# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/bh00088.fasta.huge -Q ../query/KIAA1995.ptfa ./tmplib.25089 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1995, 1011 aa vs ./tmplib.25089 library 1986494 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9318+/-0.0063; mu= 13.6551+/- 0.429 mean_var=147.0261+/-34.652, 0's: 0 Z-trim: 54 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.105774 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1901 ( 1265 res) hh03635 (1265) 754 127.6 9.9e-30 KIAA0623 ( 1100 res) hg04615 (1100) 457 82.2 4e-16 KIAA1142 ( 467 res) hh05864 ( 467) 449 80.6 5.4e-16 KIAA0722 ( 1066 res) hk02030s1 (1066) 451 81.3 7.4e-16 KIAA1264 ( 753 res) hj01058 ( 753) 439 79.3 2.1e-15 KIAA0204 ( 1164 res) ha02801 (1164) 436 79.1 3.8e-15 KIAA0551 ( 1385 res) hh00867s1 (1385) 435 79.0 4.7e-15 KIAA1278 ( 1311 res) hg03689(revised) (1311) 428 77.9 9.6e-15 KIAA0213 ( 1626 res) ha04841s1 (1626) 421 76.9 2.3e-14 KIAA0881 ( 1064 res) hk07534 (1064) 413 75.5 4.1e-14 KIAA1361 ( 1005 res) fj02367 (1005) 400 73.5 1.6e-13 KIAA0096 ( 766 res) ha01240s1 ( 766) 396 72.7 2e-13 KIAA0175 ( 656 res) ha02337 ( 656) 395 72.5 2e-13 KIAA1860 ( 689 res) fh18358 ( 689) 388 71.5 4.4e-13 KIAA0936 ( 640 res) hh04647 ( 640) 377 69.7 1.3e-12 KIAA0537 ( 698 res) hg03925 ( 698) 372 69.0 2.4e-12 KIAA0687 ( 1175 res) hk02992 (1175) 374 69.6 2.7e-12 KIAA1811 ( 715 res) ha06731 ( 715) 361 67.4 7.8e-12 KIAA1765 ( 608 res) fj12188(revised) ( 608) 359 67.0 8.7e-12 KIAA0999 ( 1371 res) fj10213 (1371) 357 67.1 1.8e-11 KIAA0032 ( 1054 res) ha01920 (1054) 343 64.8 6.7e-11 KIAA0619 ( 1428 res) hg04117 (1428) 334 63.6 2.1e-10 KIAA0781 ( 950 res) hk09678 ( 950) 328 62.5 3.1e-10 KIAA0968 ( 527 res) hj06483 ( 527) 324 61.5 3.2e-10 KIAA0344 ( 2066 res) hg01568 (2066) 332 63.5 3.3e-10 KIAA0369 ( 794 res) hh00177 ( 794) 322 61.5 5.2e-10 KIAA1124 ( 1760 res) fg05708 (1760) 322 61.9 8.5e-10 KIAA1760 ( 2219 res) af00030 (2219) 304 59.3 6.6e-09 KIAA1297 ( 2242 res) fg03883 (2242) 295 57.9 1.7e-08 KIAA1593 ( 953 res) fj09260 ( 953) 286 56.1 2.6e-08 KIAA0834 ( 453 res) hj05353 ( 453) 273 53.7 6.5e-08 KIAA0904 ( 1535 res) ha00554 (1535) 278 55.1 8.2e-08 KIAA1028 ( 501 res) fh00176s1 ( 501) 267 52.8 1.3e-07 KIAA1639 ( 2584 res) af14886 (2584) 272 54.5 2.1e-07 KIAA0965 ( 489 res) hj06174s1 ( 489) 256 