# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fk08985.fasta.nr -Q ../query/KIAA1971.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA1971, 830 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7807467 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4786+/-0.000207; mu= 8.7591+/- 0.011 mean_var=154.6192+/-29.384, 0's: 39 Z-trim: 85 B-trim: 16 in 1/65 Lambda= 0.103144 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|152112352|sp|Q8TF30.2|WHDC1_HUMAN RecName: Full ( 809) 5492 829.7 0 gi|114658582|ref|XP_510552.2| PREDICTED: WAS prote ( 813) 5412 817.8 0 gi|194039576|ref|XP_001927350.1| PREDICTED: WAS pr ( 809) 4248 644.6 4.9e-182 gi|109082188|ref|XP_001082027.1| PREDICTED: simila ( 595) 3770 573.3 1e-160 gi|149057373|gb|EDM08696.1| similar to junction-me ( 797) 3501 533.4 1.4e-148 gi|152112353|sp|Q571B6.2|WHDC1_MOUSE RecName: Full ( 793) 3374 514.5 6.8e-143 gi|194206245|ref|XP_001498251.2| PREDICTED: WAS pr ( 687) 3091 472.3 3e-130 gi|148674985|gb|EDL06932.1| WAS protein homology r ( 709) 3001 458.9 3.2e-126 gi|126273657|ref|XP_001365503.1| PREDICTED: simila ( 803) 2992 457.7 8.9e-126 gi|29476874|gb|AAH42749.1| WAS protein homology re ( 724) 2919 446.7 1.6e-122 gi|73951590|ref|XP_852133.1| PREDICTED: similar to ( 592) 1873 291.0 9.7e-76 gi|148674987|gb|EDL06934.1| WAS protein homology r ( 501) 1743 271.6 5.8e-70 gi|47230612|emb|CAF99805.1| unnamed protein produc ( 789) 1706 266.3 3.6e-68 gi|29747772|gb|AAH50804.1| Whdc1 protein [Mus musc ( 489) 1683 262.6 2.8e-67 gi|26348869|dbj|BAC38074.1| unnamed protein produc ( 415) 1508 236.5 1.7e-59 gi|82185655|sp|Q6NVC9.1|JMY_DANRE RecName: Full=Ju ( 846) 1438 226.4 3.8e-56 gi|172045600|sp|A8E4X8.1|JMY_XENTR RecName: Full=J ( 843) 1402 221.1 1.5e-54 gi|81869425|sp|Q9QXM1.1|JMY_MOUSE RecName: Full=Ju ( 983) 1264 200.6 2.6e-48 gi|60552527|gb|AAH90835.1| Junction-mediating and ( 983) 1264 200.6 2.6e-48 gi|148668617|gb|EDL00936.1| junction-mediating and ( 769) 1229 195.3 8.1e-47 gi|194670435|ref|XP_606924.4| PREDICTED: similar t ( 991) 1226 195.0 1.3e-46 gi|126315698|ref|XP_001367434.1| PREDICTED: simila ( 967) 1224 194.7 1.6e-46 gi|149059052|gb|EDM10059.1| rCG44539 [Rattus norve ( 675) 1214 193.0 3.5e-46 gi|172045777|sp|Q8N9B5.2|JMY_HUMAN RecName: Full=J ( 988) 1177 187.7 2.1e-44 gi|195947369|ref|NP_689618.3| junction-mediating a ( 988) 1176 187.5 2.3e-44 gi|114599489|ref|XP_517685.2| PREDICTED: junction- ( 712) 1157 184.5 1.3e-43 gi|126315700|ref|XP_001367477.1| PREDICTED: simila ( 714) 1140 182.0 7.5e-43 gi|119582841|gb|EAW62437.1| hCG2004723, isoform CR ( 193) 1126 179.3 1.3e-42 gi|120659968|gb|AAI30625.1| JMY protein [Homo sapi ( 622) 1096 175.4 6.4e-41 gi|73952351|ref|XP_852894.1| PREDICTED: similar to ( 851) 1080 173.2 4.1e-40 gi|21754391|dbj|BAC04495.1| unnamed protein produc ( 634) 1055 169.3 4.5e-39 gi|47124122|gb|AAH69906.1| Jmy protein [Mus muscul ( 621) 992 159.9 2.9e-36 gi|21757855|dbj|BAC05201.1| unnamed protein produc ( 209) 959 154.5 4.2e-35 gi|148674986|gb|EDL06933.1| WAS protein homology r ( 221) 897 145.3 2.6e-32 gi|74206304|dbj|BAE24898.1| unnamed protein produc ( 555) 837 136.8 2.4e-29 gi|89477404|gb|ABD73923.1| junction-mediating and ( 131) 780 127.6 3.2e-27 gi|169208040|ref|XP_001727030.1| PREDICTED: simila ( 131) 772 126.4 7.4e-27 gi|189531963|ref|XP_001334115.2| PREDICTED: simila ( 601) 770 126.9 2.5e-26 gi|47228432|emb|CAG05252.1| unnamed protein produc ( 588) 725 120.2 2.6e-24 gi|121940649|sp|Q1A5X7.1|WHDL1_HUMAN RecName: Full ( 153) 676 112.2 1.6e-22 gi|169208753|ref|XP_001723155.1| PREDICTED: simila ( 130) 665 110.5 4.6e-22 gi|47226707|emb|CAG07866.1| unnamed protein produc ( 491) 661 110.6 1.7e-21 gi|169217978|ref|XP_001131954.2| PREDICTED: simila ( 114) 645 107.5 3.3e-21 gi|115666398|ref|XP_001200303.1| PREDICTED: hypoth (1055) 618 104.5 2.4e-19 gi|149449738|ref|XP_001519602.1| PREDICTED: simila ( 227) 589 99.5 1.7e-18 gi|148674988|gb|EDL06935.1| WAS protein homology r ( 142) 580 97.9 3.1e-18 gi|149567435|ref|XP_001511736.1| PREDICTED: simila ( 221) 491 84.9 4.1e-14 gi|18044855|gb|AAH20052.1| Jmy-pending protein [Mu ( 446) 471 82.2 5.1e-13 gi|215500506|gb|EEC10000.1| Whdc1 protein, putativ ( 491) 350 64.3 1.4e-07 gi|210085433|gb|EEA33900.1| hypothetical protein B ( 742) 344 63.6 3.5e-07 >>gi|152112352|sp|Q8TF30.2|WHDC1_HUMAN RecName: Full=WAS (809 aa) initn: 5492 init1: 5492 opt: 5492 Z-score: 4424.8 bits: 829.7 E(): 0 Smith-Waterman score: 5492; 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