# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/ah02593.fasta.huge -Q ../query/KIAA2003.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA2003, 460 aa vs ./tmplib.25089 library 1987045 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.6120+/-0.00583; mu= 21.7664+/- 0.399 mean_var=141.0395+/-35.631, 0's: 0 Z-trim: 78 B-trim: 15 in 1/39 Lambda= 0.107995 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1710 ( 515 res) fj18457 ( 515) 1523 249.1 5.1e-67 KIAA1956 ( 680 res) fk08713 ( 680) 1477 242.1 8.1e-65 KIAA1947 ( 608 res) fh23660 ( 608) 1473 241.4 1.2e-64 KIAA1508 ( 573 res) hk06576 ( 573) 1412 231.9 8.5e-62 KIAA0326 ( 927 res) hg00579 ( 927) 1350 222.6 8.3e-59 KIAA1611 ( 813 res) fj12627 ( 813) 1345 221.7 1.4e-58 KIAA0628 ( 540 res) hh01433 ( 540) 1333 219.5 4.2e-58 KIAA1396 ( 551 res) hj08221 ( 551) 1326 218.4 9.1e-58 KIAA1829 ( 557 res) hj00069 ( 557) 1325 218.3 1e-57 KIAA1431 ( 891 res) fj00022 ( 891) 1324 218.5 1.4e-57 KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 ( 579) 1318 217.2 2.2e-57 KIAA0412 ( 720 res) hg03242 ( 720) 1302 214.9 1.3e-56 KIAA1852 ( 948 res) fj01514 ( 948) 1302 215.2 1.5e-56 KIAA0065 ( 848 res) ha00946 ( 848) 1299 214.6 2e-56 KIAA1349 ( 752 res) fj00940 ( 752) 1286 212.5 7.7e-56 KIAA1962 ( 746 res) hm00158 ( 746) 1282 211.8 1.2e-55 KIAA1559 ( 544 res) fh19195 ( 544) 1272 210.0 3.1e-55 KIAA1827 ( 469 res) fk01409 ( 469) 1269 209.4 4e-55 KIAA0798 ( 682 res) hk06584 ( 682) 1267 209.4 5.8e-55 KIAA1969 ( 595 res) fk06944 ( 595) 1254 207.3 2.2e-54 KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 ( 766) 1241 205.5 1e-53 KIAA1473 ( 574 res) fj03262 ( 574) 1235 204.3 1.7e-53 KIAA0961 ( 530 res) hj05830 ( 530) 1223 202.4 6e-53 KIAA1982 ( 599 res) fk06527(revised) ( 599) 1220 202.0 8.8e-53 KIAA1948 ( 487 res) fh24556 ( 487) 1209 200.1 2.7e-52 KIAA2007 ( 580 res) fj01689 ( 580) 1206 199.8 3.9e-52 KIAA1615 ( 484 res) fj13419 ( 484) 1181 195.7 5.4e-51 KIAA0972 ( 702 res) hj06859 ( 702) 1162 193.1 4.9e-50 KIAA1198 ( 553 res) fg01911 ( 553) 1133 188.4 1e-48 KIAA1141 ( 914 res) hk01833 ( 914) 1106 184.6 2.3e-47 KIAA1806 ( 481 res) fk00438 ( 481) 1087 181.1 1.4e-46 KIAA1588 ( 613 res) fj08823 ( 613) 1086 181.1 1.7e-46 KIAA1871 ( 821 res) hj05256s1 ( 821) 1081 180.6 3.3e-46 KIAA1015 ( 841 res) hk03609(revised) ( 841) 1021 171.3 2.2e-43 KIAA0426 ( 613 res) hh01274 ( 613) 904 152.8 5.9e-38 KIAA1954 ( 468 res) fk02322 ( 468) 876 148.2 1.1e-36 KIAA1339 ( 409 res) fj00071 ( 409) 813 138.2 9.3e-34 KIAA0441 ( 702 res) hh00601s1 ( 702) 800 136.7 4.7e-33 KIAA1979 ( 309 res) fj09511 ( 309) 705 121.2 9.7e-29 KIAA1285 ( 785 res) hh11563(revised) ( 785) 677 117.6 2.9e-27 KIAA1951 ( 679 res) fj05532 ( 679) 632 110.5 3.5e-25 KIAA0924 ( 617 res) hh02883 ( 617) 630 110.1 4.2e-25 KIAA0557 ( 493 res) hh01334 ( 493) 629 109.7 4.3e-25 KIAA1675 ( 1286 res) ae00102 (1286) 528 94.9 3.4e-20 KIAA0236 ( 1696 res) ha04654 (1696) 515 93.1 1.5e-19 KIAA0478 ( 1253 res) hh05955 (1253) 473 86.3 