51.1 4.1e-07 KIAA0787 ( 557 res) hk05521s1 ( 557) 255 51.0 4.9e-07 KIAA1101 ( 467 res) hk08029 ( 467) 251 50.3 6.8e-07 KIAA1790 ( 1369 res) fh24104 (1369) 256 51.7 7.8e-07 KIAA1477 ( 870 res) fj04927 ( 870) 249 50.4 1.2e-06 KIAA0472 ( 365 res) hh00171 ( 365) 236 47.9 2.8e-06 KIAA1048 ( 897 res) hh02560 ( 897) 236 48.4 5e-06 KIAA1417 ( 1379 res) fh14782 (1379) 223 46.6 2.6e-05 KIAA0536 ( 1028 res) hg03863 (1028) 207 44.0 0.00012 KIAA0973 ( 1583 res) hj06871 (1583) 208 44.4 0.00014 KIAA0303 ( 2137 res) hg00009 (2137) 204 44.0 0.00025 KIAA0561 ( 1308 res) hh01676 (1308) 200 43.1 0.00028 KIAA0807 ( 1329 res) hk04449(revised) (1329) 199 43.0 0.00032 KIAA1338 ( 1495 res) fh16948 (1495) 198 42.9 0.00038 KIAA0151 ( 723 res) ha03241 ( 723) 193 41.7 0.00041 KIAA0641 ( 1326 res) hj03494s1 (1326) 196 42.5 0.00044 >>KIAA1901 ( 1265 res) hh03635 (1265 aa) initn: 721 init1: 695 opt: 754 Z-score: 625.6 bits: 127.6 E(): 9.9e-30 Smith-Waterman score: 754; 42.308% identity (75.000% similar) in 260 aa overlap (84-343:11-268) 60 70 80 90 100 110 KIAA19 SGGCGDSSPGPSASQGPRAGGGAAEQEELHYIPIRVLGRGAFGEATLYRRTEDDSLVVWK :. .. .:.:.::.: : . ::: : : KIAA19 RCLRKRIMEKYVRLQKIGEGSFGKAILVKSTEDGRQYVIK 10 20 30 40 120 130 140 150 160 170 KIAA19 EVDLTRLSEKERRDALNEIVILALLQHDNIIAYYNHFMDNTTLLIELEYCNGGNLYDKIL :....:.: :::... :...:: ..: ::. : . : .: .: : ..::.::.:. .: KIAA19 EINISRMSSKEREESRREVAVLANMKHPNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGDLFKRIN 50 60 70 80 90 100 180 190 200 210 220 230 KIAA19 RQKDKLFEEEMVVWYLFQIVSAVSCIHKAGILHRDIKTLNIFLTKANLIKLGDYGLAKKL :: ::.:.... .. :: :.. .: :::::::. :::::: . ..:::.:.:. : KIAA19 AQKGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVHDRKILHRDIKSQNIFLTKDGTVQLGDFGIARVL 110 120 130 140 150 160 240 250 260 270 280 290 KIAA19 NSEYSMAETLVGTPYYMSPELCQGVKYNFKSDIWAVGCVIFELLTLKRTFDATNPLNLCV :: .:.: .:::::.:::.:.. :: ::::::.:::..:: :::..:.: . :: . KIAA19 NSTVELARTCIGTPYYLSPEICENKPYNNKSDIWALGCVLYELCTLKHAFEAGSMKNLVL 170 180 190 200 210 220 300 310 320 330 340 350 KIAA19 KIVQGIRAMEVDSSQYSLELIQMVHSCLDQDPEQRPTADELLDRPLLRKRRREMEEKVTL ::..: .. : .:: .: ..: . . ..:..::... .:.. .. :: KIAA19 KIISG--SFPPVSLHYSYDLRSLVSQLFKRNPRDRPSVNSILEKGFIAKRIEKFLSPQLI 230 240 250 260 270 360 370 380 390 400 410 KIAA19 LNAPTKRPRSSTVTEAPIAVVTSRTSEVYVWGGGKSTPQKLDVIKSGCSARQVCAGNTHF KIAA19 