KIAA07 THTGEKPYICSECGKGFTTKHYVIIHQRNHTGEKPYICNECGKGFTMKSRMIEHQRTHTG 370 380 390 400 410 420 330 340 350 360 370 380 KIAA20 EKPYECKECGIAFTRSSQLTEHLKTHTAKDPFECKICGKSFRNSSCLSDHFRIHTGIKPY :::: :.::: .: :.:.: : ..::.. . :. :::.: .: : : : ::: ::: KIAA07 EKPYICSECGKGFPRKSNLIVHQRNHTVEKSYLCSECGKGFTVKSMLIIHQRTHTGEKPY 430 440 450 460 470 480 390 400 410 420 430 440 KIAA20 KCKDCGKAFTQNSDLTKHARTHSGERPYECKECGKAFARSSRLSEHTRTHTGEKPFECVK :..:::.: .: : : :::.::.::.:.::::.: .: : : ::::::::. : . KIAA07 TCSECGKGFPLKSRLIVHQRTHTGEKPYRCSECGKGFIVNSGLMLHQRTHTGEKPYICNE 490 500 510 520 530 540 450 460 470 480 490 500 KIAA20 CGKAFAISSNLSGHLRIHTGEKPFECLECGKAFTHSSSLNNHMRTHSAKKPFTCMECGKA :::.::..::: : : ::::::: : ::::.:: . : :.. :. .: : :::.. KIAA07 CGKGFAFKSNLVVHQRTHTGEKPFMCSECGKGFTMKRYLIVHQQIHTEEKSCICSECGRG 550 560 570 580 590 600 510 520 530 540 550 560 KIAA20 FKFPTCVNLHMRIHTGEKPYKCKQCGKSFSYSNSFQLHERTHTGEKPYECKECGKAFSSS : : . :: ..::::::: :..:::.:.... . .:.::::::::. :.:: :::::. KIAA07 FAKETELALHKQVHTGEKPYGCNECGKGFTMKSRLIVHQRTHTGEKPFVCSECRKAFSSK 610 620 630 640 650 660 570 580 KIAA20 SSFRNHERRHADERLSA .. :.: : .. KIAA07 RNLIVHQRTHNGNKP 670 680 >>KIAA1473 ( 574 res) fj03262 (574 aa) initn: 2896 init1: 1488 opt: 1502 Z-score: 1197.1 bits: 231.4 E(): 1.5e-61 Smith-Waterman score: 1666; 44.330% identity (70.447% similar) in 582 aa overlap (3-577:15-574) 10 20 30 40 KIAA20 DSVTFDDLAVDFTPEEWTLLDPTQRNLYRDVMLENYKNLATVGYQLFK .:: :.:..:. ::: :: .:.::::.::::::.::. :: : KIAA14 AKTLGPPGSLETGVLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQQNLYRNVMLENYRNLVFVGIAASK 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 KIAA20 PSLISWLEQ-EESRTVQRGDFQASEWKV-QLKTKELALQQDVLGEPTSSGIQMIGSHNGG :.::. ::: .: .:.: .. : : . ...: .: :. .. .: . KIAA14 PDLITCLEQGKEPWNVKRHEMVAEPPVVCSYFARDLWPKQ---GK--KNYFQKVI----- 70 80 90 100 110 110 120 130 140 150 160 KIAA20 EVSDVKQCGDVSSEHSCLKTHVRTQNSENTFECYLYGVDFLTLHKKTSTGEQRSVFSQCG . :.:: :. :. . .... :: .. . :.. .: : ..: :: KIAA14 -LRRYKKCG---CENLQLRKYCKSMD-----ECKVHKECYNGLNQCLTT-TQNKIF-QCD 120 130 140 150 170 180 190 200 210 220 KIAA20 KAFSL-----NPDVVCQRTCTGEKAFDCSDSGKSFINHSHLQGHLRTHNGESLHEWKECG : .. : . : ::.:.: :.. ::: ::: : : :.::. .. :::: KIAA14 KYVKVFHKFSNSNRHTIRH-TGKKSFKCKECEKSFCMLSHLAQHKRIHSGEKPYKCKECG 160 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 280 KIAA20 RGFIHSTDLAVRIQTHRSEKPYKCKECGKGFRYSAYLNIHMGTHTGDNPYECKECGKAFT ... ....:... . : ..:::::.::::.: ..:. : ::: .::.:.::::::. KIAA14 KAYNETSNLSTHKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLSHLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFN 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 KIAA20 RSCQLTQHRKTHTGEKPYKCKDCGRAFTVSSCLSQHMKIHVGEKPYECKECGIAFTRSSQ .: .:: :.. :::::::::..:::::. :: :. : ::.:::::.:.::: ::..:: KIAA14 QSANLTTHKRIHTGEKPYKCEECGRAFSQSSTLTAHKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSST 280 290 300 310 320 330 350 360 370 380 390 400 KIAA20 LTEHLKTHTAKDPFECKICGKSFRNSSCLSDHFRIHTGIKPYKCKDCGKAFTQNSDLTKH :: : ::.. ..:. :::.: . : :. : :::.: :::::..::::: :.: :: : KIAA14 LTTHKIIHTGEKFYKCEECGKAFSQLSHLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTH 340 350 360 370 380 390 410 420 430 440 450 460 KIAA20 ARTHSGERPYECKECGKAFARSSRLSEHTRTHTGEKPFECVKCGKAFAISSNLSGHLRIH : :.::. :.:. :.:::.: :.:. : : ::::::..: .::::: .::.:. : :: KIAA14 KRIHAGEKFYKCEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIH 400 410 420 430 440 450 470 480 490 500 510 520 KIAA20 TGEKPFECLECGKAFTHSSSLNNHMRTHSAKKPFTCMECGKAFKFPTCVNLHMRIHTGEK :::::..: ::::::..::.:..: :...::. ::::::. . .. : :::::: KIAA14 TGEKPYKCEECGKAFNQSSTLSKHKVIHTGEKPYKYEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTGEK 460 470 480 490 500 510 530 540 550 560 570 580 KIAA20 PYKCKQCGKSFSYSNSFQLHERTHTGEKPYECKECGKAFSSSSSFRNHERRHADERLSA ::::..:::.:. :. .. :. ::::: :. . :..: .. ... ...: : :. KIAA14 PYKCEECGKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESCNNACDNIAKISKYKRNCAGEK 520 530 540 550 560 570 580 residues in 1 query sequences 1986925 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:25:21 2008 done: Thu Dec 18 15:25:21 2008 Total Scan time: 0.480 Total Display time: 0.210 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]