1.3e-17 KIAA1020 ( 638 res) fg00473s1 ( 638) 431 79.1 9.1e-16 KIAA1231 ( 1061 res) fh08195s1 (1061) 423 78.3 2.6e-15 KIAA1388 ( 599 res) fj06552 ( 599) 415 76.6 5e-15 KIAA1190 ( 174 res) hg03443a ( 174) 373 68.9 2.9e-13 >>KIAA1710 ( 515 res) fj18457 (515 aa) initn: 4045 init1: 1381 opt: 1523 Z-score: 1295.1 bits: 249.1 E(): 5.1e-67 Smith-Waterman score: 1529; 49.041% identity (72.921% similar) in 469 aa overlap (24-459:46-514) 10 20 30 40 50 KIAA20 GPLSPGPYQCRPSLPAQLYPQSLMAAATLRTPTQGTVTFEDVAVHFSWEEWGL :::. : . .:. :::::.:.... ::: KIAA17 RSSGSFAGQERCLLAAFPALSPWRRTLVLEMAATLLMAGSQAPVTFEDMAMYLTREEWRP 20 30 40 50 60 70 60 70 80 90 100 KIAA20 LDEAQRCLYRDVMLENLALLTSLDVH-------RQKQHLGEK-HFRSNVGR-ALFVKTCT :: ::: :::::: :: . ..::: . ::...: .: .. : : .. KIAA17 LDAAQRDLYRDVMQENYGNVVSLDFEIRSENEVNPKQEISEDVQFGTTSERPAENAEENP 80 90 100 110 120 130 110 120 130 140 KIAA20 FHVSGEPS---TCREVGK---------------DFLAK----LGFLHQQAAHTGEQSNSK : : . :. : :.:.. :. .. .: :. .. KIAA17 ESEEGFESGDRSERQWGDLTAEEWVSYPLQPVTDLLVHKEVHTGIRYHICSHCGKAFSQI 140 150 160 170 180 190 150 160 170 180 190 200 KIAA20 SDGG--AISHRGKTHYNCGEHTKAFSGKHTLVQQQRTLTTERCYICSECGKSFSKSYSLN :: . .: : :.: : :.:: . :.:.::: : :: : :.::::::..: : KIAA17 SDLNRHQKTHTGDRPYKCYECGKGFSRSSHLIQHQRTHTGERPYDCNECGKSFGRSSHLI 200 210 220 230 240 250 210 220 230 240 250 260 KIAA20 DHWRLHTGEKPYECRECGKSFRQSSSLIQHRRVHTAVRPHECDECGKLFSNKSNLIKHRR .: .::::::..: :::::: . : ::::.:.:.. .:.::.:::: :: .:.: .:.: KIAA17 QHQTIHTGEKPHKCNECGKSFCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSHLAQHQR 260 270 280 290 300 310 270 280 290 300 310 320 KIAA20 VHTGERPYECSECGKSFSQRSALLQHRGVHTGERPYECSECGKFFTYHSSLIKHQKVHSG .::::.::::.:::..::.:: :..: ::::::::.:.:::: :. .:.:..:...:.: KIAA17 THTGEKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTG 320 330 340 350 360 370 330 340 350 360 370 380 KIAA20 SRPYECSECGKSFSQNSSLIEHHRVHTGERPYKCSECGKSFSQRSALLQHRGVHTGERPY .::.:.:::..::. : :..:.:.::::.::.:. ::::::. : :. :. .::::.:: KIAA17 EKPYHCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHTGEKPY 380 390 400 410 420 430 390 400 410 420 430 440 KIAA20 ECSECGKFFPYSSSLRKHQRVHTGSRPYECSECGKSFTQNSGLIKHRRVHTGEKPYECTE ::.:: . : :.: ::::.::: .:::: .:::.:::.:.:: :.::::::::::::: KIAA17 ECNECWRSFGERSDLIKHQRTHTGEKPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYECTE 440 450 460 470 480 490 450 460 KIAA20 CGKSFSHNSSLIKHQRIHSR : ::::..:.::::.:.:. KIAA17 CEKSFSRSSALIKHKRVHTD 500 510 >>KIAA1956 ( 680 res) fk08713 (680 aa) initn: 1466 init1: 1466 opt: 1477 Z-score: 1255.5 bits: 242.1 E(): 8.1e-65 Smith-Waterman score: 1749; 53.137% identity (70.392% similar) in 510 aa overlap (31-459:1-509) 10 20 30 40 50 KIAA20 GPLSPGPYQCRPSLPAQLYPQSLMAAATLRTPT--QGTVTFEDVAVHFSWEEWGLLDEAQ ::. ::::.::::::.:: :::.::.:.: KIAA19 TPAIMQGTVAFEDVAVNFSQEEWSLLSEVQ 10 20 30 60 70 KIAA20 RCLYRDVMLENLALLTSL------------------------------------------ ::::.:::::: .:..:: KIAA19 RCLYHDVMLENWVLISSLGCWCGSEDEEAPSKKSISIQRVSQVSTPGAGVSPKKAHSCEM 40 50 60 70 80 90 80 