AEEFCLKTFSKFGSQPIPAKRPASGQNSISVMPAQKITKPAAKYGIPLAYKKYGDKKLHE 280 290 300 310 320 330 >>KIAA0623 ( 1100 res) hg04615 (1100 aa) initn: 418 init1: 165 opt: 457 Z-score: 381.4 bits: 82.2 E(): 4e-16 Smith-Waterman score: 468; 33.893% identity (64.094% similar) in 298 aa overlap (62-342:47-337) 40 50 60 70 80 KIAA19 AMSVLGEYERHCDSINSDFGSESGGCGDSSPGPSASQGPRA--GGGAAEQE--ELHYIPI :.: . : : :::: . ...: KIAA06 HESPPGPGAAAAPDPPHAGALRARGAAVLIPAPHCAARPSAVCPGGAAMEVVGDFEYSKR 20 30 40 50 60 70 90 100 110 120 130 140 KIAA19 RVLGRGAFGEATLYR---RTEDDSLVVWKEVDLTRLSEKERRDALNEIVILALLQHDNII ..:.::: :...: : . : :. : .. :: : . .:: :: :::.::. KIAA06 DLVGHGAF--AVVFRGRHRQKTDWEVAIKSINKKNLS-KSQILLGKEIKILKELQHENIV 80 90 100 110 120 130 150 160 170 180 190 200 KIAA19 AYYN-HFMDNTTLLIELEYCNGGNLYDKILRQKDKLFEEEMVVWYLFQIVSAVSCIHKAG : :. . . :...:. .::::::.: : :. : : :. . : .: ::..:. .:. : KIAA06 ALYDVQELPNSVFLV-MEYCNGGDLAD-YLQAKGTLSEDTIRV-FLHQIAAAMRILHSKG 140 150 160 170 180 190 210 220 230 240 250 KIAA19 ILHRDIKTLNIFLTKANL---------IKLGDYGLAKKLNSEYSMAETLVGTPYYMSPEL :.:::.: ::.:. :: ::..:.:.:. :.:.. :: :: :.:.::.::. KIAA06 IIHRDLKPQNILLSYANRRKSSVSGIRIKIADFGFARYLHSNM-MAATLCGSPMYMAPEV 200 210 220 230 240 260 270 280 290 300 310 KIAA19 CQGVKYNFKSDIWAVGCVIFELLTLKRTFDATNPLNLCVKIVQGIRAMEVDSSQYSLELI .. .:. :.:.:..: ::.. :. : :.:..: .: . .. : . : : KIAA06 IMSQHYDAKADLWSIGTVIYQCLVGKPPFQANSPQDLRMFYEKNRSLMPSIPRETSPYLA 250 260 270 280 290 300 320 330 340 350 360 370 KIAA19 QMVHSCLDQDPEQRPTADELLDRPLLRKRRREMEEKVTLLNAPTKRPRSSTVTEAPIAVV ... . :... ..: . ....:.:.. KIAA06 NLLLGLLQRNQKDRMDFEAFFSHPFLEQGPVKKSCPVPVPMYSGSVSGSSCGSSPSCRFA 310 320 330 340 350 360 >>KIAA1142 ( 467 res) hh05864 (467 aa) initn: 447 init1: 313 opt: 449 Z-score: 379.0 bits: 80.6 E(): 5.4e-16 Smith-Waterman score: 449; 31.102% identity (64.173% similar) in 254 aa overlap (90-342:203-450) 60 70 80 90 100 110 KIAA19 SSPGPSASQGPRAGGGAAEQEELHYIPIRVLGRGAFGEATLYRRTEDDSLVVWKEVDLTR .:.:. : . . . .::. :..:: . KIAA11 QRVSHEQFRAALQLVVDPGDPRSYLDNFIKIGEGSTGIVCIATVRSSGKLVAVKKMDLRK 180 190 200 210 220 230 120 130 140 150 160 170 KIAA19 LSEKERRDAL-NEIVILALLQHDNIIAYYNHFMDNTTLLIELEYCNGGNLYDKILRQKDK ..::. : ::.::. ::.:.. .:: .. . : . .:. .:: : : . . . KIAA11 ---QQRRELLFNEVVIMRDYQHENVVEMYNSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTR-- 240 250 260 270 280 180 190 200 210 