# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fk06527mrp1.fasta.nr -Q ../query/KIAA1982.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1982, 599 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7798606 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9021+/-0.000186; mu= 8.2790+/- 0.010 mean_var=77.1369+/-14.855, 0's: 36 Z-trim: 244 B-trim: 36 in 1/66 Lambda= 0.146030 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|158706490|sp|Q8TF20.2|ZN721_HUMAN RecName: Full ( 911) 4261 908.8 0 gi|119120877|ref|NP_597731.2| zinc finger protein ( 923) 4261 908.8 0 gi|119603074|gb|EAW82668.1| hCG1981959, isoform CR ( 955) 4261 908.8 0 gi|114592718|ref|XP_526499.2| PREDICTED: zinc fing ( 868) 4235 903.3 0 gi|114592716|ref|XP_001136398.1| PREDICTED: zinc f ( 900) 4235 903.3 0 gi|114592714|ref|XP_001136574.1| PREDICTED: zinc f ( 955) 4235 903.3 0 gi|108995335|ref|XP_001106411.1| PREDICTED: zinc f ( 762) 2939 630.2 6.9e-178 gi|114676315|ref|XP_512535.2| PREDICTED: zinc fing (1226) 2795 600.1 1.3e-168 gi|109124151|ref|XP_001087503.1| PREDICTED: simila (1063) 2750 590.5 8.5e-166 gi|118600985|ref|NP_003421.2| zinc finger protein (1191) 2746 589.7 1.7e-165 gi|119605346|gb|EAW84940.1| zinc finger protein 91 (1185) 2741 588.7 3.4e-165 gi|114676418|ref|XP_524454.2| PREDICTED: zinc fing (1325) 2740 588.5 4.3e-165 gi|221043150|dbj|BAH13252.1| unnamed protein produ (1159) 2736 587.6 7e-165 gi|549839|sp|Q05481.1|ZNF91_HUMAN RecName: Full=Zi (1191) 2734 587.2 9.5e-165 gi|158255948|dbj|BAF83945.1| unnamed protein produ (1191) 2717 583.6 1.1e-163 gi|187671941|sp|A6NN14.3|YS032_HUMAN RecName: Full (1173) 2682 576.2 1.9e-161 gi|12585543|sp|O43345.1|ZN208_HUMAN RecName: Full= (1167) 2681 576.0 2.2e-161 gi|109124478|ref|XP_001104516.1| PREDICTED: simila (1233) 2680 575.8 2.6e-161 gi|119605317|gb|EAW84911.1| zinc finger protein 20 (1137) 2678 575.4 3.3e-161 gi|73948425|ref|XP_541659.2| PREDICTED: similar to (1259) 2661 571.9 4.2e-160 gi|119605319|gb|EAW84913.1| zinc finger protein 20 ( 851) 2657 570.9 5.7e-160 gi|114676354|ref|XP_528849.2| PREDICTED: zinc fing (1227) 2653 570.2 1.3e-159 gi|114676358|ref|XP_512547.2| PREDICTED: zinc fing (1186) 2638 567.0 1.2e-158 gi|119605325|gb|EAW84919.1| hCG1773661 [Homo sapie (1119) 2627 564.6 5.6e-158 gi|169213828|ref|XP_001715017.1| PREDICTED: simila (1291) 2627 564.7 6.2e-158 gi|169213614|ref|XP_001719825.1| PREDICTED: simila (1291) 2627 564.7 6.2e-158 gi|73947674|ref|XP_541442.2| PREDICTED: similar to (1142) 2621 563.4 1.4e-157 gi|126330148|ref|XP_001380123.1| PREDICTED: simila ( 782) 2619 562.8 1.4e-157 gi|114676858|ref|XP_512615.2| PREDICTED: zinc fing (1120) 2620 563.2 1.5e-157 gi|114676856|ref|XP_001163591.1| PREDICTED: zinc f (1238) 2620 563.2 1.7e-157 gi|109461612|ref|XP_001078762.1| PREDICTED: simila (1321) 2617 562.6 2.7e-157 gi|109458488|ref|XP_574414.2| PREDICTED: similar t (1396) 2617 562.6 2.8e-157 gi|158256142|dbj|BAF84042.1| unnamed protein produ ( 803) 2591 556.9 8.4e-156 gi|109066435|ref|XP_001098865.1| PREDICTED: zinc f ( 852) 2591 556.9 8.8e-156 gi|117646676|emb|CAL37453.1| hypothetical protein ( 809) 2590 556.7 9.8e-156 gi|21542325|sp|Q9UII5.1|ZN107_HUMAN RecName: Full= ( 783) 2588 556.3 1.3e-155 gi|119598381|gb|EAW77975.1| zinc finger protein 58 ( 820) 2588 556.3 1.3e-155 gi|115502480|sp|P17038.3|ZNF43_HUMAN RecName: Full ( 803) 2587 556.1 1.5e-155 gi|32879853|gb|AAP88757.1| zinc finger protein 43 ( 804) 2587 556.1 1.5e-155 gi|33878892|gb|AAH06528.2| Zinc finger protein 43 ( 809) 2587 556.1 1.5e-155 gi|117646814|emb|CAL37522.1| hypothetical protein ( 809) 2585 555.7 2e-155 gi|38032|emb|CAA41932.1| ZNF43 [Homo sapiens] ( 803) 2581 554.8 3.6e-155 gi|123227460|emb|CAM27169.1| novel KRAB box and zi ( 834) 2580 554.6 4.3e-155 gi|114677092|ref|XP_512625.2| PREDICTED: zinc fing (1377) 2582 555.2 4.6e-155 gi|57999465|emb|CAI45941.1| hypothetical protein [ ( 803) 2578 554.2 5.6e-155 gi|126324559|ref|XP_001368136.1| PREDICTED: simila ( 762) 2565 551.4 3.6e-154 gi|73946821|ref|XP_862028.1| PREDICTED: similar to ( 930) 2564 551.3 4.8e-154 gi|73947807|ref|XP_541674.2| PREDICTED: similar to (2872) 2569 552.8 5.2e-154 gi|73946823|ref|XP_862054.1| PREDICTED: similar to (1014) 2560 550.5 9.2e-154 gi|114586410|ref|XP_526188.2| PREDICTED: zinc fing (1027) 2556 549.6 1.7e-153 >>gi|158706490|sp|Q8TF20.2|ZN721_HUMAN RecName: Full=Zin (911 aa) initn: 16160 init1: 4261 opt: 4261 Z-score: 4854.1 bits: 908.8 E(): 0 Smith-Waterman score: 4261; 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