90 KIAA20 ------DV----------HRQK---------------------QHLGEKHFRSNVGRALF :. :.:: :.:::: .::.: .::: KIAA19 CGAILGDILHLADHQGTHHKQKLHRCEAWGNKLYDSSNRPHQNQYLGEKPYRSSVEEALF 100 110 120 130 140 150 100 110 120 130 140 150 KIAA20 VKTCTFHVSGEPSTCREVGKDFLAKLGFLHQQAAHTGEQSNSKSDGGAISHRGKTHYNCG :: : :::: : : . ::::: . :.: :.:.::::.:::: . . . : :::.:: KIAA19 VKRCKFHVSEESSIFIQSGKDFLPSSGLLLQEATHTGEKSNSKPECESPFQWGDTHYSCG 160 170 180 190 200 210 160 170 180 190 200 210 KIAA20 EHTKAFSGKHTLVQQQRTLTTERCYICSECGKSFSKSYSLNDHWRLHTGEKPYECRECGK : : : ::..::::: . :.:: : :::::::: :...: :.:::..:::: :::: KIAA19 ECMKHSSTKHVFVQQQRLPSREECY-CWECGKSFSKYDSVSNHQRVHTGKRPYECGECGK 220 230 240 250 260 220 230 240 250 260 270 KIAA20 SFRQSSSLIQHRRVHTAVRPHECDECGKLFSNKSNLIKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQ :: ...::.::.::::. ::.:: :::: ::.:..:..:.:::::::::::.:::::::: KIAA19 SFSHKGSLVQHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGERPYECGECGKSFSQ 270 280 290 300 310 320 280 290 300 310 320 330 KIAA20 RSALLQHRGVHTGERPYECSECGKFFTYHSSLIKHQKVHSGSRPYECSECGKSFSQNSSL ..:..:. :::::::::: :::: :: ...::.::. :.. ::::: :::: :::...: KIAA19 NGTLIKHQRVHTGERPYECEECGKCFTQKGNLIQHQRGHTSERPYECEECGKCFSQKGTL 330 340 350 360 370 380 340 350 360 370 380 390 KIAA20 IEHHRVHTGERPYKCSECGKSFSQRSALLQHRGVHTGERPYECSECGKFFPYSSSLRKHQ ::::::: ::::.:.:::::::... : .:. :::::::::.:::: : ...: .:: KIAA19 TEHHRVHTRERPYECGECGKSFSRKGHLRNHQRGHTGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQ 390 400 410 420 430 440 400 410 420 430 440 450 KIAA20 RVHTGSRPYECSECGKSFTQNSGLIKHRRVHTGEKPYECTECGKSFSHNSSLIKHQRIHS : ::: ::::: :: : : .: ::.:.::::::.::::.::::::. .:.. :::.:. KIAA19 RSHTGERPYECRECRKLFRGKSHLIEHQRVHTGERPYECNECGKSFQDSSGFRVHQRVHT 450 460 470 480 490 500 460 KIAA20 R KIAA19 GEKPFECSECGKSFPQSCSLLRHRRVHTGERPYECGECGKSFHQSSSLLRHQKTHTAERP 510 520 530 540 550 560 >>KIAA1947 ( 608 res) fh23660 (608 aa) initn: 7896 init1: 1378 opt: 1473 Z-score: 1252.5 bits: 241.4 E(): 1.2e-64 Smith-Waterman score: 1473; 52.344% identity (74.219% similar) in 384 aa overlap (76-459:59-439) 50 60 70 80 90 100 KIAA20 FSWEEWGLLDEAQRCLYRDVMLENLALLTSLDVHRQKQHLGEKHFRSNVGRALFVKTCTF : .: ::.:: :: ::. :: ::. . KIAA19 AQPCETCSSLLKDILHLAEHDGTHPKRTAKLYLH-QKEHLREKLTRSDEGRPSFVND-SV 30 40 50 60 70 80 110 120 130 140 150 160 KIAA20 HVSGEPSTCREVGKDFLAKLGFLHQQAAHTGEQSNSKSDGGAISHRGKTHYNCGEHTKAF :.. . :: . :::: . :.::: :.: . . . : . :...:.: . : : KIAA19 HLAKRNLTCMQGGKDFTGDSD-LQQQALHSGWKPHRDTHGVEAFQSGQNNYSCTQCGKDF 90 100 110 120 130 140 170 180 190 200 210 220 KIAA20 SGKHTLVQQQRTLTTERCYICSECGKSFSKSYSLNDHWRLHTGEKPYECRECGKSFRQSS .::: ..:. : :: : :::::: : . .: : : ::::.::.: ::::.: . KIAA19 CHQHTLFEHQKIHTEERPYECSECGKLFRYNSDLIKHQRNHTGERPYKCSECGKAFSLKY 150 160 170 180 190 200 230 240 250 260 270 280 KIAA20 SLIQHRRVHTAVRPHECDECGKLFSNKSNLIKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQRSALLQ ...::...::. ::.::.:::: : ::.:..:.:.:: ::: ::::::.: .. :. KIAA19 NVVQHQKIHTGERPYECSECGKAFLRKSHLLQHQRIHTRPRPYVCSECGKAFLTQAHLVG 