220 230 KIAA19 LFEEEMVVWYLFQIVSAVSCIHKAGILHRDIKTLNIFLTKANLIKLGDYGLAKKLNSEYS ..::... . ...:.: .: :..:::::. .:.::. . .::.:.:. ....: KIAA11 -MNEEQIAAVCLAVLQALSVLHAQGVIHRDIKSDSILLTHDGRVKLSDFGFCAQVSKEVP 290 300 310 320 330 340 240 250 260 270 280 290 KIAA19 MAETLVGTPYYMSPELCQGVKYNFKSDIWAVGCVIFELLTLKRTFDATNPLNLCVKIVQG ..::::::.:.::: . . :. . :::..: ...:.. . . ::. : .. KIAA11 RRKSLVGTPYWMAPELISRLPYGPEVDIWSLGIMVIEMVDGEPPYFNEPPLKAMKMIRDN 350 360 370 380 390 400 300 310 320 330 340 350 KIAA19 IRAMEVDSSQYSLELIQMVHSCLDQDPEQRPTADELLDRPLLRKRRREMEEKVTLLNAPT . . . : : .. : .:: :: :: ::: .:.: : KIAA11 LPPRLKNLHKVSPSLKGFLDRLLVRDPAQRATAAELLKHPFLAKAGPPASIVPLMRQNRT 410 420 430 440 450 460 360 370 380 390 400 410 KIAA19 KRPRSSTVTEAPIAVVTSRTSEVYVWGGGKSTPQKLDVIKSGCSARQVCAGNTHFAVVTV KIAA11 R >>KIAA0722 ( 1066 res) hk02030s1 (1066 aa) initn: 436 init1: 197 opt: 451 Z-score: 376.6 bits: 81.3 E(): 7.4e-16 Smith-Waterman score: 451; 31.379% identity (64.483% similar) in 290 aa overlap (62-340:11-294) 40 50 60 70 80 90 KIAA19 AMSVLGEYERHCDSINSDFGSESGGCGDSSPGPSASQGPRAGGGAAEQEELHYIPIRVLG : :. .. : . ::. .... ..: KIAA07 RLGPPPPAPRPRPACAMEP-GRGGTETVGKFEFSRKDLIG 10 20 30 100 110 120 130 140 KIAA19 RGAFGEATLYRRTEDDSL-VVWKEVDLTRLSEKERRDALNEIVILALLQHDNIIAYYN-H .:::. . :. : .: :. : .. :. : . .:: :: :.:.::.: :. . KIAA07 HGAFAVVFKGRHREKHDLEVAVKCINKKNLA-KSQTLLGKEIKILKELKHENIVALYDFQ 40 50 60 70 80 90 150 160 170 180 190 200 KIAA19 FMDNTTLLIELEYCNGGNLYDKILRQKDKLFEEEMVVWYLFQIVSAVSCIHKAGILHRDI : :.. :. .::::::.: : . . . . :. . .: ::..:. .:. ::.:::. KIAA07 EMANSVYLV-MEYCNGGDLADYL--HAMRTLSEDTIRLFLQQIAGAMRLLHSKGIIHRDL 100 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 260 KIAA19 KTLNIFLT-----KAN----LIKLGDYGLAKKLNSEYSMAETLVGTPYYMSPELCQGVKY : ::.:. .:: .:..:.:.:. :.:.. :: :: :.:.::.::. .. .: KIAA07 KPQNILLSNPAGRRANPNSIRVKIADFGFARYLQSNM-MAATLCGSPMYMAPEVIMSQHY 160 170 180 190 200 210 270 280 290 300 310 320 KIAA19 NFKSDIWAVGCVIFELLTLKRTFDATNPLNLCVKIVQGIRAMEVDSSQYSLELIQMVHSC . :.:.:..: .... :: : :.:..: .: . .. . . . : : :.. . KIAA07 DGKADLWSIGTIVYQCLTGKAPFQASSPQDLRLFYEKNKTLVPTIPRETSAPLRQLLLAL 220 230 240 250 260 270 330 340 350 360 370 380 KIAA19 LDQDPEQRPTADELLDRPLLRKRRREMEEKVTLLNAPTKRPRSSTVTEAPIAVVTSRTSE :... ..: ::.. .:.: KIAA07 LQRNHKDRMDFDEFFHHPFLDASPSVRKSPPVPVPSYPSSGSGSSSSSSSTSHLASPPSL 280 290 300 310 320 330 >>KIAA1264 ( 753 res) hj01058 (753 aa) initn: 407 init1: 314 opt: 439 Z-score: 368.4 bits: 79.3 E(): 2.1e-15 Smith-Waterman score: 439; 30.040% identity (65.613% similar) in 253 aa overlap (90-341:489-735) 60 70 80 90 100 110 KIAA19 SSPGPSASQGPRAGGGAAEQEELHYIPIRVLGRGAFGEATLYRRTEDDSLVVWKEVDLTR .:.:. : . . . . . :. :..:: . KIAA12 SRVSHEQFRAALQLVVSPGDPREYLANFIKIGEGSTGIVCIATEKHTGKQVAVKKMDLRK 460 470 480 490 500 510 120 130 140 150 160 170 KIAA19 LSEKERRDAL-NEIVILALLQHDNIIAYYNHFMDNTTLLIELEYCNGGNLYDKILRQKDK ..::. : ::.::. .:::.. .:. .. . : . .:. .:: : : . . . KIAA12 ---QQRRELLFNEVVIMRDYHHDNVVDMYSSYLVGDELWVVMEFLEGGALTDIVTHTR-- 520 530 540 550 560 570 180 190 200 210 220 230 KIAA19 LFEEEMVVWYLFQIVSAVSCIHKAGILHRDIKTLNIFLTKANLIKLGDYGLAKKLNSEYS ..::... .... :.: .:. :..:::::. .:.::. . :::.:.:. ....: KIAA12 -MNEEQIATVCLSVLRALSYLHNQGVIHRDIKSDSILLTSDGRIKLSDFGFCAQVSKEVP 580 590 600 610 620 630 240 250 260 270 280 290 KIAA19 MAETLVGTPYYMSPELCQGVKYNFKSDIWAVGCVIFELLTLKRTFDATNPLNLCVKIVQG ..::::::.:.::. . . :. . :::..: ...:.. . . ::. .: .. KIAA12 KRKSLVGTPYWMAPEVISRLPYGTEVDIWSLGIMVIEMIDGEPPYFNEPPLQAMRRIRDS 640 650 660 670 680 690 300 310 320 330 340 350 KIAA19 IRAMEVDSSQYSLELIQMVHSCLDQDPEQRPTADELLDRPLLRKRRREMEEKVTLLNAPT . : . : : .. : ..: :: ::.::: .:.:. KIAA12 LPPRVKDLHKVSSVLRGFLDLMLVREPSQRATAQELLGHPFLKLAGPPSCIVPLMRQYRH 700 710 720 730 740 750 360 370 380 390 400 410 KIAA19 KRPRSSTVTEAPIAVVTSRTSEVYVWGGGKSTPQKLDVIKSGCSARQVCAGNTHFAVVTV KIAA12 H >>KIAA0204 ( 1164 res) ha02801 (1164 aa) initn: 389 init1: 164 opt: 436 Z-score: 363.8 bits: 79.1 E(): 3.8e-15 Smith-Waterman score: 436; 29.688% identity (66.016% similar) in 256 aa overlap (90-340:52-304) 60 70 80 90 100 110 KIAA19 SSPGPSASQGPRAGGGAAEQEELHYIPIRVLGRGAFGEATLYRRTEDDSLVVWKEVDLTR :: ::::.. . : . :.. : .: KIAA02 FKLGSEKKKKQYEHVKRDLNPEDFWEIIGELGDGAFGKVYKAQNKETSVLAAAKVIDTK- 30 40 50 60 70 80 120 130 140 150 160 170 KIAA19 LSEKERRDALNEIVILALLQHDNIIAYYNHFMDNTTLLIELEYCNGGNLYDKILRQKDKL ::.: .: . :: ::: .: ::. . :. ...: : .:.: :: . : .. . .. KIAA02 -SEEELEDYMVEIDILASCDHPNIVKLLDAFYYENNLWILIEFCAGGAV-DAVMLELERP 90 100 110 120 130 180 190 200 210 220 230 KIAA19 FEEEMVVWYLFQIVSAVSCIHKAGILHRDIKTLNIFLTKANLIKLGDYGLAKKLNSEYSM . : .. : ..:.. .: :.:::.:. ::..: . :::.:.:.. : . . KIAA02 LTESQIQVVCKQTLDALNYLHDNKIIHRDLKAGNILFTLDGDIKLADFGVSAKNTRTIQR 140 150 160 