# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/bf00346mrp1.fasta.nr -Q ../query/KIAA1999.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1999, 1275 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7825855 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3085+/-0.000186; mu= 13.6571+/- 0.010 mean_var=77.1871+/-14.813, 0's: 35 Z-trim: 42 B-trim: 50 in 1/66 Lambda= 0.145983 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|74710068|sp|Q6R327.1|RICTR_HUMAN RecName: Full= (1708) 8414 1782.8 0 gi|73954299|ref|XP_536496.2| PREDICTED: similar to (1790) 8299 1758.5 0 gi|221136891|ref|NP_001137568.1| rapamycin insensi (1708) 8257 1749.7 0 gi|109464459|ref|XP_226812.4| PREDICTED: similar t (1680) 8155 1728.2 0 gi|194223939|ref|XP_001917002.1| PREDICTED: simila (1670) 8124 1721.7 0 gi|81892765|sp|Q6QI06.1|RICTR_MOUSE RecName: Full= (1708) 8028 1701.5 0 gi|111307629|gb|AAI20904.1| 4921505C17Rik protein (1556) 8025 1700.8 0 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B (1622) 1967 424.9 1.9e-115 gi|156212649|gb|EDO33699.1| predicted protein [Nem ( 921) 1741 377.2 2.7e-101 gi|115650794|ref|XP_796625.2| PREDICTED: similar t (1956) 1703 369.4 1.2e-98 gi|149016487|gb|EDL75705.1| rCG50949 [Rattus norve ( 389) 1567 340.2 1.5e-90 gi|190583342|gb|EDV23413.1| hypothetical protein T (1496) 1454 316.9 6.1e-83 gi|35192918|gb|AAH58643.1| 4921505C17Rik protein [ ( 219) 1401 305.1 3.2e-80 gi|215496545|gb|EEC06185.1| Rapamycin-insensitive ( 987) 1242 272.1 1.2e-69 gi|91090772|ref|XP_969499.1| PREDICTED: similar to (1495) 1137 250.1 7.7e-63 gi|198428287|ref|XP_002121750.1| PREDICTED: simila (1623) 1049 231.6 3.1e-57 gi|212506111|gb|EEB10416.1| conserved hypothetical (1475) 1048 231.4 3.3e-57 gi|164649552|gb|EDR13794.1| predicted protein [Lac (1298) 985 218.0 3e-53 gi|116503189|gb|EAU86084.1| hypothetical protein C (1246) 973 215.5 1.7e-52 gi|1175418|sp|Q09743.1|STE16_SCHPO RecName: Full=P (1309) 935 207.5 4.4e-50 gi|22832550|gb|AAF48942.2| rapamycin-insensitive c (1936) 916 203.6 9.6e-49 gi|33589262|gb|AAQ22398.1| SD16537p [Drosophila me (1936) 916 203.6 9.6e-49 gi|190614546|gb|EDV30070.1| GF15953 [Drosophila an (1948) 913 203.0 1.5e-48 gi|190649408|gb|EDV46686.1| GG18066 [Drosophila er (1955) 902 200.7 7.5e-48 >>gi|74710068|sp|Q6R327.1|RICTR_HUMAN RecName: Full=Rapa (1708 aa) initn: 8414 init1: 8414 opt: 8414 Z-score: 9566.5 bits: 1782.8 E(): 0 Smith-Waterman score: 8414; 100.000% identity (100.000% similar) in 1275 aa overlap (1-1275:434-1708) 10 20 30 KIAA19 ANTILPHSHSHHLHCLPTLMNMAASFDIPK :::::::::::::::::::::::::::::: gi|747 LLEGLVEVITNSDDHISVRATILLGELLHMANTILPHSHSHHLHCLPTLMNMAASFDIPK 410 420 430 440 450 460 40 50 60 70 80 90 KIAA19 EKRLRASAALNCLKRFHEMKKRGPKPYSLHLDHIIQKAIATHQKRDQYLRVQKDIFILKD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|747 EKRLRASAALNCLKRFHEMKKRGPKPYSLHLDHIIQKAIATHQKRDQYLRVQKDIFILKD 470 480 490 500 510 520 100 110 120 130 140 150 KIAA19 TEEALLINLRDSQVLQHKENLEWNWNLIGTILKWPNVNLRNYKDEQLHRFVRRLLYFYKP 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(1790 aa) initn: 8299 init1: 8299 opt: 8299 Z-score: 9435.3 bits: 1758.5 E(): 0 Smith-Waterman score: 8299; 98.039% identity (99.922% similar) in 1275 aa overlap (1-1275:516-1790) 10 20 30 KIAA19 ANTILPHSHSHHLHCLPTLMNMAASFDIPK :::::::::::::::::::::::::::::: gi|739 LLEGLVEVITNSDDHISVRATILLGELLHMANTILPHSHSHHLHCLPTLMNMAASFDIPK 490 500 510 520 530 540 40 50 60 70 80 90 KIAA19 EKRLRASAALNCLKRFHEMKKRGPKPYSLHLDHIIQKAIATHQKRDQYLRVQKDIFILKD ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::: gi|739 EKRLRASAALNCLKRFHEMKKRGPKPYSLHLDHIIQKAIATHQKRDQYLRVQKDIFVLKD 550 560 570 580 590 600 100 110 120 130 140 150 KIAA19 TEEALLINLRDSQVLQHKENLEWNWNLIGTILKWPNVNLRNYKDEQLHRFVRRLLYFYKP ::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|739 TEEALLMNLRDSQVLQHKENLEWNWNLIGTILKWPNVNLRNYKDEQLHRFVRRLLYFYKP 610 620 630 640 650 660 160 170 180 190 200 210 KIAA19 SSKLYANLDLDFAKAKQLTVVGCQFTEFLLESEEDGQGYLEDLVKDIVQWLNASSGMKPE ::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|739 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