210 220 230 240 250 260 290 300 310 320 330 340 KIAA20 HRGVHTGERPYECSECGKFFTYHSSLIKHQKVHSGSRPYECSECGKSFSQNSSLIEHHRV :. .::::::: :.::::.: : :.::.:::::.: ::. : :::: : .. .:: :.:: KIAA19 HQKIHTGERPYGCNECGKYFMYSSALIRHQKVHTGERPFYCCECGKFFMDSCTLIIHQRV 270 280 290 300 310 320 350 360 370 380 390 400 KIAA20 HTGERPYKCSECGKSFSQRSALLQHRGVHTGERPYECSECGKFFPYSSSLRKHQRVHTGS ::::.::.:.:::: : ::.:..:. :::::.::::::::::: .:.: ::::::: KIAA19 HTGEKPYECNECGKFFRYRSTLIRHQKVHTGEKPYECSECGKFFMDTSTLIIHQRVHTGE 330 340 350 360 370 380 410 420 430 440 450 460 KIAA20 RPYECSECGKSFTQNSGLIKHRRVHTGEKPYECTECGKSFSHNSSLIKHQRIHSR .::::..::: : : .:.:::.::.::::.:::: : . .: .:::.:. KIAA19 KPYECNKCGKFFRYCFTLNRHQRVHSGERPYECSECGKFFVDSCTLKSHQRVHTGERPFE 390 400 410 420 430 440 KIAA19 CSICGKSFRCRSTLDTHQRIHTGERPYECSECGKFFRHNSNHIRHRRNHFGERSFECTEC 450 460 470 480 490 500 >>KIAA1508 ( 573 res) hk06576 (573 aa) initn: 6650 init1: 1371 opt: 1412 Z-score: 1201.3 bits: 231.9 E(): 8.5e-62 Smith-Waterman score: 1513; 54.922% identity (77.202% similar) in 386 aa overlap (75-459:104-488) 50 60 70 80 90 100 KIAA20 HFSWEEWGLLDEAQRCLYRDVMLENLALLTSLDVHR-QKQHLGEKHFRSNVGRALFVKTC : ..:. :: ::: :. . .: :. .: KIAA15 LRDILQMIELQASPCGQKLYLGGASRDFWMSSNLHQLQKLDNGEKLFKVDGDQASFMMNC 80 90 100 110 120 130 110 120 130 140 150 160 KIAA20 TFHVSGEPSTCREVGKDFLAKLGFLHQQAAHTGEQSNSKSDGGAISHRGKTHYNCGEHTK :::::.: : :::.:: : :.:..:.. : :. .:. . :. . : : KIAA15 RFHVSGKPFTFGEVGRDFSATSGLLQHQVTPTIERPHSRIRHLRVP-TGRKPLKYTESRK 140 150 160 170 180 190 170 180 190 200 210 220 KIAA20 AFSGKHTLVQQQRTLTTERCYICSECGKSFSKSYSLNDHWRLHTGEKPYECRECGKSFRQ .: : ...:.::. . :: : :::::::::.: .. : . : . .:: :::::: . KIAA15 SFREKSVFIQHQRADSGERPYKCSECGKSFSQSSGFLRHRKAHGRTRTHECSECGKSFSR 200 210 220 230 240 250 230 240 250 260 270 280 KIAA20 SSSLIQHRRVHTAVRPHECDECGKLFSNKSNLIKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQRSAL .. : ::.::::. ::..:.:::: : . : ::.:.:::::::::::::::::::. . : KIAA15 KTHLTQHQRVHTGERPYDCSECGKSFRQVSVLIQHQRVHTGERPYECSECGKSFSHSTNL 260 270 280 290 300 310 290 300 310 320 330 340 KIAA20 LQHRGVHTGERPYECSECGKFFTYHSSLIKHQKVHSGSRPYECSECGKSFSQNSSLIEHH .::..::. :::::::::: :.. ..:..: .::.: ::::::::::.:: : ::.:. KIAA15 YRHRSAHTSTRPYECSECGKSFSHSTNLFRHWRVHTGVRPYECSECGKAFSCNIYLIHHQ 320 330 340 350 360 370 350 360 370 380 390 400 KIAA20 RVHTGERPYKCSECGKSFSQRSALLQHRGVHTGERPYECSECGKFFPYSSSLRKHQRVHT : ::::::: ::::::::.:.:.:.::. ::::::::::::::: : ::.: .:.:.:: KIAA15 RFHTGERPYVCSECGKSFGQKSVLIQHQRVHTGERPYECSECGKVFSQSSGLFRHRRAHT 380 390 400 410 420 430 410 420 430 440 450 460 KIAA20 GSRPYECSECGKSFTQNSGLIKHRRVHTGEKPYECTECGKSFSHNSSLIKHQRIHSR ..::::::: :::. .. ::.:. :::::.::::. ::::: ... ::.:: .:. KIAA15 KTKPYECSECEKSFSCKTDLIRHQTVHTGERPYECSVCGKSFIRKTHLIRHQTVHTNERP 440 450 460 470 480 490 KIAA15 YECDECGKSYSQSSALLQHRRVHTGERPYECRECGKSFTRKNHLIQHKTVHTGERPYECS 500 510 520 530 540 550 >>KIAA0326 ( 927 res) hg00579 (927 aa) initn: 6330 init1: 1312 opt: 1350 Z-score: 1147.6 bits: 222.6 E(): 8.3e-59 Smith-Waterman score: 