170 180 190 240 250 260 270 280 290 KIAA19 AETLVGTPYYMSPE--LCQGVK---YNFKSDIWAVGCVIFELLTLKRTFDATNPLNLCVK ....::::.:.:: .:. : :..:.:.:..: ...:. .. ::. . .: KIAA02 RDSFIGTPYWMAPEVVMCETSKDRPYDYKADVWSLGITLIEMAEIEPPHHELNPMRVLLK 200 210 220 230 240 250 300 310 320 330 340 350 KIAA19 IVQGIRAMEVDSSQYSLELIQMVHSCLDQDPEQRPTADELLDRPLLRKRRREMEEKVTLL :... .. :..: .. .....::... . : :...::..:.. KIAA02 IAKSEPPTLAQPSRWSSNFKDFLKKCLEKNVDARWTTSQLLQHPFVTVDSNKPIRELIAE 260 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 410 KIAA19 NAPTKRPRSSTVTEAPIAVVTSRTSEVYVWGGGKSTPQKLDVIKSGCSARQVCAGNTHFA KIAA02 AKAEVTEEVEDGKEEDEEEETENSLPIPASKRASSDLSIASSEEDKLSQNACILESVSEK 320 330 340 350 360 370 >>KIAA0551 ( 1385 res) hh00867s1 (1385 aa) initn: 337 init1: 189 opt: 435 Z-score: 362.1 bits: 79.0 E(): 4.7e-15 Smith-Waterman score: 435; 27.240% identity (64.158% similar) in 279 aa overlap (87-353:53-327) 60 70 80 90 100 110 KIAA19 CGDSSPGPSASQGPRAGGGAAEQEELHYIPIRVLGRGAFGEATLYRRTEDDSLVVWKEVD ....: :..:.. :... .:.. : .: KIAA05 EVDMASDSPARSLDEIDLSALRDPAGIFELVELVGNGTYGQVYKGRHVKTGQLAAIKVMD 30 40 50 60 70 80 120 130 140 150 160 KIAA19 LTRLSEKERRDALNEIVILALLQHDNIIAYYNHF-------MDNTTLLIELEYCNGGNLY .: :.: .. .: .. .: :: .::. : ::. :. .:.:..:.. KIAA05 VTGDEEEEIKQEIN--MLKKYSHHRNIATYYGAFIKKNPPGMDDQLWLV-MEFCGAGSVT 90 100 110 120 130 170 180 190 200 210 220 KIAA19 DKILRQKDKLFEEEMVVWYLFQIVSAVSCIHKAGILHRDIKTLNIFLTKANLIKLGDYGL : : : . ..:: ... .:. ..: .:. ..::::: :..::. .:: :.:. KIAA05 DLIKNTKGNTLKEEWIAYICREILRGLSHLHQHKVIHRDIKGQNVLLTENAEVKLVDFGV 140 150 160 170 180 190 230 240 250 260 270 280 KIAA19 AKKLNSEYSMAETLVGTPYYMSPEL--CQ---GVKYNFKSDIWAVGCVIFELLTLKRTFD . .:. . .:..::::.:.::. :. . :.::::.:..: . .:. . KIAA05 SAQLDRTVGRRNTFIGTPYWMAPEVIACDENPDATYDFKSDLWSLGITAIEMAEGAPPLC 200 210 220 230 240 250 290 300 310 320 330 340 KIAA19 ATNPLNLCVKIVQGIRAMEVDSSQYSLELIQMVHSCLDQDPEQRPTADELLDRPLLRKRR .:. . .. : .. :...: .. ....::: .. :::....:. .:..: . KIAA05 DMHPMR-ALFLIPRNPAPRLKSKKWSKKFQSFIESCLVKNHSQRPATEQLMKHPFIRDQP 260 270 280 290 300 310 350 360 370 380 390 400 KIAA19 REMEEKVTLLNAPTKRPRSSTVTEAPIAVVTSRTSEVYVWGGGKSTPQKLDVIKSGCSAR : . .. : KIAA05 NERQVRIQLKDHIDRTKKKRGEKDETEYEYSGSEEEEEENDSGEPSSILNLPGESTLRRD 320 330 340 350 360 370 >>KIAA1278 ( 1311 res) hg03689(revised) (1311 aa) initn: 422 init1: 267 opt: 428 Z-score: 356.6 bits: 77.9 E(): 9.6e-15 Smith-Waterman score: 428; 32.946% identity (63.566% similar) in 258 aa overlap (84-340:21-271) 60 70 80 90 100 110 KIAA19 SGGCGDSSPGPSASQGPRAGGGAAEQEELHYIPIRVLGRGAFGEATLYRRTEDDSLVVWK : ....:.:.::.. :: . ..:. : KIAA12 LFTVSTFFLLRDPETSVMEKYHVLEMIGEGSFGRVYKGRRKYSAQVVALK 10 20 30 40 50 120 130 140 150 160 170 KIAA19 EVDLTRLSEKERRDALNEIVILALLQHDNIIAYYNHFMDNTTLLIELEYCNGGNLYDKIL . :::: :. :: :. :.: ::. . . : . ... .: .: .:. .:: KIAA12 FIPKLGRSEKELRNLQREIEIMRGLRHPNIVHMLDSFETDKEVVVVTDYAEG-ELF-QIL 60 70 80 90 100 180 190 200 210 220 230 KIAA19 RQKDKLFEEEMVVWYLFQIVSAVSCIHKAGILHRDIKTLNIFLTKANLIKLGDYGLAKKL .. :: :..: :.:::. .:. :::::.: ::.:.:.. ::: :.:.:. . KIAA12 EDDGKL-PEDQVQAIAAQLVSALYYLHSHRILHRDMKPQNILLAKGGGIKLCDFGFARAM 110 120 130 140 150 160 240 250 260 270 280 290 KIAA19 NSEYSMAETLVGTPYYMSPELCQGVKYNFKSDIWAVGCVIFELLTLKRTFDATNPLNLCV ... . .. ::: :::::: . :. .:.:.:::...:: . : ::. ..: KIAA12 STNTMVLTSIKGTPLYMSPELVEERPYDHTADLWSVGCILYELAVGTPPFYATSIFQLVS 170 180 190 200 210 220 300 310 320 330 340 350 KIAA19 KIVQG-IRAMEVDSSQYSLELIQMVHSCLDQDPEQRPTADELLDRPLLRKRRREMEEKVT :.. .: : : . ..... : .::.:: . .:: .:.. KIAA12 LILKDPVRW----PSTISPCFKNFLQGLLTKDPRQRLSWPDLLYHPFIAGHVTIITEPAG 230 240 250 260 270 280 360 370 380 390 400 410 KIAA19 LLNAPTKRPRSSTVTEAPIAVVTSRTSEVYVWGGGKSTPQKLDVIKSGCSARQVCAGNTH KIAA12 PDLGTPFTSRLPPELQVLKDEQAHRLAPKGNQSRILTQAYKRMAEEAMQKKHQNTGPALE 290 300 310 320 330 340 >>KIAA0213 ( 1626 res) ha04841s1 (1626 aa) initn: 325 init1: 163 opt: 421 Z-score: 349.8 bits: 76.9 E(): 2.3e-14 Smith-Waterman score: 421; 30.385% identity (65.385% similar) in 260 aa overlap (90-341:1367-1620) 60 70 80 90 100 110 KIAA19 SSPGPSASQGPRAGGGAAEQEELHYIPIRVLGRGAFGEATLYRRTEDDSLVVWKEVDLTR .:.: .:.. .. :.. ::. . KIAA02 GQVCDTPKSYDNVMHVGLRKVTFKWQRGNKIGEGQYGKVYTCISVDTGELMAMKEIRFQP 1340 1350 1360 1370 1380 1390 120 130 140 150 160 170 KIAA19 LSEKERRDALNEIVILALLQHDNIIAYYNHFMDNTTLLIELEYCNGGNLYDKILRQKDKL ..: ... .:. :. ..: :.. :.. . . : .:::. :.: ... : KIAA02 NDHKTIKETADELKIFEGIKHPNLVRYFGVELHREEMYIFMEYCDEGTL-EEVSRLG--- 1400 1410 1420 1430 1440 1450 180 190 200 210 220 230 KIAA19 FEEEMVVWYLFQIVSAVSCIHKAGILHRDIKTLNIFLTKANLIKLGDYGLAKKL-NSEYS ..:... : ::. :.. .:. ::.::::: :::::...::::::.: . :: :. . KIAA02 LQEHVIRLYSKQITIAINVLHEHGIVHRDIKGANIFLTSSGLIKLGDFGCSVKLKNNAQT 1460 1470 1480 1490 1500 1510 240 