1405; 52.909% identity (75.623% similar) in 361 aa overlap (110-458:206-566) 80 90 100 110 120 130 KIAA20 RQKQHLGEKHFRSNVGRALFVKTCTFHVSGEPSTCREVGKDFLAKLGFLHQQAAHTGEQS .: : : ::.: .:..: ::::. KIAA03 ALTTWNSPPVVPANEPSLRELVQGRPAGAEKPYICNECGKSFSQWSKLLRHQRIHTGERP 180 190 200 210 220 230 140 150 160 170 180 KIAA20 NSKSDGGAI------------SHRGKTHYNCGEHTKAFSGKHTLVQQQRTLTTERCYICS :. :. : .: :. :.: . : :: . .:::.::: : :. : :. KIAA03 NTCSECGKSFTQSSHLVQHQRTHTGEKPYKCPDCGKCFSWSSNLVQHQRTHTGEKPYKCT 240 250 260 270 280 290 190 200 210 220 230 240 KIAA20 ECGKSFSKSYSLNDHWRLHTGEKPYECRECGKSFRQSSSLIQHRRVHTAVRPHECDECGK :: :.:..: .: : : :::::::.: :: ..: .::.::::. .::. .:..: :::: KIAA03 ECEKAFTQSTNLIKHQRSHTGEKPYKCGECRRAFYRSSDLIQHQATHTGEKPYKCPECGK 300 310 320 330 340 350 250 260 270 280 290 300 KIAA20 LFSNKSNLIKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQRSALLQHRGVHTGERPYECSECGKFFTY :... ::.::...:.::.::.:.:::::: : : : ::. .::::.:::: :::: : . KIAA03 RFGQNHNLLKHQKIHAGEKPYRCTECGKSFIQSSELTQHQRTHTGEKPYECLECGKSFGH 360 370 380 390 400 410 310 320 330 340 350 360 KIAA20 HSSLIKHQKVHSGSRPYECSECGKSFSQNSSLIEHHRVHTGERPYKCSECGKSFSQRSAL :.:::::..: :..: :::.:. ...:..:.:.::::::::: ::::::: : : KIAA03 SSTLIKHQRTHLREDPFKCPVCGKTFTLSATLLRHQRTHTGERPYKCPECGKSFSVSSNL 420 430 440 450 460 470 370 380 390 400 410 420 KIAA20 LQHRGVHTGERPYECSECGKFFPYSSSLRKHQRVHTGSRPYECSECGKSFTQNSGLIKHR ..:. .: ::::: :..::: : .::.: .:::.::: .::.::.::::: ..: ::.:: KIAA03 INHQRIHRGERPYICADCGKSFIMSSTLIRHQRIHTGEKPYKCSDCGKSFIRSSHLIQHR 480 490 500 510 520 530 430 440 450 460 KIAA20 RVHTGEKPYECTECGKSFSHNSSLIKHQRIHSR :.:::::::.: :::::::..:.:: : : : KIAA03 RTHTGEKPYKCPECGKSFSQSSNLITHVRTHMDENLFVCSDCGKAFLEAHELEQHRVIHE 540 550 560 570 580 590 KIAA03 RGKTPARRAQGDSLLGLGDPSLLTPPPGAKPHKCLVCGKGFNDEGIFMQHQRIHIGENPY 600 610 620 630 640 650 >>KIAA1611 ( 813 res) fj12627 (813 aa) initn: 6316 init1: 1345 opt: 1345 Z-score: 1143.8 bits: 221.7 E(): 1.4e-58 Smith-Waterman score: 1408; 47.891% identity (72.953% similar) in 403 aa overlap (75-459:237-639) 50 60 70 80 90 100 KIAA20 HFSWEEWGLLDEAQRCLYRDVMLENLALLTSLDVHRQKQHLGEKHFRSN-VGRALFVKTC :: ..:.: . : .. : :.:. .. KIAA16 NNGSSVSPLQQIPSSVQTHRSKKYHELNHFSLLTQRRKANSCGKPYKCNECGKAFTQNSN 210 220 230 240 250 260 110 120 130 140 150 KIAA20 -TFHV---SGE-PSTCREVGKDFLAKLGFLHQQAAHTGEQSNSKSDGGAI--------SH : : ::: : : : :: : .. .. .:. ::::. . . : . .: KIAA16 LTSHRRIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNLTIHQVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATH 270 280 290 300 310 320 160 170 180 190 200 KIAA20 R----GKTHYNCGEHTKAFSGKHTLVQQQRTLTTERCYICSECGKSFSKSYSLNDHWRLH : :. :.:.: ::: :. .:. .: : :. . :.:::: :... : .:::.: KIAA16 RRIHTGEKPYKCNECGKAFRGHSNLTTHQLIHTGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIH 330 340 350 360 370 380 210 220 230 240 250 260 KIAA20 TGEKPYECRECGKSFRQSSSLIQHRRVHTAVRPHECDECGKLFSNKSNLIKHRRVHTGER ::::::.: ::::.: ::: :. .::. .:..:.::::.: .: : .::::::::. KIAA16 TGEKPYKCNECGKAFSVRSSLAIHQTIHTGEKPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEK 390 400 410 420 430 440 270 280 290 300 310 320 KIAA20 PYECSECGKSFSQRSALLQHRGVHTGERPYECSECGKFFTYHSSLIKHQKVHSGSRPYEC ::.:.::::.::..: : :. .::: .:..:.::.: :: .:.: .:...:.: .::.: KIAA16 PYKCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKPFKCNECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKC 450 460 470 480 490 500 330 340 350 360 370 380 KIAA20 SECGKSFSQNSSLIEHHRVHTGERPYKCSECGKSFSQRSALLQHRGVHTGERPYECSECG .::::.:: ::: :. .:.::.:::: ::::::.:.: : .:::.:.::.::.:.::: KIAA16 NECGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCIECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECG 510 520 530 540 550 560 390 400 410 420 430 440 KIAA20 KFFPYSSSLRKHQRVHTGSRPYECSECGKSFTQNSGLIKHRRVHTGEKPYECTECGKSFS : : .:.: .: ::::: .::.:..::..:.. :.: :. .:::::::.: :::: : KIAA16 KVFAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFR 570 580 590 600 610 620 450 460 KIAA20 HNSSLIKHQRIHSR ::: : :.:::. KIAA16 HNSYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSH 630 640 650 660 670 680 >>KIAA0628 ( 540 res) hh01433 (540 aa) initn: 2563 init1: 1333 opt: 1333 Z-score: 1135.0 bits: 219.5 E(): 4.2e-58 Smith-Waterman score: 1333; 54.808% identity (81.090% similar) in 312 aa overlap (148-459:147-458) 120 130 140 150 160 170 KIAA20 GKDFLAKLGFLHQQAAHTGEQSNSKSDGGAISHRGKTHYNCGEHTKAFSGKHTLVQQQRT ::: :. :.: . :.:. . :...:: KIAA06 LQRELIEGEANPCDICGKTFTFNSDLVRHRISHAGEKPYTCDQCGKGFGQSSHLMEHQRI 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 KIAA20 LTTERCYICSECGKSFSKSYSLNDHWRLHTGEKPYECRECGKSFRQSSSLIQHRRVHTAV : :: :.:. :::.: . .: .: :.:.::::..: .:::.: .::.::.:.:::: KIAA06 HTGERLYVCNVCGKDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFKCAQCGKAFCHSSDLIRHQRVHTRE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 KIAA20 RPHECDECGKLFSNKSNLIKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQRSALLQHRGVHTGERPYE :: :: :::: ::..: ::.:.:.:::::::::.:::::: . :.:..: .:: . :: KIAA06 RPFECKECGKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNECGKSFIRSSSLIRHYQIHTEVKQYE 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 KIAA20 CSECGKFFTYHSSLIKHQKVHSGSRPYECSECGKSFSQNSSLIEHHRVHTGERPYKCSEC :.:::: : ..:.::.::..:.: ::.::.::::.: ..:.::.:.:.::::::: :.:: KIAA06 CKECGKAFRHRSDLIEHQRIHTGERPFECNECGKAFIRSSKLIQHQRIHTGERPYVCNEC 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 KIAA20 GKSFSQRSALLQHRGVHTGERPYECSECGKFFPYSSSLRKHQRVHTGSRPYECSECGKSF :: ::: : . ::. .::::. :::.:::: : :: : .::..::: : :::.::::.: KIAA06 GKRFSQTSNFTQHQRIHTGEKLYECNECGKAFFLSSYLIRHQKIHTGERVYECKECGKAF 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 KIAA20 TQNSGLIKHRRVHTGEKPYECTECGKSFSHNSSLIKHQRIHSR :.. : .:...:.:..:.:: .:::.: ..:.:. :: ::. KIAA06 LQKAHLTEHQKIHSGDRPFECKDCGKAFIQSSKLLLHQIIHTGEKPYVCSYCGKGFIQRS 420 430 440 450 460 470 KIAA06 NFLQHQKIHTEEKLYECSQYGRDFNSTTNVKNNQRVHQEGLSLSKAPIHLGERSVDKGEH 480 490 500 510 520 530 >>KIAA1396 ( 551 res) hj08221 (551 aa) initn: 5183 init1: 1157 opt: 1326 Z-score: 1129.0 bits: 