250 260 270 280 290 KIAA19 M---AETLVGTPYYMSPEL---CQGVKYNFKSDIWAVGCVIFELLTLKRTF-DATNPLNL : ... .:: ::.::. .: .. .:::..:::..:..: :: . . . ... KIAA02 MPGEVNSTLGTAAYMAPEVITRAKGEGHGRAADIWSLGCVVIEMVTGKRPWHEYEHNFQI 1520 1530 1540 1550 1560 1570 300 310 320 330 340 350 KIAA19 CVKIVQGIRAMEVDSSQYSLELIQMVHSCLDQDPEQRPTADELLDRPLLRKRRREMEEKV :. .: . . . : : ... ::..::..: ::..:::. ... KIAA02 MYKVGMGHKPPIPE--RLSPEGKDFLSHCLESDPKMRWTASQLLDHSFVKVCTDEE 1580 1590 1600 1610 1620 360 370 380 390 400 410 KIAA19 TLLNAPTKRPRSSTVTEAPIAVVTSRTSEVYVWGGGKSTPQKLDVIKSGCSARQVCAGNT >>KIAA0881 ( 1064 res) hk07534 (1064 aa) initn: 276 init1: 101 opt: 413 Z-score: 345.2 bits: 75.5 E(): 4.1e-14 Smith-Waterman score: 413; 29.054% identity (64.189% similar) in 296 aa overlap (62-343:12-300) 40 50 60 70 80 KIAA19 AMSVLGEYERHCDSINSDFGSESGGCGDSSPGPSASQGPRAGG----GAAE-----QEEL :: . : :::. .:: . : KIAA08 PLPGQAPLSGPPGATMPAGGRAGSLKDPDVAELFFKDDPEK 10 20 30 40 90 100 110 120 130 140 KIAA19 HYIPIRVLGRGAFGEATLYRRTEDDSLVVWKEVDLT-RLSEKERRDALNEIVILALLQHD . .: .:.:.:: . . : .... .:. :... . . :... .: ..:. .: :.: KIAA08 LFSDLREIGHGSFGAVYFARDVRNSEVVAIKKMSYSGKQSNEKWQDIIKEVRFLQKLRHP 50 60 70 80 90 100 150 160 170 180 190 200 KIAA19 NIIAYYNHFMDNTTLLIELEYCNGGNLYDKILRQKDKLFEEEMVVWYLFQIVSAVSCIHK : : : . .. . : . .::: :. . .:. . : ..: .. ..... .:. KIAA08 NTIQYRGCYLREHTAWLVMEYCLGSA--SDLLEVHKKPLQEVEIAAVTHGALQGLAYLHS 110 120 130 140 150 210 220 230 240 250 KIAA19 AGILHRDIKTLNIFLTKANLIKLGDYGLAKKLNSEYSMAETLVGTPYYMSPELCQGV--- ...:::.:. ::.:.. .:.::::.: : : .. :...:::::.:.::. .. KIAA08 HNMIHRDVKAGNILLSEPGLVKLGDFGSA----SIMAPANSFVGTPYWMAPEVILAMDEG 160 170 180 190 200 210 260 270 280 290 300 310 KIAA19 KYNFKSDIWAVGCVIFELLTLKRTFDATNPLNLCVKIVQGIRAMEVDSSQYSLELIQMVH .:. : :.:..: . .:: : . : .. .:.:. . ..:...: . ..: KIAA08 QYDGKVDVWSLGITCIELAERKPPLFNMNAMSALYHIAQNESPV-LQSGHWSEYFRNFVD 220 230 240 250 260 270 320 330 340 350 360 370 KIAA19 SCLDQDPEQRPTADELLD-RPLLRKRRREMEEKVTLLNAPTKRPRSSTVTEAPIAVVTSR :::.. :..:::.. :: : .::.: KIAA08 SCLQKIPQDRPTSEVLLKHRFVLRERPPTVIMDLIQRTKDAVRELDNLQYRKMKKILFQE 280 290 300 310 320 330 1011 residues in 1 query sequences 1986494 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:24:52 2008 done: Thu Dec 18 15:24:53 2008 Total Scan time: 0.660 Total Display time: 0.240 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]