218.4 E(): 9.1e-58 Smith-Waterman score: 1394; 48.267% identity (72.525% similar) in 404 aa overlap (75-459:116-519) 50 60 70 80 90 100 KIAA20 HFSWEEWGLLDEAQRCLYRDVMLENLALLTSLDVHRQKQHLGEKHFRSNVGRALFVKTCT :. ....: ..:.: :. : :... . KIAA13 YTKFGKCIHLENIEESIYNHTSDKKSFSKNSIVIKHKKVYVGKKLFKCNECDKTFTHSSS 90 100 110 120 130 140 110 120 130 140 150 KIAA20 FHV-----SGE-PSTCREVGKDFLAKLGFLHQQAAHTGEQ--------SNSKSDGGAISH . : .:: : .:.: :: : . . ... .::::. . :.. :.: KIAA13 LTVHFRIHTGEKPYACEECGKAFKQRQHLAQHHRTHTGEKLFECKECRKAFKQSEHLIQH 150 160 170 180 190 200 160 170 180 190 200 KIAA20 R----GKTHYNCGEHTKAFSGKHTLVQQQRTLTTERCYICSECGKSFSKSYSLNDHWRLH . :. :.: : ::: :.:.:: : :. : :.::::.:: . :. : : : KIAA13 QRIHTGEKPYKCKECRKAFRQPAHLAQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSDGSSFARHQRCH 210 220 230 240 250 260 210 220 230 240 250 260 KIAA20 TGEKPYECRECGKSFRQSSSLIQH-RRVHTAVRPHECDECGKLFSNKSNLIKHRRVHTGE ::..:::: ::::.:: ..:.:.: : ::. .: .: .::: :: . .:: :::.:::: KIAA13 TGKRPYECIECGKAFRYNTSFIRHWRSYHTGEKPFNCIDCGKAFSVHIGLILHRRIHTGE 270 280 290 300 310 320 270 280 290 300 310 320 KIAA20 RPYECSECGKSFSQRSALLQHRGVHTGERPYECSECGKFFTYHSSLIKHQKVHSGSRPYE .::.:. :::.::. :. :. .::::.::::. ::: :..:.:: .::.:::: .::: KIAA13 KPYKCDVCGKTFSSGSSRTVHQRIHTGEKPYECDICGKDFSHHASLTQHQRVHSGEKPYE 330 340 350 360 370 380 330 340 350 360 370 380 KIAA20 CSECGKSFSQNSSLIEHHRVHTGERPYKCSECGKSFSQRSALLQHRGVHTGERPYECSEC :.::::.: :: :. : :.::::.::.:.::::.: : : :. .::::.:::: :: KIAA13 CKECGKAFRQNVHLVSHLRIHTGEKPYECKECGKAFRISSQLATHQRIHTGEKPYECIEC 390 400 410 420 430 440 390 400 410 420 430 440 KIAA20 GKFFPYSSSLRKHQRVHTGSRPYECSECGKSFTQNSGLIKHRRVHTGEKPYECTECGKSF :. : : : .::..::: .::::.::::.:.:. .: .:.:.:::::::.::::::.: KIAA13 GNAFKQRSHLAQHQKTHTGEKPYECNECGKAFSQTCNLTQHQRIHTGEKPYKCTECGKAF 450 460 470 480 490 500 450 460 KIAA20 SHNSSLIKHQRIHSR : .:: .:::.:. KIAA13 SDSSSCAQHQRLHTGQRPYQCFECGKAFRRKLSLICHQRSHTGEEP 510 520 530 540 550 >>KIAA1829 ( 557 res) hj00069 (557 aa) initn: 6650 init1: 1293 opt: 1325 Z-score: 1128.1 bits: 218.3 E(): 1e-57 Smith-Waterman score: 1331; 48.901% identity (72.802% similar) in 364 aa overlap (97-460:207-554) 70 80 90 100 110 120 KIAA20 LENLALLTSLDVHRQKQHLGEKHFRSNVGRALFVKTCTFHVSGEPSTCREVGKDFLAKLG .::.. : : . : : : : KIAA18 QSTYLSKDIGIPPGEKPYESHDFSKLLSFHSLFTQHQTTHFGKLPHGYDECGDAFSCYSF 180 190 200 210 220 230 130 140 150 160 170 180 KIAA20 FLHQQAAHTGEQSNSKSDGGAISHRGKTHYNCGEHTKAFSGKHTLVQQQRTLTTERCYIC : . : :.::. : :.. :::: : ..::: :. : : KIAA18 FTQPQRIHSGEKP----------------YACNDCGKAFSHDFFLSEHQRTHIGEKPYEC 240 250 260 270 280 190 200 210 220 230 240 KIAA20 SECGKSFSKSYSLNDHWRLHTGEKPYECRECGKSFRQSSSLIQHRRVHTAVRPHECDECG .::.:.: .: : .: :.::::::. : ::::.: . . :..:.:.::. .:.:: ::. KIAA18 KECNKAFRQSAHLAQHQRIHTGEKPFACNECGKAFSRYAFLVEHQRIHTGEKPYECKECN 290 300 310 320 330 340 250 260 270 280 290 300 KIAA20 KLFSNKSNLIKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQRSALLQHRGVHTGERPYECSECGKFFT : : ....: .:.:.::::.::::..:::.::.: :: :. .::::.:..:::::: : KIAA18 KAFRQSAHLNQHQRIHTGEKPYECNQCGKAFSRRIALTLHQRIHTGEKPFKCSECGKTFG 350 360 370 380 390 400 310 320 330 340 350 360 KIAA20 YHSSLIKHQKVHSGSRPYECSECGKSFSQNSSLIEHHRVHTGERPYKCSECGKSFSQRSA :.: : .::..:.: .:::: .::: : .:.: .:::.::::::..::.:::.::. . KIAA18 YRSHLNQHQRIHTGEKPYECIKCGKFFRTDSQLNRHHRIHTGERPFECSKCGKAFSDALV 410 420 430 440 450 460 370 380 390 400 410 420 KIAA20 LLQHRGVHTGERPYECSECGKFFPYSSSLRKHQRVHTGSRPYECSECGKSFTQNSGLIKH :..:. :.::.::::..::: : .: : .:::.::: .:::::::::.: : .: : KIAA18 LIHHKRSHAGEKPYECNKCGKAFSCGSYLNQHQRIHTGEKPYECSECGKAFHQILSLRLH 470 480 490 500 510 520 430 440 450 460 KIAA20 RRVHTGEKPYECTECGKSFSHNSSLIKHQRIHSR .:.:.:::::.:.:::..:: :.: .:::::.: KIAA18 QRIHAGEKPYKCNECGNNFSCVSALRRHQRIHNRETL 530 540 550 >>KIAA1431 ( 891 res) fj00022 (891 aa) initn: 1267 init1: 1267 opt: 1324 Z-score: 1125.9 bits: 218.5 E(): 1.4e-57 Smith-Waterman score: 1376; 46.875% identity (70.913% similar) in 416 aa overlap (51-459:405-803) 30 40 50 60 70 80 KIAA20 QSLMAAATLRTPTQGTVTFEDVAVHFSWEEWGLLDEAQRCLYRDVMLENLALLTSLDVHR :. ::.... .. ..:. .:. ... KIAA14 GQETQFRQEPITHNKTLSKERERTYNKSGRWSYLDDSEEKVHNRDSIKNFQK-SSVVIKQ 380 390 400 410 420 430 90 100 110 120 130 KIAA20 QKQHLGEKHFRSNVGRALFVKTCTFHV-----SGE-PSTCREVGKDFLAKLGFLHQQAAH . :.: :. : . :... .. : .:: : : : :: : .: ..: : KIAA14 TGIYAGKKLFKCNECKKTFTQSSSLTVHQRIHTGEKPYKCNECGKAFSDGSSFARHQRCH 440 450 460 470 480 490 140 150 160 170 180 190 KIAA20 TGEQSNSKSDGGAISHRGKTHYNCGEHTKAFSGKHTLVQQQRTLTT-ERCYICSECGKSF :: : :.: : ::: . .:... : : :. . : .:::.: KIAA14 TG----------------KKPYECIECGKAFIQNTSLIRHWRYYHTGEKPFDCIDCGKAF 500 510 520 530 200 210 220 230 240 250 KIAA20 SKSYSLNDHWRLHTGEKPYECRECGKSFRQSSSLIQHRRVHTAVRPHECDECGKLFSNKS : .::.: :.:::::::.: : :::: .::: :.:.::. .:.::: : : ::... KIAA14 SDHIGLNQHRRIHTGEKPYKCDVCHKSFRYGSSLTVHQRIHTGEKPYECDVCRKAFSHHA 540 550 560 570 580 590 260 270 280 290 300 310 KIAA20 NLIKHRRVHTGERPYECSECGKSFSQRSALLQHRGVHTGERPYECSECGKFFTYHSSLIK .: .:.:::.::.:..:.::::.: : : .: .::::.:.::.:::: :. :.: KIAA14 SLTQHQRVHSGEKPFKCKECGKAFRQNIHLASHLRIHTGEKPFECAECGKSFSISSQLAT 600 610 620 630 640 650 320 330 340 350 360 370 KIAA20 HQKVHSGSRPYECSECGKSFSQNSSLIEHHRVHTGERPYKCSECGKSFSQRSALLQHRGV ::..:.: .::::. :.:.:.:.. : .:...::::.::.:.::::.::: . :.::. : KIAA14 HQRIHTGEKPYECKVCSKAFTQKAHLAQHQKTHTGEKPYECKECGKAFSQTTHLIQHQRV 660 670 680 690 700 710 380 390 400 410 420 430 KIAA20 HTGERPYECSECGKFFPYSSSLRKHQRVHTGSRPYECSECGKSFTQNSGLIKHRRVHTGE ::::.::.: :::: : .:: .:::.:::.::::: ::::.: .:.:: ::: :::: KIAA14 HTGEKPYKCMECGKAFGDNSSCTQHQRLHTGQRPYECIECGKAFKTKSSLICHRRSHTGE 720 730 740 750 760 770 440 450 460 KIAA20 KPYECTECGKSFSHNSSLIKHQRIHSR :::::. :::.::: .:: :::::: KIAA14 KPYECSVCGKAFSHRQSLSVHQRIHSGKKPYECKECRKTFIQIGHLNQHKRVHTGERSYN 780 790 800 810 820 830 460 residues in 1 query sequences 1987045 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:25:11 2008 done: Thu Dec 18 15:25:11 2008 Total Scan time: 0.420 Total Display time: 0.130 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]